Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7097
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7097, 194 aa
1>>>pF1KB7097 194 - 194 aa - 194 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4254+/-0.000899; mu= 12.1587+/- 0.053
mean_var=88.8307+/-24.169, 0's: 0 Z-trim(106.3): 351 B-trim: 991 in 2/47
Lambda= 0.136079
statistics sampled from 8534 (8926) to 8534 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1182 242.1 2.5e-64
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1182 242.1 2.5e-64
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1131 232.1 2.6e-61
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1082 222.5 2.1e-58
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1010 208.4 3.7e-54
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 980 202.5 2.2e-52
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 889 184.6 5.2e-47
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 834 173.8 9.3e-44
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 825 172.0 3.2e-43
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 692 146.0 2.6e-35
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 685 144.6 6.1e-35
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 685 144.6 6.1e-35
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 685 144.6 6.2e-35
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 677 143.0 1.8e-34
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 673 142.2 3.1e-34
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 673 142.2 3.1e-34
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 671 141.8 4e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 669 141.4 5.4e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 667 141.0 6.9e-34
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 657 139.1 2.7e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 653 138.3 4.6e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 653 138.3 4.7e-33
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 652 138.1 5.3e-33
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 650 137.7 7.1e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 650 137.7 7.3e-33
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 650 137.7 7.6e-33
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 643 136.3 1.8e-32
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 642 136.1 2.1e-32
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 639 135.5 3.1e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 638 135.4 4e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 637 135.1 4.2e-32
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 636 134.9 4.7e-32
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 636 134.9 4.8e-32
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 629 133.6 1.2e-31
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 625 132.8 2.1e-31
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 625 132.8 2.1e-31
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 625 132.8 2.1e-31
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 625 132.8 2.3e-31
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 624 132.6 2.4e-31
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 623 132.4 2.8e-31
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 623 132.4 2.8e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 622 132.2 3.2e-31
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 621 132.0 3.6e-31
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 620 131.8 4.1e-31
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 620 131.8 4.2e-31
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 618 131.4 5.5e-31
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 617 131.2 6.2e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 615 130.8 8.3e-31
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 615 130.8 8.4e-31
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 614 130.6 9.2e-31
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1182 init1: 1182 opt: 1182 Z-score: 1268.3 bits: 242.1 E(32554): 2.5e-64
Smith-Waterman score: 1182; 89.7% identity (95.4% similar) in 194 aa overlap (1-194:117-310)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
::::::::::::::: .::::.::::::.:
CCDS56 PAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYDRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
:::::::::..:: ::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.:
CCDS56 SWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS56 VGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHP
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
::::::.::::: ::: ::::::.::: :::::::::: :::::
CCDS56 EEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGALRRALGKESHS
270 280 290 300 310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1182 init1: 1182 opt: 1182 Z-score: 1268.3 bits: 242.1 E(32554): 2.5e-64
Smith-Waterman score: 1182; 89.7% identity (95.4% similar) in 194 aa overlap (1-194:117-310)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
::::::::::::::: .::::.::::::.:
CCDS43 PAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYDRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
:::::::::..:: ::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.:
CCDS43 SWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS43 VGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHP
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
::::::.::::: ::: ::::::.::: :::::::::: :::::
CCDS43 EEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGALRRALGKESHS
270 280 290 300 310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1190 init1: 1128 opt: 1131 Z-score: 1214.1 bits: 232.1 E(32554): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 1131; 86.4% identity (95.3% similar) in 191 aa overlap (1-191:118-308)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
::::::.::::::.: .:: : :: .::.:
CCDS43 KRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSYDRYMAICHPLQYSVIMRWGVCTVLAVT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
::.::::::.::: ::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::: .:::
CCDS43 SWACGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCEILSVLKLACADTWLNQVVIFAASVFIL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS43 VGPLCLVLVSYSRILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCMVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
::::::: :::: ::::::::::.:::.::::::.:.: :.
CCDS43 EEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGALKRVLWKQRSK
270 280 290 300 310
>>CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1082 init1: 1082 opt: 1082 Z-score: 1162.2 bits: 222.5 E(32554): 2.1e-58
Smith-Waterman score: 1082; 83.8% identity (92.7% similar) in 191 aa overlap (1-191:117-307)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
::::::. ::::::: .:.:.:: .::..
CCDS43 QESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYDRYADICHPLRYNSLMSWRVCTVLAVA
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
::. . :::.: . ::: ::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS43 SWVFSFLLALVPLVLILSLPFCGPHEINHFFCEILSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFIL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS43 VGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHP
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
::::::: :::: ::::::::::.:::.:::::::::: ::
CCDS43 EEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGALRRALRKERLT
270 280 290 300 310
>>CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1058 init1: 1001 opt: 1010 Z-score: 1085.8 bits: 208.4 E(32554): 3.7e-54
Smith-Waterman score: 1010; 76.4% identity (91.1% similar) in 191 aa overlap (1-191:117-307)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
: :::::::::::.: .::.:.:: .:: :
CCDS43 HKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYDRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLAST
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
: . :::.::..::::::::::..::::::.:.::..:::::: :::::.::. :::
CCDS43 CWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQIMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFIL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS43 VGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHS
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
.:..:.: :::: :::.::::::.:::.::::::.:.: :.
CCDS43 QERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGALKRVLWKQRSM
270 280 290 300 310
>>CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 (318 aa)
initn: 1003 init1: 980 opt: 980 Z-score: 1053.8 bits: 202.5 E(32554): 2.2e-52
Smith-Waterman score: 980; 71.2% identity (90.6% similar) in 191 aa overlap (1-191:117-307)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
::::::::::::..: .::.:.:: :..:
CCDS43 QKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYDRYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
::.:: :..:: :.:::::::::..::.::::::::.:::::::.:::::::.:.:.:
CCDS43 SWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEILSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
:::: :.:::: :::.:::.::. ::: :::::::::::::::::: :.:.::.: : .
CCDS43 VGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTCSSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQR
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
:::.:.: ::.: ::::::::::.:::...::::.::: ..
CCDS43 EEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGALHRALQRKRSMRTVYGLCL
270 280 290 300 310
>>CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1000 init1: 889 opt: 889 Z-score: 957.4 bits: 184.6 E(32554): 5.2e-47
Smith-Waterman score: 889; 65.5% identity (85.6% similar) in 194 aa overlap (1-194:117-310)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
::::::::::::::: :::::::::::.:
CCDS43 PAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYDRYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 SWTCGSLLAMVHVSLILRLPFCGPREINHFFCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACMFIL
:: : :::.::. :.: : ::::...:::::::..::.:::::: .:.:...:. . .:
CCDS43 SWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEIMAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VGPLCLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSRHP
:: . ...:: ::: :::.:::::: .:::: :::::::::::.:.::.::. :. . :
CCDS43 VGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSICSSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESP
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190
pF1KB7 EEQQKVLFLFYSSFNPMLNPLIYNLRNVEVKGALRRALCKESHS
.::.: :.::.: ::::::::::.::: ::.:.:.: : :. :
CCDS43 KEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTLKRMLEKKRTS
270 280 290 300 310
>>CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 884 init1: 834 opt: 834 Z-score: 899.0 bits: 173.8 E(32554): 9.3e-44
Smith-Waterman score: 834; 63.8% identity (85.1% similar) in 188 aa overlap (1-188:117-304)
10 20 30
pF1KB7 MSYDRYVAICHPLRYFIIMTWKVCITLAIT
:::: ::::::::::. ::::.::::::.:
CCDS55 PAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYDLYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
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CCDS51 KEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTLKRVLGVERAL
270 280 290 300 310
>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 (369 aa)
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Smith-Waterman score: 692; 52.7% identity (80.3% similar) in 188 aa overlap (1-188:168-355)
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start: Fri Nov 4 04:41:05 2016 done: Fri Nov 4 04:41:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]