Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7156
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7156, 359 aa
1>>>pF1KB7156 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1138+/-0.00111; mu= 11.4897+/- 0.066
mean_var=128.7463+/-43.139, 0's: 0 Z-trim(104.0): 334 B-trim: 1036 in 2/46
Lambda= 0.113033
statistics sampled from 7040 (7701) to 7040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 2369 398.5 4.7e-111
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 2369 398.5 5e-111
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 2369 398.5 5e-111
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 759 135.9 5.1e-32
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 689 124.5 1.4e-28
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 689 124.5 1.4e-28
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 658 119.4 4.6e-27
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 652 118.5 9.5e-27
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 645 117.3 2e-26
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 632 115.2 9e-26
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 624 113.9 2.2e-25
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 614 112.3 6.8e-25
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 614 112.3 7.4e-25
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 612 111.9 8.3e-25
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 611 111.8 9.6e-25
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 611 111.8 9.7e-25
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 609 111.5 1.2e-24
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 605 110.8 2e-24
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 597 109.5 4.8e-24
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 596 109.3 5.1e-24
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 592 108.7 7.9e-24
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 592 108.7 8e-24
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 592 108.7 8e-24
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 592 108.7 8.3e-24
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 584 107.4 2.1e-23
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 580 106.7 3e-23
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 573 105.6 7.3e-23
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 572 105.4 7.7e-23
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 570 105.1 9.7e-23
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 568 104.8 1.2e-22
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 565 104.4 1.9e-22
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 561 103.7 2.9e-22
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 560 103.5 3.3e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 560 103.6 3.5e-22
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 559 103.4 3.6e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 559 103.4 4.2e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 556 102.9 5e-22
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 556 102.9 5e-22
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 556 102.9 5e-22
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 556 102.9 5.1e-22
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 556 102.9 5.2e-22
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 555 102.7 5.3e-22
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 555 102.7 5.4e-22
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 548 101.5 1.2e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 538 99.9 3.5e-21
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 530 98.6 8.7e-21
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 526 97.9 1.4e-20
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 525 97.8 1.6e-20
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 524 97.6 1.7e-20
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 524 97.6 1.8e-20
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369 Z-score: 2107.3 bits: 398.5 E(32554): 4.7e-111
Smith-Waterman score: 2369; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 FYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
310 320 330 340 350
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369 Z-score: 2106.8 bits: 398.5 E(32554): 5e-111
Smith-Waterman score: 2369; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:30-388)
10 20 30
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLTFTSECGCTTFGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAME
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 YRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCII
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 IWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLII
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGII
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLS
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB7 TKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369 Z-score: 2106.8 bits: 398.5 E(32554): 5e-111
Smith-Waterman score: 2369; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:36-394)
10 20 30
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HKSTDSPKAPQLRGGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVM
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 IPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAM
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 IIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 IRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNL
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB7 STKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
370 380 390
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
initn: 723 init1: 627 opt: 759 Z-score: 688.3 bits: 135.9 E(32554): 5.1e-32
Smith-Waterman score: 759; 36.5% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (31-337:47-355)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL-
:: :: ::::.:.. : .::.... .:
CCDS14 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN-IVVVTLFCCQKGP
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
: :.:....:::.::: .: ::::::.: ...: : :: .::. .. ...:..::.:..
CCDS14 KKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFI
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
::.:.::: ....:. :. ::. :. ..: .: :.:::.. :.: :: ....
CCDS14 TCMSVDRYQSVIYPFLSQ-RRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNA
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CAFHYESQN-STLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
: . . .. . :..: ::::::..:...: : : : : : :. ::. :..
CCDS14 CIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQV
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
.:. :.:: :.. :.: ...::::.: .:.: .:.. ..: :.:..: ... :.:.:
CCDS14 LKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVN
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPP---KAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPC
:..: :.:..:.. . .... .: ..: .: : :.:
CCDS14 PFLYCFVGNRFQQKLRSVFR-VPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMETFVS
320 330 340 350 360
pF1KB7 FEVE
>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa)
initn: 467 init1: 264 opt: 689 Z-score: 626.7 bits: 124.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 689; 33.8% identity (70.6% similar) in 320 aa overlap (5-318:11-321)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDD--CPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIV
:: :: .. : : : . ... ..: :: ..:.:: .:::::..:
CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNL
.. ..::....::::::.::: ::.:::.::. .: . : : ...::.... ..:.
CCDS27 YWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQ--WKFQTFMCKVVNSMYKMNF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRT--MLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVF
:. :.:. :.:.:::.::.. :... : .: .:..:. ::.::. .: :.. ..
CCDS27 YSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQI-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 FIENTNITVCAFHYESQNST-LPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQ
:...:..:.. : :..:: : .. : ::::..::... ::.: ..: ::
CCDS27 -KEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTL-----IQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 KNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI-IRDCRIADIVDTAMPITI
.: . .:. .... : .: .:.. . ..... .. : .: .. .: . .:
CCDS27 AKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 CIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSS
::.:..::::..: :.:..:.: ... ::
CCDS27 TIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa)
initn: 467 init1: 264 opt: 689 Z-score: 626.5 bits: 124.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 689; 33.8% identity (70.6% similar) in 320 aa overlap (5-318:23-333)
10 20 30 40
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDD--CPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFV
:: :: .. : : : . ... ..: :: ..:.
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340 350
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CCDS27 SLKLSSMLLETTSGALSL
360
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CCDS27 THHT-CSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSK-
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CCDS79 GPNMGKGGEQMHEKSIPYSQETLVVD
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CCDS52 ARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGA-WVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLL
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. :
CCDS52 ETADNDNASSFTM
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359 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]