Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7129
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7129, 316 aa
1>>>pF1KB7129 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1816+/-0.00107; mu= 10.7420+/- 0.062
mean_var=183.0998+/-64.013, 0's: 0 Z-trim(104.7): 404 B-trim: 413 in 1/49
Lambda= 0.094783
statistics sampled from 7514 (8021) to 7514 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 2.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 2089 298.8 3.7e-81
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1793 258.3 5.6e-69
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1245 183.4 2e-46
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1220 179.9 2.2e-45
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1205 177.9 9e-45
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1186 175.4 5.9e-44
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1183 174.9 7.3e-44
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1172 173.4 2.1e-43
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1171 173.3 2.3e-43
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1157 171.3 8.6e-43
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1157 171.3 8.7e-43
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1147 170.0 2.2e-42
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1127 167.2 1.5e-41
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1123 166.7 2.1e-41
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1119 166.1 3.1e-41
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1098 163.3 2.3e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 970 145.8 4.3e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 960 144.4 1.1e-34
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 956 143.9 1.6e-34
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 953 143.4 2.2e-34
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 949 142.9 3.2e-34
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 948 142.8 3.6e-34
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 939 141.6 8.5e-34
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 938 141.4 8.9e-34
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 937 141.2 9.7e-34
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 937 141.3 9.8e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 935 141.0 1.2e-33
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 933 140.7 1.4e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 929 140.1 2.1e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 929 140.1 2.1e-33
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 920 138.9 4.9e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 912 137.8 1e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 909 137.4 1.4e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 909 137.5 1.4e-32
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 907 137.2 1.7e-32
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 905 136.9 2e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 904 136.8 2.3e-32
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 898 135.9 4e-32
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 897 135.8 4.3e-32
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 888 134.5 1e-31
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 884 134.0 1.5e-31
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 881 133.6 2e-31
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 878 133.2 2.6e-31
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 878 133.2 2.6e-31
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 878 133.2 2.7e-31
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 877 133.1 2.9e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 875 132.8 3.4e-31
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 875 132.8 3.7e-31
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 874 132.6 3.8e-31
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 874 132.6 3.8e-31
>>CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 (316 aa)
initn: 2089 init1: 2089 opt: 2089 Z-score: 1570.5 bits: 298.8 E(32554): 3.7e-81
Smith-Waterman score: 2089; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRALR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 RLLGKERDSRESWRAA
::::::::::::::::
CCDS46 RLLGKERDSRESWRAA
310
>>CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1793 init1: 1793 opt: 1793 Z-score: 1351.8 bits: 258.3 E(32554): 5.6e-69
Smith-Waterman score: 1793; 87.9% identity (96.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMYFF
:::::: :::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.: :.::::::::
CCDS34 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::::::
CCDS34 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCEVP
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CCDS34 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGTCS
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CCDS34 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRALR
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::. ::.:
CCDS34 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 RLLGKERDSRESWRAA
::::::
CCDS34 RLLGKEMGLTQS
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1243 init1: 1243 opt: 1245 Z-score: 946.9 bits: 183.4 E(32554): 2e-46
Smith-Waterman score: 1245; 60.9% identity (85.5% similar) in 304 aa overlap (3-305:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMY
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CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAF
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CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCE
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CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VPSLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGT
::.:..:.: ::. ::. : : ::.:::.: .:: ::: .::::::.:. : .:::.:
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRA
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CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LRRLL-GKERDSRESWRAA
::.:: ::
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1239 init1: 1220 opt: 1220 Z-score: 928.4 bits: 179.9 E(32554): 2.2e-45
Smith-Waterman score: 1220; 56.4% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (2-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHS
:: :: :.:.:::. : :: ..::::. ::.::.:: .::.:: : .::.
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PMYFFLSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTV
:::::::.:::::::.::: .::.:::::::.::::. :: .::.. :.::::::.::.:
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDF
:..:::.:::.::::....:::.: :: ..:: ....: ... :. .:.: :.:.: :
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LCEVPSLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKA
.::::.:.:::: :: ::. : ..: :::..:: :::.:::: ..:.::..:.:. .:.
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEI
::::..:: .:.::. .. .:::: . .: .:::..:::.: :::::::.:::::: .
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 KRALRRLLGKERDSRESWRAA
. :..::.: :
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1205 init1: 1205 opt: 1205 Z-score: 917.3 bits: 177.9 E(32554): 9e-45
Smith-Waterman score: 1205; 59.3% identity (81.8% similar) in 307 aa overlap (2-308:4-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMY
::.:: .::.:.:.:.:: :: .:.... ::::::.::. ::::: : :::.:::
CCDS10 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAF
::::.:: ::: :.:: :::::.::::: ::::. :: .::..:: ::.::::::.::::
CCDS10 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCE
:::::::.::.:..:..:.::: :: .: . .: .:..:. ::.::.: :.... ::::
CCDS10 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIACLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VPSLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGT
::..:.:.::::: :. : ..:..::::.:. :: :::::.: :: . ::::.:
CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRA
: ::: :: :::.:. :: : . : .:::..:::.. :: .:::.::::: :.: :
CCDS10 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 LRRLLGKERDSRESWRAA
::::::: :.
CCDS10 LRRLLGKGREVG
310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1186 init1: 1186 opt: 1186 Z-score: 902.6 bits: 175.4 E(32554): 5.9e-44
Smith-Waterman score: 1186; 55.9% identity (84.2% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMY
::.: :. :.:: ::..: :: ::. . ::.::. :: :::.: . .::.:::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
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CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
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CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
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CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
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pF1KB7 EVPSLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFG
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CCDS43 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
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CCDS43 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
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pF1KB7 ALRRLLGKERDSRESWRAA
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CCDS43 AAKRLLGWEWGK
310
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CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]