FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7122, 309 aa
1>>>pF1KB7122 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4231+/-0.00142; mu= 9.4444+/- 0.081
mean_var=196.0635+/-69.469, 0's: 0 Z-trim(102.0): 433 B-trim: 394 in 1/47
Lambda= 0.091596
statistics sampled from 6234 (6765) to 6234 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1283 183.2 2.7e-46
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CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1122 161.8 6.1e-40
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CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1041 151.1 1e-36
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CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 989 144.2 1.2e-34
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 989 144.2 1.2e-34
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 989 144.2 1.2e-34
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 989 144.2 1.2e-34
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CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 979 143.0 3.2e-34
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 974 142.2 4.7e-34
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CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 931 136.6 2.4e-32
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 926 135.9 3.9e-32
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 914 134.3 1.2e-31
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 891 131.3 9.5e-31
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 879 129.7 2.9e-30
>>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 1471.1 bits: 280.3 E(32554): 1.3e-75
Smith-Waterman score: 2019; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 MKWEALAGK
:::::::::
CCDS31 MKWEALAGK
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
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Smith-Waterman score: 1314; 60.5% identity (86.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:31-339)
10 20 30
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFL
:.:.::::::::::::.: : :.. ..::
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 VMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTI
..:..:.. ::::.:::..:::: :::::::. ::..:...:.. :::.::: ::.. ::
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGG
:..::..:::..:.:.:. .:::.:::::::.::::::: : :. ::: ::. .::.::
CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFL
:.:...:.::.::.::::::.::.:.:::. :: ::::.:.. :: . :.: .:.. :.
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMA
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CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KB7 VSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLWMKWEALAGK
: ..::::::::::::.:::.::::.::: : .::::
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
>>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 (309 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
: :.:::::::::::::: .. ::. .:: :.:. ... :.:::::: .: :::::::::
CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
:..::..:. .::: .::.:.:.: .. :: ..::.::.: :::: :: .:::::::::.
CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
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pF1KB7 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
::::::::::: .:. .:: :.:: .:::::.:: ::.::. :.::::::.::::.:::.
CCDS31 YVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
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CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
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pF1KB7 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
:.:::.: :.::::.:::: .: :::::.:: ..:: ::::::::::::..:.:..::
CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 MKWEALAGK
CCDS31 SRKAISSVK
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
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Smith-Waterman score: 1283; 60.1% identity (86.1% similar) in 303 aa overlap (1-302:55-357)
10 20 30
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFL
:.::. ::::.::::..: .. .: .:::
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KB7 VMYVATVLENLLIVVTIITSQSLR-SPMYFFLTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTT
.:.::: :.::::::..: .: ::::::: :::.::. ::::..::.:::.: . :
CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 ISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDRYVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVG
::..::. :::.::::.:: .:.::.:::::::::::::::. ::. :.: ...: ::.:
CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 GFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLFQLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIF
:..:.:::.:: .:.::::::.:.::.:::. :: ::::::::.::.:..:::..:. :
CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSSHLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAM
.:..::.::: ::...::.:: ::::::.::..::.::::::::.: :: . .::
CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300
pF1KB7 AVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLWMKWEALAGK
:. :..:.:::::::.:: :::.::...: .
CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
330 340 350 360 370
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1269; 61.2% identity (87.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
:::.::.:::.::::::: .. ::. .::.:.:. ::. .:::::: .: :: ::::.
CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
:..::..:. .::: .:..:. .: . .: ..::.::.: ::::::. :::::::::.
CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
:::::::::: ::. :: :..: .:.:::.:: ::.::..:.::::::.::::.:::
CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
::.:::::::.: :... :::..:. : .:..::.::::::...: ..:::::::: :
CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
:.:::.::::::::.::::..: :::::.:. ..::::::::::::.::..:.:..::
CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 MKWEALAGK
CCDS73 SRKDISGDK
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1292 init1: 1266 opt: 1266 Z-score: 933.3 bits: 180.8 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1266; 62.6% identity (84.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
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CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
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CCDS31 RRDLISSST
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]