FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7185, 444 aa
1>>>pF1KB7185 444 - 444 aa - 444 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4241+/-0.000892; mu= 17.1882+/- 0.054
mean_var=126.5408+/-44.574, 0's: 0 Z-trim(106.7): 348 B-trim: 1058 in 2/48
Lambda= 0.114014
statistics sampled from 8493 (9138) to 8493 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 3006 506.4 2.3e-143
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 1892 323.2 3.2e-88
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 530 99.1 8.7e-21
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 530 99.1 8.8e-21
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 530 99.3 1e-20
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 491 92.7 7.5e-19
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CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 450 86.0 8.3e-17
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 438 84.0 3.1e-16
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 429 82.5 8.1e-16
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 422 81.3 1.8e-15
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 418 80.8 3.5e-15
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 415 80.2 4.1e-15
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 406 78.7 1.1e-14
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 399 77.4 2.2e-14
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 400 77.7 2.3e-14
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 399 77.6 2.6e-14
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 397 77.3 3.5e-14
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 395 77.0 4.4e-14
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 394 76.7 4.4e-14
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 394 76.9 5.7e-14
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 389 75.9 7.8e-14
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 381 74.6 2e-13
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 377 73.9 3.1e-13
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 377 74.0 3.3e-13
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 373 73.4 5.6e-13
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 362 71.6 1.9e-12
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 356 70.5 3.7e-12
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 356 70.5 3.7e-12
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 355 70.4 4.1e-12
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 355 70.4 4.3e-12
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 353 70.1 5.5e-12
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 350 69.5 6.7e-12
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 347 69.1 1.1e-11
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 344 68.5 1.4e-11
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 342 68.2 1.7e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 342 68.2 1.7e-11
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 339 67.7 2.4e-11
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 339 67.7 2.4e-11
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 339 67.7 2.4e-11
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 339 67.7 2.4e-11
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CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 339 67.7 2.4e-11
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 339 67.7 2.5e-11
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 338 67.5 2.5e-11
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 339 67.7 2.5e-11
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 339 67.8 2.6e-11
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 339 67.8 2.8e-11
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 335 67.0 3.7e-11
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8 ( 398) 334 66.9 4.3e-11
>>CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 (444 aa)
initn: 3006 init1: 3006 opt: 3006 Z-score: 2687.5 bits: 506.4 E(32554): 2.3e-143
Smith-Waterman score: 3006; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDEEFLRYLWREYLHPKEYEWVLIAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDEEFLRYLWREYLHPKEYEWVLIAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTITCLPATLVVDITETW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 YIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTITCLPATLVVDITETW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAICHPLMFKSTAKRARNSIVIIWIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 FFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAICHPLMFKSTAKRARNSIVIIWIVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CIIMIPQAIVMECSTVFPGLANKTTLFTVCDERWGGEIYPKMYHICFFLVTYMAPLCLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 CIIMIPQAIVMECSTVFPGLANKTTLFTVCDERWGGEIYPKMYHICFFLVTYMAPLCLMV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LAYLQIFRKLWCRQIPGTSSVVQRKWKPLQPVSQPRGPGQPTKSRMSAVAAEIKQIRARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LAYLQIFRKLWCRQIPGTSSVVQRKWKPLQPVSQPRGPGQPTKSRMSAVAAEIKQIRARR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KTARMLMIVLLVFAICYLPISILNVLKRVFGMFAHTEDRETVYAWFTFSHWLVYANSAAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KTARMLMIVLLVFAICYLPISILNVLKRVFGMFAHTEDRETVYAWFTFSHWLVYANSAAN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PIIYNFLSGKFREEFKAAFSCCCLGVHHRQEDRLTRGRTSTESRKSLTTQISNFDNISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PIIYNFLSGKFREEFKAAFSCCCLGVHHRQEDRLTRGRTSTESRKSLTTQISNFDNISKL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB7 SEQVVLTSISTLPAANGAGPLQNW
::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SEQVVLTSISTLPAANGAGPLQNW
430 440
>>CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 1853 init1: 1261 opt: 1892 Z-score: 1697.4 bits: 323.2 E(32554): 3.2e-88
Smith-Waterman score: 1892; 69.2% identity (85.6% similar) in 416 aa overlap (24-433:17-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDEEFLRYLWREYLHPKEYEWVLIAG
..:: : ::.:: :::::::.::.::.:::::::.
CCDS34 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDE-FLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTITCLPATLVVDITETW
:. ::::::.::.:::.:::.::::::::::::::::::::::: ::::.:.:::::.:
CCDS34 YVAVFVVALVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESW
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAICHPLMFKSTAKRARNSIVIIWIVS
.::..:::::::::.:::::.::::: :::::::::::::.:::::.:::.::. :: ::
CCDS34 LFGHALCKVIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CIIMIPQAIVMECSTVFPGLANKTTLFTVCDERWGGEIYPKMYHICFFLVTYMAPLCLMV
::.::: :::::.:.: :::.: ::.::::::. ..:::.:: :::.:::.::: ::.
CCDS34 LAIMVPQAAVMECSSVLPELANRTRLFSVCDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLGLMA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB7 LAYLQIFRKLWCRQIPGTSSVVQRKWKPLQPVSQ----PRG-PGQPTKSRMSAVAAEIKQ
.::.::::::: ::::::.:.. :.:: .: .: .: :.: . : : ::.::
CCDS34 MAYFQIFRKLWGRQIPGTTSALVRNWK--RPSDQLGDLEQGLSGEP-QPRARAFLAEVKQ
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IRARRKTARMLMIVLLVFAICYLPISILNVLKRVFGMFAHTEDRETVYAWFTFSHWLVYA
.:::::::.:::.::::::.::::::.::::::::::: .. :::.::: ::::::::::
CCDS34 MRARRKTAKMLMVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NSAANPIIYNFLSGKFREEFKAAFSCCCLGVHHRQEDRLTRGRTSTESRKSLTTQISNFD
::::::::::::::::::.:::::::: :. . :.:. :.:::. :
CCDS34 NSAANPIIYNFLSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPRSSA-SHKSLSLQSRC--
350 360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KB7 NISKLSEQVVLTSIST-LPAANGAGPLQNW
.:::.::.:::::..: ::
CCDS34 SISKISEHVVLTSVTTVLP
410 420
>>CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (420 aa)
initn: 605 init1: 419 opt: 530 Z-score: 486.7 bits: 99.1 E(32554): 8.7e-21
Smith-Waterman score: 658; 32.1% identity (59.9% similar) in 377 aa overlap (8-379:6-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDEEFLRYLWREYLHPKEYEWVLIAG
:. .:: ..:.:.. . . . .. : ::: . ..: .
CCDS35 MNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINIT---YVNY----YLHQPQVAAIFIIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTITCLPATLVVDITETW
:...: . ..::..:: : .:.::.:::: ::.::...:.:: : :.: ::. .: :
CCDS35 YFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGW
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAICHPLMFKSTAKRARNSIVIIWIVS
::...::. .: .::..::.:: ::.::. . .:. : : : : :.:::...
CCDS35 PFGNTMCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 CIIMIPQAIVMECST-----VFPGLANKTTLFTVCDERWGGEIYPKMYHICFFLVTYMAP
:: :.:.... . : . :::. : : : .. . :.: .: :.::
CCDS35 ITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LCLMVLAYLQIFRKLWCRQIPGTSSVVQRKWKPLQPVSQPRGPGQPTKSRMSAVAAEIKQ
: :.:. : .: .:. .: :. :..: . ::
CCDS35 LSLIVIMYGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQW---HVVS----------------------
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IRARRKTARMLMIVLLVFAICYLPISILNVLKRVFGMFAHTEDRETVYAWFTFSHWLVYA
: ..: .::.:: :.: . .::. : .:. . . . ..: . :.:::...
CCDS35 -RKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYI-YPFAHWLAFG
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NSAANPIIYNFLSGKFREEFKAAFSCCCLGVHHRQEDRLTRGRTSTESRKSLTTQISNFD
::..:::::.:.. .::. :. ::
CCDS35 NSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQEST
330 340 350 360 370 380
>>CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 605 init1: 419 opt: 530 Z-score: 486.6 bits: 99.1 E(32554): 8.8e-21
Smith-Waterman score: 658; 32.1% identity (59.9% similar) in 377 aa overlap (8-379:9-351)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDEEFLRYLWREYLHPKEYEWVLIA
:. .:: ..:.:.. . . . .. : ::: . ..:
CCDS47 MFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINIT---YVNY----YLHQPQVAAIFII
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 GYIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTITCLPATLVVDITET
.:...: . ..::..:: : .:.::.:::: ::.::...:.:: : :.: ::. .:
CCDS47 SYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 WFFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAICHPLMFKSTAKRARNSIVIIWIV
: ::...::. .: .::..::.:: ::.::. . .:. : : : : :.:::..
CCDS47 WPFGNTMCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SCIIMIPQAIVMECST-----VFPGLANKTTLFTVCDERWGGEIYPKMYHICFFLVTYMA
. :: :.:.... . : . :::. : : : .. . :.: .: :.:
CCDS47 AITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PLCLMVLAYLQIFRKLWCRQIPGTSSVVQRKWKPLQPVSQPRGPGQPTKSRMSAVAAEIK
:: :.:. : .: .:. .: :. :..: . ::
CCDS47 PLSLIVIMYGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQW---HVVS---------------------
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QIRARRKTARMLMIVLLVFAICYLPISILNVLKRVFGMFAHTEDRETVYAWFTFSHWLVY
: ..: .::.:: :.: . .::. : .:. . . . ..: . :.:::..
CCDS47 --RKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYI-YPFAHWLAF
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ANSAANPIIYNFLSGKFREEFKAAFSCCCLGVHHRQEDRLTRGRTSTESRKSLTTQISNF
.::..:::::.:.. .::. :. ::
CCDS47 GNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQES
330 340 350 360 370 380
>>CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (522 aa)
initn: 605 init1: 419 opt: 530 Z-score: 485.6 bits: 99.3 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 658; 32.1% identity (59.9% similar) in 377 aa overlap (8-379:108-450)
10 20 30
pF1KB7 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDE
:. .:: ..:.:.. . . .
CCDS35 RTCCCRRAWWILVPAADRARRERFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINIT--
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 EFLRYLWREYLHPKEYEWVLIAGYIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLS
.. : ::: . ..: .:...: . ..::..:: : .:.::.:::: ::.::.
CCDS35 -YVNY----YLHQPQVAAIFIISYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLA
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LADVLVTITCLPATLVVDITETWFFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAIC
..:.:: : :.: ::. .: : ::...::. .: .::..::.:: ::.::. .
CCDS35 ISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVV
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.:. : : : : :.:::... :: :.:.... . : . :::. : :
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: .. . :.: .: :.::: :.:. : .: .:. .: :. :..: . :
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: : ..: .::.:: :.: . .::. : .:. .
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. . ..: . :.:::...::..:::::.:.. .::. :. ::
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CCDS35 AYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
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CCDS43 FSTLLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSED
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CCDS82 MC-QRPPKPQEDRPPSPVPSFRVAWTEKNDGQRAPLANNLLPTSQLQSGKTDLSSVEPIV
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CCDS76 RKIAPHGQNMTVSVVI
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444 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 05:41:04 2016 done: Fri Nov 4 05:41:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]