Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7052
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7052, 539 aa
1>>>pF1KB7052 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1573+/-0.000913; mu= -5.6883+/- 0.055
mean_var=381.0682+/-79.795, 0's: 0 Z-trim(117.9): 871 B-trim: 120 in 1/52
Lambda= 0.065701
statistics sampled from 17803 (18730) to 17803 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.831), E-opt: 0.2 (0.575), width: 16
Scan time: 3.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1 ( 539) 3787 372.6 6.4e-103
CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1 ( 573) 3787 372.6 6.7e-103
CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19 ( 584) 751 84.9 2.9e-16
CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18 ( 619) 726 82.5 1.6e-15
CCDS46691.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22 ( 537) 599 70.4 5.9e-12
CCDS13895.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22 ( 641) 599 70.5 6.7e-12
CCDS13894.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22 ( 687) 599 70.5 7e-12
>>CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1 (539 aa)
initn: 3787 init1: 3787 opt: 3787 Z-score: 1961.2 bits: 372.6 E(32554): 6.4e-103
Smith-Waterman score: 3787; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSPDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSPDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 MHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB7 PAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
490 500 510 520 530
>>CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1 (573 aa)
initn: 3787 init1: 3787 opt: 3787 Z-score: 1960.9 bits: 372.6 E(32554): 6.7e-103
Smith-Waterman score: 3787; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:35-573)
10 20 30
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GPHPPSPQAAAPGEAWPGPSQAPWQSLEEKMGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFKKLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFKKLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 PDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDSPPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDSPPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQ
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 TKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSY
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 EPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPEELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPEELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 DSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 IHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLK
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 GQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGP
490 500 510 520 530 540
520 530
pF1KB7 PVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
550 560 570
>>CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19 (584 aa)
initn: 1448 init1: 627 opt: 751 Z-score: 405.5 bits: 84.9 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 1093; 40.2% identity (59.8% similar) in 535 aa overlap (6-483:6-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
: ::::::::::..:: ::::: : :::..: ..: :. :::.::::::.:::
CCDS12 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
:::: .:::. .: :.:::. ::: ::..::::::::.:.::.
CCDS12 KLFT---SGAVVDQ-----------QNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGD
70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KB7 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSP------------DEDDCERARQYLEAF--
.:.:::::::: : .: ..:. . : : . :. . ::..::: :
CCDS12 ILSAARLLEIPAVSHVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQS
110 120 130 140 150 160
170 180
pF1KB7 ---------ATATASGVP--------NGEDSPPQV--------------------PLPPP
:.:.:.. : . :. .. : ::
CCDS12 NPMNSLPPAAAAAAASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPA
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PPPPPRPVARRSRKP-----RKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGS
:: . . .: : : : ..: . : .: :::.:. :
CCDS12 ERPPTGDGDEGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASL--S
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPL-SPEEL
.. :::: . .:.: :: .. : :. .....:. : ::
CCDS12 EAAPEPGDSPGFLSGAA---EGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEES
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPR
.:. .. . :.:. :. .. :. :: :. .: :.. :.::.:.:.:.:::::::
CCDS12 RADDKGVMDYYLKYFSGAHDGDVYPAW-SQ-KVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPR
350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 HMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHL
:.::::::::. :..: :::::.::::.::::::::.:: : .: : : :.:::::::..
CCDS12 HIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRV
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 HTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAG
::: :::.: : :.:.. :::.:::: ..: : .:: :: . : :: .:.. :
CCDS12 HTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATPG
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530
pF1KB7 LDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
CCDS12 APAQPSSPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGAGGGGDSGGGPGAATDGNF
520 530 540 550 560 570
>>CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18 (619 aa)
initn: 1277 init1: 678 opt: 726 Z-score: 392.4 bits: 82.5 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 1182; 41.9% identity (61.3% similar) in 535 aa overlap (1-491:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
:.. :.:::::::.::::.: :::::. : :::. . .: ::::::.::::::.:::
CCDS32 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
:::: : : .. : :.::: ::::.:.::::::.::: ...:.
CCDS32 KLFTAG--------------TLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKH
70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQ--GSGLEAPSPDEDDCERA---RQYLEAFATATASGVP
.:.:::.::: :.. .:.::.. :.: : . ..:: .. .. : .
CCDS32 ILNAARMLEIQCIVNVCLEIMEPGGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 NGEDSPPQVPLPPPP-------PPPPRPVARR--SRKPRKAFLQTKGARANHL-VPEVPT
. :: : :: : : .... : :: . ... .:: : . .
CCDS32 DTEDFADQENLPDPQDISCHQSPSKTDHLTEKAYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB7 VPA--HPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPGDSYSP---PT--GT-ASPPEGPQSYEPYE---
. . . : . .. : : . .: .. : : :. :. :: :.. : .
CCDS32 IESLLRENLYPKANIPDRRPSLSPFAP--DFFPHLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVI
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB7 -----GEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPEELGSDEDAI--DPDLMAYLSSLHQDNLA
:::.::: :: . . . :. :. : . : :::. : .:.
CCDS32 KNRKIKEEEKEELPPPPPPPFPNDFFKDMFPDLPGGPLGPIKAENDYGAYLNFLSATHLG
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 PGLDSQDKLV--RKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTR
:: :: :: . . :.::.:::.: :::::::::::::::::. : .: :::::
CCDS32 -GLFPPWPLVEERKLKPKASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCTICEVRFTR
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 NDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHL
.:::::::::::::::: : :: :.:.:.:::::::..::: :::.:..:.:.:.. :::
CCDS32 QDKLKIHMRKHTGERPYLCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYKSFTRSDHL
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KB7 QRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDA--------PPHYPPPSTAA-ASPAGLDLSNGHLDTFRL
.::.: :.: .: :: :: : : : :. :: . : .: .:::
CCDS32 HRHIKRQSCRMARPRRGRKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVGGHLGGAAV
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530
pF1KB7 SLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
CCDS32 CLPGPSPAKHFLAAPKGALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLAFALAENVA
530 540 550 560 570 580
>>CCDS46691.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22 (537 aa)
initn: 451 init1: 179 opt: 599 Z-score: 328.1 bits: 70.4 E(32554): 5.9e-12
Smith-Waterman score: 610; 27.6% identity (54.6% similar) in 529 aa overlap (16-507:22-529)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLG-HLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLA
::.:.: ::.::. : ..::. .:. . .::::::
CCDS46 MERVNDASCGPSGCYTYQVSRHSTEMLHNLNQQRKNGGRFCDVLLRVGDESFPAHRAVLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB7 ACSHYFKKLFTE--GGGGAVMGA----GGSGTATGGAGAGVCELDF--VGPEALGALLEF
:::.::...:. : :::. :. ::. .: ::...: ::.. .. ...: .:.:
CCDS46 ACSEYFESVFSAQLGDGGAADGGPADVGGATAAPGGGAGGSRELEMHTISSKVFGDILDF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 AYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSPDEDDCERARQYLEA
:::. ... ..: .. ::..: . :: :.:... :... : :: .
CCDS46 AYTSRIVVRLESFPELMTAAKFLLMRSVIEICQEVIKQSNVQILVPP------ARADIML
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FATATASGVPNGEDSPPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQTKGAR--ANHLVPEV
: .: . : . : .: : .:.. .. :: .. .: .
CCDS46 FRPPGTSDLGFPLDMTNGAALA----ANSNGIAG-SMQPEEEAARAAGAAIAGQASLPVL
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 PTVPAHPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELV
: : :. ::: .. . ..: : .....:: . . . . . .
CCDS46 PGVDRLPM------VAGPLSPQLLTSP----FPSVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSM
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB7 YPPAYGLAQGGGPPLSPE-ELGSDEDAIDPDLMAY-LSSLHQD--NLAP------GLD-S
. :: ..: : . .. .: . . . ..::. .: : :: :
CCDS46 FGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLRQHEAQHGVTSLQLGYIDLPPPRLGENGLPIS
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 QDKLVRKRRSQMPQE--CPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLK
.: ..::. .. : .: ::.. . .: :: .:.::::..: :::.:: :.:...
CCDS46 EDPDGPRKRSRTRKQVACEICGKIFRDVYHLNRHKLSHSGEKPYSCPVCGLRFKRKDRMS
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KB7 IHMRKHTGE--RPYSCPHCPARFLHSYDLKNHM-HLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQR
:.:.: : .:: : : : . :..:. ..::..::..:. :. .:: .:.:.
CCDS46 YHVRSHDGSVGKPYICQSCGKGFSRPDHLNGHIKQVHTSERPHKCQTCNASFATRDRLRS
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490
pF1KB7 HLKG-------QNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPST-AAASPAGLDLSNGHLDTFRLSLA
:: : : . : : ::. . ::. ..: .
CCDS46 HLACHEDKVPCQVCGKYLRAAYMADHLKKHSEGPSNFCSICNRGLQAPGAHPEWGSSVPL
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530
pF1KB7 R--FWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
: .:.: :
CCDS46 RQDLWQQRRPEMLTSGSD
520 530
>>CCDS13895.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22 (641 aa)
initn: 451 init1: 179 opt: 599 Z-score: 327.1 bits: 70.5 E(32554): 6.7e-12
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