FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7125, 312 aa
1>>>pF1KB7125 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4066+/-0.00135; mu= 14.8548+/- 0.079
mean_var=140.4433+/-49.169, 0's: 0 Z-trim(100.5): 370 B-trim: 787 in 2/45
Lambda= 0.108224
statistics sampled from 5658 (6122) to 5658 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 832 142.6 3.9e-34
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 823 141.1 1e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 822 141.1 1.2e-33
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 785 135.3 6.7e-32
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CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 674 117.9 1e-26
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 664 116.3 3.1e-26
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 629 110.9 1.4e-24
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 621 109.6 3.3e-24
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 596 105.7 4.9e-23
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 547 98.1 9.7e-21
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 539 96.8 2.3e-20
>>CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (99.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHISPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS
::::::::::::
CCDS31 QIRIHVVKMFCS
310
>>CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 (316 aa)
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Smith-Waterman score: 1610; 75.2% identity (91.3% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
: : .:.:::.. :.:::::::::::::::: :.:::..:::::.: ::: : ::: :
CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
.::::.::.:::::: . :.:::::::::..::: ::.::.:::.::..:.::::::.::
CCDS31 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
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pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
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CCDS31 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
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pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
:::::::::::. ...:::::::::::.. :::. ::::::.:::::::.::::::::::
CCDS31 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::::::::::.:::.::
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
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310
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS
::: :.::.:
CCDS31 QIRDHIVKVFFFKKVT
310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
: . : : . :: . :.::::::... :::.::::.:.::.::: .: .::.. :::.:
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
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pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
.. ::.::..::..:... .::::::::.:. : :..:: ::.:::.. .::..::::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
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: : ::::: ::... :.:...: :: : .:: :.: : ..:: :. : . :: :.
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pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
:::::....:. :....: :::: . ... ::.: :.:::..:. .::::: .:::.:.
CCDS31 YCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLV-FDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKS
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
..:: .:.::.: :: :.:::.::::: ..: :::::....:..:::.:::..::..:
CCDS31 LSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS
:: : :..
CCDS31 QIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
300 310 320
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
: : .:. . : :.::::..: ::..:::..:..::.:: :: .:. : .::.:
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
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pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
.: ::.::. ::... :: .:: : ::::.. .: :: ::.::.: ::. :.:::.:. :
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
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pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
:::::::::::::...:.:. .. ..:: . ::...:. : : : . . . ... :.
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKL-LPYCRGNILPHT
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pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
::.::...::. .::.:: ::::.::. . :::. :: :: .:. .: : . .:: ::
CCDS44 YCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKA
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250 260 270 280 290
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHI-PPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKT
:::: ::::... : ::::::.:::: :: :: ::. ..::::.:: .::.:::.::
CCDS44 FNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 TQIRIHVVKMFCS
::: :....
CCDS44 KQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
300 310 320
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1078; 50.6% identity (80.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERS
:: :: : . :: . :.::::::.:. :::.:: .::.:..::. :: .:..:.:
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LHEPLYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGI
::::.: ::.:: . :..:... .::::::::::. :: : .:: .:.::: . ..:: .
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 LVAMALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTV
:::::.:::.::: :::.. :.: ... :. ..:::. .:.: ::.. :. : .
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVP-LVFLLLRLPFCGHRI
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pF1KB7 ISHSYCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEA
: :.:::::.:..:: :...:: .:: ... .:. .: :::..:. .:: ::. ::
CCDS31 IPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLG-NISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEA
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 RFKAFNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYG
:.::.::: .:: :.: :. :::::.::::: .:: ::::.....:..::: :::..::
CCDS31 RLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 AKTTQIRIHVVKMFCS
..: ::: .:...:
CCDS31 VRTKQIRERVLRIFLKTNH
300 310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1077; 49.7% identity (80.1% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]