Result of FASTA (omim) for
pF1KB7273
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7273, 1332 aa
1>>>pF1KB7273 1332 - 1332 aa - 1332 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.0997+/-0.000535; mu= -23.0828+/- 0.034
mean_var=645.0299+/-133.420, 0's: 0 Z-trim(121.7): 123 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.050499
statistics sampled from 38462 (38604) to 38462 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.453), width: 16
Scan time: 19.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008870 (OMIM: 601247,616559) son of sevenless h (1332) 9052 676.0 4.9e-193
NP_005624 (OMIM: 135300,182530,610733) son of seve (1333) 6229 470.3 4e-131
XP_011531364 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE (1326) 6089 460.1 4.7e-128
XP_011531366 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE (1276) 5952 450.1 4.6e-125
XP_005264572 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE (1318) 5786 438.0 2.1e-121
XP_011531368 (OMIM: 135300,182530,610733) PREDICTE ( 978) 4443 340.1 4.7e-92
NP_722522 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl ( 489) 511 53.4 4.7e-06
NP_001139120 (OMIM: 606600) ras-specific guanine n (1257) 511 53.7 9.7e-06
XP_016877945 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1260) 511 53.7 9.7e-06
XP_016877944 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specifi (1270) 511 53.7 9.8e-06
NP_002882 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucl (1273) 511 53.7 9.8e-06
XP_016865171 (OMIM: 606614) PREDICTED: ras-specifi (1142) 482 51.6 3.9e-05
NP_008840 (OMIM: 606614) ras-specific guanine nucl (1237) 482 51.6 4.1e-05
NP_005303 (OMIM: 600303) rap guanine nucleotide ex (1077) 420 47.0 0.00085
NP_001291204 (OMIM: 600303) rap guanine nucleotide (1094) 420 47.0 0.00086
NP_941372 (OMIM: 600303) rap guanine nucleotide ex (1095) 420 47.0 0.00086
XP_006717137 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1100) 420 47.0 0.00087
XP_011516881 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1108) 420 47.0 0.00087
XP_011516880 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1139) 420 47.0 0.00089
XP_011516879 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1160) 420 47.1 0.0009
XP_011516878 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1161) 420 47.1 0.0009
XP_016870128 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1192) 420 47.1 0.00092
XP_016870127 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1194) 420 47.1 0.00092
XP_016870126 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1225) 420 47.1 0.00094
XP_005272248 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1226) 420 47.1 0.00094
XP_006717135 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1232) 420 47.1 0.00094
XP_016870125 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1233) 420 47.1 0.00094
XP_016870124 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1241) 420 47.1 0.00095
XP_016870123 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1241) 420 47.1 0.00095
XP_011516877 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1246) 420 47.1 0.00095
XP_016870122 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1247) 420 47.1 0.00095
XP_011516876 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1247) 420 47.1 0.00095
XP_011516875 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1255) 420 47.1 0.00096
XP_005272243 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1264) 420 47.1 0.00096
XP_006717130 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1270) 420 47.1 0.00097
XP_011516874 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1272) 420 47.1 0.00097
XP_011516873 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1273) 420 47.1 0.00097
XP_011516872 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1277) 420 47.1 0.00097
XP_011516871 (OMIM: 600303) PREDICTED: rap guanine (1278) 420 47.1 0.00097
NP_001284601 (OMIM: 605667) ral guanine nucleotide ( 739) 376 43.7 0.0059
XP_011517538 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 515) 363 42.6 0.0086
NP_001177657 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 529) 363 42.6 0.0088
NP_001309249 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 537) 363 42.6 0.0089
NP_001177658 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 537) 363 42.6 0.0089
XP_016870835 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 549) 362 42.6 0.0095
NP_001309253 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 514) 361 42.5 0.0095
NP_055451 (OMIM: 614444) ras-specific guanine nucl ( 557) 362 42.6 0.0096
XP_016870836 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 557) 362 42.6 0.0096
XP_016870837 (OMIM: 614444) PREDICTED: ras-specifi ( 527) 361 42.5 0.0097
NP_001309251 (OMIM: 614444) ras-specific guanine n ( 576) 362 42.6 0.0099
>>NP_008870 (OMIM: 601247,616559) son of sevenless homol (1332 aa)
initn: 9052 init1: 9052 opt: 9052 Z-score: 3586.6 bits: 676.0 E(85289): 4.9e-193
Smith-Waterman score: 9052; 100.0% identity (100.0% similar) in 1332 aa overlap (1-1332:1-1332)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQQAPQPYEFFSEENSPKWRGLLVSALRKVQEQVHPTLSANEESLYYIEELIFQLLNKLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MQQAPQPYEFFSEENSPKWRGLLVSALRKVQEQVHPTLSANEESLYYIEELIFQLLNKLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MAQPRTVQDVEERVQKTFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRRNPLLLPVDKIHPSLKEVLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MAQPRTVQDVEERVQKTFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRRNPLLLPVDKIHPSLKEVLGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KVDYHVSLYIVAVLEYISADILKLAGNYVFNIRHYEISQQDIKVSMCADKVLMDMFDQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KVDYHVSLYIVAVLEYISADILKLAGNYVFNIRHYEISQQDIKVSMCADKVLMDMFDQDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IGLVSLCEDEPSSSGELNYYDLVRTEIAEERQYLRELNMIIKVFREAFLSDRKLFKPSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 IGLVSLCEDEPSSSGELNYYDLVRTEIAEERQYLRELNMIIKVFREAFLSDRKLFKPSDI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EKIFSNISDIHELTVKLLGLIEDTVEMTDESSPHPLAGSCFEDLAEEQAFDPYETLSQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EKIFSNISDIHELTVKLLGLIEDTVEMTDESSPHPLAGSCFEDLAEEQAFDPYETLSQDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LSPEFHEHFNKLMARPAVALHFQSIADGFKEAVRYVLPRLMLVPVYHCWHYFELLKQLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LSPEFHEHFNKLMARPAVALHFQSIADGFKEAVRYVLPRLMLVPVYHCWHYFELLKQLKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 CSEEQEDRECLNQAITALMNLQGSMDRIYKQYSPRRRPGDPVCPFYSHQLRSKHLAIKKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 CSEEQEDRECLNQAITALMNLQGSMDRIYKQYSPRRRPGDPVCPFYSHQLRSKHLAIKKM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 NEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGPLTRIGAKHERHIFLFDGLMISCKPNHGQTRLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGPLTRIGAKHERHIFLFDGLMISCKPNHGQTRLPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 YSSAEYRLKEKFVMRKIQICDKEDTCEHKHAFELVSKDENSIIFAAKSAEEKNNWMAALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YSSAEYRLKEKFVMRKIQICDKEDTCEHKHAFELVSKDENSIIFAAKSAEEKNNWMAALI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SLHYRSTLDRMLDSVLLKEENEQPLRLPSPEVYRFVVKDSEENIVFEDNLQSRSGIPIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SLHYRSTLDRMLDSVLLKEENEQPLRLPSPEVYRFVVKDSEENIVFEDNLQSRSGIPIIK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 GGTVVKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLLIERFEIPEPEPTDADKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GGTVVKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLLIERFEIPEPEPTDADKLA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 IEKGEQPISADLKRFRKEYVQPVQLRILNVFRHWVEHHFYDFERDLELLERLESFISSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 IEKGEQPISADLKRFRKEYVQPVQLRILNVFRHWVEHHFYDFERDLELLERLESFISSVR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 GKAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANGVSHNITFESPPPPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GKAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANGVSHNITFESPPPPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 EIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 ENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAVNSVSVYRLDHTFEALQERKRKILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 ENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAVNSVSVYRLDHTFEALQERKRKILD
850 860 870 880 890 900
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pF1KB7 EAVELSQDHFKKYLVKLKSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EAVELSQDHFKKYLVKLKSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRR
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pF1KB7 KVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNPMGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNPMGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 QPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNTGRHGSTSGTLRGHPTPLEREPCKISFSRIAETELESTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNTGRHGSTSGTLRGHPTPLEREPCKISFSRIAETELESTV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB7 SAPTSPNTPSTPPVSASSDLSVFLDVDLNSSCGSNSIFAPVLLPHSKSFFSSCGSLHKLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SAPTSPNTPSTPPVSASSDLSVFLDVDLNSSCGSNSIFAPVLLPHSKSFFSSCGSLHKLS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB7 EEPLIPPPLPPRKKFDHDASNSKGNMKSDDDPPAIPPRQPPPPKVKPRVPVPTGAFDGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EEPLIPPPLPPRKKFDHDASNSKGNMKSDDDPPAIPPRQPPPPKVKPRVPVPTGAFDGPL
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 HSPPPPPPRDPLPDTPPPVPLRPPEHFINCPFNLQPPPLGHLHRDSDWLRDISTCPNSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HSPPPPPPRDPLPDTPPPVPLRPPEHFINCPFNLQPPPLGHLHRDSDWLRDISTCPNSPS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB7 TPPSTPSPRVPRRCYVLSSSQNNLAHPPAPPVPPRQNSSPHLPKLPPKTYKRELSHPPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 TPPSTPSPRVPRRCYVLSSSQNNLAHPPAPPVPPRQNSSPHLPKLPPKTYKRELSHPPLY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KB7 RLPLLENAETPQ
::::::::::::
NP_008 RLPLLENAETPQ
1330
>>NP_005624 (OMIM: 135300,182530,610733) son of sevenles (1333 aa)
initn: 4614 init1: 4562 opt: 6229 Z-score: 2475.1 bits: 470.3 E(85289): 4e-131
Smith-Waterman score: 6229; 69.5% identity (85.6% similar) in 1351 aa overlap (1-1330:1-1332)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQQAPQPYEFFSEENSPKWRGLLVSALRKVQEQVHPTLSANEESLYYIEELIFQLLNKLC
:: :::::::::.:::::::: ::.::: :::::: .:...: :.::::.:::: ::
NP_005 MQAQQLPYEFFSEENAPKWRGLLVPALKKVQGQVHPTLESNDDALQYVEELILQLLNMLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MAQPRTVQDVEERVQKTFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRRNPLLLPVDKIHPSLKEVLGY
.::::...::::::::.:::::::::::::::::::::::::: :::.:::: :::::::
NP_005 QAQPRSASDVEERVQKSFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRRNPLSLPVEKIHPLLKEVLGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 KVDYHVSLYIVAVLEYISADILKLAGNYVFNIRHYEISQQDIKVSMCADKVLMDMFDQD-
:.:..::.::::::::::::::::.:::: :::::::..:::::.::::::::::: ::
NP_005 KIDHQVSVYIVAVLEYISADILKLVGNYVRNIRHYEITKQDIKVAMCADKVLMDMFHQDV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 -DIGLVSLCEDEPSSSGELNYYDLVRTEIAEERQYLRELNMIIKVFREAFLSDRKLFKPS
::...:: ..:::.::: .:::::.. .:: :::.::::.::::::: :.:. :::. .
NP_005 EDINILSLTDEEPSTSGEQTYYDLVKAFMAEIRQYIRELNLIIKVFREPFVSNSKLFSAN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DIEKIFSNISDIHELTVKLLGLIEDTVEMTDESSPHPLAGSCFEDLAEEQAFDPYETLSQ
:.:.::: : :::::.::::: ::::::::::.:::::.:::::::::: ::::::. ..
NP_005 DVENIFSRIVDIHELSVKLLGHIEDTVEMTDEGSPHPLVGSCFEDLAEELAFDPYESYAR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 DILSPEFHEHFNKLMARPAVALHFQSIADGFKEAVRYVLPRLMLVPVYHCWHYFELLKQL
::: : ::..: . ...:..::..:::..::::::.::::::.:.::::: :::::::::
NP_005 DILRPGFHDRFLSQLSKPGAALYLQSIGEGFKEAVQYVLPRLLLAPVYHCLHYFELLKQL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 KACSEEQEDRECLNQAITALMNLQGSMDRIYKQYSPRRRPGDPVCPFYSHQLRSKHLAIK
. ::.:::.:::.::::::.:.:..:..: .. .:: .. .: :::.:...:.::::
NP_005 EEKSEDQEDKECLKQAITALLNVQSGMEKICSKSLAKRRLSESACRFYSQQMKGKQLAIK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 KMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGPLTRIGAKHERHIFLFDGLMISCKPNHGQTRL
:::::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::: :: :::: ::
NP_005 KMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGTLTRVGAKHERHIFLFDGLMICCKSNHGQPRL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PGYSSAEYRLKEKFVMRKIQICDKEDTCEHKHAFELVSKDENSIIFAAKSAEEKNNWMAA
:: :.::::::::: :::.:: ::.:: :.:::::.. :::::.::.:::::::::::::
NP_005 PGASNAEYRLKEKFFMRKVQINDKDDTNEYKHAFEIILKDENSVIFSAKSAEEKNNWMAA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 LISLHYRSTLDRMLDSVLLKEENEQPLRLPSPEVYRFVVKDSEENIVFEDNLQSRSGIPI
::::.:::::.:::: ..:.::.:. .:::: .::::. ::::::.::.:.: ..::::
NP_005 LISLQYRSTLERMLDVTMLQEEKEEQMRLPSADVYRFAEPDSEENIIFEENMQPKAGIPI
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 IKGGTVVKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLLIERFEIPEPEPTDADK
::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::.
NP_005 IKAGTVIKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLIIERFEIPEPEPTEADR
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XP_011 --PGTMR-HPTPLQQEPRKISYSRIPESETESTASAPNSPRTPLTPPPASGASSTTDVCS
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.: : .: : ...: : :::. .: : :: : ..: .:::.:::.. .
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..: :: : :.::::::::: .:: . : : :: : : :
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: :.: :. : . :..::::::: . :: . . ::::: ::.::::. :
XP_011 PREPVRTPDVFSSSPLHLQPPPLG---KKSD--HGNAFFPNSPSPFTPPPPQTPSPHGTR
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: .. : ... .: .:::::::..: :.::::::::::: .:: ..: :::::
XP_011 R-HLPSPPLTQEVDLHSIAGPPVPPRQSTSQHIPKLPPKTYKREHTHPSMHRDGPPLLEN
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1330
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XP_011 AHSS
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::...:: ..:::.::: .:::::.. .:: :::.::::.::::::: :.:. :::. .
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. ::.:::.:::.::::::.:.:..:..: .. .:: .. .: :::.:...:.::::
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:: :.::::::::: :::.:: ::.:: :.:::::.. :::::.::.:::::::::::::
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pF1KB7 VRGKAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANGVSHNITFESPPPPIEWHISKPGQFETFDLMTLH
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: : :: : : :: :.: :. : . :..::::::: . :: .
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pF1KB7 DRIYKQYSPRRRPGDPVCPFYSHQLRSKHLAIKKMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIME
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XP_011 EKICSKSLAKRRLSESACRFYSQQMKGKQLAIKKMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIME
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pF1KB7 RLPSPEVYRFVVKDSEENIVFEDNLQSRSGIPIIKGGTVVKLIERLTYHMYADPNFVRTF
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XP_011 RLPSADVYRFAEPDSEENIIFEENMQPKAGIPIIKAGTVIKLIERLTYHMYADPNFVRTF
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::::::::::::::::.::::::::::::.::..:::.:.::.::.::::::::.:::::
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pF1KB7 RILNVFRHWVEHHFYDFERDLELLERLESFISSVRGKAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANG
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XP_011 RVLNVCRHWVEHHFYDFERDAYLLQRMEEFIGTVRGKAMKKWVESITKIIQRKKIARDNG
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pF1KB7 VSHNITFESPPPPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGS
.:::::.: :: .:::::.::..:::::.:::::::::::::::::::: :::::::::
XP_011 PGHNITFQSSPPTVEWHISRPGHIETFDLLTLHPIEIARQLTLLESDLYRAVQPSELVGS
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pF1KB7 VWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::::::::::.:::
XP_011 VWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVETENLEERVAVVSRIIEILQVFQELNN
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pF1KB7 FNGVLEIVSAVNSVSVYRLDHTFEALQERKRKILDEAVELSQDHFKKYLVKLKSINPPCV
::::::.:::.:: ::::::::: . :..:::.:: :::.::.::::.::.:::::::
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::::::::::::::::: . ::..::.::::::::::::::::::::::::::::.: :.
XP_011 PFFGIYLTNILKTEEGNPEVLKRHGKELINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRVESDI
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pF1KB7 RRFFENLNPMGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCKQPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNTGRH
.::::::::::.. ::::::::::::::::::: : ::::.: .. :::::.::.. :
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XP_011 ---PGTMR-HPTPLQQEPRKISYSRIPESETESTASAPNSPRTPLTPPPASGASSTTDVC
700 710 720 730 740
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pF1KB7 VFLDVDLNSSCGS--NSIFAPVLLPHS-KSFFSSCGSLHKLSEEPLIPPPLPPRKKFDH-
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XP_011 SVFDSDHSSPFHSSNDTVFIQVTLPHGPRSASVSSISLTKGTDEVPVPPPVPPRRRPESA
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pF1KB7 --DASNSKGNMKSDDDPPAIPPRQPPPPKVKPRVPVPTGAFDGPLHSPPPPPPRDPLPDT
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XP_011 PAESSPSKIMSKHLDSPPAIPPRQPTSKAYSPRYSIS----DRTSISDPPESP----PLL
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pF1KB7 PPPVPLRPPEHFINCPFNLQPPPLGHLHRDSDWLRDISTCPNSPST----PPSTPSPRVP
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XP_011 PPREPVRTPDVFSSSPLHLQPPPLG---KKSD--HGNAFFPNSPSPFTPPPPQTPSPHGT
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pF1KB7 RRCYVLS---SSQNNLAHPPAPPVPPRQNSSPHLPKLPPKTYKRELSHPPLYRL--PLLE
:: .. : ... .: .:::::::..: :.::::::::::: .:: ..: ::::
XP_011 RR-HLPSPPLTQEVDLHSIAGPPVPPRQSTSQHIPKLPPKTYKREHTHPSMHRDGPPLLE
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1330
pF1KB7 NAETPQ
::..
XP_011 NAHSS
>>NP_722522 (OMIM: 606600) ras-specific guanine nucleoti (489 aa)
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pF1KB7 LLIERFEIPEPEPTDADKLAIEKGEQPISADLKRFRKEYV--QPVQLRILNVFRHWVEHH
: . ::.: . . :.:::.:::: .:
NP_722 FAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKH
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pF1KB7 FYDFERDLELLERLESFISSVRG--KAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANGVSHNITFESPP
::: . :: .. .:. : . . . .. :.::: : . . ...::.:
NP_722 SQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPG--DNQITLEEIT
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pF1KB7 PPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINS
: ..: ::. . . :::.:::::. ...:. :. :. : : .:. .
NP_722 QMAEGVKAEP--FENHSAL-----EIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERT
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pF1KB7 PNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAV
: ..: .: .... . . :.. :... ::... . . . .. . :.:.:.::::.:..
NP_722 PYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSM
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pF1KB7 NSVSVYRLDHTFEALQERKRKILDEAVEL--SQDHFKKYLVKLKSINPPCVPFFGIYLTN
: ...:: .:. .... . ..:. .: :. .::. ::. .:::::..:.:::.
NP_722 NRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTD
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 ILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNP
. :::. .. . :.:::: : ...: ::.:.:. : .. . . ... :.
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pF1KB7 MGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCKQPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNTGRHGSTSGTLRG
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NP_722 SFVMDEES----LYESSLRIEPKLPT
470 480
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650 660 670 680 690
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: . ::.: . . :.:::.:::: .:
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>>XP_016877945 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specific gu (1260 aa)
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Smith-Waterman score: 523; 29.5% identity (63.2% similar) in 353 aa overlap (671-1017:923-1257)
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XP_016 SFVMDEES----LYESSLRIEPKLPT
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>>XP_016877944 (OMIM: 606600) PREDICTED: ras-specific gu (1270 aa)
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XP_016 SQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPG--DNQITLEEIT
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pF1KB7 PPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINS
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pF1KB7 PNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAV
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
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XP_016 NRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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1200 1210 1220 1230 1240
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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XP_016 SFVMDEES----LYESSLRIEPKLPT
1250 1260 1270
1332 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:33:22 2016 done: Fri Nov 4 06:33:25 2016
Total Scan time: 19.700 Total Display time: 0.480
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]