Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7151
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7151, 350 aa
1>>>pF1KB7151 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7617+/-0.00123; mu= 13.5077+/- 0.073
mean_var=133.1650+/-40.621, 0's: 0 Z-trim(102.7): 281 B-trim: 967 in 2/47
Lambda= 0.111142
statistics sampled from 6647 (7075) to 6647 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 2280 377.9 6.7e-105
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 1610 270.5 1.5e-72
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 1341 227.4 1.4e-59
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 719 127.7 1.6e-29
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 719 127.7 1.6e-29
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 ( 356) 663 118.7 7.6e-27
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 628 113.1 4e-25
CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 ( 333) 625 112.5 5e-25
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 527 96.9 2.8e-20
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 524 96.4 3.9e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 524 96.4 4.1e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 524 96.4 4.2e-20
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 476 88.7 8.3e-18
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 473 88.3 1.2e-17
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 473 88.4 1.4e-17
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 471 87.9 1.5e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 469 87.6 1.9e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 469 87.6 1.9e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 469 87.6 1.9e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 469 87.6 1.9e-17
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 469 87.6 1.9e-17
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 469 87.7 2e-17
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 469 87.7 2e-17
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 468 87.4 2e-17
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 468 87.4 2e-17
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 469 87.7 2e-17
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 468 87.6 2.4e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 459 86.0 5.4e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 455 85.3 8.6e-17
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 452 84.9 1.3e-16
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 446 83.9 2.4e-16
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 446 84.0 2.5e-16
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 431 81.5 1.3e-15
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 427 80.7 1.7e-15
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 427 80.8 1.8e-15
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 426 80.7 2.2e-15
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 426 80.7 2.2e-15
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 415 78.9 6.8e-15
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 408 77.8 1.5e-14
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 396 75.9 6e-14
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 395 75.7 6.6e-14
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 392 75.2 9.2e-14
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 389 74.7 1.3e-13
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 388 74.6 1.4e-13
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 386 74.3 1.8e-13
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 384 73.9 2.2e-13
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 384 74.0 2.3e-13
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 384 74.0 2.3e-13
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 381 73.5 3.2e-13
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 380 73.3 3.3e-13
>>CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 2280 init1: 2280 opt: 2280 Z-score: 1996.7 bits: 377.9 E(32554): 6.7e-105
Smith-Waterman score: 2280; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACTFNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACTFNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSSRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLNPML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLNPML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 YVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
310 320 330 340 350
>>CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 1262 init1: 1262 opt: 1610 Z-score: 1416.1 bits: 270.5 E(32554): 1.5e-72
Smith-Waterman score: 1610; 68.9% identity (86.6% similar) in 350 aa overlap (1-349:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
:::: : : : . :::: : :. .:..::::::::::::::::::::::.:::
CCDS12 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
:: :::::.::: ::.::::..: ::: .:::::::::.. .::::::::::::..::
CCDS12 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACTFNF
::::.:::::::.::::::::: :::.:::..::.:::::.. .::: .: . :::::
CCDS12 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSSRPL
. : . :.::..::..:::.::::::.:::: ::::::. :::::.::::.:.:::::::
CCDS12 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 RVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELL-QGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLNPM
:::. :.:.::.:: :.:.:::..:: ..:.: : :: : : :. ::.:::::::::::
CCDS12 RVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSCLNPM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
::::.::::::::::.::.::::::.:::. :.:::.::. : ::.::::
CCDS12 LYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
310 320 330 340 350
>>CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 1107 init1: 1042 opt: 1341 Z-score: 1183.0 bits: 227.4 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 1341; 58.5% identity (81.8% similar) in 352 aa overlap (1-349:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
:::: :.: : . . ::. : :.. :: .::::.:::::::::::::::::.::.
CCDS12 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
:: :::::.::: :.. ::: :: :: .:::: ::::.: ...::::: ::.::..::
CCDS12 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACTFNF
::::.:::::.:.:::::.::::.:. : :.....:::: .: ::. .: . : :::
CCDS12 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSSRPL
. : . ::.:: ..: : :..::::::.::::..: ::.::.:::.. .:::::::
CCDS12 AFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 RVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRE-LLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLNPM
::.. :.:.::.:: ::...... .: ..: ::.: :: : . .. ::.::::::::::.
CCDS12 RVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLNPI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTE--DSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
::::::..:.::::..::.:::::::: ::.:::.: :.:. : :.::::
CCDS12 LYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETELQAM
310 320 330 340 350
>>CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (371 aa)
initn: 688 init1: 422 opt: 719 Z-score: 643.7 bits: 127.7 E(32554): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 719; 37.9% identity (67.5% similar) in 314 aa overlap (27-332:39-344)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMT
:. .:.... ::.::::::: .: :.:
CCDS41 SISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKMK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HTVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLI
.::. . .:::::::: :. ::. .. :: :: :: .::. .. :.: ::::.
CCDS41 KTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ALIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVAC
..:. :::. :: :::.::::.: :: . . ::.:..:. : .. :. . : ..:
CCDS41 TIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTA-NLHGKISC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 TFNFS---P----W-TNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKI
::: : : :.. . .. . :... . ::. :: .:. :... : :. :.
CCDS41 FNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVT--VTRFLCGFLVPVLIITACYLTIVCKL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 HKQGLIKSSRPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSA
... : :...:.... . .::::: ::... :. . . : .:. . ..:
CCDS41 QRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTA--MPGSVFSLGLPL--ATA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LAFFNSCLNPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQ
::. :::.::.:::::::::.. . :: . : ::.::. ..:
CCDS41 LAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKV-ALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSMNER
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB7 AK
CCDS41 TSMNERETGML
370
>>CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (373 aa)
initn: 688 init1: 422 opt: 719 Z-score: 643.7 bits: 127.7 E(32554): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 719; 37.9% identity (67.5% similar) in 314 aa overlap (27-332:41-346)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMT
:. .:.... ::.::::::: .: :.:
CCDS44 SISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKMK
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HTVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLI
.::. . .:::::::: :. ::. .. :: :: :: .::. .. :.: ::::.
CCDS44 KTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFLL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ALIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVAC
..:. :::. :: :::.::::.: :: . . ::.:..:. : .. :. . : ..:
CCDS44 TIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTA-NLHGKISC
140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 TFNFS---P----W-TNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKI
::: : : :.. . .. . :... . ::. :: .:. :... : :. :.
CCDS44 FNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVT--VTRFLCGFLVPVLIITACYLTIVCKL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 HKQGLIKSSRPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSA
... : :...:.... . .::::: ::... :. . . : .:. . ..:
CCDS44 QRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTA--MPGSVFSLGLPL--ATA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LAFFNSCLNPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQ
::. :::.::.:::::::::.. . :: . : ::.::. ..:
CCDS44 LAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKV-ALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSMNER
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB7 AK
CCDS44 TSMNERETGML
370
>>CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 (356 aa)
initn: 641 init1: 284 opt: 663 Z-score: 595.4 bits: 118.7 E(32554): 7.6e-27
Smith-Waterman score: 663; 35.0% identity (72.2% similar) in 306 aa overlap (28-332:45-347)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTH
.: .......:.::::::::.:.. :::..
CCDS12 QPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVFRMAR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIA
::.:. ...::.::: .. .::. : .. .: .: . ::. .:.: .. :.: :..
CCDS12 TVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYY-IVSRQWLLGEWACKLYITFVFLSYFASNCLLV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACT
.:..:::. ::.:::. :::::. :. . .: :..: : . .. :. .: . :
CCDS12 FISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALC-SAHLKFRTTRKWNGCTHCY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FNFSPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSS
. :. .. . :. .: . : .:..:: .:..:... :: .:. ..: ....
CCDS12 LAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLREGWVHAN
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYK-EIGIAVDVTSALAFFNSCL
:: :.: ...:::. :::..:: :. : : .:. .:. .. . .... ::. :: :
CCDS12 RPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWR-RVMLKEIYHPRMLLILQASFALGCVNSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 NPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
::.::::.:.::.:.....: ..: ::. :. .:
CCDS12 NPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
320 330 340 350
>>CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 (395 aa)
initn: 575 init1: 393 opt: 628 Z-score: 564.6 bits: 113.1 E(32554): 4e-25
Smith-Waterman score: 628; 33.8% identity (68.9% similar) in 305 aa overlap (24-328:30-331)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFR
..: . :. ... .::.. ::....:.: :
CCDS79 MSANATLKPLCPILEQMSRLQSHSNTSIRYIDHAAVLLHGLASLLGLVENGVILFVVGCR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MTHTVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVF
: .::.: :.::..:. ...:::: :.: : .: .::. .: .:.:.: :
CCDS79 MRQTVVTTWVLHLALSDLLASASLPFFTYFLAVGHSWELGTTFCKLHSSIFFLNMFASGF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LIALIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTV
:.. :.::::. :..:::.::::::. :.:: . :..:.: :.: .. :. : .
CCDS79 LLSAISLDRCLQVVRPVWAQNHRTVAAAHKVCLVLWALAVLNTVPYFVFRDTISRLDGRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ACTFNFSPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLI
: .: . : .: . . .. .. .:...: .:..:.: :.. .. .....:
CCDS79 MCYYNVLLLNPGP-DRDATCNSRQVALAVSKFLLAFLVPLAIIASSHAAVSLRLQHRGRR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KSSRPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNS
. .: .:... :.::: :::.::.: .:. . : . :. . .. ...::::::
CCDS79 RPGRFVRLVAAVVAAFALCWGPYHVFSLLEA-RAHAN-PGLRPLVWRGLPFVTSLAFFNS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CLNPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
::.:::. :. ..: ..: . :: .:..::
CCDS79 VANPVLYVLTCPDMLRKLRRSLRTVLESVLVDDSELGGAGSSRRRRTSSTARSASPLALC
300 310 320 330 340 350
CCDS79 SRPEEPRGPARLLGWLLGSCAASPQTGPLNRALSSTSS
360 370 380 390
>>CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 (333 aa)
initn: 637 init1: 389 opt: 625 Z-score: 562.8 bits: 112.5 E(32554): 5e-25
Smith-Waterman score: 625; 32.1% identity (67.2% similar) in 305 aa overlap (27-329:30-327)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTH
.: : . .. ..:.. ::: .:: :.: .
CCDS73 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNGLYLWVLRFKMKQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIA
::.:. ...: .. : : :::. . . . .:: :: ::: .....: :::...
CCDS73 TVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSLGMFTSVFFLS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACT
:.::: . .:::::.:.::: :.....: :. : :..: .: : . : :.:
CCDS73 AIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGKVTCQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FNFSPWTNDPKERINVAVAMLTVRGII-RFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKS
:.. :: ....... . : .: ::..:: :. :. : .:.:.....:.::
CCDS73 NNYAVSTNWESKEMQASRQWIHVACFISRFLLGFLLPFFIIIFCYERVASKVKERSLFKS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SRPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQV-VALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSC
:.:..:. . .::.:: ::.. .:. :. :.. :. . . : .. ::.
CCDS73 SKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTN-----QSLLLELTLILTVLTTS--FNTI
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LNPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
..: ::.:.:..:.. . ... : .: ...:::.
CCDS73 FSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
300 310 320 330
>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa)
initn: 617 init1: 394 opt: 527 Z-score: 477.6 bits: 96.9 E(32554): 2.8e-20
Smith-Waterman score: 620; 34.2% identity (67.4% similar) in 301 aa overlap (28-328:40-331)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTH
.. ... ..::::. ::..::: .::. .
CCDS23 EEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWFTGFKWKK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIA
::::. .::::.::: : ::... ::. ::::: .::: ...:.:.:::...
CCDS23 TVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMFASVFFLT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACT
.:.::. . ..::: .. :::.. . ::: :..: :. :.. :: .. :. :
CCDS23 VISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVEFNNHTL-CY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FNFSPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSS
::. .:: .... : ..::::. :. ... : . :..:.... ::
CCDS23 NNFQ--KHDP----DLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSILISS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLN
: . .. :..:: .::.::.. .. . .. . . :: . ...:::.:::::
CCDS23 RHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPL--STGLAFLNSCLN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
:.:::.... :. :. .. :. .: : :
CCDS23 PILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
310 320 330 340 350
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 436 init1: 308 opt: 524 Z-score: 474.9 bits: 96.4 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 571; 32.2% identity (64.7% similar) in 351 aa overlap (22-346:26-359)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMT
:.:. : : .... ::.:..::.::. : : :
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPT--LYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 -HTVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFL
.::... ::::.::.:: :::.. : :: .:::: .:::.. . :..::..::::
CCDS31 LKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IALIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVII-RVTTVPGKTGTV
.. ...:: . ..::. .. .::. .:: . : :..: : .::.:: : . .:. .
CCDS31 LTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNIT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ACTFNFSPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLI
.:.:.. .. .. ... :. . :.:: :. :. .:: :: ..: :
CCDS31 VCAFHYESQNS------TLPIGL----GLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB7 KSSRP-----LRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQ-GMYKEIGIA--VD--
....: .... .. ::. : :.:. ... . :.: :. .. :: ::
CCDS31 QKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDV-----LIQLGIIRDCRIADIVDTA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB7 --VTSALAFFNSCLNPMLYVFMGQDFRE---RLIHALP------ASLERALTEDSTQTSD
.: .:.::.::::..: :.:. :.. .:.. .: ..: .. : . ::
CCDS31 MPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSD
290 300 310 320 330 340
340 350
pF1KB7 TATNST---LPSAEVELQAK
....:: : :::
CCDS31 NVSSSTKKPAPCFEVE
350
350 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:19:09 2016 done: Fri Nov 4 05:19:09 2016
Total Scan time: 2.580 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]