Result of FASTA (omim) for
pF1KB7058
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7058, 613 aa
1>>>pF1KB7058 613 - 613 aa - 613 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2996+/-0.000408; mu= 8.6050+/- 0.026
mean_var=279.8872+/-60.169, 0's: 0 Z-trim(120.6): 229 B-trim: 1909 in 1/54
Lambda= 0.076662
statistics sampled from 35680 (35991) to 35680 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 12.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005293 (OMIM: 602583) prosaposin receptor GPR37 ( 613) 4191 477.3 6.8e-134
NP_001948 (OMIM: 131243,157300,616367) endothelin- ( 427) 491 67.9 8.3e-11
NP_005305 (OMIM: 305670) gastrin-releasing peptide ( 384) 431 61.2 7.7e-09
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 407 58.5 4.9e-08
NP_001188326 (OMIM: 131244,277580,600155,600501) e ( 532) 401 58.0 9.5e-08
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 388 56.4 2.1e-07
NP_000106 (OMIM: 131244,277580,600155,600501) endo ( 442) 383 55.9 3.3e-07
NP_001116131 (OMIM: 131244,277580,600155,600501) e ( 442) 383 55.9 3.3e-07
XP_011530312 (OMIM: 162641) PREDICTED: neuropeptid ( 384) 354 52.7 2.8e-06
XP_005263088 (OMIM: 162641) PREDICTED: neuropeptid ( 384) 354 52.7 2.8e-06
NP_000900 (OMIM: 162641) neuropeptide Y receptor t ( 384) 354 52.7 2.8e-06
NP_003982 (OMIM: 131244,277580,600155,600501) endo ( 436) 333 50.4 1.5e-05
XP_016871876 (OMIM: 601790) PREDICTED: neuropeptid ( 375) 322 49.1 3.2e-05
XP_016871875 (OMIM: 601790) PREDICTED: neuropeptid ( 375) 322 49.1 3.2e-05
NP_005963 (OMIM: 601790) neuropeptide Y receptor t ( 375) 322 49.1 3.2e-05
XP_011538239 (OMIM: 601790) PREDICTED: neuropeptid ( 375) 322 49.1 3.2e-05
NP_001265723 (OMIM: 601790) neuropeptide Y recepto ( 375) 322 49.1 3.2e-05
XP_011538238 (OMIM: 601790) PREDICTED: neuropeptid ( 375) 322 49.1 3.2e-05
NP_937822 (OMIM: 606925) pyroglutamylated RFamide ( 431) 288 45.4 0.00048
NP_071429 (OMIM: 607448) neuropeptide FF receptor ( 430) 282 44.8 0.00076
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 275 44.0 0.0013
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 275 44.0 0.0013
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 275 44.1 0.0015
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 272 43.7 0.0017
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 272 43.7 0.0017
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 260 42.3 0.0038
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 260 42.3 0.0041
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 260 42.3 0.0041
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 260 42.3 0.0041
XP_016864182 (OMIM: 606925) PREDICTED: pyroglutamy ( 190) 252 41.0 0.0045
NP_001159527 (OMIM: 131243,157300,616367) endothel ( 318) 254 41.5 0.0053
>>NP_005293 (OMIM: 602583) prosaposin receptor GPR37 pre (613 aa)
initn: 4191 init1: 4191 opt: 4191 Z-score: 2524.8 bits: 477.3 E(85289): 6.8e-134
Smith-Waterman score: 4191; 100.0% identity (100.0% similar) in 613 aa overlap (1-613:1-613)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRAPGALLARMSRLLLLLLLKVSASSALGVAPASRNETCLGESCAPTVIQRRGRDAWGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MRAPGALLARMSRLLLLLLLKVSASSALGVAPASRNETCLGESCAPTVIQRRGRDAWGPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NSARDVLRARAPREEQGAAFLAGPSWDLPAAPGRDPAAGRGAEASAAGPPGPPTRPPGPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NSARDVLRARAPREEQGAAFLAGPSWDLPAAPGRDPAAGRGAEASAAGPPGPPTRPPGPW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RWKGARGQEPSETLGRGNPTALQLFLQISEEEEKGPRGAGISGRSQEQSVKTVPGASDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RWKGARGQEPSETLGRGNPTALQLFLQISEEEEKGPRGAGISGRSQEQSVKTVPGASDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YWPRRAGKLQGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YWPRRAGKLQGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TNRRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TNRRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RAATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDLGFSGRAPAERCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RAATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDLGFSGRAPAERCI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 IKISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFTITCSLVTARKIRKAEKACTRGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IKISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFTITCSLVTARKIRKAEKACTRGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 KRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLLNIISQFLLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLLNIISQFLLFF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCCEECIQKSSTVTSDDNDNEYTTELELSPFSTIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCCEECIQKSSTVTSDDNDNEYTTELELSPFSTIR
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB7 REMSTFASVGTHC
:::::::::::::
NP_005 REMSTFASVGTHC
610
>>NP_001948 (OMIM: 131243,157300,616367) endothelin-1 re (427 aa)
initn: 471 init1: 137 opt: 491 Z-score: 315.0 bits: 67.9 E(85289): 8.3e-11
Smith-Waterman score: 491; 26.5% identity (62.7% similar) in 332 aa overlap (262-580:81-397)
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PGGPRRGNSTNRRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYY
: .: .:: .:..:: ... :. .:
NP_001 THQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRIIYQNKC
60 70 80 90 100 110
300 310 320 330 340
pF1KB7 MRSISNSLLANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLE--DFS---CKIVPYIEVASLG
::. :.:.:.::. :.. . . ::. .:. :. .: .. ::. ::. :... .:.:
NP_001 MRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVG
120 130 140 150 160 170
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 VTTFTLCALCIDRFRAATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKE
.:...:::: .::.::... . . : :. ... ::. ...::.::.. .
NP_001 ITVLNLCALSVDRYRAVASWS-RVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVM---
180 190 200 210 220
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 DLGFSGRAPAER-CIIKISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFT-ITCSLV
. : :. .. :... . . . :.... :: :: :::.: . : : .:.
NP_001 -VPFEYRGEQHKTCMLNATSKFMEF-------YQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLM
230 240 250 260 270
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 TARKIRKAEKACTRGNKRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQ
: . . . . . . ..... . .. :: :......: .: .. :. . . ...
NP_001 TCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDK
280 290 300 310 320 330
530 540 550 560 570
pF1KB7 QTMDLLNI------ISQFLLFFKSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCCEECIQKSSTV
. .::.. :. : ..::..:. :. . : :. :. : ::: : :..: .
NP_001 NRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCC---CYQSKSLM
340 350 360 370 380 390
580 590 600 610
pF1KB7 TSDDNDNEYTTELELSPFSTIRREMSTFASVGTHC
::
NP_001 TSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
400 410 420
>>NP_005305 (OMIM: 305670) gastrin-releasing peptide rec (384 aa)
initn: 462 init1: 251 opt: 431 Z-score: 279.7 bits: 61.2 E(85289): 7.7e-09
Smith-Waterman score: 460; 26.9% identity (61.4% similar) in 324 aa overlap (262-577:41-350)
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PGGPRRGNSTNRRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYY
:.. . ::. :.:::.... : :
NP_005 LEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNITLIKIFCTVKS
20 30 40 50 60 70
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MRSISNSLLANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFT
::.. : ....::. :.:... : :. . :. .::. ..::..:.:...:.::..::
NP_005 MRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRWLFGRIGCKLIPFIQLTSVGVSVFT
80 90 100 110 120 130
360 370 380 390 400
pF1KB7 LCALCIDRFRAAT---NVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDL
: :: ::..: . ..: . ... : : : ::. ..:::.::.:. ::
NP_005 LTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKIC----LKAAFIWIISMLLAIPEAVFS-----DL
140 150 160 170 180
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GFSGRAPAERCIIKISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLP-TLFTITCSLVTAR
. ... .:. .: : . . .. : : .. .: ..... ...
NP_005 HPFHEESTNQTFISCAP-YPHSNELHPKIHSMAS----FLVFYVIPLSIISVYYYFIAKN
190 200 210 220 230
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 KIRKAEKACTRGN---KRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQ
:..: . ..:: :.::. .... ::.... :..:: .:... . .: . :.
NP_005 LIQSAYNLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDT
240 250 260 270 280 290
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 QTMDLL-NIISQFLLFFKSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCCEECIQKSSTVTSDDN
. . .. .: ...: : .:::.: :. : : : . : :: : .: .
NP_005 SMLHFVTSICARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTGRSTT
300 310 320 330 340 350
590 600 610
pF1KB7 DNEYTTELELSPFSTIRREMSTFASVGTHC
NP_005 CMTSLKSTNPSVATFSLINGNICHERYV
360 370 380
>>NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor isoform (390 aa)
initn: 383 init1: 249 opt: 407 Z-score: 265.3 bits: 58.5 E(85289): 4.9e-08
Smith-Waterman score: 412; 25.1% identity (57.1% similar) in 366 aa overlap (214-566:1-341)
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RRAGKLQGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNSTNR
.:...:. : :. : .: :. .:
NP_002 MPSKSLS-NLSVTTGANESGSVPEG-----
10 20
250 260 270 280 290
pF1KB7 RVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMC----LSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSL
. : : .. . .. : : ..:. .:..::. .. : : :::. : .
NP_002 ---WERDFLPASDGTTTELVIRCVIPSLYLLIITVGLLGNIMLVKIFITNSAMRSVPNIF
30 40 50 60 70 80
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDR
..::: :.:... :.:. . . .:.. .::..: :...:.::..::: :: ::
NP_002 ISNLAAGDLLLLLTCVPVDASRYFFDEWMFGKVGCKLIPVIQLTSVGVSVFTLTALSADR
90 100 110 120 130 140
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FRAATN---VQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDLGFSGRAPA
.:: .: .: ....: .: ::: ..:::.::.:. .... .. .
NP_002 YRAIVNPMDMQTSGALLRTC----VKAMGIWVVSVLLAVPEAVFSEVAR--ISSLDNSSF
150 160 170 180 190
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 ERCIIKISPD-LPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLP-TLFTITCSLVTARKIRKAEK
:: . : : :. . . : :: .: ....: .. :..:..
NP_002 TACIPYPQTDELHPKIHSVLI----------FLVYFLIPLAIISIYYYHIAKTLIKSAHN
200 210 220 230 240
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ACTRGN---KRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLL-
. : :.:.. .... :.... . :: .:..: . .. . .. . ..
NP_002 LPGEYNEHTKKQMETRKRLAKIVLVFVGCFIFCWFPNHILYMYRSFNYNEIDPSLGHMIV
250 260 270 280 290 300
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 NIISQFLLFFKSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCCEECIQKSSTVTSDDNDNEYTTE
..... : : .:::.: :. : . : : : ::
NP_002 TLVARVLSFGNSCVNPFALYLLSESFRRHFNSQLCCGRKSYQERGTSYLLSSSAVRMTSL
310 320 330 340 350 360
600 610
pF1KB7 LELSPFSTIRREMSTFASVGTHC
NP_002 KSNAKNMVTNSVLLNGHSMKQEMAL
370 380 390
>>NP_001188326 (OMIM: 131244,277580,600155,600501) endot (532 aa)
initn: 431 init1: 245 opt: 401 Z-score: 260.1 bits: 58.0 E(85289): 9.5e-08
Smith-Waterman score: 509; 27.3% identity (54.8% similar) in 484 aa overlap (114-576:42-503)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 PSWDLPAAPGRDPAAGRGAEASAAGPPGPPTRPPGPWRWKGARGQEPSETLGRGNP-TAL
. : . : : : : :: .: .::
NP_001 TPSKRWRLHCLAFSQRFVRAGPACSSREACSSPRAGWNPAGFR--LP----GRWSPFVAL
20 30 40 50 60
150 160 170 180
pF1KB7 QLFLQISEEEE-----KGPRGAGIS--------GRSQEQSVKTVPGASDLFYWPRRAGKL
.: :: : . . : ::: : ::. : . : : . : .. : .
NP_001 HLVCQIREALKLRSGHRTPSGAGSSMQPPPSLCGRALVALVLAC-GLSRI--WGEERG-F
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNSTNRRVRLKN
.. :: .::. .. :. : . ::. . . : : : ..: : .
NP_001 PPDRATPLLQTAEIMTPPTK-TLWPKGSNASLARSLAPA-EVPKGDRTAGSPPRTISPPP
130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSLLANLAFWDFL
:. . : .: ..: ::::: ... :. .: ::. : :.:.::. :.:
NP_001 CQGPIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLALGDLL
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDRFRAATNVQMY
: . .:. ... :.. : . ::.::.:. ::.:.:...:::: :::.::... .
NP_001 HIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYRAVASWS-R
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDLGFSGRAPAERCIIKISPDLPD
. : . :......::: ...::.::.. .. : ..: . . :... :
NP_001 IKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDIITMD--YKG-SYLRICLLH-----PV
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFTITC-SLVTARKIRKAEKACTRGNKRQIQLES
.. : .:. :: :. ::::: .: .:.: . .:: : ... .
NP_001 QKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEMLRKKSGMQIALND-HLKQRR
360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 QMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLLNI------ISQFLLFFKS
.. :: :......: .: .. :. . . . . .::.. :. . ..:
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:..:. :. . : :. : : :: :. .:.:
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530
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. :: :. ::::: .: .:.: . .:: : ... . .. :: :...
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pF1KB7 NGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNSTNRRVRLKNPFYPLTQESYGA
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NP_001 LLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYRAVASWS-RIKGIGVPKWTAV
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NP_001 RFKNCFKSCLCCWCQSFEEKQSLEEKQSCLKFKANDHGYDNFRSSNKYSSS
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pF1KB7 SLLANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCI
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pF1KB7 ELELSPFSTIRREMSTFASVGTHC
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pF1KB7 GNSTNRRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISN
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pF1KB7 ELELSPFSTIRREMSTFASVGTHC
XP_005 LKQASPVAFKKINNNDDNEKI
370 380
613 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 04:19:54 2016 done: Fri Nov 4 04:19:56 2016
Total Scan time: 12.550 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]