Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7023
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7023, 1106 aa
1>>>pF1KB7023 1106 - 1106 aa - 1106 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6520+/-0.00144; mu= -8.7472+/- 0.082
mean_var=544.0310+/-129.264, 0's: 0 Z-trim(107.3): 298 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.054987
statistics sampled from 9203 (9477) to 9203 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 3.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106) 7360 600.9 5.1e-171
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089) 3019 256.5 2.3e-67
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 759 77.2 2e-13
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 976) 759 77.2 2e-13
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 ( 993) 735 75.3 7.7e-13
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 ( 972) 697 72.3 6.1e-12
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298) 699 72.6 6.6e-12
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363) 699 72.6 6.8e-12
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 696 72.4 7.9e-12
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 668 70.1 3.7e-11
>>CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106 aa)
initn: 7360 init1: 7360 opt: 7360 Z-score: 3183.8 bits: 600.9 E(32554): 5.1e-171
Smith-Waterman score: 7360; 100.0% identity (100.0% similar) in 1106 aa overlap (1-1106:1-1106)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGLETDERKRLYIFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGLETDERKRLYIFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVALPVPYDHQRGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVALPVPYDHQRGFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GIFEDRSYICKTTIGDREVDSDAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTVVRQGENITLMCIVIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIFEDRSYICKTTIGDREVDSDAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTVVRQGENITLMCIVIGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWFKDNRTLGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWFKDNRTLGDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLLGNSSEEESQLETNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLLGNSSEEESQLETNV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 TYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPFKVVVISAILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPFKVVVISAILA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 VLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 HLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 PVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 KICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 GTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 LLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDND
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 YIIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCDSPLEPQDEPEPEPQLELQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YIIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCDSPLEPQDEPEPEPQLELQV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KB7 EPEPELEQLPDSGCPAPRAEAEDSFL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPEPELEQLPDSGCPAPRAEAEDSFL
1090 1100
>>CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089 aa)
initn: 2551 init1: 996 opt: 3019 Z-score: 1322.8 bits: 256.5 E(32554): 2.3e-67
Smith-Waterman score: 3019; 45.7% identity (72.5% similar) in 1071 aa overlap (8-1059:6-1057)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MRLPGAMPALALKGELLL-LSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAP
::. . : :: :::.: :.: .. : : :....:.: : : : .
CCDS34 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILC---QLSLPSIL-PNENEKVVQLNSSFSLRCFGESE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VVWER-MSQEPPQEMA----KAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGLETD-ER
: :. ::.: ... . ..: : .:: ... .. :: : : .: .. :.. :
CCDS34 VSWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVALPVPY
...::.:::: :.:.: . .... . ::::.:::. ::::...: : :. :
CCDS34 RHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVV--PASY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DHQRGFSGIFEDRSYICKTTIGDREVDSDAYYVYRLQVSS-INVSVNAVQTVVRQGENIT
: ..::.: : :::..:. .. .. . :: :...: ... ..:..:: ..::.:.
CCDS34 DSRQGFNGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LMCIVIGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMP-YHIRSILHIPSAELEDSGTYTC
. : :..::::...:::: . .:. . . . . .: .. : .: : ..::: : :
CCDS34 VTCAVFNNEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEE--IKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYEC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 NVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWF
. ... . .. : ..:.: :.:.... . :. ..::. . . : .::::: . :.
CCDS34 AARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 KDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQL
:.: :: .. . ::. ......: :: :.: :.:.: ..::::. : .::: . .:.:
CCDS34 KNNLTLIENLT-EITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFEL
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 QINVPVRVLELSESHPDS-GEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLLGNSS
.:: .:.: ..: : : ::::: ..: : :.: : :.:.:.: : :.:.:.
CCDS34 LTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANN-
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 EEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPF
. . .: . ... : . . . .:.. ..::: .: .: ...:. .: .:
CCDS34 -----VSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRS
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 KVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYD
...: .:.:.:.:..:::::.:...:..::::::::.::::.: ::::::::::::::::
CCDS34 ELTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYD
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMS
: ::.::: :::::.:::::::.:::.::.:::.:: .::::::::: ::::::::::::
CCDS34 SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMS
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 ELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRP
:::::.:::::::.:::::::::.:::::::::: :::::.:::.:. .::.:: .:
CCDS34 ELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEK---
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760
pF1KB7 PSAELYSNAL-PVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESS
:. :: .: :. :.: :. :..: ::::.. ....:::::. : ::.::. :
CCDS34 PKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRS
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 NYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINE-SPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLA
: : . : . . : .. : :. .::..:.:::: ::::::::::::::::
CCDS34 LYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLA
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 ARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWS
:::::. .::.:::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::..::::::::::
CCDS34 ARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWS
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 FGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIR
.::::::::.::::::: . .. ::: :: :::::.: ::..:.:::: :::. . : :
CCDS34 YGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKR
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 PPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPG-FHGL--RSPLDTS
: : .: ..: :: :::.:... .::.:::::. : .. . . :. .. :
CCDS34 PSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKL
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB7 SVLYTAVQPNE--GDNDYIIPLPD--PKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCD
. ... .. .:. ::::::: : :: : : .. : .: . ..:.:. :
CCDS34 KDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGK-RNRHSSQTSEESAIETGSSSSTF
1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090 1100
pF1KB7 SPLEPQDEPEPEPQLELQVEPEPELEQLPDSGCPAPRAEAEDSFL
CCDS34 IKREDETIEDIDMMDDIGIDSSDLVEDSFL
1060 1070 1080
>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (972 aa)
initn: 1451 init1: 740 opt: 759 Z-score: 354.4 bits: 77.2 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 1783; 34.9% identity (63.8% similar) in 1016 aa overlap (13-988:5-950)
10 20 30 40
pF1KB7 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLL--------EPQISQGLVVTP---PGP-ELVLNVSS
.: .: .:::: .:..: : : :: .:.. :..
CCDS47 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGD
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 TFVLTCSGSAPVVWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGL
. : :. . : : . .: . :. .. :: ::.: :: ...::
CCDS47 EIRLLCTDPGFVKWTFEILDETNE--NKQNEWITEKAEATN-----TGKYTCT--NKHGL
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ETDERKRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVA
.. .:.:: ::. :: . . .. : .. . : .:::. :: . :: .
CCDS47 SNS----IYVFVRDPAKLFLVDRS----LYGKEDNDTLVRCPLTDPE--VTNYSLKGCQG
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KB7 LPVPYDHQ---RGFSGIF---EDRSY--ICKTTIGDRE---VDSDAYYV-YRLQVSSINV
:.: : . .::. :.: .: :.: : :. . . : ... :
CCDS47 KPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -SVNAVQTVVRQGENITLMCIV--IGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLL-DMPYHI
::. .. ..:.::..:. : . ... : . : ... .: : ... :. :.
CCDS47 VSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYS-TWKRENSQT-KLQEKYNSWHHGDFNYER
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHR
.. : : ::...:::.. : .... .. . . .. ::..:.. .. ..: :.. .
CCDS47 QATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN--VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGE
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 SRTLQVVFEAYPPPT-VLWFKDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEA
. : : .::.: : :. :::. :. : ...: :. :::::: :.:.: .:.
CCDS47 NVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK--WEDYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEG
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 GHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVLELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSAC
: ::. . . :... ..:.. .:. ..: .. . ..: . :.:.:.: : :
CCDS47 GTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEIL----TYDRLVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFC
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KB7 RDL-KRCPRELPPT---LLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVR
.:: . :. :..:. ..: .. . ... ..: .:.
CCDS47 PGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSS----------IDSSAFKHNG---TVE
450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 CTLRNAVGQDTQ------EVIVVPHSLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPR
: : ::. . . . ::.: : ..:. ... .. :: ..:: . . .::
CCDS47 CKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTL-FTPLLIGFVIVAGMMCII-VMILTYKYLQKPM
500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 YEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHG
::..:::.: . .:..:.:.:: ::::: ::.::..: .:.:::.::::.::::::.:
CCDS47 YEVQWKVVEEI--NGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYG
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 LSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIIT
: .:.:.: ::::::: .:. .:..:::::::..:.:: :.:.:::::::: ::: .::
CCDS47 LIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVIT
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 EYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYM
::: ::::...:.:.. .:. : .. : ::.: : :. : ..: . ::
CCDS47 EYCCYGDLLNFLRRKRDSFI--CSKQEDHAEAALYKNLLH------SKESSCSDSTNEYM
670 680 690 700 710
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 DMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPV-LSY
::. .:.:: . :.: : ... ..:. :: ...... . :.
CCDS47 DMKP--GVSYV--VPTKAD-KRRSVRIGSYI-----------ERDVTPAIMEDDELALDL
720 730 740 750 760
810 820 830 840 850 860
pF1KB7 MDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISK
::..::::::.:: :::::::.::::::::.:. .:...::::::::::: ::::. :
CCDS47 EDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVK
770 780 790 800 810 820
870 880 890 900 910 920
pF1KB7 GSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRG
:.. ::.:::::::::: .:: :::::.::.:::.:.::..::: .:.. .::. ::.:
CCDS47 GNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEG
830 840 850 860 870 880
930 940 950 960 970 980
pF1KB7 YRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRS
.:: .: :: :.:.::. ::. :: :.:.: :.:. ..:. .. :... .
CCDS47 FRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNR
890 900 910 920 930 940
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB7 DHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEG
..:.. .:
CCDS47 QKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
950 960 970
>>CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (976 aa)
initn: 1451 init1: 740 opt: 759 Z-score: 354.4 bits: 77.2 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 1781; 35.0% identity (64.4% similar) in 1010 aa overlap (13-988:5-954)
10 20 30 40
pF1KB7 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLL--------EPQISQGLVVTP---PGP-ELVLNVSS
.: .: .:::: .:..: : : :: .:.. :..
CCDS34 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGD
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 TFVLTCSGSAPVVWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGL
. : :. . : : . .: . :. .. :: ::.: :: ...::
CCDS34 EIRLLCTDPGFVKWTFEILDETNE--NKQNEWITEKAEATN-----TGKYTCT--NKHGL
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ETDERKRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVA
.. .:.:: ::. :: . . .. : .. . : .:::. :: . :: .
CCDS34 SNS----IYVFVRDPAKLFLVDRS----LYGKEDNDTLVRCPLTDPE--VTNYSLKGCQG
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KB7 LPVPYDHQ---RGFSGIF---EDRSY--ICKTTIGDRE---VDSDAYYV-YRLQVSSINV
:.: : . .::. :.: .: :.: : :. . . : ... :
CCDS34 KPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -SVNAVQTVVRQGENITLMCIV--IGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLL-DMPYHI
::. .. ..:.::..:. : . ... : . : ... .: : ... :. :.
CCDS34 VSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYS-TWKRENSQT-KLQEKYNSWHHGDFNYER
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHR
.. : : ::...:::.. : .... .. . . .. ::..:.. .. ..: :.. .
CCDS34 QATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN--VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGE
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 SRTLQVVFEAYPPPT-VLWFKDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEA
. : : .::.: : :. :::. :. : ...: :. :::::: :.:.: .:.
CCDS34 NVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK--WEDYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEG
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 GHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVLELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSAC
: ::. . . :... ..:.. .:. ..: .. . ..: . :.:.:.: : :
CCDS34 GTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEIL----TYDRLVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFC
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KB7 RDL-KRCPRELPPT---LLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVR
.:: . :. :..:. ..: .. . . . :. .:.. . . ..
CCDS34 PGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSI--DSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 CTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWK
. : ...: : ::.: : ..:. ... .. :: ..:: . . .:: ::..::
CCDS34 AYFNFAFKGNNKEQIH-PHTL-FTPLLIGFVIVAGMMCII-VMILTYKYLQKPMYEVQWK
510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 VIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQA
:.: . .:..:.:.:: ::::: ::.::..: .:.:::.::::.::::::.:: .:.:
CCDS34 VVEEI--NGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDA
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 TMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYG
.: ::::::: .:. .:..:::::::..:.:: :.:.:::::::: ::: .::::: ::
CCDS34 AMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYG
620 630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 DLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDE
::...:.:.. .:. : .. : ::.: : :. : ..: . ::::.
CCDS34 DLLNFLRRKRDSFI--CSKQEDHAEAALYKNLLH------SKESSCSDSTNEYMDMKP--
680 690 700 710 720
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 SVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPV-LSYMDLVGF
.:.:: . :.: : ... ..:. :: ...... . :. ::..:
CCDS34 GVSYV--VPTKAD-KRRSVRIGSYI-----------ERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSF
730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KB7 SYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLP
:::::.:: :::::::.::::::::.:. .:...::::::::::: ::::. ::.. ::
CCDS34 SYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLP
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
pF1KB7 LKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQP
.:::::::::: .:: :::::.::.:::.:.::..::: .:.. .::. ::.:.:: .:
CCDS34 VKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSP
840 850 860 870 880 890
930 940 950 960 970 980
pF1KB7 AHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAIL
:: :.:.::. ::. :: :.:.: :.:. ..:. .. :... . ..:..
CCDS34 EHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVD
900 910 920 930 940 950
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB7 RSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLAS
.:
CCDS34 HSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
960 970
>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 (993 aa)
initn: 1281 init1: 735 opt: 735 Z-score: 344.0 bits: 75.3 E(32554): 7.7e-13
Smith-Waterman score: 1396; 34.7% identity (60.9% similar) in 790 aa overlap (222-1001:259-986)
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 TTIGDREVDSDAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTVVRQGENITLMCIVIG-NEVVNFEWTYP
: .. :: . . : .. :. .. :
CCDS31 IRCCARNELGRECTRLFTIDLNQTPQTTLPQLFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELE
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300
pF1KB7 RK--ESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSIL-HIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAIN
: : : : .. . . . :: .. . :. .:.: ::: : . : ...:.
CCDS31 NKALEEGNYFE-MSTYSTNRTM-IRILFAFVSSVARNDTGYYTC----SSSKHPSQSAL-
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWFKDNRTLGDSSAGEIAL
.:.::.:.. . .. . .. ..: :.::: : . ... . :
CCDS31 VTIVEKGFINATNSSEDYEI-DQYEEFCFSVRFKAYPQIRCTWTFSRKSFPCEQKG----
350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 STRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVL-ELSESH
. : ... .. . :.: ..: ..::. : :.: .:: : : :.
CCDS31 LDNGYSISKFCNHKH-------QPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQ
400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLK-RCPRELPPTLLGNSSEEESQLETNVTYWEE
. : . :.: :. :. : : . : .:. . . ..... :
CCDS31 AS-------CFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITEGVWNRKANRKV-----FGQWVS
450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 EQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIV-VPHSLPFKVVVIS--AILALV
::: .... . . :.: :..: . . ... : .:: :: : ...
CCDS31 S------STLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGVC
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 VLTIISLIILI-MLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLV
.: :. : .:: ..:. ::: . .... ..:. .::.::: . :: ::.::..:
CCDS31 LLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLE
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPH
.:..:::::::.:..:::.:.:.. ....::::::: : :::..:::::::.:..:: :
CCDS31 FGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSH
620 630 640 650 660 670
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNALP
:.:::::::: .::::.: ::: ::::..::. ... : . .. . . .:
CCDS31 ENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFY-----
680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 VGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPS
:. : . : : ... . : . : .:. ... : :.:
CCDS31 -----PTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGL--HGNSFHSEDE-----IEYENQ---
730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 APERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVK
.: . .: ::.. ::. :.::::.::::: :.::::::::::::. .::.::
CCDS31 --KRLEEEEDLN---VLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVK
780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 ICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGG
::::::::::: ::::. .:.. ::.:::::::.:...:: :::::.::::::::.::
CCDS31 ICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGV
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 TPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERL
.::: .:.. .::. :. :..: :: .:..::: :::.:: . :: : .:. .:
CCDS31 NPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQ
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 LGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDY
:... . ::.:: . . : : :: ::
CCDS31 LADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 IIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCDSPLEPQDEPEPEPQLELQVE
>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 (972 aa)
initn: 1332 init1: 690 opt: 697 Z-score: 327.8 bits: 72.3 E(32554): 6.1e-12
Smith-Waterman score: 1736; 36.0% identity (62.5% similar) in 982 aa overlap (18-969:5-921)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLLEPQISQGL-VVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAP
.: :::. .::. :. : ::::.. ..: .: : :..
CCDS43 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VVWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGLETDERKRLYIF
: :. : . . .::. ::.:. .: : .:: : ::. : ....
CCDS43 VEWD---GPPSPHWTLYSDGS-SSILSTNNATFQNTGTYRCTEP---GDPLGGSAAIHLY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VPDPTVGFLPND--AEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLV--VTLHEKKGDVAL---PVP
: ::. : . :.:. .: : . .:: .::: : :.: . .: .
CCDS43 VKDPAR---PWNVLAQEVVVF--EDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYS
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KB7 YDHQRGFS----GIFEDRSYICKTTIGDREVDSDAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTV----
.. .::. ......: :.. .: :.: : . ::.:... . :. :
CCDS43 FSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSALMGGRKVMSIS---IRLKVQKVIPGPPALTLVPAEL
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 VR-QGENITLMCIVIGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAEL
:: .:: ..: . . .: ::. .. .... .:. : . . . :. :.. ....
CCDS43 VRIRGEAAQIVCSASSVDV-NFD-VFLQHNNTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDF
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 EDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAY
. .:.:.: ... . :. .. . ::::.:. : .: . .: . . .. .:.:. :::
CCDS43 QHAGNYSCVASNVQGKHST--SMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAY
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 PPPTVLWFKDNRTLGDSS--AGEIALSTRNVSET-RYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFH
: : . :: : : :.. ....: :.. :.: :.: .:::.:.. : .
CCDS43 PG---LQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARN
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KB7 EDAEVQLSFQLQINVPVRVLELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRD-LKRCPR
. :.:.: . : .: . :: :. : . :.::::. : : :: .
CCDS43 PGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSG--TLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDE
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 ELPPTLLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQ
. . : : : .. : : : .. ... . .: .:.::. .
CCDS43 AQVLQVWDDPYPE-------VLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSW
450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 EVIVVP---HSLP-----FKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIES
: . :. : : ::. : .....: .. :..:.. ...::.:..:::.:::
CCDS43 AFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVV-ACMSIMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIES
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 VSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKV
.:. : ..:: ::::. ::.::..: .:.:::.::::.:::::: ::.. .:..::
CCDS43 Y--EGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKV
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 AVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVD
:::::::::...::.::::::::::::: : :.::::::::.:::. .::::: ::::..
CCDS43 AVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLN
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 YLHRNKHTFLQHH-SDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVD
.:.:. ...: : . : .. :.: . : ..: . :.:. ... : :.
CCDS43 FLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKN---IHLE-KKYV----RRDSGFSSQGVDTYVE
680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 YVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQV
. :. ::: :.. . .. . : : ::. :: ::
CCDS43 MRPVST-----------SSN-----DSFSEQDLDKE------DGRP-LELRDLLHFSSQV
730 740 750 760
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 ANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWM
:.:: :::::::.:::.::::::. .:...:: ::::::::: ::::: ::.. ::.:::
CCDS43 AQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWM
770 780 790 800 810 820
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 APESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHAS
::::::. .::. :::::.::::::::.:: .::: . .: .::. .: ::.::::: :
CCDS43 APESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAP
830 840 850 860 870 880
940 950 960 970 980 990
pF1KB7 DEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQA
.:: ::: :: . :: :.:. .:.. : ...
CCDS43 KNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSEL
890 900 910 920 930 940
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB7 RLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLN
CCDS43 EEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
950 960 970
>>CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298 aa)
initn: 1082 init1: 689 opt: 699 Z-score: 327.2 bits: 72.6 E(32554): 6.6e-12
Smith-Waterman score: 1116; 34.3% identity (60.4% similar) in 717 aa overlap (286-969:529-1181)
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 RLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAIN--ITVVES
:. : : :...:. :::. : .:.. .
CCDS43 NPIESLDTWTEFVEGKNKTVSKLVIQNANVSAMYKCVVSNKVG--QDERLIYFYVTTIPD
500 510 520 530 540 550
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 GYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEA--YPPPTVLWFKDN-RTLGDSSAGEIALSTR
:.. . . :: ... . . .: : . :.. : :: :. .. . :. .
CCDS43 GFT-----IESKPSEELLEGQPVLLSCQADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCK
560 570 580 590 600 610
380 390 400 410
pF1KB7 NVSE---------------TRYVS-ELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQIN
:: .:... :.. :: . :::. .. .: . . . .
CCDS43 NVHLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEV--QDRRSHDKHCHKKY
620 630 640 650 660
420 430 440 450 460
pF1KB7 VPVRVLE---LSESHPD-----SGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLL
. :..:: :... : : ..: : :.:.: .: . ::
CCDS43 LSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY--KDER---------LL
670 680 690 700 710
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 GNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPH
::.: .: . .:.. . . .: . . : : :. .. :..... .. .
CCDS43 ----EEKS----GVDLADSNQKLSI-QRVREEDAGRYLCSVCNAKGCVNSSASVAVEGSE
720 730 740 750 760
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 SLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRY-EIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPM
. .:: . ..... . :..::. ...: . .:. . . . :. . .
CCDS43 DKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQCE
770 780 790 800 810 820
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 QLPYD-STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSE
: :: : ::.::..: :::.:: ::::.::::.: :. .... ::::::: : .::
CCDS43 YLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATASE
830 840 850 860 870 880
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 KQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKG-GPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQH
..::::::::. :.: ::::::::::::: ::...:.:.:.::.: ..:. .. .:
CCDS43 HRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAF---
890 900 910 920 930 940
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 HSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKY
: :: .. : . . : :. .: . : : : . ...
CCDS43 ------SPCAE--KSPEQRGR-FRAMVELA------RLDRRRPGSSDRVLF------ARF
950 960 970 980
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 ADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCV
. :.. : :. .: . :: :.. ::: .:.::: :::::::..:.
CCDS43 SKTEGGARRASPDQ----------EAEDLWLSP-LTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCI
990 1000 1010 1020 1030
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 HRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTL
::::::::.:. :. .::::::::::::..: .:. :::. ::::::::::::...:::
CCDS43 HRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 SDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEE
:::::::.::::::.::..::: . .::.: . .. : :: : :. : .:: .::
CCDS43 SDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSG
1100 1110 1120 1130 1140 1150
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 KFEIRPPFSQLVLLLERLL-GEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPL
. :: ::.:: .: :: :.: ...
CCDS43 DPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADA
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363 aa)
initn: 1082 init1: 689 opt: 699 Z-score: 327.0 bits: 72.6 E(32554): 6.8e-12
Smith-Waterman score: 1116; 34.3% identity (60.4% similar) in 717 aa overlap (286-969:529-1181)
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 RLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAIN--ITVVES
:. : : :...:. :::. : .:.. .
CCDS44 NPIESLDTWTEFVEGKNKTVSKLVIQNANVSAMYKCVVSNKVG--QDERLIYFYVTTIPD
500 510 520 530 540 550
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 GYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEA--YPPPTVLWFKDN-RTLGDSSAGEIALSTR
:.. . . :: ... . . .: : . :.. : :: :. .. . :. .
CCDS44 GFT-----IESKPSEELLEGQPVLLSCQADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCK
560 570 580 590 600 610
380 390 400 410
pF1KB7 NVSE---------------TRYVS-ELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQIN
:: .:... :.. :: . :::. .. .: . . . .
CCDS44 NVHLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEV--QDRRSHDKHCHKKY
620 630 640 650 660
420 430 440 450 460
pF1KB7 VPVRVLE---LSESHPD-----SGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLL
. :..:: :... : : ..: : :.:.: .: . ::
CCDS44 LSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY--KDER---------LL
670 680 690 700 710
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 GNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPH
::.: .: . .:.. . . .: . . : : :. .. :..... .. .
CCDS44 ----EEKS----GVDLADSNQKLSI-QRVREEDAGRYLCSVCNAKGCVNSSASVAVEGSE
720 730 740 750 760
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 SLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRY-EIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPM
. .:: . ..... . :..::. ...: . .:. . . . :. . .
CCDS44 DKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQCE
770 780 790 800 810 820
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 QLPYD-STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSE
: :: : ::.::..: :::.:: ::::.::::.: :. .... ::::::: : .::
CCDS44 YLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATASE
830 840 850 860 870 880
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 KQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKG-GPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQH
..::::::::. :.: ::::::::::::: ::...:.:.:.::.: ..:. .. .:
CCDS44 HRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAF---
890 900 910 920 930 940
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 HSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKY
: :: .. : . . : :. .: . : : : . ...
CCDS44 ------SPCAE--KSPEQRGR-FRAMVELA------RLDRRRPGSSDRVLF------ARF
950 960 970 980
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 ADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCV
. :.. : :. .: . :: :.. ::: .:.::: :::::::..:.
CCDS44 SKTEGGARRASPDQ----------EAEDLWLSP-LTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCI
990 1000 1010 1020 1030
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 HRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTL
::::::::.:. :. .::::::::::::..: .:. :::. ::::::::::::...:::
CCDS44 HRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 SDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEE
:::::::.::::::.::..::: . .::.: . .. : :: : :. : .:: .::
CCDS44 SDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSG
1100 1110 1120 1130 1140 1150
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 KFEIRPPFSQLVLLLERLL-GEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPL
. :: ::.:: .: :: :.: ...
CCDS44 DPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADA
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>>CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338 aa)
initn: 1233 init1: 691 opt: 696 Z-score: 325.8 bits: 72.4 E(32554): 7.9e-12
Smith-Waterman score: 1183; 34.0% identity (62.4% similar) in 736 aa overlap (255-978:499-1170)
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 VRQGENITLMCIVIGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAELE
: .: .:. . . . . . :. .
CCDS93 HPCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSR
470 480 490 500 510 520
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 DSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYP
:: : : ....:. . .. :: : .:. : .. : . .:. : :.. .
CCDS93 ISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPT-EGEDLKLSCTVNKFLYRDV
530 540 550 560 570 580
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 PPTVLWFKDNRTLGDS-SAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRA--FHE
.: .:::. : : ..:.. .: . .::.. :.. ..: :. :: .
CCDS93 TWILLRTVNNRTMHYSISKQKMAIT----KEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYT
590 600 610 620 630 640
410 420 430 440 450
pF1KB7 DAEVQLSFQLQI---NVPVRVLELSE-SHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRC
:. . .. : ..: . .::. . :. :. :.. :.:.:.: : .. ..
CCDS93 GEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITW--FKNNHKI
650 660 670 680 690 700
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 PRELPPTLLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQD
.: : .:: .: : : . . :.: .. .: . :. :. :.... ..
CCDS93 QQE-PGIILGPGS---STLFIERVTEEDEGVYHCKATNQKGSVES--SAYLTVQGTSDKS
710 720 730 740 750
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 TQEVIVVPHSLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGH
. :.:.. . ..: : ..:: :.. .:. ::. . :. :
CCDS93 NLELITLTCT------CVAATLFWLLLT------LFIRKMKRSSSEIKTDYL-SIIMDPD
760 770 780 790 800
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 EYIYVDPM--QLPYD-STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVK
: . .: . .:::: : ::. :..: ::..:: ::::.::.:.: :...: . ::::
CCDS93 E-VPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVK
810 820 830 840 850 860
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 MLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTK-GGPIYIITEYCRYGDLVDYL
::: : .:: .:::.::::..:.: ::::::::::::: :::...:.:::.::.: .::
CCDS93 MLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYL
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 HRNKHTF-LQHHSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYV
. .. : :.. . . :. : . .: : : :.:. . . ...:.:..
CCDS93 KSKRDLFFLNKDAALHMEPKKEKMEPGLEQGKK-PRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLS--
930 940 950 960 970
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 PMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVAN
::. . .. : : ... ::...:.:::
CCDS93 -------DVEEEEDSDGFYKEP-----------------------ITMEDLISYSFQVAR
980 990 1000
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 GMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAP
:::::.:..:.::::::::.:. :...::::::::::::... .:. ::.: ::::::::
CCDS93 GMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAP
1010 1020 1030 1040 1050 1060
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 ESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDE
::::...:.: :::::.:.::::::.:::.::: . :.:.: . ...:.:: : ... :
CCDS93 ESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
940 950 960 970 980 990
pF1KB7 IYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARL
::.:: ::.. . :: :..:: :.: :. . . :: ....
CCDS93 IYQIMLDCWHRDPKERPRFAELV---EKL-GDLLQANVQQDGKDYIPINAILTGNSGFTY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB7 PGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEV
CCDS93 STPAFSEDFFKESISAPKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIKTFEELLPNATSMFDDYQG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
>>CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356 aa)
initn: 1155 init1: 664 opt: 668 Z-score: 313.7 bits: 70.1 E(32554): 3.7e-11
Smith-Waterman score: 1140; 29.9% identity (56.4% similar) in 1010 aa overlap (34-962:226-1164)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 PGAMPALALKGELLLLSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAPVV--
:: :. . :.:. .::.:.. . .
CCDS34 GMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVG
200 210 220 230 240 250
70 80 90 100
pF1KB7 ----WERMSQEPPQEMA-----KAQDGT----FSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGL
:: :.. .. :.:.:. : :.::. ..: : : : :. : ::
CCDS34 IDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRSDQGLYTCA--ASSGL
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150
pF1KB7 ETDERKRLYIFVPD-PTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTD---PQL--------
: ... .. : . : :.: ... : .. : .. :: . :..
CCDS34 MT-KKNSTFVRVHEKPFVAF--GSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIP
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200
pF1KB7 VVTLHEKKGDVALPVPYDHQR---GFSGIF------EDRSYICKTT------IGDREVDS
. . : :. .: . .: ... :. : .:.. . . ::.. . :
CCDS34 LESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVYVPPQIGEKSLIS
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250
pF1KB7 --DAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTVVRQGENITLMCIVIGNEVVNFEWTYPRKE------
:.: :. . .: . .. .. : ...:. :: .:
CCDS34 PVDSYQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVED
440 450 460 470 480 490
260 270 280 290 300
pF1KB7 --SGRLVEPVTD-F-LLDMPYHIRSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINIT
.: .: . : :.. . : : : .:.. :. : :.....:. . :..:..
CCDS34 FQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANV--SALYKCEAVNKVG--RGERVISFH
500 510 520 530 540
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWFKDNRTLGDSSAGEIALST
:... . : . .: .: ..: .: . . .. :.: . .::. .
CCDS34 VTRGPEITLQPD---MQPTE-QESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPTPV
550 560 570 580 590 600
370 380 390 400 410
pF1KB7 -RNVSE---------TRYVSELTLVRVKVA---EAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVP
.:.. . .... ....: : . : :. : . .. . :..:
CCDS34 CKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLTVL
610 620 630 640 650 660
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 VRVL-----ELSESHPDSGEQT-VRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLLGNSS
:: .: .. . ::. : : . : : :.:.: .: . ::. .:.
CCDS34 ERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMW--FKDNE--------TLVEDSG
670 680 690 700 710
480 490 500 510 520
pF1KB7 EEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNA--VGQDTQEVIVVPHSL
.. . :.: . ..: : . : . : . :. .: . . .:: .:
CCDS34 IVLKDGNRNLTIRRVRKEDEGLYTCQACSV-----LGCAKVEAFFIIEGAQE----KTNL
720 730 740 750 760
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 PFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPM--Q
. ..: .:..:. . :.:.. .. :.. . :. : : . .: .
CCDS34 EIIILVGTAVIAMFFWLL--LVIILRTVKRANGGELKTGYL-SIVMDPDE-LPLDEHCER
770 780 790 800 810
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 LPYD-STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEK
:::: : ::.:::.: ::. :: ::::::.:: : :.... . ::::::: : ::.
CCDS34 LPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEH
820 830 840 850 860 870
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 QALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTK-GGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHH
.::::::::. :.: ::::::::::::: :::...:.:.:..:.: ::. ... :. ..
CCDS34 RALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYK
880 890 900 910 920 930
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 SDKRRPPSAELYSNALPVGLP--LPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVK
. : ... : .:.:: : : : .: . ...:... ..:.
CCDS34 TKGARFRQGKDYVGAIPVDLKRRLDSITSSQSSASSGFVE---EKSL-------------
940 950 960 970 980
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 YADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNC
.:.: . :: : : . :. :. .:.:::.:::::::..:
CCDS34 -SDVEEEE--APEDLY----------------KDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKC
990 1000 1010 1020
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 VHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTT
.::::::::.:. : ..::::::::::::..: .:. ::.. :::::::::.::. .::
CCDS34 IHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 LSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWE
:::::::.::::::.::..::: . ..:.: .:.: :: : ... :.:. : ::.
CCDS34 QSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 EKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPL
. :: ::.:: : ::
CCDS34 GEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEEDSGLSLPTSPVSCMEE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1106 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:14:38 2016 done: Thu Nov 3 18:14:39 2016
Total Scan time: 3.960 Total Display time: 0.360
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]