Result of FASTA (omim) for
pF1KB7122
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7122, 309 aa
1>>>pF1KB7122 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1593+/-0.000563; mu= 16.6142+/- 0.034
mean_var=115.7019+/-32.301, 0's: 0 Z-trim(107.5): 391 B-trim: 978 in 1/47
Lambda= 0.119235
statistics sampled from 15027 (15567) to 15027 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 5.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1269 230.2 4.2e-60
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 868 161.2 2.4e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 868 161.2 2.5e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 823 153.5 5.3e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 804 150.2 5e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 801 149.7 7.2e-36
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 801 149.7 7.3e-36
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 801 149.7 7.3e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 801 149.7 7.3e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 800 149.5 8.2e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 786 147.1 4.4e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 784 146.8 5.5e-35
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 783 146.6 6.1e-35
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 775 145.2 1.6e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 748 140.6 4e-33
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 745 140.0 5.7e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 737 138.7 1.5e-32
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 729 137.3 3.9e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 712 134.3 2.9e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 570 110.0 6.7e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 481 94.6 2.7e-19
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 223 50.3 6.4e-06
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 222 50.3 9e-06
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 222 50.4 9.6e-06
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 217 49.4 1.6e-05
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 213 48.6 2.1e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 206 47.3 4.8e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 199 46.1 0.00011
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 199 46.3 0.00014
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 198 46.1 0.00014
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 198 46.2 0.00016
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 198 46.3 0.00017
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 195 45.6 0.00022
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 193 45.2 0.00026
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 195 45.8 0.00026
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1269 init1: 1269 opt: 1269 Z-score: 1200.1 bits: 230.2 E(85289): 4.2e-60
Smith-Waterman score: 1269; 61.2% identity (87.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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pF1KB7 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KB7 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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pF1KB7 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
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pF1KB7 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 MKWEALAGK
NP_001 SRKDISGDK
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 868; 43.7% identity (77.0% similar) in 300 aa overlap (3-299:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
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pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
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pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
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pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYSSKGRHKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDK-AMA-VSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
.::.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 868; 43.7% identity (77.0% similar) in 300 aa overlap (3-299:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
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pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYSSKGRHKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDK-AMA-VSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
.::.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 828 init1: 635 opt: 868 Z-score: 827.1 bits: 161.2 E(85289): 2.5e-39
Smith-Waterman score: 868; 43.7% identity (77.0% similar) in 300 aa overlap (3-299:15-314)
10 20 30 40
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTII
::..:.::.::::... . ... . :: ::.:::: ::::....
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KB7 TSQSLRSPMYFFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGV
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KB7 PNIIDHFICDLFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYS
: : ::.::. :: :.:.:::. ... ..... .. :: ..::: : :. :: :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KB7 SKGRHKALSTCSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDK-AMA-VSDSIITPMLNPLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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290 300
pF1KB7 TLRNAEVKSAMKKLWMKWEALAGK
.::: .:.:.::.
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 891 init1: 561 opt: 823 Z-score: 785.4 bits: 153.5 E(85289): 5.3e-37
Smith-Waterman score: 823; 41.9% identity (76.2% similar) in 298 aa overlap (2-296:4-301)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
.: ...:::.::::...::: :. :::.:. ::: :: ... : ...:..:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
:::. ::..:: :....::...: ::.. :::. ::. :.. .. . ::. .:::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
:::.:::.:: :..::: : :..::...:... :.. . .. :: :.: ::.::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKS-YSSKGRHKALST
:. :.:.:: . . .. .:. :. .:....::. .: :. : .:..:::.:.::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPI--DKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
:.::::...::.. ::. :.:: .. . ::. .: ... ::::::::.::. :::.:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 694 init1: 600 opt: 804 Z-score: 767.7 bits: 150.2 E(85289): 5e-36
Smith-Waterman score: 804; 41.2% identity (76.4% similar) in 301 aa overlap (2-299:4-304)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
:: .....:.::::... :: .. ..:: ::..::: ::::.... ... :..:::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSS-KGRHKALST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVS--DSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
...:
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 801; 41.3% identity (73.0% similar) in 300 aa overlap (3-299:6-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YFFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KB7 YDRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFIC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KB7 DLFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYSSKGRHKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KB7 TCSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVV--THPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKS
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300
pF1KB7 AMKKLWMKWEALAGK
:.:.:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 794 init1: 570 opt: 801 Z-score: 764.9 bits: 149.7 E(85289): 7.3e-36
Smith-Waterman score: 801; 41.8% identity (72.3% similar) in 311 aa overlap (2-309:4-314)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYSSKGRHKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPI--DKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 794 init1: 570 opt: 801 Z-score: 764.9 bits: 149.7 E(85289): 7.3e-36
Smith-Waterman score: 801; 41.8% identity (72.3% similar) in 311 aa overlap (2-309:4-314)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYSSKGRHKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPI--DKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
.:: :. .:..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 794 init1: 570 opt: 801 Z-score: 764.9 bits: 149.7 E(85289): 7.3e-36
Smith-Waterman score: 801; 41.8% identity (72.3% similar) in 311 aa overlap (2-309:4-314)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMY
.::. :.:::::::. . . . ..::::::.::: : :::. : .. :..:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAY
:::: :::.:: ... :.:.... :.. .: ...: .::: .::. ..::.::::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICD
:::::.: :.:. :: .: .. .::.::. . .: . .:.:.: ..:::. :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCS-LKSYSSKGRHKALST
:. .. :::.:: . . ..: .. .. : ... :: :. . :: : .::.::. :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPI--DKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSA
:.::::::.: . :: :..: . . .: ..: .:.::::::.::.::: :::.:
NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 MKKLWMKWEALAGK
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]