FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7020, 998 aa
1>>>pF1KB7020 998 - 998 aa - 998 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8317+/-0.00113; mu= -4.8560+/- 0.067
mean_var=351.7478+/-77.610, 0's: 0 Z-trim(112.4): 568 B-trim: 161 in 1/53
Lambda= 0.068385
statistics sampled from 12499 (13196) to 12499 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 5.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 6755 681.6 2.1e-195
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 4737 482.5 1.8e-135
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 4732 482.0 2.7e-135
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 4728 481.6 3.4e-135
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 4722 481.0 5.1e-135
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 3877 397.7 6.3e-110
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 3815 391.5 4.4e-108
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 3719 382.1 3.1e-105
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 3697 379.9 1.4e-104
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 3695 379.7 1.6e-104
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 3187 329.6 2e-89
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 2606 272.3 3.5e-72
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3 (1130) 2244 236.6 2.2e-61
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 1991 211.6 6.4e-54
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 1945 207.1 1.6e-52
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 1945 207.1 1.6e-52
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 (1008) 1867 199.4 3.2e-50
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 1816 194.3 1e-48
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 (1022) 1810 193.7 1.6e-48
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 1801 192.6 1.8e-48
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 ( 729) 1740 186.7 1.5e-46
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 1735 186.3 2.6e-46
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 ( 495) 1400 153.0 1.4e-36
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 279) 913 104.8 2.6e-22
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 ( 295) 862 99.7 9e-21
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 746 88.9 7.8e-17
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 740 88.3 1.2e-16
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 740 88.3 1.2e-16
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 734 87.6 1.5e-16
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 734 87.6 1.5e-16
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 709 84.8 4.3e-16
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 709 85.0 6.7e-16
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 697 83.5 7.5e-16
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 704 84.6 1.1e-15
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 699 84.0 1.2e-15
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 697 83.7 1.2e-15
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 699 84.0 1.2e-15
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 699 84.0 1.3e-15
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 704 84.7 1.3e-15
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 704 84.7 1.3e-15
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 704 84.7 1.3e-15
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 694 83.4 1.3e-15
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 699 84.1 1.3e-15
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 693 83.3 1.4e-15
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 704 84.7 1.4e-15
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 693 83.3 1.5e-15
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 693 83.3 1.5e-15
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 693 83.3 1.5e-15
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 694 83.5 1.5e-15
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 689 82.9 1.9e-15
>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 (998 aa)
initn: 6755 init1: 6755 opt: 6755 Z-score: 3621.5 bits: 681.6 E(32554): 2.1e-195
Smith-Waterman score: 6755; 100.0% identity (100.0% similar) in 998 aa overlap (1-998:1-998)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAGRVNTKVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAGRVNTKVRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVIAPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVIAPGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQGEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQGEGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLILEWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLILEWS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLLAHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLLAHTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPPERPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPPERPN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GVILDYEMKYFEKSEGIASTVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQYSRPAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVILDYEMKYFEKSEGIASTVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQYSRPAEF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 ETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEYTEKLQQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEYTEKLQQY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 IAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKQPGRREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKQPGRREV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 FVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFMENCALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFMENCALD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYW
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 DMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNAA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 SLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFDLVAQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFDLVAQM
910 920 930 940 950 960
970 980 990
pF1KB7 TAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
970 980 990
>>CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (986 aa)
initn: 3989 init1: 2297 opt: 4737 Z-score: 2545.6 bits: 482.5 E(32554): 1.8e-135
Smith-Waterman score: 4737; 70.4% identity (86.2% similar) in 986 aa overlap (23-998:10-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES
::::::: :.::::::. .:.::.: :: :
CCDS22 MALRRLGAALLLLPLLA------AVEETLMDSTTATAELGWMVHPPS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIP
:::::::::: :: ::::::::: :::::::::: :: :: ..:..::.::.::::.:::
CCDS22 GWEEVSGYDENMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 NIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNT
..::::::::::.::::: : :. . : :::::.::::::: :::::..: : ..::
CCDS22 SVPGSCKETFNLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KVRSFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVI
.::::::.:..:::::::: :.:::::.::.::.:: . :.: :::.::: ::::
CCDS22 EVRSFGPVSRSGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 APGTCIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ
: :.:: :: ::.::.::::::::::.::.: : : .: : . . . :: :: :..::.:
CCDS22 ARGSCIANAEEVDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLI
:. : :: :::::: .:. :.:.:..:::: : : :::.:: :..:::.::::::.
CCDS22 GDEACTHCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLM
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLL
:::. ::: :::.::.::.:::.: ..: .::.:: :::...:::::::: :..:: ::
CCDS22 LEWTPPRDSGGREDLVYNIICKSC--GSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLL
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 AHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPP
:::.::::.::::::. .::. :..:.::::::::::: : .. : . .:.::::. :
CCDS22 AHTQYTFEIQAVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ERPNGVILDYEMKYFEK--SEGIASTVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQY
..:::::::::..:.:: :: :... : :.: ..::. : :: :::::::::::.:
CCDS22 DQPNGVILDYELQYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRY
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 SRPAEFETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEYT
: :.: .: . ..::.::::.::..:::::..::::::::: :. . .:::::
CCDS22 SGKMYFQTMTE-AEYQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYT
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 EKLQQY----IAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRG
.:::.: ..::::.::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::: :
CCDS22 DKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 RLKQPGRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIL
.:: ::.::.:::::::: ::::.:::::::::::::::::::.:.:::::::: ::::.
CCDS22 HLKLPGKREIFVAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMII
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 TEFMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNL
:::::: .:::::: ::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS22 TEFMENGSLDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 VCKVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWE
:::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS22 VCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWE
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 VMSYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVN
::::::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::::: .::: ::::.::::
CCDS22 VMSYGERPYWDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 TLDKLIRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAG
::::.::: :::..: .::.. ::::::.::::.:.:: .::.:::::.:::::..::
CCDS22 TLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAG
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990
pF1KB7 FASFDLVAQMTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
:.:::.:.:: ::.::.::::::::::::.::: :: :::: :.:
CCDS22 FTSFDVVSQMMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
940 950 960 970 980
>>CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055 aa)
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Smith-Waterman score: 4732; 70.4% identity (86.2% similar) in 985 aa overlap (23-997:10-985)
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CCDS23 GFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
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CCDS46 NVPGSCKETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNT
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.:::::::.. :::::::: ::::::.:::.:.::: : . .::.::::.:::: :::::
CCDS46 EVRSFGPLTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVI
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pF1KB7 APGTCIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ
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CCDS46 ARGTCIPNAEEVDVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVA-CKACPAGTFKASQ
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CCDS46 SGKMCFQTLTD-DDYKSELREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYS
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pF1KB7 EKLQQYI----APGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRG
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CCDS46 DKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKG
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CCDS46 RLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMII
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CCDS46 TEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNL
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CCDS46 VCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWE
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CCDS46 VMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVN
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pF1KB7 TLDKLIRNAASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAG
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CCDS46 TLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAG
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CCDS46 FTSLQLVTQMTSEDLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
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CCDS57 MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWEE
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CCDS24 IRNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLE
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CCDS24 AVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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CCDS29 SPDSFSISGE-SSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGH
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CCDS29 ISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSL
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pF1KB7 SRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPY
:: ::::: . .::. :::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS29 SRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPY
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pF1KB7 WDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNA
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CCDS29 WEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNP
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pF1KB7 ASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFDLVAQ
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CCDS29 GSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAK
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pF1KB7 MTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQM-NQTLPVQV
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CCDS29 ISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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CCDS75 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
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CCDS75 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
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CCDS75 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIK----ENQYIKIDT
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