Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7197
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7197, 372 aa
1>>>pF1KB7197 372 - 372 aa - 372 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8033+/-0.000814; mu= 15.0322+/- 0.049
mean_var=112.9121+/-27.833, 0's: 0 Z-trim(110.3): 326 B-trim: 1295 in 2/49
Lambda= 0.120699
statistics sampled from 10891 (11479) to 10891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 2482 443.0 2e-124
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CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 1499 271.9 6.9e-73
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 1499 271.9 6.9e-73
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 1499 271.9 7e-73
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 1499 271.9 7e-73
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 1499 271.9 7.1e-73
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 1499 271.9 7.2e-73
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 1499 271.9 7.2e-73
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CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 1499 272.0 8.1e-73
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CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 1344 244.8 7.9e-65
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 1318 240.2 1.8e-63
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 1250 228.5 7.5e-60
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 1237 226.1 3e-59
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 930 172.8 4.6e-43
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 890 165.8 5.8e-41
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 827 154.8 1e-37
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 806 151.1 1.3e-36
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 806 151.2 1.4e-36
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 800 150.2 3.1e-36
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 796 149.4 4.6e-36
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 604 116.0 6e-26
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 579 111.6 1.1e-24
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 574 110.8 2.1e-24
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 527 102.6 5.7e-22
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 524 102.0 8e-22
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 524 102.0 8.3e-22
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 524 102.1 8.8e-22
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 524 102.1 8.9e-22
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 522 101.7 1.1e-21
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 518 101.0 1.7e-21
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 515 100.5 2.4e-21
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 515 100.5 2.5e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 498 97.5 1.9e-20
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 496 97.2 2.6e-20
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 490 96.1 5e-20
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 490 96.1 5.2e-20
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 488 95.8 6.8e-20
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 482 94.8 1.4e-19
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 482 94.8 1.4e-19
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 480 94.4 1.7e-19
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 478 94.0 2.1e-19
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 477 93.8 2.3e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 473 93.2 3.9e-19
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 471 92.8 4.9e-19
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 464 91.6 1.2e-18
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 463 91.4 1.2e-18
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 460 90.9 1.9e-18
>>CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 2482 init1: 2482 opt: 2482 Z-score: 2347.4 bits: 443.0 E(32554): 2e-124
Smith-Waterman score: 2482; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANASGPPGARSASSLALAIAITALYSAVC
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CCDS32 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANASGPPGARSASSLALAIAITALYSAVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPCGRPDPSSFSRAREATARERVTAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPCGRPDPSSFSRAREATARERVTAC
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB7 TPSDGPGGGAAA
::::::::::::
CCDS32 TPSDGPGGGAAA
370
>>CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (389 aa)
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Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)
10 20 30
pF1KB7 MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
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CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: .. :. ::.: :::: ::.:::.:: :::. ::::::::::::::::::::::::
CCDS55 P--TGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
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100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
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CCDS55 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
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CCDS55 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPI
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CCDS55 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPC
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CCDS55 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB7 GRPDPSSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA
. . .. .: :. : . :: :
CCDS55 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS
360 370 380
>>CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (392 aa)
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Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)
10 20 30
pF1KB7 MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
:::: :. .. : .: :: :. .: .. :
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40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: .. :. ::.: :::: ::.:::.:: :::. ::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 ATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
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CCDS47 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
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160 170 180 190 200 210
pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
::::: .::.::.: :.:.:..:.:.: ::.:. :.:.. : : : :.:::... ::::
CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
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220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPI
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CCDS47 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPC
::.::. .:: : . .:. :.::::::.:: ::::::::::::::::::..:
CCDS47 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB7 GRPDPSSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA
. . .. .: :. : . :: :
CCDS47 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQVRSL
360 370 380 390
>>CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (397 aa)
initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499 Z-score: 1422.0 bits: 271.9 E(32554): 6.9e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)
10 20 30
pF1KB7 MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
:::: :. .. : .: :: :. .: .. :
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
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pF1KB7 PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: .. :. ::.: :::: ::.:::.:: :::. ::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 ATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
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CCDS47 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
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CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPI
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CCDS47 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPC
::.::. .:: : . .:. :.::::::.:: ::::::::::::::::::..:
CCDS47 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB7 GRPDPSSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA
. . .. .: :. : . :: :
CCDS47 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQRERRQKSDW
360 370 380 390
>>CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (400 aa)
initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499 Z-score: 1421.9 bits: 271.9 E(32554): 7e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)
10 20 30
pF1KB7 MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
:::: :. .. : .: :: :. .: .. :
CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: .. :. ::.: :::: ::.:::.:: :::. ::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 ATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
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CCDS55 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
::::: .::.::.: :.:.:..:.:.: ::.:. :.:.. : : : :.:::... ::::
CCDS55 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPI
:.:::..:.::::::::::.:::.:::.:::::::::.::::::::::::..:.:::.::
CCDS55 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
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CCDS43 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
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CCDS43 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
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CCDS43 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
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340 350 360 370
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CCDS43 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQCLPIPSLSCWALEQGCLVVYPGPLQGPLV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]