Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7223
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7223, 505 aa
1>>>pF1KB7223 505 - 505 aa - 505 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3965+/-0.00102; mu= 17.3731+/- 0.061
mean_var=71.2733+/-13.902, 0's: 0 Z-trim(104.3): 29 B-trim: 39 in 1/48
Lambda= 0.151919
statistics sampled from 7829 (7849) to 7829 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 ( 505) 3416 758.4 4.2e-219
CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 512) 791 183.0 6.7e-46
CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 562) 753 174.7 2.3e-43
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CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 563) 613 144.1 4e-34
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CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 440 106.1 1e-22
CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 440 106.1 1e-22
CCDS10609.1 SCNN1B gene_id:6338|Hs108|chr16 ( 640) 304 76.4 1.1e-13
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CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 692) 299 75.3 2.5e-13
CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 728) 299 75.3 2.6e-13
CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16 ( 649) 287 72.6 1.4e-12
CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 ( 647) 269 68.7 2.2e-11
>>CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 (505 aa)
initn: 3416 init1: 3416 opt: 3416 Z-score: 4047.0 bits: 758.4 E(32554): 4.2e-219
Smith-Waterman score: 3416; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEQTEKSKVYAENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGIHNIVQNRSKI
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CCDS37 MEQTEKSKVYAENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGIHNIVQNRSKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RRVLWLVVVLGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RRVLWLVVVLGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AVAKFGVIFFLWHIVSKVLHLQEITANSTGSREATDFAASHQNFSIVEFIRNKGFYLNNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AVAKFGVIFFLWHIVSKVLHLQEITANSTGSREATDFAASHQNFSIVEFIRNKGFYLNNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TLLDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGETLQAKRKVSVSGRGLSLLFNVNQEAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TLLDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGETLQAKRKVSVSGRGLSLLFNVNQEAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TDNPALGFVDAGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEYPWGECNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TDNPALGFVDAGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEYPWGECNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVSPVLDHIEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVSPVLDHIEF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRENLVKIEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRENLVKIEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 NYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFYWICIFFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFYWICIFFLL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB7 KISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
:::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
490 500
>>CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (512 aa)
initn: 639 init1: 264 opt: 791 Z-score: 937.6 bits: 183.0 E(32554): 6.7e-46
Smith-Waterman score: 791; 32.1% identity (63.9% similar) in 446 aa overlap (41-468:20-455)
20 30 40 50 60
pF1KB7 AENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGI-HNIVQNRSKIRRVLWLVVV
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CCDS42 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLN-----RFQTDAVAK
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CCDS42 VGSLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FGVIFFLWHIVSKVL--HLQEITANSTGSREATDFAASH-QNFSIVEFIRNKGFYLNNST
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CCDS42 AGELLALLDVNLQIPDPHLADPSV-LEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKD-M
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 LLDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGET---LQAKRKVSVSGRGLSLLFNVNQE
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CCDS42 MLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGG-TGNGLEIMLDIQQD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AFTDNPALGFVD-----AGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEY
. : : .. ::. ::: .. : .. ::. :... :. .. . ..
CCDS42 EYL--PIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PWGEC-NPNIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVS
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CCDS42 PWGECRSSEMGLDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 PVLDHIEFKDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIR
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CCDS42 PALGLLAEKD-----SNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYIS
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 ENLVKIEINYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFY
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CCDS42 ENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIK
400 410 420 430 440 450
480 490 500
pF1KB7 WICIFFLLKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
CCDS42 EKLLDLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
460 470 480 490 500 510
>>CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (562 aa)
initn: 683 init1: 250 opt: 753 Z-score: 892.0 bits: 174.7 E(32554): 2.3e-43
Smith-Waterman score: 753; 30.3% identity (62.4% similar) in 439 aa overlap (41-468:67-492)
20 30 40 50 60
pF1KB7 AENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGIHNI-VQNRSKIRRVLWLVVV
:: : ..:: ..: :.. :.::: :.
CCDS58 SESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAF
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTDAVAKFGVIF
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CCDS58 VLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLY
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLWHIVSKVLHLQEITANSTGSREATDFAASHQNFSIVEFIRNKGFYLNNSTLLDCEFFG
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CCDS58 L-----APMLGLDESDDPGVPLAPPGPEAFSGEPFNLHRFY-NRSCHRLEDMLLYCSYQG
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGETLQAKRKV--SVSGRGLSLLFNVNQEAFTDNPALG
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CCDS58 GPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYL--PVWG
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FVD-----AGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEYPWGECNP--
.: ::: ::: . : .: ::. :... :. .. . .. ::: :.
CCDS58 ETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVT
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KB7 -NIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVSPVLDHIE
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CCDS58 MDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLV
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FKDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRENLVKIE
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CCDS58 EKD-----QEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLD
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 INYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFYWICIFFL
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CCDS58 IFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRG
450 460 470 480 490 500
480 490 500
pF1KB7 LKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
CCDS58 KCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
510 520 530 540 550 560
>>CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (528 aa)
initn: 723 init1: 250 opt: 643 Z-score: 762.1 bits: 150.6 E(32554): 4e-36
Smith-Waterman score: 781; 30.6% identity (63.3% similar) in 447 aa overlap (41-468:21-458)
20 30 40 50 60
pF1KB7 AENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGI-HNIVQNRSKIRRVLWLVVV
:: :...::. : . .: ...:.:: .
CCDS44 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCF
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTDAVAKFGVIF
:::.... :. :: . .:... . .. :::::.::::.:. . :.: . ..
CCDS44 LGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSK-NDLY
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLWHIVSKVLHLQEITANSTGSREATDFAASHQNF--------SIVEFIRNKGFYLNNST
.... . . :: .. .... .. .. :: .. :: : . .
CCDS44 HAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRD-M
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 LLDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGETLQAKRKV--SVSGRGLSLLFNVNQEA
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CCDS44 LLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FTDNPALGFVD-----AGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEYP
. :. : .: ::: ::: . : .: ::. :... :. .. . .. :
CCDS44 YL--PVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 WGECNP---NIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCV
:: :. . :. :.::: ..: .:..... ..:.: .:: . : ..: :.
CCDS44 WGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SPVLDHIEFKDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYI
.:.:: . :: . : . :. .: .:. ..::. . :::.::.:.:..::
CCDS44 DPALDFLVEKD-----QEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYI
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 RENLVKIEINYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNF
::.. ..: . :::. .:.:: .. ::.:.:::.::: :::..:..:...: .
CCDS44 GENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVI
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KB7 YWICIFFLLKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
CCDS44 KHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARG
470 480 490 500 510 520
>>CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (563 aa)
initn: 611 init1: 264 opt: 613 Z-score: 726.1 bits: 144.1 E(32554): 4e-34
Smith-Waterman score: 714; 30.0% identity (61.0% similar) in 454 aa overlap (47-468:66-506)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 EKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGIHNIVQNRSKI-----RRVLWLVVVLG
.::.... .:. ::.::...
CCDS11 GQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSLSRAKLHGLRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCT
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 SVSLV-TWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTDAVAKFGVIFF
: .:. .:. ::: ....:. : .. .. ... ::::: :: : .. ..: : ...
CCDS11 SFGLLLSWSSN-RLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFPAVTVCNNNPLRFPRLSK-GDLYY
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170
pF1KB7 LWH-------------IVSKVLHLQEITANSTGSREATDF----AASHQNFSIVEFIRNK
: .::..:. .: :. .:: : . . :.
CCDS11 AGHWLGLLLPNRTARPLVSELLRGDE--PRRQWFRKLADFRLFLPPRHFEGISAAFMDRL
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GFYLNNSTLLDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGET---LQAKRKVSVSGRGLS
: :.. ::.:.. :. :.:..:. :::.::.:. :: :: : . : . .: ::
CCDS11 GHQLED-MLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGG-TGNGLE
220 230 240 250 260
240 250 260 270 280
pF1KB7 LLFNVNQEAFTDNPALGFVD-----AGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQ
......:. . : : .. ::. ::: .. : .. ::. :... :. ..
CCDS11 IMLDIQQDEYL--PIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQE
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 VKTVHQEYPWGEC-NPNIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDL
. .. ::::: . .. :. : :: ..: .:....: ..:.: .:: . :
CCDS11 QRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTP
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 QKYFSCVSPVLDHIEFKDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKL
... :. :.: . :: .. : . :. .: .:. ..::. . ::: ::.
CCDS11 EQHKECAEPALGLLAEKD-----SNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKF
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 NQSRKYIRENLVKIEINYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEII
:.:.::: ::.. ..: . :::. .:.:: :. ::.:.:::.::: :::..::.:..
CCDS11 NKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELF
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500
pF1KB7 EYLFTNFYWICIFFLLKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
.:..
CCDS11 DYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIA
510 520 530 540 550 560
>>CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (574 aa)
initn: 706 init1: 149 opt: 542 Z-score: 641.9 bits: 128.5 E(32554): 2e-29
Smith-Waterman score: 680; 29.5% identity (61.8% similar) in 424 aa overlap (41-445:21-435)
20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]