Result of FASTA (omim) for
pF1KB7021
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7021, 548 aa
1>>>pF1KB7021 548 - 548 aa - 548 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4680+/-0.000328; mu= 18.7854+/- 0.021
mean_var=92.9533+/-18.896, 0's: 0 Z-trim(117.0): 350 B-trim: 1126 in 1/54
Lambda= 0.133028
statistics sampled from 28239 (28649) to 28239 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 10.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_644807 (OMIM: 608302) leucine-rich repeat LGI f ( 548) 3756 731.2 1.9e-210
NP_005088 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich gliom ( 557) 2068 407.3 6.5e-113
NP_060646 (OMIM: 608301) leucine-rich repeat LGI f ( 545) 2002 394.6 4.2e-109
NP_001295205 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich gl ( 509) 1641 325.3 2.8e-88
NP_644813 (OMIM: 608303) leucine-rich repeat LGI f ( 537) 1565 310.7 7.3e-84
NP_001295204 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich gl ( 291) 998 201.7 2.7e-51
XP_016872400 (OMIM: 600512,604619) PREDICTED: leuc ( 281) 991 200.3 6.6e-51
XP_016863845 (OMIM: 608301) PREDICTED: leucine-ric ( 287) 968 195.9 1.4e-49
XP_011524897 (OMIM: 608303) PREDICTED: leucine-ric ( 365) 969 196.2 1.5e-49
XP_016881919 (OMIM: 608303) PREDICTED: leucine-ric ( 365) 969 196.2 1.5e-49
XP_016881917 (OMIM: 608303) PREDICTED: leucine-ric ( 365) 969 196.2 1.5e-49
XP_016881918 (OMIM: 608303) PREDICTED: leucine-ric ( 365) 969 196.2 1.5e-49
XP_011512152 (OMIM: 608301) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 965 195.4 2.4e-49
XP_016872401 (OMIM: 600512,604619) PREDICTED: leuc ( 243) 571 119.6 1.1e-26
XP_005264764 (OMIM: 269400,605158) PREDICTED: pero (1455) 365 80.8 3.2e-14
XP_011515759 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 353 78.5 1.6e-13
XP_005248194 (OMIM: 612303) PREDICTED: adhesion G ( 833) 328 73.5 2.9e-12
NP_660333 (OMIM: 612303) adhesion G protein-couple (1321) 328 73.7 4.1e-12
XP_011515758 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 317 71.6 1.9e-11
NP_001299615 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich re ( 962) 301 68.4 1.2e-10
XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolo (1460) 303 68.9 1.2e-10
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523) 303 68.9 1.3e-10
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530) 303 68.9 1.3e-10
XP_011531881 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 298 67.7 1.6e-10
XP_016861625 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 298 67.7 1.6e-10
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495) 301 68.5 1.6e-10
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499) 301 68.5 1.6e-10
XP_016861624 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 867) 298 67.8 1.6e-10
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509) 301 68.5 1.6e-10
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529) 301 68.6 1.7e-10
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533) 301 68.6 1.7e-10
NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653) 296 67.3 1.7e-10
XP_016867994 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 296 67.3 1.7e-10
XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 296 67.3 1.7e-10
XP_011531880 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1045) 298 67.8 1.9e-10
XP_016861623 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1068) 298 67.8 1.9e-10
NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and (1093) 298 67.8 1.9e-10
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521) 296 67.6 3.2e-10
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525) 296 67.6 3.2e-10
XP_005273528 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G ( 813) 292 66.6 3.5e-10
XP_011512212 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1159) 293 66.9 3.9e-10
NP_848665 (OMIM: 610462) reticulon-4 receptor-like ( 420) 287 65.4 4.2e-10
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 293 67.0 4.8e-10
XP_011542785 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G (1308) 292 66.8 4.9e-10
NP_116166 (OMIM: 606823) adhesion G protein-couple (1338) 292 66.8 5e-10
XP_011542783 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G (1361) 292 66.8 5e-10
XP_016873559 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 284 64.9 8.4e-10
XP_016873566 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 284 64.9 8.4e-10
XP_011518543 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 284 64.9 8.4e-10
XP_016873563 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 284 64.9 8.4e-10
>>NP_644807 (OMIM: 608302) leucine-rich repeat LGI famil (548 aa)
initn: 3756 init1: 3756 opt: 3756 Z-score: 3899.0 bits: 731.2 E(85289): 1.9e-210
Smith-Waterman score: 3756; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLMLQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKAVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLMLQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKAVPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYLFIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 NLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYLFIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCKVKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 NNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCKVKW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAEPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 LVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAEPFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVAQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 YSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVAQLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLYRWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 GGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLYRWH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 QNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQPFLVGGRRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 PDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQPFLVGGRRY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQELAVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTLVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 LALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQELAVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTLVYR
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HIVVDLSA
::::::::
NP_644 HIVVDLSA
>>NP_005088 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich glioma-in (557 aa)
initn: 1503 init1: 1468 opt: 2068 Z-score: 2148.1 bits: 407.3 E(85289): 6.5e-113
Smith-Waterman score: 2068; 52.0% identity (81.5% similar) in 535 aa overlap (22-548:23-557)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLM--LQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKA
.::. : .. . : : :: :.::.:.:.: ....
NP_005 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAKPKCPAVCTCTKDNALCENARS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VPRNLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYL
.::..: .::::..: ..:.::..:.: : ::.::..::.: .:.:.:: :: ::.::
NP_005 IPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLLLFTSNSFDVISDDAFIGLPHLEYL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FIENNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCK
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NP_005 FIENNNIKSISRHTFRGLKSLIHLSLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCDCK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKWLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAE
.:::::::.:::.:: ::: .::.....:...: ..:::: :.:. : : . ..: .
NP_005 LKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLSID
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PFLYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVA
: : .: :...::: .. : .:.::.::. .:.:: : . :.: :::.:...::::.::
NP_005 TFSYLNDEYVVIAQPFTGKCIFLEWDHVEKTFRNYDNITGTSTVVCKPIVIETQLYVIVA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QLFGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLY
::::::.::. : ...: ..:::. ..:::::.:.:.:...:::.:::::::: :..:
NP_005 QLFGGSHIYKRDSFANKFIKIQDIEILKIRKPNDIETFKIENNWYFVVADSSKAGFTTIY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 RWHQNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVD------GEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQF
.:. :::::::.:: :.::::.:... :.::.::::: ::::::... . :
NP_005 KWNGNGFYSHQSLHAWYRDTDVEYLEIVRTPQTLRTPHLILSSSSQRPVIYQWNKATQLF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 VAQGEVTQVPDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQ
. : .. .. :. ::::: . : :.::.:.:::::...: :. :...: .:::::...:
NP_005 TNQTDIPNMEDVYAVKHFSVKGDVYICLTRFIGDSKVMKWGGSSFQDIQRMPSRGSMVFQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PFLVGGRRYLALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQELAVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPS
:. ... .: ::::.::::.:.:: . :::.:::: :::::.: .. . ..:.: :
NP_005 PLQINNYQYAILGSDYSFTQVYNWDAEKAKFVKFQELNVQAPRSFTHVSINKRNFLFASS
490 500 510 520 530 540
540
pF1KB7 FKGQTLVYRHIVVDLSA
:::.: .:.:..:::::
NP_005 FKGNTQIYKHVIVDLSA
550
>>NP_060646 (OMIM: 608301) leucine-rich repeat LGI famil (545 aa)
initn: 1976 init1: 1976 opt: 2002 Z-score: 2079.8 bits: 394.6 E(85289): 4.2e-109
Smith-Waterman score: 2002; 51.5% identity (80.4% similar) in 542 aa overlap (7-547:5-544)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLRARGGPGP-GLLALSALGFCLMLQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKAVP
::: : ::: : . ::. . . : . :: .::::... .:: :. ::
NP_060 MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVR--RLARCPATCSCTKESIICVGSSWVP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RNLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYLFI
: .:... ::.:::..::::.: ::::: ::.::::::.::.: :.::.:: ::.::::
NP_060 RIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ENNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCKVK
:.: : ..:. .::::..:::::::::....::::.: :: : .::::::...::::.:
NP_060 EGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 WLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAEPF
:: :: ::.::. . : .::..::.:..:. ...: :::::..::: . .::.. :
NP_060 WLYLWLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVAQL
..:.:.:.:::.. : .:.::..: ..:.:: : . : : :: ...:.:..::::::
NP_060 NSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 FGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLYRW
::::.::..: . :.:...:::. .:. ::::.: :.:: . .:..::::::: ...:.:
NP_060 FGGSHIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIADSSKAGLSTVYKW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HQNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQ
...::::.:.:: : :::: :::: .:: .::.:: ::.:.: ::....:.:: .:.. .
NP_060 NSKGFYSYQSLHEWFRDTDAEFVDIDGKSHLILSSRSQVPIILQWNKSSKKFVPHGDIPN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 VPDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQPFLVGGRR
. :. ::: :: :: :.:.::::...::.. .: :.:::::::...:::: .
NP_060 MEDVLAVKSFRMQNTLYLSLTRFIGDSRVMRWNSKQFVEIQALPSRGAMTLQPFSFKDNH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 YLALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQELAVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTLVY
:::::::..:.::::::. .: : .:.:. :::::.: . . ....: ::::.: ..
NP_060 YLALGSDYTFSQIYQWDKEKQLFKKFKEIYVQAPRSFTAVSTDRRDFFFASSFKGKTKIF
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB7 RHIVVDLSA
.::.::::
NP_060 EHIIVDLSL
540
>>NP_001295205 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich glioma (509 aa)
initn: 1079 init1: 1044 opt: 1641 Z-score: 1705.7 bits: 325.3 E(85289): 2.8e-88
Smith-Waterman score: 1757; 46.2% identity (73.6% similar) in 535 aa overlap (22-548:23-509)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLM--LQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKA
.::. : .. . : : :: :.::.:.:.: ....
NP_001 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAKPKCPAVCTCTKDNALCENARS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VPRNLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYL
.::..: .::::..: ..:.::..:.: : ::.:
NP_001 IPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLL------------------------
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FIENNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCK
:::::::::::.:::. :: :...::::::.:::::
NP_001 ------------------------SLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCDCK
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKWLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAE
.:::::::.:::.:: ::: .::.....:...: ..:::: :.:. : : . ..: .
NP_001 LKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLSID
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PFLYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVA
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NP_001 TFSYLNDEYVVIAQPFTGKCIFLEWDHVEKTFRNYDNITGTSTVVCKPIVIETQLYVIVA
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QLFGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLY
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NP_001 QLFGGSHIYKRDSFANKFIKIQDIEILKIRKPNDIETFKIENNWYFVVADSSKAGFTTIY
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 RWHQNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVD------GEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQF
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NP_001 KWNGNGFYSHQSLHAWYRDTDVEYLEIVRTPQTLRTPHLILSSSSQRPVIYQWNKATQLF
320 330 340 350 360 370
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pF1KB7 VAQGEVTQVPDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQ
. : .. .. :. ::::: . : :.::.:.:::::...: :. :...: .:::::...:
NP_001 TNQTDIPNMEDVYAVKHFSVKGDVYICLTRFIGDSKVMKWGGSSFQDIQRMPSRGSMVFQ
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PFLVGGRRYLALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQELAVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPS
:. ... .: ::::.::::.:.:: . :::.:::: :::::.: .. . ..:.: :
NP_001 PLQINNYQYAILGSDYSFTQVYNWDAEKAKFVKFQELNVQAPRSFTHVSINKRNFLFASS
440 450 460 470 480 490
540
pF1KB7 FKGQTLVYRHIVVDLSA
:::.: .:.:..:::::
NP_001 FKGNTQIYKHVIVDLSA
500
>>NP_644813 (OMIM: 608303) leucine-rich repeat LGI famil (537 aa)
initn: 1531 init1: 1148 opt: 1565 Z-score: 1626.6 bits: 310.7 E(85289): 7.3e-84
Smith-Waterman score: 1565; 42.8% identity (72.8% similar) in 544 aa overlap (8-548:2-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLMLQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKAVPR
:: : :: :.. : : : :::: :: :::..:.:.: : .:
NP_644 MGGAGILLLLLAGAGV-----VVAWRPPKGK-CPLRCSCSKDSALCEGSPDLPV
10 20 30 40
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pF1KB7 NLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYLFIE
.. ..::.:: .. .... :.: ..: :..::..::.:..: :.::.:::::::::::
NP_644 SFSPTLLSLSLVRTGVTQLKAGSFLRIPSLHLLLFTSNSFSVIEDDAFAGLSHLQYLFIE
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pF1KB7 NNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCKVKW
.:.: ..:: ..:::.::::::::::.:.:::: .:: :: :. .::::: ..:::.: :
NP_644 DNEIGSISKNALRGLRSLTHLSLANNHLETLPRFLFRGLDTLTHVDLRGNPFQCDCRVLW
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 LVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAEPFL
:..:. .:..:. ::.: ... ... : . : : . .. .::.. :.:.:::
NP_644 LLQWMPTVNASVGTGACAGPASLSHMQLHHLDPKTFKCRAIELSWFQTVGESALSVEPFS
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 YSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVAQLF
:... ...:::: .. : ::.::: ...: ...:: :.: :::.:. .:.:..:.:.
NP_644 YQGEPHIVLAQPFAGRCLILSWDYSLQRFRPEEELPAASVVSCKPLVLGPSLFVLAARLW
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pF1KB7 GGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLYRWH
::: .. :.. : . :.:. .::: : . ..:. :.:::.::::.:.:
NP_644 GGSQLWARPSPGLRLAPTQTLAPRRLLRPNDAELLWLEGQPCFVVADASKAGSTTLLCRD
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 QNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQV
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NP_644 GPGFYPHQSLHAWHRDTDAEALELDGRPHLLLASASQRPVLFHW--TGGRFERRTDIPEA
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 PDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQPFLVGGRRY
:. :..::.:: : .:::.:::::: ..::.:. : .: :::::. ..::.:.. .
NP_644 EDVYATRHFQAGGDVFLCLTRYIGDSMVMRWDGSMFRLLQQLPSRGAHVFQPLLIARDQL
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pF1KB7 LALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQEL---AVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTL
:::::.:.:. . . . . .::: :. ::::: .. . ..:.: ::: :
NP_644 AILGSDFAFSQVLRLEPDKGLLEPLQELGPPALVAPRAFAHITMAGRRFLFAACFKGPTQ
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB7 VYRHIVVDLSA
.:.: .::::
NP_644 IYQHHEIDLSA
530
>>NP_001295204 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich glioma (291 aa)
initn: 1093 init1: 961 opt: 998 Z-score: 1042.0 bits: 201.7 E(85289): 2.7e-51
Smith-Waterman score: 998; 51.3% identity (80.6% similar) in 263 aa overlap (22-282:23-285)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLM--LQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKA
.::. : .. . : : :: :.::.:.:.: ....
NP_001 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAKPKCPAVCTCTKDNALCENARS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 VPRNLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYL
.::..: .::::..: ..:.::..:.: : ::.::..::.: .:.:.:: :: ::.::
NP_001 IPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLLLFTSNSFDVISDDAFIGLPHLEYL
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pF1KB7 FIENNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCK
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NP_001 FIENNNIKSISRHTFRGLKSLIHLSLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCDCK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKWLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAE
.:::::::.:::.:: ::: .::.....:...: ..:::: :.:. : : . ..: .
NP_001 LKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLSID
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PFLYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVA
: : .: :...::: .. : .:.::.::. .:.:: : . .:
NP_001 TFSYLNDEYVVIAQPFTGKCIFLEWDHVEKTFRNYDNITVLREIHRFTNMS
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QLFGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLY
>>XP_016872400 (OMIM: 600512,604619) PREDICTED: leucine- (281 aa)
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Smith-Waterman score: 991; 52.3% identity (81.6% similar) in 256 aa overlap (22-275:23-278)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLRARGGPGPGLLALSALGFCLM--LQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKA
.::. : .. . : : :: :.::.:.:.: ....
XP_016 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAKPKCPAVCTCTKDNALCENARS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VPRNLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYL
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XP_016 IPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLLLFTSNSFDVISDDAFIGLPHLEYL
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 FIENNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCK
:::::.: ..:. :::::::: :::::::::::::.:::. :: :...::::::.:::::
XP_016 FIENNNIKSISRHTFRGLKSLIHLSLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCDCK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKWLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAE
.:::::::.:::.:: ::: .::.....:...: ..:::: :.:. : : . ..: .
XP_016 LKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLSID
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PFLYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVA
: : .: :...::: .. : .:.::.::. .:.:: :
XP_016 TFSYLNDEYVVIAQPFTGKCIFLEWDHVEKTFRNYDNITGS
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QLFGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLY
>>XP_016863845 (OMIM: 608301) PREDICTED: leucine-rich re (287 aa)
initn: 1125 init1: 939 opt: 968 Z-score: 1010.9 bits: 195.9 E(85289): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 968; 50.5% identity (78.3% similar) in 277 aa overlap (7-282:5-279)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGLRARGGPGP-GLLALSALGFCLMLQVSAKRPPKTPPCPPSCSCTRDTAFCVDSKAVP
::: : ::: : . ::. . . : . :: .::::... .:: :. ::
XP_016 MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVR--RLARCPATCSCTKESIICVGSSWVP
10 20 30 40 50
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pF1KB7 RNLPSEVISLTLVNAAFSEIQDGAFSHLPLLQFLLLNSNKFTLIGDNAFTGLSHLQYLFI
: .:... ::.:::..::::.: ::::: ::.::::::.::.: :.::.:: ::.::::
XP_016 RIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFI
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 ENNDIWALSKFTFRGLKSLTHLSLANNNLQTLPRDIFRPLDILNDLDLRGNSLNCDCKVK
:.: : ..:. .::::..:::::::::....::::.: :: : .::::::...::::.:
XP_016 EGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAK
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 WLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDCITTDFVLYQTLAFPAVSAEPF
:: :: ::.::. . : .::..::.:..:. ...: :::::..::: . .::.. :
XP_016 WLYLWLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTF
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 LYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAPSAVHCKPMVVDSQLYVVVAQL
..:.:.:.:::.. : .:.::..: ..:.:: : . . :
XP_016 NSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITVEDDEHGTTLESAA
240 250 260 270 280
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pF1KB7 FGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRIDGDWYFAVADSSKAGATSLYRW
>>XP_011524897 (OMIM: 608303) PREDICTED: leucine-rich re (365 aa)
initn: 880 init1: 583 opt: 969 Z-score: 1010.6 bits: 196.2 E(85289): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 969; 39.4% identity (70.8% similar) in 363 aa overlap (189-548:5-365)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LDILNDLDLRGNSLNCDCKVKWLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDC
:..:. ::.: ... ... : . : :
XP_011 MPTVNASVGTGACAGPASLSHMQLHHLDPKTFKC
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ITTDFVLYQTLAFPAVSAEPFLYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAP
. .. .::.. :.:.::: :... ...:::: .. : ::.::: ...: ...::
XP_011 RAIELSWFQTVGESALSVEPFSYQGEPHIVLAQPFAGRCLILSWDYSLQRFRPEEELPAA
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 SAVHCKPMVVDSQLYVVVAQLFGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRID
:.: :::.:. .:.:..:.:.::: .. :.. : . :.:. .::: : . ..
XP_011 SVVSCKPLVLGPSLFVLAARLWGGSQLWARPSPGLRLAPTQTLAPRRLLRPNDAELLWLE
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 GDWYFAVADSSKAGATSLYRWHQNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQA
:. :.:::.::::.:.: ::: ::.:: :::::: : .. .:.:.:...:.::
XP_011 GQPCFVVADASKAGSTTLLCRDGPGFYPHQSLHAWHRDTDAEALELDGRPHLLLASASQR
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 PVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQVPDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSE
::...: : .: . .. .. :. :..::.:: : .:::.:::::: ..::.:. :
XP_011 PVLFHW--TGGRFERRTDIPEAEDVYATRHFQAGGDVFLCLTRYIGDSMVMRWDGSMFRL
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 VQALPSRGSLALQPFLVGGRRYLALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQEL---AVQAPRA
.: :::::. ..::.:.. . :::::.:.:. . . . . .::: :. ::::
XP_011 LQQLPSRGAHVFQPLLIARDQLAILGSDFAFSQVLRLEPDKGLLEPLQELGPPALVAPRA
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pF1KB7 FCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTLVYRHIVVDLSA
: .. . ..:.: ::: : .:.: .::::
XP_011 FAHITMAGRRFLFAACFKGPTQIYQHHEIDLSA
340 350 360
>>XP_016881919 (OMIM: 608303) PREDICTED: leucine-rich re (365 aa)
initn: 880 init1: 583 opt: 969 Z-score: 1010.6 bits: 196.2 E(85289): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 969; 39.4% identity (70.8% similar) in 363 aa overlap (189-548:5-365)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LDILNDLDLRGNSLNCDCKVKWLVEWLAHTNTTVAPIYCASPPRFQEHKVQDLPLREFDC
:..:. ::.: ... ... : . : :
XP_016 MPTVNASVGTGACAGPASLSHMQLHHLDPKTFKC
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ITTDFVLYQTLAFPAVSAEPFLYSSDLYLALAQPGVSACTILKWDYVERQLRDYDRIPAP
. .. .::.. :.:.::: :... ...:::: .. : ::.::: ...: ...::
XP_016 RAIELSWFQTVGESALSVEPFSYQGEPHIVLAQPFAGRCLILSWDYSLQRFRPEEELPAA
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SAVHCKPMVVDSQLYVVVAQLFGGSYIYHWDPNTTRFTRLQDIDPQRVRKPNDLEAFRID
:.: :::.:. .:.:..:.:.::: .. :.. : . :.:. .::: : . ..
XP_016 SVVSCKPLVLGPSLFVLAARLWGGSQLWARPSPGLRLAPTQTLAPRRLLRPNDAELLWLE
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GDWYFAVADSSKAGATSLYRWHQNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQA
:. :.:::.::::.:.: ::: ::.:: :::::: : .. .:.:.:...:.::
XP_016 GQPCFVVADASKAGSTTLLCRDGPGFYPHQSLHAWHRDTDAEALELDGRPHLLLASASQR
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 PVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQVPDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSE
::...: : .: . .. .. :. :..::.:: : .:::.:::::: ..::.:. :
XP_016 PVLFHW--TGGRFERRTDIPEAEDVYATRHFQAGGDVFLCLTRYIGDSMVMRWDGSMFRL
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 VQALPSRGSLALQPFLVGGRRYLALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQEL---AVQAPRA
.: :::::. ..::.:.. . :::::.:.:. . . . . .::: :. ::::
XP_016 LQQLPSRGAHVFQPLLIARDQLAILGSDFAFSQVLRLEPDKGLLEPLQELGPPALVAPRA
280 290 300 310 320 330
520 530 540
pF1KB7 FCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTLVYRHIVVDLSA
: .. . ..:.: ::: : .:.: .::::
XP_016 FAHITMAGRRFLFAACFKGPTQIYQHHEIDLSA
340 350 360
548 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:55:37 2016 done: Thu Nov 3 22:55:39 2016
Total Scan time: 10.280 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]