Result of FASTA (omim) for
pF1KB7198
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7198, 463 aa
1>>>pF1KB7198 463 - 463 aa - 463 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6724+/-0.000368; mu= 21.6951+/- 0.023
mean_var=77.3058+/-16.043, 0's: 0 Z-trim(114.9): 247 B-trim: 2653 in 2/48
Lambda= 0.145871
statistics sampled from 24694 (24970) to 24694 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 8.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002053 (OMIM: 138032) glucagon-like peptide 1 r ( 463) 3190 681.0 1.8e-195
XP_016866239 (OMIM: 138032) PREDICTED: glucagon-li ( 468) 3039 649.3 6.6e-186
XP_016866240 (OMIM: 138032) PREDICTED: glucagon-li ( 287) 1767 381.4 1.8e-105
NP_000151 (OMIM: 125853,138033) glucagon receptor ( 477) 1425 309.6 1.2e-83
XP_006722340 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: gluc ( 477) 1425 309.6 1.2e-83
XP_016879935 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: gluc ( 475) 1420 308.6 2.4e-83
NP_004237 (OMIM: 603659) glucagon-like peptide 2 r ( 553) 1281 279.4 1.7e-74
XP_016880828 (OMIM: 603659) PREDICTED: glucagon-li ( 559) 1271 277.3 7.5e-74
XP_011521841 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: gluc ( 444) 1162 254.2 5.2e-67
XP_016879936 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: gluc ( 355) 1071 235.0 2.6e-61
XP_011522379 (OMIM: 603659) PREDICTED: glucagon-li ( 578) 1051 231.0 6.6e-60
NP_000155 (OMIM: 137241) gastric inhibitory polype ( 466) 1012 222.7 1.7e-57
NP_001295347 (OMIM: 137241) gastric inhibitory pol ( 430) 1003 220.8 6e-57
XP_016880829 (OMIM: 603659) PREDICTED: glucagon-li ( 483) 951 209.9 1.3e-53
XP_005256918 (OMIM: 603659) PREDICTED: glucagon-li ( 400) 950 209.6 1.3e-53
XP_016880830 (OMIM: 603659) PREDICTED: glucagon-li ( 448) 950 209.6 1.4e-53
XP_016868069 (OMIM: 601970) PREDICTED: vasoactive ( 300) 746 166.5 8.9e-41
NP_003373 (OMIM: 601970) vasoactive intestinal pol ( 438) 732 163.7 8.9e-40
XP_006716170 (OMIM: 601970) PREDICTED: vasoactive ( 455) 732 163.8 9.1e-40
XP_005249618 (OMIM: 601970) PREDICTED: vasoactive ( 463) 732 163.8 9.2e-40
NP_002971 (OMIM: 182098) secretin receptor precurs ( 440) 705 158.1 4.6e-38
XP_016860159 (OMIM: 182098) PREDICTED: secretin re ( 435) 693 155.5 2.6e-37
XP_011509923 (OMIM: 182098) PREDICTED: secretin re ( 445) 693 155.5 2.7e-37
XP_016860161 (OMIM: 182098) PREDICTED: secretin re ( 377) 686 154.0 6.6e-37
XP_006716171 (OMIM: 601970) PREDICTED: vasoactive ( 392) 677 152.1 2.5e-36
NP_001238813 (OMIM: 192321) vasoactive intestinal ( 409) 671 150.9 6.2e-36
XP_005265496 (OMIM: 192321) PREDICTED: vasoactive ( 410) 671 150.9 6.2e-36
NP_001295188 (OMIM: 601970) vasoactive intestinal ( 422) 671 150.9 6.3e-36
XP_011514852 (OMIM: 601970) PREDICTED: vasoactive ( 439) 671 150.9 6.5e-36
XP_005263787 (OMIM: 182098) PREDICTED: secretin re ( 262) 666 149.6 9.5e-36
XP_016860160 (OMIM: 182098) PREDICTED: secretin re ( 409) 664 149.4 1.7e-35
NP_001238811 (OMIM: 192321) vasoactive intestinal ( 416) 661 148.8 2.7e-35
XP_005265495 (OMIM: 192321) PREDICTED: vasoactive ( 416) 661 148.8 2.7e-35
XP_011532381 (OMIM: 192321) PREDICTED: vasoactive ( 416) 661 148.8 2.7e-35
NP_001238814 (OMIM: 192321) vasoactive intestinal ( 430) 661 148.8 2.8e-35
XP_005265494 (OMIM: 192321) PREDICTED: vasoactive ( 456) 661 148.8 2.9e-35
NP_004615 (OMIM: 192321) vasoactive intestinal pol ( 457) 661 148.8 2.9e-35
XP_016860162 (OMIM: 182098) PREDICTED: secretin re ( 267) 654 147.1 5.5e-35
NP_001158209 (OMIM: 114131,166710) calcitonin rece ( 508) 636 143.6 1.2e-33
NP_001109 (OMIM: 102981) pituitary adenylate cycla ( 468) 635 143.4 1.3e-33
NP_001186566 (OMIM: 102981) pituitary adenylate cy ( 447) 611 138.3 4.2e-32
XP_005249675 (OMIM: 102981) PREDICTED: pituitary a ( 411) 600 135.9 2e-31
NP_001291451 (OMIM: 601970) vasoactive intestinal ( 358) 568 129.1 1.9e-29
XP_005265401 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60 ( 562) 557 127.0 1.3e-28
XP_016862422 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60 ( 593) 557 127.0 1.3e-28
NP_000307 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60000 ( 593) 557 127.0 1.3e-28
NP_001171673 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60 ( 593) 557 127.0 1.3e-28
XP_011532270 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60 ( 600) 557 127.1 1.3e-28
XP_011532269 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60 ( 606) 557 127.1 1.4e-28
XP_016862421 (OMIM: 125350,156400,168468,215045,60 ( 606) 557 127.1 1.4e-28
>>NP_002053 (OMIM: 138032) glucagon-like peptide 1 recep (463 aa)
initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190 Z-score: 3630.4 bits: 681.0 E(85289): 1.8e-195
Smith-Waterman score: 3190; 100.0% identity (100.0% similar) in 463 aa overlap (1-463:1-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 RLEHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RLEHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
430 440 450 460
>>XP_016866239 (OMIM: 138032) PREDICTED: glucagon-like p (468 aa)
initn: 3039 init1: 3039 opt: 3039 Z-score: 3458.6 bits: 649.3 E(85289): 6.6e-186
Smith-Waterman score: 3039; 99.8% identity (99.8% similar) in 441 aa overlap (23-463:28-468)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPP
: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEIEKPSVLGGEGAGEGLAEPTGLPYMPSPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLT
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB7 SWERWRLEHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SWERWRLEHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
430 440 450 460
>>XP_016866240 (OMIM: 138032) PREDICTED: glucagon-like p (287 aa)
initn: 1767 init1: 1767 opt: 1767 Z-score: 2014.5 bits: 381.4 E(85289): 1.8e-105
Smith-Waterman score: 1767; 99.6% identity (99.6% similar) in 252 aa overlap (23-274:28-279)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPP
: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEIEKPSVLGGEGAGEGLAEPTGLPYMPSPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWAAGPGTPT
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLT
>>NP_000151 (OMIM: 125853,138033) glucagon receptor prec (477 aa)
initn: 1373 init1: 861 opt: 1425 Z-score: 1622.9 bits: 309.6 E(85289): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 1425; 47.5% identity (73.7% similar) in 463 aa overlap (7-456:9-461)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETV-QKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
:: : ::::. .:: .... . . .::. : ::...:. :::
NP_000 MPPCQPQRPLLLLLLLLAC------QPQVPSAQVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPP-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
:.: ::::::.:.:::: .. .:.:::::::: .: . :.. : .: :. . .
NP_000 TELVCNRTFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWV-RGPRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLY----IIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLH
:::: :.:. . ::. .... .: ..:::::.::..::..: ::: :. .::
NP_000 QPWRDASQCQMD--GEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CTRNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTA-AQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLL
:::: :: ::::::.:.: ::.. :. :. :: ... . . :: .::.. ..
NP_000 CTRNAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MQYCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYE
::: ..::: ::::::.::..::....: :. .: ::..::::.:.::::::..:: :.:
NP_000 MQYGIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 DEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKS
. ::: :.::..: :.:.:...:: .::.::::.. ..:.::.: : .:: : :::::
NP_000 NVQCWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKS
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 TLTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLE
:::::::::.:::.:::: ::::.:::: ::: .: ..:::::.::.::::.:.::: :
NP_000 TLTLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSE
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pF1KB7 FRKSWERWRL-------EHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
.:. :.:::: .. .: :: :.. :. : .::. .:
NP_000 LRRRWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLP
420 430 440 450 460 470
NP_000 RLAESPF
>>XP_006722340 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: glucagon (477 aa)
initn: 1373 init1: 861 opt: 1425 Z-score: 1622.9 bits: 309.6 E(85289): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 1425; 47.5% identity (73.7% similar) in 463 aa overlap (7-456:9-461)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETV-QKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
:: : ::::. .:: .... . . .::. : ::...:. :::
XP_006 MPPCQPQRPLLLLLLLLAC------QPQVPSAQVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPP-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
:.: ::::::.:.:::: .. .:.:::::::: .: . :.. : .: :. . .
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60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLY----IIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLH
:::: :.:. . ::. .... .: ..:::::.::..::..: ::: :. .::
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120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
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:::: :: ::::::.:.: ::.. :. :. :: ... . . :: .::.. ..
XP_006 CTRNAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVF
180 190 200 210 220 230
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::: ..::: ::::::.::..::....: :. .: ::..::::.:.::::::..:: :.:
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. ::: :.::..: :.:.:...:: .::.::::.. ..:.::.: : .:: : :::::
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:::::::::.:::.:::: ::::.:::: ::: .: ..:::::.::.::::.:.::: :
XP_006 TLTLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSE
360 370 380 390 400 410
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420 430 440 450 460 470
XP_006 RLAESPF
>>XP_016879935 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: glucagon (475 aa)
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Smith-Waterman score: 1420; 47.8% identity (72.9% similar) in 462 aa overlap (7-456:6-459)
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: : :::: ... : : :.: ::. : ::...:. ::: :.:
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::::::.:.:::: .. .:.:::::::: .: . :.. : .: :. . . ::
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:: :.:. . ::. .... .: ..:::::.::..::..: ::: :. .:::::
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: :: ::::::.:.: ::.. :. :. :: ... . . :: .::.. ..:::
XP_016 NAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQY
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..::: ::::::.::..::....: :. .: ::..::::.:.::::::..:: :.:.
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::: :.::..: :.:.:...:: .::.::::.. ..:.::.: : .:: : ::::::::
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::::::.:::.:::: ::::.:::: ::: .: ..:::::.::.::::.:.::: :.:.
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pF1KB7 SWERWRL-------EHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
:.:::: .. .: :: :.. :. : .::. .:
XP_016 RWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLPRLA
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XP_016 ESPF
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10 20 30
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::: :.:.:: . .. :. :
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::..:: .:.. : :.: ..: . .::: :::.:.::: . ::. :.: :: :::: :
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.:..:: : :.: : .:.. :.: ::: :.. ... . :: : ..:::::
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..:. .: .: ..:: .:.:::::::::.:::::::::.:.:..::... :: . .
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. : . :: . : ::: : .:..: :.::: ::::::.::.::: .:: :. .. :.
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 IGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIV
.::. :.:::::::... :. :::: :.: . : ::: :... . :::.::.... ..
NP_004 LGWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLKILKLL
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340 350 360 370 380 390
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.:::::. :: : : :::::::.::::::.::..:.:. :....: ..:.:: .:...
NP_004 ISKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLS
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::.:..::. : :.:.::. :.:: : :. : . : . : . ::: ..:: :
NP_004 SFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKDFRFLGKCP-KKLSEG
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450 460
pF1KB7 ATAGSSMYTATCQASCS
:
NP_004 DGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTMANTM
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>>XP_016880828 (OMIM: 603659) PREDICTED: glucagon-like p (559 aa)
initn: 1231 init1: 921 opt: 1271 Z-score: 1446.9 bits: 277.3 E(85289): 7.5e-74
Smith-Waterman score: 1271; 44.7% identity (71.5% similar) in 459 aa overlap (4-449:47-493)
10 20 30
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLW
::: :.:.:: . .. :. :
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pF1KB7 ETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWAS
::..:: .:.. : :.: ..: . .::: :::.:.::: . ::. :.: :: :::: :
XP_016 ETTRKWAQYKQACLRDLLKEP---SGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGN-VSVPCPSYLPWWS
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pF1KB7 ------SVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLL-FLYI
: .:..:: : :.: : .:.. :.: ::: :.. ... . :: : .
XP_016 EELCLLSESSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECSENHSFKQNVDRYALLSTLQL
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 IYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYS
.:::::..:. .: .: ..:: .:.:::::::::.:::::::::.:.:..::... ::
XP_016 MYTVGYSFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 TAAQ-QHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWI
. .. : . :: . : ::: : .:..: :.::: ::::::.::.::: .:: :. .
XP_016 KRPDNENGWMSYLS-EMSTSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRL
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270 280 290 300 310 320
pF1KB7 FRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFV
. :. .::. :.:::::::... :. :::: :.: . : ::: :... . :::.::.
XP_016 WPRYLLLGWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFL
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330 340 350 360 370 380
pF1KB7 RVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLF
... ...:::::. :: : : :::::::.::::::.::..:.:. :....: ..:.::
XP_016 KILKLLISKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLF
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390 400 410 420 430 440
pF1KB7 TELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERWRLEHLHIQRDSSM-KPL----KCPT
.:...::.:..::. : :.:.::. :.:: : :. : . : . : . :::
XP_016 IQLTLSSFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKDFRFLGKCP-
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pF1KB7 SSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
..:: : :
XP_016 KKLSEGDGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDV
490 500 510 520 530 540
>>XP_011521841 (OMIM: 125853,138033) PREDICTED: glucagon (444 aa)
initn: 1123 init1: 861 opt: 1162 Z-score: 1324.1 bits: 254.2 E(85289): 5.2e-67
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pF1KB7 GPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDLFCNRTFDEY--ACWPDGEPGS
::: . :. . .. : ::..
XP_011 MGRFLGAYAAFEDPAKGP---CHSSGPHHRGQSWCATEPST
10 20 30
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pF1KB7 FVNVS-CPWYLPWASS-VPQGH--VYRFCTAEGLWLQKDNSSLPWRDLSECEESKRGERS
. .. : .: .: .: : :.. : .: :. . . :::: :.:. . ::.
XP_011 SIPAGRTPPPIPRPTSPAPVQHRFVFKRCGPDGQWV-RGPRGQPWRDASQCQMD--GEEI
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 SPEEQLLFLY----IIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIHLNLFASFILRA
.... .: ..:::::.::..::..: ::: :. .:::::: :: ::::::.:.:
XP_011 EVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCTRNAIHANLFASFVLKA
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 LSVFIKDAALKWMYSTA-AQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAANYYWLLVEGVY
::.. :. :. :: ... . . :: .::.. ..::: ..::: ::::::.:
XP_011 SSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVFMQYGIVANYCWLLVEGLY
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 LYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRNSNMNYWLIIR
:..::....: :. .: ::..::::.:.::::::..:: :.:. ::: :.::..: :.:
XP_011 LHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFENVQCWTSNDNMGFWWILR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 LPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLLGTHEVIFAFV
.:...:: .::.::::.. ..:.::.: : .:: : ::::::::::::::.:::.::::
XP_011 FPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKSTLTLIPLLGVHEVVFAFV
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pF1KB7 MDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERWRL-------E
::::.:::: ::: .: ..:::::.::.::::.:.::: :.:. :.:::: .
XP_011 TDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSELRRRWHRWRLGKVLWEER
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pF1KB7 HLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
. .: :: :.. :. : .::. .:
XP_011 NTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLPRLAESPF
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initn: 1077 init1: 861 opt: 1071 Z-score: 1221.8 bits: 235.0 E(85289): 2.6e-61
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pF1KB7 SSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCT
..:::::.::..::..: ::: :. .::::
XP_016 MDGEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLHCT
10 20 30 40 50
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTA-AQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQ
:: :: ::::::.:.: ::.. :. :. :: ... . . :: .::.. ..::
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pF1KB7 YCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDE
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pF1KB7 GCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTL
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pF1KB7 TLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFR
:::::::.:::.:::: ::::.:::: ::: .: ..:::::.::.::::.:.::: :.:
XP_016 TLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSELR
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 KSWERWRL-------EHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
. :.:::: .. .: :: :.. :. : .::. .:
XP_016 RRWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLPRL
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XP_016 AESPF
463 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:52:47 2016 done: Fri Nov 4 05:52:48 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]