Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7171
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7171, 482 aa
1>>>pF1KB7171 482 - 482 aa - 482 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5456+/-0.000953; mu= 11.6555+/- 0.057
mean_var=114.9245+/-29.955, 0's: 0 Z-trim(108.1): 237 B-trim: 1646 in 3/48
Lambda= 0.119638
statistics sampled from 9669 (9991) to 9669 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 3282 577.8 8.5e-165
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 516 100.3 3.4e-21
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 508 99.0 9e-21
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 506 98.6 1.1e-20
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 468 92.0 1.1e-18
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 465 91.5 1.6e-18
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 465 91.6 1.6e-18
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 465 91.6 1.7e-18
CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 ( 337) 456 90.0 4.4e-18
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 413 82.6 7.8e-16
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 ( 356) 392 78.9 9.7e-15
CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 ( 333) 387 78.1 1.7e-14
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 362 73.8 3.5e-13
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 353 72.2 1e-12
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 353 72.2 1.1e-12
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 353 72.2 1.1e-12
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 328 67.9 2.2e-11
>>CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 (482 aa)
initn: 3282 init1: 3282 opt: 3282 Z-score: 3072.1 bits: 577.8 E(32554): 8.5e-165
Smith-Waterman score: 3282; 100.0% identity (100.0% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQRTVNTIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQRTVNTIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLTAISLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLTAISLDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNRCGYKFGLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 CLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNRCGYKFGLSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTFQRPSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTFQRPSAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLSTHLKLFPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLSTHLKLFPSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVIMIACYSFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVIMIACYSFIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLGKTLMSWDHVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLGKTLMSWDHVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 IALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSNNVISERNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 IALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSNNVISERNST
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TV
::
CCDS85 TV
>>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 747 init1: 516 opt: 516 Z-score: 493.9 bits: 100.3 E(32554): 3.4e-21
Smith-Waterman score: 561; 28.0% identity (50.9% similar) in 440 aa overlap (22-461:36-326)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLK
: ::..::....::.:. ::.::.::....
CCDS33 YTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVPDILALVIFAVVFLVGVLGNALVVWVTAFE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MQRTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVF
.::.:.::::.:..::.: ::.::. .. .. . .::.: :...::.:.:::.::..
CCDS33 AKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLILLNMYASIL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LLTAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNR
::..:: :: :.::::::::: :..:.: :. : .:... :: :.:: . :
CCDS33 LLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVV-------R
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CGYKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQP
: .:
CCDS33 EEY---------FP----------------------------------------------
180
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QTFQRPSADSLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLS
::. :
CCDS33 -----------------------------------PKVLCGV------------------
190
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 THLKLFPSASSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVI
:: . : . :..:.:::.::: : .
CCDS33 ------------------------DY------SHDKRRER---AVAIVRLVLGFLWPLLT
200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 MIACYSFIVFRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLGK
. ::.::..: : ..: .::..:.:.::: :.. : ::.. :.. . .: .:
CCDS33 LTICYTFILLRTWSRRATRS-TKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFL
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TLMSWDHVCIALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSN
: . : .:...: : :.::..:.. :. :. . :.:. ..:. ...::
CCDS33 LLKKLDSLCVSFAYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSLLRNVLTEESVVRESKSFT
280 290 300 310 320 330
480
pF1KB7 NVISERNSTTV
CCDS33 RSTVDTMAQKTQAV
340 350
>>CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 762 init1: 498 opt: 508 Z-score: 486.4 bits: 99.0 E(32554): 9e-21
Smith-Waterman score: 508; 46.1% identity (76.6% similar) in 154 aa overlap (24-176:27-180)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQRTVN
:: .:.:..::.::. :::::.::::..: :::.
CCDS12 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLTAIS
:: .:.:.:::. .::: .. .:. .::.: :::::: .. .:.:.::::. :.
CCDS12 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNR-CGYKF
::::. :..:.: ::::.:..: .. :..:.:. .:::.. : : . : ..:
CCDS12 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTFQR
CCDS12 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
>>CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 748 init1: 483 opt: 506 Z-score: 484.5 bits: 98.6 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 512; 27.6% identity (51.5% similar) in 464 aa overlap (3-460:4-327)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTD-LLSQPWNEPPV-ILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQRTVN
.:: : :. .: .: .. . :.:... ..::..:. :::::.::::..: ::::
CCDS12 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLTAIS
:: .:.:.:::. ::: .. .:.. .::.: :::::. .: .:.:.::.:.: :.
CCDS12 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVY-REIFTTDNHNRCGYKF
::::. :..: : ::::....: . .:. ..:. .: :.. : ::.. . : ..:
CCDS12 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTFQR
. :.:: ..: ::
CCDS12 A---------FWGDT----AVE-----------RL-------------------------
190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PSADSLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLSTHLKL
::: .. :. :: :.
CCDS12 --------------------NVF----ITMAKV-------------------FLILHF--
200
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 FPSASSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVIMIACY
..:: .: :. .::
CCDS12 ---------------------------------------------IIGFSVPMSIITVCY
210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SFIVFRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLG---KTL
..:. ...:... :: :. .:: ..::: :..:: ::...:.: . : :. : .
CCDS12 GIIAAKIHRNHMIKS-SRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKII
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 MSWDHVCIALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSNNV
. . .:: :::.::.::...:..:... .:. :: :..:
CCDS12 LVLINPTSSLAFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTT
290 300 310 320 330 340
480
pF1KB7 ISERNSTTV
CCDS12 SASPPEETELQAM
350
>>CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 647 init1: 451 opt: 468 Z-score: 449.1 bits: 92.0 E(32554): 1.1e-18
Smith-Waterman score: 472; 25.6% identity (51.0% similar) in 453 aa overlap (24-474:27-340)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQRTVN
:........::.::. :::::.::::..: .::.
CCDS12 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLTAIS
:: .:.:..::. .::: ... :. :.::.: ::::.. .:. .:.:.::::.. :.
CCDS12 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNRCGYKFG
::::. :..:.: ::::.:..: .. ::.:... .::..
CCDS12 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIR-----------------
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTFQRP
.. :: . . : :::
CCDS12 ----------------------VTTVPG----KTGTVACTFNFSPWT-------------
170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SADSLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLSTHLKLF
: : . .. . :.:..
CCDS12 -ND--------------------PKERINVAV------------------AMLTV-----
190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PSASSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVIMIACYS
.: : :...:: : :. . :.
CCDS12 --------------RG------------------------IIRFIIGFSAPMSIVAVSYG
210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FIVFRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLG--KTLMS
.:. .... . :: :. .:: :.:.:..::.::.. .... . : : : .
CCDS12 LIATKIHKQGLIKS-SRPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGI
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 WDHVCIALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSNNVIS
: ::: :::.::.::...:.:::.. ... . :: :..:. :... .:...
CCDS12 AVDVTSALAFFNSCLNPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLP
290 300 310 320 330 340
480
pF1KB7 ERNSTTV
CCDS12 SAEVELQAK
350
>>CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (371 aa)
initn: 751 init1: 464 opt: 465 Z-score: 446.0 bits: 91.5 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 553; 29.3% identity (51.9% similar) in 457 aa overlap (24-479:39-356)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQ
:. .:. :.. .::. :::::. .: .::.
CCDS41 SISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKMK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLL
.::: .:::.:..::.: . ::. ... :.. .: .: .::. ... :::.:::::
CCDS41 KTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNRCG
: :: :::. :. :.: ::::.: .: : :::.:: . : .:.:. . .. :
CCDS41 TIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANLHGKISCF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQT
.:.::. :: :: : ::
CCDS41 NNFSLST-----------------------PGS-------SS-------W--PT------
190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FQRPSADSLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLSTH
: : .:
CCDS41 --------------------------------------------H--SQMD---------
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LKLFPSASSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVIMI
: :.. . ...:.::.. :::.: .:.
CCDS41 -----------------PVGYSRH----------------MVVTVTRFLCGFLVPVLIIT
210 220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ACYSFIVFRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLGKTL
::: :: ..::.:.::.. : :.. :... .:..:: ::: .:.:: .: . ..
CCDS41 ACYLTIVCKLQRNRLAKTK-KPFKIIVTIIITFFLCWCPYH---TLNLLELHHTAMPGSV
240 250 260 270 280 290
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 MSWD-HVCIALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSNN
.: . ::: ::::.::.::...:.:: :: . .. . : :.::. .:.. ::.
CCDS41 FSLGLPLATALAIANSCMNPILYVFMGQDF-KKFKVALFSRLVNALSEDTGHSSY-PSHR
300 310 320 330 340
480
pF1KB7 VISERNSTTV
... .:
CCDS41 SFTKMSSMNERTSMNERETGML
350 360 370
>>CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (373 aa)
initn: 751 init1: 464 opt: 465 Z-score: 445.9 bits: 91.6 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 553; 29.3% identity (51.9% similar) in 457 aa overlap (24-479:41-358)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQ
:. .:. :.. .::. :::::. .: .::.
CCDS44 SISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKMK
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLL
.::: .:::.:..::.: . ::. ... :.. .: .: .::. ... :::.:::::
CCDS44 KTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFLL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNRCG
: :: :::. :. :.: ::::.: .: : :::.:: . : .:.:. . .. :
CCDS44 TIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANLHGKISCF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQT
.:.::. :: :: : ::
CCDS44 NNFSLST-----------------------PGS-------SS-------W--PT------
200
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FQRPSADSLPRGSARLTSQNLYSNVFKPADVVSPKIPSGFPIEDHETSPLDNSDAFLSTH
: : .:
CCDS44 --------------------------------------------H--SQMD---------
210
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LKLFPSASSNSFYESELPQGFQDYYNLGQFTDDDQVPTPLVAITITRLVVGFLLPSVIMI
: :.. . ...:.::.. :::.: .:.
CCDS44 -----------------PVGYSRH----------------MVVTVTRFLCGFLVPVLIIT
220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ACYSFIVFRMQRGRFAKSQSKTFRVAVVVVAVFLVCWTPYHIFGVLSLLTDPETPLGKTL
::: :: ..::.:.::.. : :.. :... .:..:: ::: .:.:: .: . ..
CCDS44 ACYLTIVCKLQRNRLAKTK-KPFKIIVTIIITFFLCWCPYH---TLNLLELHHTAMPGSV
240 250 260 270 280 290
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 MSWD-HVCIALASANSCFNPFLYALLGKDFRKKARQSIQGILEAAFSEELTRSTHCPSNN
.: . ::: ::::.::.::...:.:: :: . .. . : :.::. .:.. ::.
CCDS44 FSLGLPLATALAIANSCMNPILYVFMGQDF-KKFKVALFSRLVNALSEDTGHSSY-PSHR
300 310 320 330 340 350
480
pF1KB7 VISERNSTTV
... .:
CCDS44 SFTKMSSMNERTSMNERETGML
360 370
>>CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 (395 aa)
initn: 596 init1: 453 opt: 465 Z-score: 445.6 bits: 91.6 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 465; 47.3% identity (72.0% similar) in 150 aa overlap (26-174:35-184)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQRT
.... .:. :::: ::..:.:.: .:..:
CCDS79 ATLKPLCPILEQMSRLQSHSNTSIRYIDHAAVLLHGLASLLGLVENGVILFVVGCRMRQT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLTA
: : : :::.:.::: :::: ::. .: : .::: ::. :::::: :::.:
CCDS79 VVTTWVLHLALSDLLASASLPFFTYFLAVGHSWELGTTFCKLHSSIFFLNMFASGFLLSA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTT-DNHNRCGY
::::::: : .:.: ::::.:. : ..: .:..: . .: ::.:. .. :.. : :
CCDS79 ISLDRCLQVVRPVWAQNHRTVAAAHKVCLVLWALAVLNTVPYFVFRDTISRLDGRIMCYY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTF
CCDS79 NVLLLNPGPDRDATCNSRQVALAVSKFLLAFLVPLAIIASSHAAVSLRLQHRGRRRPGRF
190 200 210 220 230 240
>>CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 (337 aa)
initn: 587 init1: 430 opt: 456 Z-score: 438.2 bits: 90.0 E(32554): 4.4e-18
Smith-Waterman score: 456; 40.2% identity (66.9% similar) in 169 aa overlap (20-183:32-197)
10 20 30 40
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAG
.: . . . . ::.:.:::..: ::::
CCDS12 GNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAWVAG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 LKMQRTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFAS
.: :.. :.:::..::::::::::. . .: :.:::: :. .::::.:.:.::
CCDS12 KVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYAS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VFLLTAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSI---CGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTT
:.::.:.: : :.... : : .: ::.. :: :..:... .: .::..
CCDS12 VLLLAALSADLCFLALGPAW---WSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 DNHNR--CGYKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWT
: : .: ::: .
CCDS12 HFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALLCWAARRCRPLGTAI
180 190 200 210 220 230
>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa)
initn: 705 init1: 410 opt: 413 Z-score: 397.7 bits: 82.6 E(32554): 7.8e-16
Smith-Waterman score: 413; 38.2% identity (73.7% similar) in 152 aa overlap (25-176:40-191)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAGLKMQR
.:.:. :.:.::.:::..:.: .:.: ..
CCDS23 EEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWFTGFKWKK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFASVFLLT
::.:.:::.:..::.. : ::. ....:.. .::.: .::: ::::::::.::
CCDS23 TVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMFASVFFLT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSICGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTTDNHNRCGY
.::::. . ...:. . ::.. . . ::..: .. :.. .:. .::. :
CCDS23 VISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVEFNNHTLCYN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWTVPTVFQPQTF
.:
CCDS23 NFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILISSRHFWTIL
190 200 210 220 230 240
482 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 00:55:40 2016 done: Sat Nov 5 00:55:41 2016
Total Scan time: 2.960 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]