Result of FASTA (omim) for
pF1KB7179
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7179, 479 aa
1>>>pF1KB7179 479 - 479 aa - 479 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0524+/-0.000444; mu= 19.3597+/- 0.027
mean_var=68.5376+/-14.086, 0's: 0 Z-trim(109.1): 178 B-trim: 167 in 1/53
Lambda= 0.154921
statistics sampled from 17110 (17289) to 17110 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 8.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 3225 730.4 2.5e-210
NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 1560 358.3 2.6e-98
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 1137 263.8 7.9e-70
NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 1070 248.8 2.6e-65
NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 1051 244.6 5.1e-64
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 1020 237.6 5.9e-62
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 1020 237.6 6e-62
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 999 233.0 1.8e-60
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 988 230.5 8.2e-60
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 975 227.6 6e-59
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 971 226.7 1.1e-58
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 971 226.7 1.2e-58
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 971 226.7 1.2e-58
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 971 226.7 1.2e-58
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 964 225.1 3.5e-58
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 964 225.1 3.5e-58
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 964 225.1 3.5e-58
XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 961 224.4 5.4e-58
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 951 222.2 2.5e-57
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 951 222.2 2.5e-57
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 949 221.8 3.6e-57
XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 946 221.0 4.6e-57
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 940 219.7 1.3e-56
NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 936 218.8 2.5e-56
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 904 211.7 3.5e-54
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 904 211.7 3.6e-54
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 904 211.7 3.6e-54
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 895 209.7 1.6e-53
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 895 209.7 1.6e-53
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 884 207.2 7.9e-53
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 851 199.8 1.2e-50
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 851 199.8 1.2e-50
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 835 196.3 1.6e-49
XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 835 196.3 1.6e-49
XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 753 177.9 4.6e-44
NP_647536 (OMIM: 609756) CHRNA7-FAM7A fusion prote ( 412) 749 177.0 8.8e-44
XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412) 749 177.0 8.8e-44
XP_016877372 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 440) 749 177.0 9.2e-44
XP_016877371 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 441) 749 177.0 9.2e-44
NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 730 172.8 1.8e-42
NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 730 172.8 1.9e-42
NP_001289964 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine ( 244) 720 170.4 5.2e-42
NP_001289963 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine ( 244) 720 170.4 5.2e-42
XP_011518536 (OMIM: 606372) PREDICTED: neuronal ac ( 244) 720 170.4 5.2e-42
XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 682 162.1 3.6e-39
XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 677 160.9 5.6e-39
XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 677 160.9 5.6e-39
XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 638 152.0 1.7e-36
XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 634 151.1 3.2e-36
XP_011520457 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 290) 625 149.2 1.5e-35
>>NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine recept (479 aa)
initn: 3225 init1: 3225 opt: 3225 Z-score: 3896.9 bits: 730.4 E(85289): 2.5e-210
Smith-Waterman score: 3225; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MNWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NKADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NKADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NQVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NQVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPASENVPLIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPASENVPLIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PHHSRERDHLTKVYSKLPESNLKAARNKDLSRKKDMNKRLKNDLGCQGKNPQEAESYCAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PHHSRERDHLTKVYSKLPESNLKAARNKDLSRKKDMNKRLKNDLGCQGKNPQEAESYCAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB7 YKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFFIMVFVMTILIIARAD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 YKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFFIMVFVMTILIIARAD
430 440 450 460 470
>>NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine recept (450 aa)
initn: 1707 init1: 1540 opt: 1560 Z-score: 1886.1 bits: 358.3 E(85289): 2.6e-98
Smith-Waterman score: 1668; 55.4% identity (77.5% similar) in 453 aa overlap (26-478:25-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTL
:.:. : ::: ::: .:..::::: :::..:::::
NP_065 MGLRSHHLSLGLLLLFLLPAECLGAEGRLALKLFRDLFANYTSALRPVADTDQTLNVTL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLY
..::::: :::::::.:: :::::: : :::: :: . : :::.:::::.::::::::::
NP_065 EVTLSQIIDMDERNQVLTLYLWIRQEWTDAYLRWDPNAYGGLDAIRIPSSLVWRPDIVLY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NKADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNG
:::: . ..::::::.:: . :::::::.::: :::. :::: :.:.:::::::..:
NP_065 NKADAQPPGSASTNVVLRHDGAVRWDAPAITRSSCRVDVAAFPFDAQHCGLTFGSWTHGG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NQVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFY
.:.:. ...:.::.:.:::.: :::: . :..:::::::::::::::::.::.. :
NP_065 HQLDVRPRGAAASLADFVENVEWRVLGMPARRRVLTYGCCSEPYPDVTFTLLLRRRAAAY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPASENVPLIG
. :::.::::::.::::.:.::: ::::::::::.:::.:::::..:: :: .:.:::::
NP_065 VCNLLLPCVLISLLAPLAFHLPADSGEKVSLGVTVLLALTVFQLLLAESMPPAESVPLIG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCLS
:::.:::...: ::::::..::.:.:: .:::: :::...: ...: : : . :: :
NP_065 KYYMATMTMVTFSTALTILIMNLHYCGPSVRPVPAWARALLLGHLARGLCVRERGEPC--
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PHHSRERDHLTKVYSKLPESNLKAARNKDLSRKKDMNKRLKNDLGCQGKNPQEAESYCAQ
.:: . : :.: .: : . .: . : :
NP_065 -GQSRPPE-----LSPSPQSPEGGA-------------------GPPAGPCHEPRCLCRQ
360 370 380 390
430 440 450 460 470
pF1KB7 YKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFFIMVFVMTILIIARAD
..: ... ::. ...:.:.. .::..:.:.::::. ::: :..::..:....:
NP_065 -EALLHHVATIANTFRSHRAAQRCHEDWKRLARVMDRFFLAIFFSMALVMSLLVLVQAL
400 410 420 430 440 450
>>NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine recept (494 aa)
initn: 1150 init1: 901 opt: 1137 Z-score: 1374.6 bits: 263.8 E(85289): 7.9e-70
Smith-Waterman score: 1137; 36.9% identity (71.6% similar) in 447 aa overlap (32-468:35-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 NWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTLQ
..::. :: :.. .::::... ..: ..
NP_004 KGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLYN
....:. ..:: :::. . ::.:.::.: : :: .:::....:.:.: .:.:::::::
NP_004 VAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNGN
.: . . .:...:.:.:.::: ::: :::: .:.:.::::.:.:.: ::::::.
NP_004 NAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFYI
..:.. .. :..:: :. :::. . :. :.:.:: : : :.:... ..: ::
NP_004 EIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMFYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-SENVPLIG
.::.:::..::::. : ::::. ::::.: ...::..::: :...: .:. : :::.:
NP_004 INLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLVG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCLS
.: . :: ..: : ..:..:.:::. .. .:.:...:.:: . .::.. . :.
NP_004 EYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLM----RWPLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 PHHSRERDHLTKVYSKLPESNLKAARNKDLSRKKDMNKRLKNDLGCQGK----NPQ----
.. : . . .. : .. :.... :. .. . .:.:. . . .:
NP_004 KTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 EAESYCAQYKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFFIM-VFVMT
: . . . . ....::. .:.:. :. ..:: :: :.:: :.:.:.:. ::
NP_004 ENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTA
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ILIIARAD
NP_004 GLFLQPLLGNTGKS
490
>>NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcholine (502 aa)
initn: 1111 init1: 490 opt: 1070 Z-score: 1293.6 bits: 248.8 E(85289): 2.6e-65
Smith-Waterman score: 1115; 37.6% identity (69.9% similar) in 489 aa overlap (12-478:9-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTL
:. .::: :.. . .:.. .::...: ..:. ::: . .. :.: .
NP_000 MRCSPGGVWLALAASLLHV--SLQGEFQRKLYKELVKNYNPLERPVANDSQPLTVYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLY
...: :: :.::.::.::. .:... : : :: :. ..: :. ..:.:. .:.:::.::
NP_000 SLSLLQIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNVSEYPGVKTVRFPDGQIWKPDILLY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NKADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNG
:.::.. . .:::.. .: . :.: :::: .:: .:::: :.:.: ::::.:.:
NP_000 NSADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NQVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFY
..:. .. .:.: .: . ::.. :.:. .. : ::.:::::::::. ..::. .:
NP_000 WSLDL--QMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB7 IVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-SENVPLI
.:::::::::: :: : : ::: ::::.:::.:.::..:::.:.::::::: :..::::
NP_000 GLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GKYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCL
..:. .:: .. :...:..:.. : .. .:.:.::..:.. . : . ::. .
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: .:...: :..: .: . : :: . . :. : . . . . ..:
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360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB7 --------QGKNPQEAESYCAQYKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRF
.: .: :.. : :.: ....:::. .. . ... :::: .: :.::.
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420 430 440 450 460 470
460 470
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. : ..... :: :. :
NP_000 CLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
480 490 500
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10 20 30 40 50
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: ....: :: :.::.::.::. .:... : : :: :. ..: :. ..:.:. .:.:::
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.:::.::.. . .:::.. .: . :.: :::: .:: .:::: :.:.: ::::.
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:::..:. .:: .. :...:..:.. : .. .:.:.::..:.. . : . ::
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360 370 380 390 400
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. . : .:...: :..: .: . : :: . . :. : . . . . .
NP_001 DKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRM
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410 420 430 440 450
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.: .: .: :.. : :.: ....:::. .. . ... :::: .: :.
NP_001 ACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLA--KIL-EEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVV
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460 470
pF1KB7 DRFFMWIFFIMVFVMTILIIARAD
::. . : ..... :: :. :
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pF1KB7 KADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNGN
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pF1KB7 VNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-SENVPLIG
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pF1KB7 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCLS
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pF1KB7 NWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTLQ
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NP_000 LSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARASEAEHRLFERLFEDYNEIIRPVANVSDPVIIHFE
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pF1KB7 ITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLYN
...::. .:: :::. . ::..:::.: : :. ..: : . .:.:.. .:.:::::::
NP_000 VSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQKIWKPDIVLYN
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pF1KB7 KADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNGN
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NP_000 NAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCTMKFGSWSYDKA
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 QVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFYI
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NP_000 KIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYSLYIRRLPLFYT
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pF1KB7 VNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-SENVPLIG
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NP_000 INLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVIPLIG
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pF1KB7 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVY----DVGE
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NP_000 EYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTTHTMPSWVKTVFLNLLPRVMFMTRPTSNEGN
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NP_000 AQKPRPLYGAELSNLN-CFSRAESKGCKEGYPCQDGMCGYCHHRRIKISNFSANLTRSSS
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pF1KB7 AESYCA---------QYKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFF
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NP_000 SESVDAVLSLSALSPEIKEAIQSVKYIAENMKAQNEAKEIQDDWKYVAMVIDRIFLWVFT
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pF1KB7 IMVFVMTILIIARAD
.. .. :
NP_000 LVCILGTAGLFLQPLMAREDA
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pF1KB7 MNWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGK-YAQ-KLFNDLFEDYSNALRPVEDTDK
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pF1KB7 VLNVTLQITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWR
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pF1KB7 PDIVLYNKADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFG
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NP_000 PDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCTMKFG
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NP_000 SWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFVIR
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pF1KB7 RRSSFYIVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-S
: :: .::.:::.::: :. : ::::. :::..: ...::..::: :...::.:. :
NP_000 RLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPSTS
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pF1KB7 ENVPLIGKYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYD
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NP_000 LVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHTMPTWVRRVFLDIVPRLLLMKR
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NP_000 PSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQSLHPPSPSFCVPLDVPAEPGP
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>>NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine rec (479 aa)
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pF1KB7 NWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTLQ
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....:. .. ::.: : :: .:::....:.:.: .:.:::::::
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pF1KB7 KADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNGN
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NP_001 NAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDKA
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pF1KB7 QVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFYI
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pF1KB7 VNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-SENVPLIG
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NP_001 INLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLVG
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pF1KB7 KYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWARVVILKYMSRVLFVYDVGESCLS
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NP_001 EYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLM----RWPLD
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pF1KB7 PHHSRERDHLTKVYSKLPESNLKAARNKDLSRKKDMNKRLKNDLGCQGK----NPQ----
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NP_001 KTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVV
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pF1KB7 EAESYCAQYKVLTRNIEYIAKCLKDHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFFIM-VFVMT
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NP_001 ENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTA
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pF1KB7 ILIIARAD
NP_001 GLFLQPLLGNTGKS
470
>>XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) PREDI (464 aa)
initn: 1046 init1: 586 opt: 975 Z-score: 1179.3 bits: 227.6 E(85289): 6e-59
Smith-Waterman score: 1049; 36.4% identity (69.0% similar) in 467 aa overlap (15-476:15-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNWSHSCISFCWIYFAASRLRAAETADGKYAQKLFNDLFEDYSNALRPVEDTDKVLNVTL
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XP_016 MFMCLEGGEKNLTVLVSSAVSAGLVLGSEHETRLVAKLFKDYSSVVRPVEDHRQVVEVTV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 QITLSQIKDMDERNQILTAYLWIRQIWHDAYLTWDRDQYDGLDSIRIPSDLVWRPDIVLY
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XP_016 GLQLIQLINVDEVNQIVTTNVRLKQQWVDYNLKWNPDDYGGVKKIHIPSEKIWRPDLVLY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 NKADDESSEPVNTNVVLRYDGLITWDAPAITKSSCVVDVTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNG
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XP_016 NNADGDFAIVKFTKVLLQYTGHITWTPPAIFKSYCEIIVTHFPFDEQNCSMKLGTWTYDG
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pF1KB7 NQVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYGCCSE-PYPDVTFTLLLKRRSSF
. : : :. :::.:.:. :: .. . :. ..:.:: . :: :.:. ....: .
XP_016 SVVAINPESDQPDLSNFMESGEWVIKESRGWKHSVTYSCCPDTPYLDITYHFVMQRLPLY
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pF1KB7 YIVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLAMTVFQLMVAEIMPA-SENVPL
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XP_016 FIVNVIIPCLLFSFLTGLVFYLPTDSGEKMTLSISVLLSLTVFLLVIVELIPSTSSAVPL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
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::::.. ::... :: .:..:.: : . .. .:.:.: :.. . ..: . .
XP_016 IGKYMLFTMVFVIASIIITVIVINTHHRSPSTHVMPNWVRKVFIDTIPNIMFFSTMKR--
310 320 330 340 350
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pF1KB7 LSPHHSRERDHLTKVYSKLPESNLKAARNKDLSRKKDMNKRLKNDLGCQGKNPQEAESYC
: :::.. :.... . :.: :.. : : :. .:
XP_016 --P--SREKQD-KKIFTE----------DIDIS---DIS-------GKPGPPPMGFHSPL
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
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