Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7158
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7158, 363 aa
1>>>pF1KB7158 363 - 363 aa - 363 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8582+/-0.00116; mu= 13.0436+/- 0.069
mean_var=103.1494+/-26.889, 0's: 0 Z-trim(103.2): 295 B-trim: 928 in 2/43
Lambda= 0.126282
statistics sampled from 6961 (7317) to 6961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 2449 457.5 8.1e-129
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 759 149.6 3.9e-36
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 759 149.6 4.1e-36
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 759 149.6 4.2e-36
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 658 131.2 1.4e-30
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 641 128.1 1.2e-29
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 594 119.6 4.5e-27
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 594 119.6 4.9e-27
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 590 118.8 7.5e-27
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 588 118.4 9.2e-27
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 585 117.9 1.4e-26
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 585 117.9 1.4e-26
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 569 115.0 1e-25
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 569 115.0 1.1e-25
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 566 114.4 1.5e-25
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 566 114.5 1.5e-25
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 561 113.6 3.2e-25
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 560 113.3 3.2e-25
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 558 113.0 4.2e-25
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 556 112.6 5.3e-25
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 556 112.6 5.4e-25
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 552 111.9 9.2e-25
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 541 109.9 3.6e-24
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 539 109.5 4.5e-24
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 532 108.2 1.1e-23
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 522 106.4 4e-23
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 522 106.4 4.1e-23
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 520 106.1 5e-23
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 515 105.2 9.7e-23
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 512 104.6 1.5e-22
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 509 104.0 1.7e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 510 104.3 1.9e-22
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 510 104.3 1.9e-22
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 510 104.3 1.9e-22
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 510 104.3 1.9e-22
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 510 104.3 1.9e-22
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 510 104.3 1.9e-22
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 510 104.3 2e-22
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 510 104.3 2e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 510 104.3 2.1e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 510 104.4 2.2e-22
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 495 101.5 1.2e-21
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 495 101.5 1.2e-21
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 494 101.3 1.3e-21
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 494 101.3 1.3e-21
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 493 101.2 1.6e-21
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 492 101.0 1.8e-21
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 488 100.2 3e-21
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 484 99.5 4.7e-21
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 483 99.3 5.2e-21
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
initn: 2449 init1: 2449 opt: 2449 Z-score: 2426.1 bits: 457.5 E(32554): 8.1e-129
Smith-Waterman score: 2449; 100.0% identity (100.0% similar) in 363 aa overlap (1-363:1-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKGNSTLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MKGNSTLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VNIVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VNIVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GSFLTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSFLTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FRDVRTIEYLGVNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FRDVRTIEYLGVNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TNSYGKNRITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TNSYGKNRITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMET
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FVS
:::
CCDS14 FVS
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 723 init1: 627 opt: 759 Z-score: 762.2 bits: 149.6 E(32554): 3.9e-36
Smith-Waterman score: 759; 36.5% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (47-355:31-337)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN-IVVVTLFCCQKGP
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CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL-
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 KKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFI
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CCDS31 KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 TCMSVDRYQSVIYPFLSQ-RRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNA
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CCDS31 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 CIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQV
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CCDS31 CAFHYESQN-STLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 LKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVN
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CCDS31 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360
pF1KB7 PFLYCFVGNRFQQKLRSVFR-VPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMETFVS
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CCDS31 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPP---KAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPC
300 310 320 330 340 350
CCDS31 FEVE
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 723 init1: 627 opt: 759 Z-score: 761.7 bits: 149.6 E(32554): 4.1e-36
Smith-Waterman score: 759; 36.5% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (47-355:60-366)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN-IVVVTLFCCQKGP
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CCDS82 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL-
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80 90 100 110 120 130
pF1KB7 KKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFI
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CCDS82 KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 TCMSVDRYQSVIYPFLSQ-RRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNA
::.:.::: ....:. :. ::. :. ..: .: :.:::.. :.: :: ....
CCDS82 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 CIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQV
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CCDS82 CAFHYESQN-STLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 LKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVN
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CCDS82 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360
pF1KB7 PFLYCFVGNRFQQKLRSVFR-VPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMETFVS
:..: :.:..:.. . .... .: ..: .: : :.:
CCDS82 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPP---KAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPC
330 340 350 360 370 380
CCDS82 FEVE
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 723 init1: 627 opt: 759 Z-score: 761.6 bits: 149.6 E(32554): 4.2e-36
Smith-Waterman score: 759; 36.5% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (47-355:66-372)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN-IVVVTLFCCQKGP
:: :: ::::.:.. : .::.... .:
CCDS82 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL-
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 KKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFI
: :.:....:::.::: .: ::::::.: ...: : :: .::. .. ...:..::.:..
CCDS82 KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 TCMSVDRYQSVIYPFLSQ-RRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNA
::.:.::: ....:. :. ::. :. ..: .: :.:::.. :.: :: ....
CCDS82 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 CIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQV
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CCDS82 CAFHYESQN-STLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 LKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVN
.:. :.:: :.. :.: ...::::.: .:.: .:.. ..: :.:..: ... :.:.:
CCDS82 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360
pF1KB7 PFLYCFVGNRFQQKLRSVFR-VPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMETFVS
:..: :.:..:.. . .... .: ..: .: : :.:
CCDS82 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPP---KAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPC
340 350 360 370 380 390
CCDS82 FEVE
>>CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 531 init1: 304 opt: 658 Z-score: 662.2 bits: 131.2 E(32554): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 658; 33.7% identity (65.3% similar) in 323 aa overlap (35-350:47-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 STLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAI-PILYYIIFVIGFLVNI
: : :..: : . ...::.. : ::
CCDS99 SVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQPPFLWVLFVLATLENI
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSF
:...:: .:. :. ::. :::.:::.: ::.:: : .::::: ..:.: ...
CCDS99 FVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGETLCRVVNAI
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPF-LSQRRNPWQASYIVPLVW-CMACLSSLPTFYF
...:...:: :. .:.::: ... . ... :. :. ..: : ::: : . :
CCDS99 ISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLVIWGCTLLLSS-PMLVF
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KB7 RDVRTIEYLG--VNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLL
: .. : :.::....: : . .. :..::..:: :. : . : . .:
CCDS99 RTMKEYSDEGHNVTACVISYPS---LIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSVITFCTMQIMQ-VL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KTNSYGKNR--ITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVID
..: . : . :. .. .. .:.: ::::::::.. ::::.: .:...::. .::
CCDS99 RNNEMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLGILSSCQDERIID
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSSLRE
. .: .....:::.::..: .::.::..: :. :: .. .::
CCDS99 VITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVY-------QGVCQKGGCRSEPIQME
320 330 340 350 360
360
pF1KB7 METFVS
CCDS99 NSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
370 380 390
>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 STLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDA--IPILYYIIFVIGFLVN
: :: ... . : .: :: ..::::.. :
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10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGS
:.:: .. : :...:::..:::..:::.: :::.: : . . ::.:: .:::....
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60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPWQASYIVPLV-WCMACLSSLPTFYF
: .... :::: ...::: .... .. : . :. .. : .: :.:.: .::
CCDS27 FYYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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.: . ..: . :: :. .:. :: :..:...::. . :: :: : ::.
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180 190 200 210 220
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pF1KB7 NSYGKNRITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALP
. :.. .: . .... :.. : :... ..... . . :: .:::.
CCDS27 PNEKKSKAVR-----LIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
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. ....:. :::: .: :::.::.. ::..: :: . ::
CCDS27 VTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSP
290 300 310 320 330 340
360
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CCDS27 STGEHELSAGF
350
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
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10 20 30 40 50
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:.::: :.. : . .. .: ::
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..:..:.: : .:.... .. . .. ....::::: ::. ::::::. . . :.
CCDS14 SLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQ--WV
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:: .::: :.....:..:. ....:.: ::: .... ::.: .. : :: .
CCDS14 FGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGL
120 130 140 150 160 170
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: .:: : : ... : :... : . :: . .. ... . ::..::. .: :
CCDS14 CLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT----ALRVLQLVAGFLLPLLVMAYC
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pF1KB7 YFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVIN-S
: : :: : :. :. ........::.:: .:: :.:.....: : .:.. .
CCDS14 YAHILAVLLV--SRGQRRL---RAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARN
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 CEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVF-RVPITWLQG-KRESM
: . .:.: . ::. . :.::.:: ::: .:.... .. :. .: .:.
CCDS14 CGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPS
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KB7 SCRKSSSLREMETFVS
: :..:: :
CCDS14 SSRRDSSWSETSEASYSGL
350 360
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MKGNSTLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDA------IPIL
:.::: :.. : . .. .: :
CCDS48 FPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPAL
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YYIIFVIGFLVNIVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDW
: ..:..:.: : .:.... .. . .. ....::::: ::. ::::::. . . :
CCDS48 YSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQ--W
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160
pF1KB7 LFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPWQASYIVPL-VWC
.:: .::: :.....:..:. ....:.: ::: .... ::.: .. : ::
CCDS48 VFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWG
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 MACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIAT
. : .:: : : ... : :... : . :: . .. ... . ::..::. .:
CCDS48 LCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT----ALRVLQLVAGFLLPLLVMAY
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVIN-
:: : :: : :. :. ........::.:: .:: :.:.....: : .:..
CCDS48 CYAHILAVLLV--SRGQRRL---RAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALAR
290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVF-RVPITWLQG-KRES
.: . .:.: . ::. . :.::.:: ::: .:.... .. :. .: .:.
CCDS48 NCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQP
340 350 360 370 380 390
350 360
pF1KB7 MSCRKSSSLREMETFVS
: :..:: :
CCDS48 SSSRRDSSWSETSEASYSGL
400 410
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:.: . . .. . :: . : .. : : .: . . : :
CCDS54 MPFGIRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTT--SYYDDVGLLC-EKADTRALMAQF
10 20 30 40 50
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pF1KB7 IPILYYIIFVIGFLVNIVVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSY
.: :: ..:..:.: :.::: .. . . ...::..:::..:::.:.:::.: .:
CCDS54 VPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWI-HYVR
60 70 80 90 100 110
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..:.:: :::....: .... :::: ...::: .... .. : . :. .
CCDS54 GHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSI
120 130 140 150 160 170
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CCDS54 VTWGLAVLAALPEFIFYE--TEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLL
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.: :: :: : ::. : : . : . ... .:.: : :..: .:.. .
CCDS54 VMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIR-----LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSIL
240 250 260 270 280
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:.:: .::.. . ...... :.:: .: :::.::.. :: :. . :.
CCDS54 FGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYI
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350 360
pF1KB7 SMSCRKSSSLREMETFVS
CCDS54 PFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
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10 20 30 40 50
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CCDS99 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRVLPTFIISICFFG
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.: :. :. .: . .:. ::. :::..::... ::.:: ...: :: ..:.
CCDS99 LLGNLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCR
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:... . :.: :::... .: :::. ...:. :.:.. :: :.: .. : :.:
CCDS99 VINGVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIP
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CCDS99 TFLLRSIQAVPDLNITACILLLPHEA---WHFARIVELNILGFLLPLAAIVFFNYHILAS
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pF1KB7 LLKTNSYGKNRI--TRD-QVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIA
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CCDS99 LRTREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWED
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 VIDLALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSS
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CCDS99 FIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]