Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7268
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7268, 548 aa
1>>>pF1KB7268 548 - 548 aa - 548 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6866+/-0.00212; mu= 13.3744+/- 0.126
mean_var=255.3338+/-48.549, 0's: 0 Z-trim(103.7): 997 B-trim: 36 in 1/48
Lambda= 0.080264
statistics sampled from 6436 (7520) to 6436 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 3644 436.6 3.3e-122
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1978 243.7 3.8e-64
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1963 242.0 1.3e-63
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 1859 230.0 5.7e-60
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 1791 221.9 1.2e-57
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 1779 220.5 3.1e-57
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 1755 218.0 2.6e-56
CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1681 209.3 9.1e-54
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1602 200.4 5.9e-51
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1597 199.7 8e-51
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1552 194.4 2.9e-49
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1536 192.7 1.2e-48
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1484 186.5 6.4e-47
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1472 185.1 1.8e-46
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 1462 183.9 3.6e-46
CCDS55113.1 ZNF727 gene_id:442319|Hs108|chr7 ( 499) 1459 183.6 4.8e-46
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1458 183.5 5.4e-46
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1452 182.8 8.4e-46
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1439 181.4 2.7e-45
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1439 181.5 2.8e-45
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1439 181.5 2.8e-45
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1439 181.5 2.8e-45
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 1437 181.2 3.1e-45
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1438 181.7 3.9e-45
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1438 181.7 3.9e-45
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1427 180.0 6.8e-45
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CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1423 179.5 9.1e-45
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1422 179.6 1.2e-44
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1410 177.9 2.4e-44
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1407 177.7 3.5e-44
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1407 177.7 3.5e-44
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1404 177.2 3.8e-44
CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 ( 665) 1405 177.5 4.3e-44
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1397 176.6 8.2e-44
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1391 175.8 1.2e-43
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 1387 175.2 1.5e-43
CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 494) 1386 175.1 1.7e-43
CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 627) 1386 175.3 1.9e-43
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1387 175.5 1.9e-43
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1383 174.8 2.1e-43
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1383 175.0 2.6e-43
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1377 174.1 3.4e-43
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1377 174.2 3.7e-43
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1377 174.2 3.7e-43
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1377 174.2 3.8e-43
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1377 174.2 3.9e-43
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1376 174.2 4.3e-43
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1376 174.2 4.3e-43
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 1375 174.0 4.5e-43
>>CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 (517 aa)
initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644 Z-score: 2307.4 bits: 436.6 E(32554): 3.3e-122
Smith-Waterman score: 3644; 99.6% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (32-548:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
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370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
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pF1KB7 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS33 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTEKKP
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pF1KB7 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHNRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
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pF1KB7 NGESPLA
:::::::
CCDS33 NGESPLA
>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa)
initn: 6852 init1: 1579 opt: 1978 Z-score: 1265.1 bits: 243.7 E(32554): 3.8e-64
Smith-Waterman score: 1978; 60.3% identity (80.2% similar) in 474 aa overlap (32-505:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
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CCDS12 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDL
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
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CCDS12 YRDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVISLLEQGKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSL
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
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CCDS12 KKEVYEIELCQREIM-GLTKHGLEYSSFGDVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMP
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
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CCDS12 TFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSC
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pF1KB7 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
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CCDS12 GSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNL
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310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
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CCDS12 IDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQ
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pF1KB7 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
.:::.: ::::::::::..::.: :::::::::::.:: ::::: ::::.::::::.
CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHA
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pF1KB7 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKP
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CCDS12 GEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKP
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pF1KB7 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
:. ::: :..: : .. : .:.
CCDS12 YNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK
450 460 470
>>CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 (499 aa)
initn: 1459 init1: 1459 opt: 1963 Z-score: 1255.5 bits: 242.0 E(32554): 1.3e-63
Smith-Waterman score: 1963; 58.8% identity (79.1% similar) in 473 aa overlap (32-504:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
:. : :::::: :: :::. : ::::::
CCDS12 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDL
10 20 30
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pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
::.: ::....:.::::..:::::.:.:::::::::. :.: :: :::: : :
CCDS12 YREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWMIANDVTGPWCPDLESRC---EKFL
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pF1KB7 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
.. ..:. . .::::::: :: :.:. ::::..::.:: : . .:.:. . . .::
CCDS12 QKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRADWECEGQFERQV-NEECYFKQVNVTYGHMP
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
.:..:.: : :. .: :: . ..: : : . ::.:: :.:.:::. ::::::::.
CCDS12 VFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSR
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
.:.:.::. ::.:.:::.::.:::::. :..: :::.::: ::::::.: :.: . :::
CCDS12 ASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
: ::::::::::: ::.::::: : :.: :: ::::: .:: ::::::.: ..::: ::
CCDS12 ILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQ
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
.:::.: ::::::::.: ..: . ::::::.:::::::: :::::: .:: .:::.::
CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHT
330 340 350 360 370 380
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pF1KB7 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKP
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CCDS12 GDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKP
390 400 410 420 430 440
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pF1KB7 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
:: .:: .. ..: .. ::.:
CCDS12 YECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
450 460 470 480 490
>>CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 (533 aa)
initn: 4200 init1: 1570 opt: 1859 Z-score: 1190.2 bits: 230.0 E(32554): 5.7e-60
Smith-Waterman score: 1861; 52.9% identity (73.1% similar) in 516 aa overlap (32-546:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
:. :: :::::: ::::::..: ::::::
CCDS33 MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDL
10 20 30
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pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFL-EQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELF
::::: :.:::..::: ..::::::..: :. ::: :: : . :: ::::: :. :
CCDS33 YRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDEERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PKQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEM
:.. .::. : ::.::: . ::.:. : :..::::..... .. . . .: :. : :.:
CCDS33 PEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFRNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKM
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 PTFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFK
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: ::::.: : ..:. :.: : :: ::.::::.:::::: ::: .:: ::: .:
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.::.:
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CCDS46 TSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
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CCDS12 KPYECKECGKAFTRGSHLTQHQRIHTGEKSHECKECGKAFIRGSNLAQHQNVHVGRKPYK
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CCDS12 CEKCGKAYIWSSHLARHQRIHTGRKPYECKQCGKTFTWASYLAQHEKIHNERKSYECKEC
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CCDS12 GKTFLHGSEFNRHQKIHTGERNYECKECGKTFFRGSELNRHQKIHTGKRPYECEECGKAF
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>--
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CCDS12 KSSHIFSHHSYFTE-QKIHNSANLCEWTDYGNTFSHESNFAQHQNIYTFEKSYEFKDFEK
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pF1KB7 AFRVSSQLKQHQRIHTGEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSH
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CCDS12 AFSSSSHFISLL
630
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CCDS12 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDL
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CCDS12 YRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQGKEPW---KVVRKGRRQYPDLETKYETKKL
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CCDS12 SLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKNDWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEK
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CCDS12 VSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAF
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. ..: .:. .:::.: :::::::.:: :... ::..: ::::::::.: ::: .
CCDS12 RQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRG
210 220 230 240 250 260
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:: ::: ::::::: :::::::: . .:: .:
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:...::::::: ::::::.: :.:: :: .:::.: ::::::::.:..: :: :.::
CCDS12 HHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRI
330 340 350 360 370 380
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:::::::::: : ::: ::: .:: :: : :::.:: ::.::. .:.:: : :: ::
CCDS12 HTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGE
390 400 410 420 430 440
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CCDS12 KPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYE
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pF1KB7 IINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGSNGESPLA
CCDS12 CKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVML
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CCDS12 ENYSNLVSLDL----------------P----------------SRCASKDLSPEKNTYE
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CCDS12 TELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQENQKEYFRQGMIIYDKMSIFNQHT
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CCDS12 YLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSL
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CCDS12 HQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKV
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CCDS12 HTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGE
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:. ::.:: : :.:: : ::::.::::::::::: ::: ::: .:: ::: .:::. :::
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:.... : .. ::.:. :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]