Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7130
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7130, 316 aa
1>>>pF1KB7130 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9540+/-0.00126; mu= 12.5034+/- 0.074
mean_var=188.4373+/-65.300, 0's: 0 Z-trim(102.4): 401 B-trim: 399 in 1/47
Lambda= 0.093431
statistics sampled from 6430 (6922) to 6430 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 2096 295.9 2.7e-80
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 928 138.5 6.9e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 924 137.9 9.9e-33
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 912 136.3 3e-32
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 909 135.9 4e-32
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 907 135.6 4.8e-32
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 900 134.7 9.3e-32
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 898 134.4 1.1e-31
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 896 134.1 1.3e-31
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 895 134.0 1.5e-31
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 891 133.5 2.1e-31
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 890 133.3 2.3e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 886 132.9 3.6e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 885 132.6 3.7e-31
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 884 132.5 4.1e-31
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 880 132.0 6e-31
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 879 131.9 6.6e-31
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 877 131.6 7.8e-31
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 877 131.6 7.9e-31
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 875 131.3 9.5e-31
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 875 131.3 9.6e-31
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 875 131.3 9.6e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 873 131.0 1.1e-30
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 873 131.1 1.3e-30
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 872 130.9 1.3e-30
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 872 130.9 1.3e-30
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 870 130.6 1.5e-30
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 870 130.6 1.5e-30
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 870 130.7 1.6e-30
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 869 130.5 1.7e-30
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 869 130.5 1.7e-30
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 869 130.5 1.7e-30
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 869 130.5 1.7e-30
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 867 130.2 2e-30
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 867 130.2 2e-30
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 867 130.2 2e-30
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 867 130.2 2.1e-30
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 863 129.7 2.9e-30
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 862 129.6 3.2e-30
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 862 129.6 3.2e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 860 129.3 3.9e-30
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 860 129.3 3.9e-30
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 860 129.3 3.9e-30
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 859 129.1 4.2e-30
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 858 129.0 4.6e-30
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 857 128.9 5.1e-30
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 857 128.9 5.1e-30
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 857 128.9 5.1e-30
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 856 128.7 5.7e-30
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 855 128.6 6.2e-30
>>CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 (316 aa)
initn: 2096 init1: 2096 opt: 2096 Z-score: 1554.9 bits: 295.9 E(32554): 2.7e-80
Smith-Waterman score: 2096; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYDVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMMAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 KKIFGRKLFKDWQQHH
::::::::::::::::
CCDS46 KKIFGRKLFKDWQQHH
310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 922 init1: 643 opt: 928 Z-score: 704.0 bits: 138.5 E(32554): 6.9e-33
Smith-Waterman score: 928; 43.6% identity (78.3% similar) in 314 aa overlap (2-313:4-309)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
.: :...::..::.....::: ..: ::.. :. .: :: :.. .: .:.::.:::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
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CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
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CCDS46 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMG--AFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKA
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CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNE--LALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTIL-RIQSSEGRRKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LSTCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEV
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CCDS46 FSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 MMALKKIFGRKLFKDWQQHH
:.: : : : ::
CCDS46 KEAVKTI-GSK----WQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 947 init1: 623 opt: 924 Z-score: 701.1 bits: 137.9 E(32554): 9.9e-33
Smith-Waterman score: 924; 45.8% identity (77.4% similar) in 310 aa overlap (3-309:11-316)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQ
: : ..:::::::. .:: .:..::.::. :..:: ...:.. ..
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
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pF1KB7 LHSPMYFFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFF-HFLGSTEAI
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLG-TECF
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LLAIMAFDRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQK
:::.::.::..:: ::: : :... ..:.:: :...: . : .:. :: .::::::..
CCDS31 LLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNR
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pF1KB7 LNHFFYDVKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLS--CFYVIGFLLFKNRS
.:::. :. :::.:.:::: .: .. .. : .. ...:.: :... ..: :
CCDS31 INHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIA---VLKMPS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CRILHKALSTCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIY
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CCDS31 LEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIY
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KB7 TLRNKEVMMALKKIFGRKLFKDWQQHH
.:.::.: :::::. ....
CCDS31 SLKNKDVKKALKKILWKHIL
300 310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 879 init1: 637 opt: 912 Z-score: 692.3 bits: 136.3 E(32554): 3e-32
Smith-Waterman score: 912; 45.2% identity (76.4% similar) in 305 aa overlap (3-307:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
: . . :.::::. : ::. :: .: .:.....:: :.:.:. .:.::. ::
CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
:.::::: ::. :::.: :..::.:. . .::: ::.::: ::::.:. . .::..::.
CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
::..:: .::.::.::: :: :: ::.:. .:...... ..: .: ::: .::..:. :
CCDS31 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALS
: :..:::.::.. . :. .: ... :.. : : :. .......: . ::::
CCDS31 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGS--YTALLVMLRSHSREGRSKALS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMM
:::::. :: :.. : ..: :: . : :. ....:. :::.::: :::::::::.:
CCDS31 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPM--DKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 ALKKIFGRKLFKDWQQHH
:.::.. ::
CCDS31 AMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
300 310
>>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa)
initn: 856 init1: 622 opt: 909 Z-score: 690.2 bits: 135.9 E(32554): 4e-32
Smith-Waterman score: 909; 43.0% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (3-308:5-306)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
: .::.::.::::.. ::: ::: .: ..:. ...::. :.. :...:.::::::
CCDS32 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
:.: ::: .:.: .: . ::.... . ....::: ::.::. :.:.. .:: ::: :.:
CCDS32 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
::..:::.::.:. ...::::. :..:.:... .... . ... : ::: ... :: :
CCDS32 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKPLLELACSDT-LLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKAL
. ...::: :: .:. ...: ..: :... :.. . : ::: .. :..: : :::
CCDS32 LPVVFQLACVDTYVLGLFMIS-TSGIIALSCFIVLFNS--YVIVLVTVKHHSSRGSSKAL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 STCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVM
:::..::.:: ::.:: : :. : : :.. :.:....:. ::.:::.::::::.::
CCDS32 STCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLS--SFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 MALKKIFGRKLFKDWQQHH
.:..:. .: :
CCDS32 IAMRKLKNRFLNFNKAMPS
300 310
>>CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 983 init1: 611 opt: 907 Z-score: 688.8 bits: 135.6 E(32554): 4.8e-32
Smith-Waterman score: 907; 42.4% identity (75.9% similar) in 311 aa overlap (2-312:4-313)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
:: ....::::::: : : :: .:: .:: ...:: :.... :. .::.:::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
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