Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7181
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7181, 355 aa
1>>>pF1KB7181 355 - 355 aa - 355 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1463+/-0.000769; mu= 17.6863+/- 0.046
mean_var=75.7125+/-14.707, 0's: 0 Z-trim(109.5): 34 B-trim: 43 in 1/51
Lambda= 0.147398
statistics sampled from 10878 (10911) to 10878 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 2570 555.7 2.2e-158
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 2227 482.7 2e-136
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 1210 266.5 2.5e-71
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 1160 255.8 4e-68
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 1143 252.2 4.8e-67
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 1142 252.0 5.7e-67
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 1136 250.8 1.4e-66
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 1130 249.5 3.4e-66
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 1130 249.5 3.5e-66
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 1122 247.8 1.1e-65
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 1119 247.2 1.8e-65
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 1114 246.1 3.6e-65
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 1025 227.1 1.5e-59
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 948 210.8 1.5e-54
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 847 189.3 4.3e-48
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 847 189.3 4.4e-48
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 840 187.8 1.2e-47
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 840 187.8 1.2e-47
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 833 186.3 3.4e-47
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 736 165.7 5.9e-41
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 726 163.6 2.4e-40
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 726 163.6 2.7e-40
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 712 160.6 1.9e-39
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 707 159.5 4e-39
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 524 120.6 1.9e-27
>>CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 (355 aa)
initn: 2570 init1: 2570 opt: 2570 Z-score: 2957.1 bits: 555.7 E(32554): 2.2e-158
Smith-Waterman score: 2570; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
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CCDS11 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
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CCDS11 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
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CCDS11 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
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CCDS11 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
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CCDS11 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
310 320 330 340 350
>>CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 (352 aa)
initn: 2219 init1: 2219 opt: 2227 Z-score: 2562.9 bits: 482.7 E(32554): 2e-136
Smith-Waterman score: 2227; 84.2% identity (94.4% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
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CCDS15 MAP--LGYFL-LLCSLKQALGSYPIWWSLAVGPQYSSLGSQPILCASIPGLVPKQLRFCR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
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CCDS15 NYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
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CCDS15 AGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQGSPGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENRP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
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CCDS15 DARSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKDKYDS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
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CCDS15 ASEMVVEKHRESRGWVETLRPRYTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
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CCDS15 NVSSHGIDGCDLLCCGRGHNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 1209 init1: 425 opt: 1210 Z-score: 1394.1 bits: 266.5 E(32554): 2.5e-71
Smith-Waterman score: 1210; 50.7% identity (74.6% similar) in 335 aa overlap (26-355:25-351)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGS--QPLLCGSIPGLVPKQLRF
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CCDS22 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLA---KLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAI
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CCDS22 CKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLD-SLPVFGKVVTQGTREAAFVYAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADAREN
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CCDS22 SSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRER
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RPDA---RSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLK
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CCDS22 SKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGT
.:.:.:.: :: .: : ..: . . ::: :..:::: : ::.::: . ..: .::
CCDS22 EKFDGATE--VEPRRV--GSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
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CCDS22 RGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 (359 aa)
initn: 972 init1: 407 opt: 1160 Z-score: 1336.5 bits: 255.8 E(32554): 4e-68
Smith-Waterman score: 1160; 44.6% identity (69.8% similar) in 368 aa overlap (3-355:2-359)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGG-TRVLAGYPIWWSLALGQ----QYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQ
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CCDS85 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPV-CSQLPGLSPGQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFV
..:. : : : ..::.: ::.::::::: :::::.: :.. ..:: :.. ..::.::.
CCDS85 RKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNA-SVFGRVMQIGSRETAFT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCD--SHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFA
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CCDS85 HAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLP-RDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 DARENRPD--------ARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQP
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CCDS85 DAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCE
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CCDS85 EFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTR----KGRLELVNSR---FTQPTPEDLVYVDPSPDYCL
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 PNPETGSFGTRDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQEC
: :::.::. : :: ::.:.:::.:.:::::.: . :.::: :::::.: :..:
CCDS85 RNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKC
290 300 310 320 330 340
350
pF1KB7 IRIYDVHTCK
.: : . ::
CCDS85 TEIVDQYICK
350
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 983 init1: 802 opt: 1143 Z-score: 1317.2 bits: 252.2 E(32554): 4.8e-67
Smith-Waterman score: 1143; 48.9% identity (74.3% similar) in 323 aa overlap (37-355:31-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 GLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIM
.::.. ..:..::::.:.: .:.. . .
CCDS33 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGAN-IICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAI
10 20 30 40 50
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pF1KB7 PSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFA
..::...::.:::.::: ::::... .. ..:: : ..::.::..::..:::: :
CCDS33 IVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEK-TVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHA
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 VTRSCAEGTSTICGCDSHHKG--PPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDARS
:: .:..:. . :::: ...: .::::::::: :. .:. ::.:.:::: . .::
CCDS33 VTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEM
:: ::::::: .. :.:.:.:::::.:::: .:::: . : :: .: .::.::..: .
CCDS33 LMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQ-
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VVEKHRESRGWVET-LRAKY-SLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNV
:: : :: : :: : .. : : :::: :.:::.:: . ::: ::. : ::
CCDS33 -VEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB7 TSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
:: : :::: .:::::.::. . .:.: :::::.:.:. : . .: :::
CCDS33 TSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
300 310 320 330 340
>>CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 (360 aa)
initn: 1153 init1: 427 opt: 1142 Z-score: 1315.8 bits: 252.0 E(32554): 5.7e-67
Smith-Waterman score: 1142; 46.1% identity (72.9% similar) in 336 aa overlap (26-355:27-349)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSL-ALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRF
:: . : : ::. ..: ..:::: .: ..
CCDS57 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTPEVNSSWWYMRATG------GSSRVMCDNVPGLVSSQRQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAI
:. . ..: ....:: ::::::: .::::.:.: . ..:: :: ...::::::.::
CCDS57 CHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEG---WKWGGCSEDADFGVLVSREFADA
.::::.::.::.:..: :.:: .. : .. . :::::.. :.:. .: :.::
CCDS57 SSAGVVFAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RENR-PDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFL
.: . :::. :: :::.::: .. .. .:::::.:::: ..::: :. ::: ::.:
CCDS57 KERKGKDARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KDKYDSASEMVVEKHRESRGW-VETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSF
::..: ..:... .. :. : . : :: ::. ::::.::::..: . :.::.
CCDS57 WRKYNGAIQVVMNQ--DGTGFTVANER-----FKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GTRDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHT
:: :.::.::.:.:.:...:::::..: : :: : ::::: : ::.:.. ::::
CCDS57 GTAGRVCNLTSRGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEALDVHT
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 CK
::
CCDS57 CKAPKNADWTTAT
350 360
>>CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 (370 aa)
initn: 1107 init1: 597 opt: 1136 Z-score: 1308.8 bits: 250.8 E(32554): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 1136; 46.0% identity (71.8% similar) in 337 aa overlap (26-354:34-369)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGS-----QPLLCGSIPG
::... . :.: . : .: :.
CCDS87 WALLPGWVSATLLLALAALPAALAANSSGRWWGIVNVASSTNLLTDSKSLQLVLEPSLQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LVPKQLRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]