FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7018, 972 aa
1>>>pF1KB7018 972 - 972 aa - 972 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9803+/-0.00159; mu= -6.4775+/- 0.091
mean_var=473.6061+/-114.876, 0's: 0 Z-trim(105.8): 368 B-trim: 308 in 1/53
Lambda= 0.058934
statistics sampled from 8252 (8619) to 8252 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 4.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 6533 572.2 1.7e-162
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 976) 6515 570.7 5.1e-162
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 ( 972) 2267 209.5 2.7e-53
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 ( 993) 1512 145.3 5.7e-34
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 1081 108.8 7.5e-23
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089) 822 86.7 2.8e-16
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106) 759 81.3 1.2e-14
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 747 80.4 2.7e-14
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298) 721 78.2 1.2e-13
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363) 721 78.2 1.2e-13
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 695 75.6 3.4e-13
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 695 75.7 3.7e-13
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 695 75.7 3.7e-13
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 695 75.7 3.8e-13
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 695 75.7 3.8e-13
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 695 75.7 4.1e-13
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 695 75.7 4.1e-13
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 695 75.7 4.1e-13
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 690 75.2 5.2e-13
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 690 75.3 5.2e-13
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 689 75.1 5.2e-13
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 689 75.1 5.3e-13
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 690 75.3 5.5e-13
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 690 75.3 5.5e-13
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 690 75.3 5.5e-13
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 690 75.3 5.6e-13
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 689 75.2 5.6e-13
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 690 75.3 5.7e-13
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 689 75.2 5.8e-13
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 689 75.2 5.8e-13
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 685 74.8 6.8e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 678 74.2 1e-12
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 678 74.3 1.1e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 678 74.3 1.1e-12
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 631 70.4 2.1e-11
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 631 70.4 2.2e-11
>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (972 aa)
initn: 6533 init1: 6533 opt: 6533 Z-score: 3030.6 bits: 572.2 E(32554): 1.7e-162
Smith-Waterman score: 6533; 100.0% identity (100.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 YKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 EATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 PTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNEYMDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNEYMDM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 KPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 VYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 TCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB7 SSSQPLLVHDDV
::::::::::::
CCDS47 SSSQPLLVHDDV
970
>>CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (976 aa)
initn: 3428 init1: 3428 opt: 6515 Z-score: 3022.3 bits: 570.7 E(32554): 5.1e-162
Smith-Waterman score: 6515; 99.6% identity (99.6% similar) in 976 aa overlap (1-972:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB7 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFK----EQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIV
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKGNNKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 MILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAF
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 GKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGAC
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 TIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNE
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 YMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGM
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 AFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPES
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 IFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMY
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 DIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSV
910 920 930 940 950 960
960 970
pF1KB7 GSTASSSQPLLVHDDV
::::::::::::::::
CCDS34 GSTASSSQPLLVHDDV
970
>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 (972 aa)
initn: 1838 init1: 822 opt: 2267 Z-score: 1070.3 bits: 209.5 E(32554): 2.7e-53
Smith-Waterman score: 2301; 42.1% identity (69.5% similar) in 932 aa overlap (37-939:21-930)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 AWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFVKW
: :.:. .:.:. : . : :. : :.:
CCDS43 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 TFEILDE---TNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCT---NKHGLSNSIYVFVRDPAKLF-L
. ...... :..: ::: : :: . : : .:...:.:::. . .
CCDS43 DGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEV-TNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRA
. . . ::.:.:. : :::: . .. :: .:.:: . . .: :. :. .:
CCDS43 LAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDV
. .::. . :..:.: .. :::. .. . :.... : . .:: ..:. ..:
CCDS43 QSQD-YQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGS
. . .... ..:. ::: .: :.. :.. ::..... . .: . : :.:. :.
CCDS43 DVN-FDVFLQHNN-TKLAIPQQSDFHNN-RYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 ANVTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK
... ..::.....:. : :. ::...: : ::.: . .: :.. :.:.
CCDS43 HSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLG-PFSDH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 WEDYPKSENESN---IRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEI
. :: : .. :.. : : ::: .:.: :.::. : :..:.. . ::.
CCDS43 QPE-PKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LTYDRLVNG--MLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCS-ASVLPV--DVQTLNSSGPPFG
. ..:: : :.:.:.:.:.. : : : .::. :.:: : : : ::
CCDS43 SVIWTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFH
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB7 KLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTS-AYFNFAFKEQIHP--HTLFTPLLIGFVI
:..::: . ...:: : ::.:.:.::. : :.. .. . :: . ::::.... .
CCDS43 KVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMS
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 VAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSF
. ... .....: ::: ::: :.:.::..: .::.:..::::::::..::::::: :.:
CCDS43 IMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQF
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 GKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHM
:::::::::::::::::.:: : ::.. ::::::: .:: :.::::::::..:.::.:
CCDS43 GKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHE
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 NIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFI---CSKQEDHAEAALYKNLLH
:::::::::: :::.::::::::::::::::::: .... : .: .. :::.
CCDS43 NIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHL
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KB7 SKESSCSDS------TNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL
:. :: .. :..:.: : :... :. :.:. ..:
CCDS43 EKKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRP-----VSTSSND-------SFSEQDLD----KEDGR
710 720 730 740
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSN
:.:.::: :: :::.::::::::::::::.::::.:::.:...:: :::::::: ::::
CCDS43 PLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSN
750 760 770 780 790 800
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 YVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKM
:.::::::::::::::::::.:::: .::::::::.:::.:::: .::::. :.:::::.
CCDS43 YIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKL
810 820 830 840 850 860
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 IKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISEST-NHIYSNLAN
.:.:..: .: :: ..:.::..:: .: .::::.:: .....: .:. .. :.:: .
CCDS43 VKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPS
870 880 890 900 910 920
940 950 960 970
pF1KB7 CSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
:
CCDS43 SSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
930 940 950 960 970
>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 (993 aa)
initn: 1394 init1: 781 opt: 1512 Z-score: 723.3 bits: 145.3 E(32554): 5.7e-34
Smith-Waterman score: 1639; 33.9% identity (61.8% similar) in 956 aa overlap (20-935:47-958)
10 20 30 40
pF1KB7 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPG-EPSPPSIHPGKSDLI-
: .:: : :: . : ...: .: .
CCDS31 FSAMIFGTITNQDLPVIKCVLINHKNNDSSVGKSSSYPMVSESPEDLGCALRPQSSGTVY
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90
pF1KB7 ------VRVGDEIRL--LCTDPGFVK--WTFE--ILD-ETNENKQNEWITE----KAEAT
: :. : : : :: .. :.:. :. . . . ::. .. : :
CCDS31 EAAAVEVDVSASITLQVLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTET
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB7 NTGKYTCTNKHGLSNSIYVF---VRDPAKLFLVDRSLYGK-EDNDTLVRCPLTDPE-VTN
..:.: . .: .: .:. . :. . : . : :..:.:: . :: ...
CCDS31 QAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRN-TLLYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 YSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLC---LHCSVDQEGKSVLSEKFIL
. : ::. .. .: ..:. ... :.: ..: . .: .. : .
CCDS31 WVLCDSQGESCKEE-----SP---AVVKKEEKVLHELFGTDIRCCARNELGRECTRLFTI
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 KVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSW
. . .: ... . .:. :: . . : :. . ::. :: : :. : .
CCDS31 DL----NQTPQTTLPQ--LFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELEN---KALEEGNYF
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB7 HHGDFNYERQATLT----ISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANVTTTLEVVDKGFINIFPM
. . .. .: .::. ::.: . : ... ... ..: .:.:::::
CCDS31 EMSTYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVT---IVEKGFINA-TN
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 INTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKSENESNIRYVSELH
. ... :. . :...:.:. . : . ..: . . .. . : .. .. :
CCDS31 SSEDYEIDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCT-WTFSRKSFPCEQKGLDNGYSIS--KFCNHKH
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 LTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDRLVNGMLQCVAAGFPEPTI
. : : : . :.:.. . :.. . ::..:. . .. .: . :.: :.
CCDS31 -------QPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLA--EASASQASCFSDGYPLPSW
420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 DWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVG
: : :. . : . ... ::. : .:... : .. :.: :::..:
CCDS31 TWKKCSDKSPNCTEEITE-GVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLG
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 KTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT----YKYLQKPMYEVQWK
:: . . : : :.: . :. .....:: .:: .. :: : .
CCDS31 -TSCETILLNSPGPFP---FIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQ
530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 VVEEING---NNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSD
.:. ..: :.: :.: . :: ::::::. : :::.::.::::::..:::::. :.
CCDS31 MVQ-VTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTG
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 AAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCY
... ::::::: .: .::::::::::... ::.: ::::::::::..:: .: :::::
CCDS31 VSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCY
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 GDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAAL-YKNLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPT
:::::.:: ::..: . : : . . ..:. .: .. : ....: . .
CCDS31 GDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHPNSSMPGSRE-VQIHPDSDQISGL
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770 780
pF1KB7 KADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL-ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDL
.... .: . :: . . :...: .: .:::: :.::::::: :: :.:.::::
CCDS31 HGNSFHSE---DEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDL
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 AARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVW
::::.:.:::...::::::::::: .::::::.::::::::::::::.:. .::..::::
CCDS31 AARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVW
820 830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 SYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLK
::::.:::.:::: .::::.:::..:::.:..::.: .: .: :.: ::..:: : :
CCDS31 SYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRK
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 RPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVH
::.: ...... :.... . .:.:.
CCDS31 RPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVED
940 950 960 970 980 990
>>CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338 aa)
initn: 1243 init1: 705 opt: 1081 Z-score: 523.7 bits: 108.8 E(32554): 7.5e-23
Smith-Waterman score: 1304; 36.8% identity (63.1% similar) in 677 aa overlap (273-918:520-1152)
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSA--N
.::.....:. ::...: :.: :.. :
CCDS93 FILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRI--SGIYICIASNKVGTVGRN
490 500 510 520 530 540
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
.. . : .:: .: . ..::.. : . : . :: . :: ...
CCDS93 ISFYITDVPNGF-----HVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRD-VTWILL-RTVNNRTM
550 560 570 580 590 600
370 380 390 400 410
pF1KB7 DYPKSENESNI--RYVSELHLTRLKGT--EGGTYTFLVSNSDVNAAI----AFNVYVNTK
: :... : .. :.:: .. . ..:::. . : .. : ... .
CCDS93 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
610 620 630 640 650 660
420 430 440 450 460
pF1KB7 PEILTY--DRLV----NGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSG
: .: :. : . :.: : : ::: : :. :. . .: :
CCDS93 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIIL----------G
670 680 690 700 710
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 PPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVG--KTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIG
: . : .. . . .:. .::: :. : ..:::.. . :.: .
CCDS93 PGSSTLFIERVTE----EDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELIT---LT
720 730 740 750 760
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 FVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPT--QLPYD-HKWEFP
. ::. . ... : . ... :.. . : . : .: .:::: ::::
CCDS93 CTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFA
770 780 790 800 810 820
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 RNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLS
:.::..::.:: :::::::.:.:.:. :: . :::::::: .: .: .:::.:::.:.
CCDS93 RERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILT
830 840 850 860 870 880
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 YLGNHMNIVNLLGACTI-GGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYK
..:.:.:.:::::::: ::: .::.::: ::.: :.:. ::: :. .: .:::.
CCDS93 HIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNK-----DAALH-
890 900 910 920 930
710 720 730 740 750
pF1KB7 NLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVR--IGSYIERDVTPAIMEDDEL
. .::. :.::. . :. : . .: ...: . . .:..:
CCDS93 -MEPKKEK-----------MEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEED
940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 A-------LDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLAR
. . .:::.:.:.:::.:: ::.:..:::::::::::::... ..:::::::::
CCDS93 SDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLAR
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 DIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPV
:: .. .:: ::..:::.:::::::::. .:. .:::::::..:::.::::.:::::. .
CCDS93 DIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQM
1050 1060 1070 1080 1090 1100
880 890 900 910 920 930
pF1KB7 DSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHI
: : . ..::.:: .::.. :.:.:: :: :: .:: : ..:.
CCDS93 DEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQD
1110 1120 1130 1140 1150 1160
940 950 960 970
pF1KB7 YSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
CCDS93 GKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISAPKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERI
1170 1180 1190 1200 1210 1220
>>CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089 aa)
initn: 1503 init1: 788 opt: 822 Z-score: 405.8 bits: 86.7 E(32554): 2.8e-16
Smith-Waterman score: 1866; 36.5% identity (63.9% similar) in 987 aa overlap (35-955:26-984)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 RGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFV
: ::: :.... .:.... . : : . :
CCDS34 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100
pF1KB7 KWTFEILDETN--------ENKQNEWIT----EKAEATNTGKYTCTNKHGLSNS------
.: . . .: . ::... ..: .: :..:: ::: .: ..
CCDS34 SWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 -IYVFVRDPAKLF----LVDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLR
::..: :: : ..: . ..:..... : :::: : .:.. .: .: .
CCDS34 HIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPE-TPVTLHNSEGV-VPASY-
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV-VSVSKAS
: . :. . : : . .::. . : . . : . . . . . :.
CCDS34 ---DSRQGFNGTFTVGPYI-----CEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTV
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB7 YLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWK-----RENSQTKLQE-KYNSWHHGDFNYERQAT
: . :: ..:::.. . . : : . .. : :.: : : . . : :
CCDS34 Y--KSGETIVVTCAVFN-NEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIK---LVY----T
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANVT--TTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVD
::. : :.::: . : : .. .. .:. : .::::.: : .. :: :
CCDS34 LTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKH
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKS-ENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYT
..:: .:.: :. .:. : :. .. . . :. ..::: :.:.: : : ..: ::
CCDS34 FVVEVRAYPPPR-ISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYT
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KB7 FLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDRLVNG-----MLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGT
....: :. . .:.. ... :: .: ..:.: : : : :.:..:
CCDS34 IVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDI
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 EQRC----SASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSA
..: : ..: .:... . . .:.. . . ... .:.: : : .: .
CCDS34 -KKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENR
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 YFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEI--N
.... :. . .:. .::: .. .::... .: ::: ::..:.:.: : .
CCDS34 ELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIV--IISLIVLVVIWK--QKPRYEIRWRVIESISPD
520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 GNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKM
:..:.:.:: ::::: .:::::. : .:..::.::::::::.::::: .:. .: :::::
CCDS34 GHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKM
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 LKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRR
:::.:. .:..:::::::....:: :.:::::::::: .:: .::::: ::::.:.:..
CCDS34 LKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHK
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720
pF1KB7 KRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCS------DSTNEYMDMKPG--VSYV-----
.::::. . : . .: . ::. : .....::::: . ..::
CCDS34 NRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLER
690 700 710 720 730 740
730 740 750 760 770
pF1KB7 --VPTKADKRRSV--RIGSY-----IERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAF
: .: .::. : .:: .. .: . .:. .: : :::::.::::.:: :
CCDS34 KEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEF
750 760 770 780 790 800
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 LASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIF
::::::.::::::::.::..:.:.::::::::::: .::::: ::.. ::::::::::::
CCDS34 LASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIF
810 820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 NCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDI
. .:: ::::::::.:::.::::..::::: ::: ::. :: :.:: .:.:: .:.:.:
CCDS34 DNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEI
870 880 890 900 910 920
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 MKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGS
: ::...: :::.: .. ...:. . . .. : .. . ..:.: . .:..:
CCDS34 MVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVAR-MRVDSDNA
930 940 950 960 970 980
960 970
pF1KB7 TASSSQPLLVHDDV
CCDS34 YIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEE
990 1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106 aa)
initn: 1451 init1: 740 opt: 759 Z-score: 376.7 bits: 81.3 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 1783; 34.8% identity (63.6% similar) in 1016 aa overlap (5-950:13-988)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGD
.: .: .:::: .:..: : : :: .:.. :..
CCDS43 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLL--------EPQISQGLVVTP---PGP-ELVLNVSS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB7 EIRLLCTDPGFVKWTFEILDETNE--NKQNEWITEKAEATN-----TGKYTCT--NKHGL
. : :. . : : . .: . :. .. :: ::.: :: ...::
CCDS43 TFVLTCSGSAPVVWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KB7 SNS----IYVFVRDPAKLFLVDRS----LYGKEDNDTLVRCPLTDPE--VTNYSLKGCQG
.. .:.:: ::. :: . . .. : .. . : .:::. :: . :: .
CCDS43 ETDERKRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVA
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 KPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV
:.: : . :. :.: .: :.: : :. . . : ... :
CCDS43 LPVPYD------HQRGFSGIFEDRSY--ICKTTIGDRE---VDSDAYYV-YRLQVSSINV
170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 VSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYS-TWKRENSQT-KLQEKYNSWHHGDFNYER
::. .. ..:.::..:. : . ... : . : ... .: : ... :. :.
CCDS43 -SVNAVQTVVRQGENITLMCIV--IGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLL-DMPYHI
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320
pF1KB7 QATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN--VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGE
.. : : ::...:::.. : .... .. . . .. ::..:.. .. ..: :.. .
CCDS43 RSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHR
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 NVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK--WEDYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEG
. : : .::.: : :. :::. :. : ...: :. :::::: :.:.: .:.
CCDS43 SRTLQVVFEAYPPPT-VLWFKDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEA
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 GTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEIL----TYDRLVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFC
: ::. . . :... ..:.. .:. ..: .. . ..: . :.:.:.: : :
CCDS43 GHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVLELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSAC
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490
pF1KB7 PGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSS----------IDSSAFKHNG---TVE
.:: . :. :..:. ..: .. . ... ..: .:.
CCDS43 RDL-KRCPRELPPT---LLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVR
460 470 480 490 500
500 510 520 530 540
pF1KB7 CKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTL-FTPLLIGFVIVAGMMCII-VMILTYKYLQKPM
: : ::. . . . ::.: : ..:. ... .. :: ..:: . . .::
CCDS43 CTLRNAVGQDTQ------EVIVVPHSLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPR
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 YEVQWKVVEEI--NGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYG
::..:::.: . .:..:.:.:: ::::: ::.::..: .:.:::.::::.::::::.:
CCDS43 YEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHG
570 580 590 600 610 620
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVIT
: .:.:.: ::::::: .:. .:..:::::::..:.:: :.:.:::::::: ::: .::
CCDS43 LSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIIT
630 640 650 660 670 680
670 680 690 700 710
pF1KB7 EYCCYGDLLNFLRRKRDSFIC--SKQEDHAEAALYKNLLH------SKESSCSDSTNEYM
::: ::::...:.:.. .:. : .. : ::.: : :. : ..: . ::
CCDS43 EYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYM
690 700 710 720 730 740
720 730 740 750 760
pF1KB7 DMKP--GVSYV--VPTKAD-KRRSVRIGSYI-----------ERDVTPAIMEDDELALDL
::. .:.:: . :.: : ... ..:. :: ...... . :.
CCDS43 DMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPV-LSY
750 760 770 780 790 800
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 EDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVK
::..::::::.:: :::::::.::::::::.:. .:...::::::::::: ::::. :
CCDS43 MDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISK
810 820 830 840 850 860
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 GNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEG
:.. ::.:::::::::: .:: :::::.::.:::.:.::..::: .:.. .::. ::.:
CCDS43 GSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRG
870 880 890 900 910 920
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 FRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNR
.:: .: :: :.:.::. ::. :: :.:.: :.:. ..:. .. :... .
CCDS43 YRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRS
930 940 950 960 970 980
950 960 970
pF1KB7 QKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
..:.. .:
CCDS43 DHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEG
990 1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356 aa)
initn: 1181 init1: 718 opt: 747 Z-score: 370.2 bits: 80.4 E(32554): 2.7e-14
Smith-Waterman score: 1182; 31.1% identity (57.7% similar) in 899 aa overlap (90-918:300-1158)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DPGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGL-SNSIYVFVRDPAKLF
.. : :::. . :: ... .::: : :
CCDS34 KKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPF
270 280 290 300 310 320
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LVDRSLYGKEDNDTL---VRCP-----LTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGI
.. : . . . :. :: : ::. :. .: :: .. . :
CCDS34 VAFGSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPPEIKWYK----NGIPLESNHTIKAGHVLTI
330 340 350 360 370 380
180 190 200 210 220
pF1KB7 M-IKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKS-VLSEKFILKVRPAFKAVPVVS-VSKASYLLREGE
: .. . . . : ...: .: :.: ... : : . ..: :.. .: :
CCDS34 MEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVS--LVVYVPPQIGEKSLISPVDSYQY----GT
390 400 410 420 430
230 240 250 260
pF1KB7 EFTVTCTIKDVSSSVYSTW--------KRENSQT-KLQEKY--NSWHH-GDF--------
:.:::. . . : : ::. .. . : . :. ::
CCDS34 TQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVEDFQGGNKIEV
440 450 460 470 480 490
270 280 290 300 310
pF1KB7 NYERQATL-----TISSARV---NDSGVFMCYANNTFGSANVTTTLEVVDKGFINIFPMI
: .. : . :.:. . : :... : : : : .. . ...:. :.. : .
CCDS34 NKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGERVISFHVTRGPEITLQPDM
500 510 520 530 540 550
320 330 340 350 360
pF1KB7 NTTV-------FVNDGENVDLIVEYEAFPKPE--H--QQWIYMNRTFTDKWE-DYPKSEN
. : . : . . .. :. :.: : . . ... :. . :
CCDS34 QPTEQESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKLNATMFSN
560 570 580 590 600 610
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVN----AAIAFNVYVNTKPEI---LTYDR
.: . ::. . :. . : :. :... .. .. ..: . : : : .
CCDS34 STNDILIMELKNASLQ--DQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLTVLERVAPTITGNLENQT
620 630 640 650 660 670
430 440 450 460 470
pF1KB7 LVNGM---LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTL-NSSGPPFGKLVVQS
: ..:.:.: : : : :. : .:: ..:: . .
CCDS34 TSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWF---------------KDNETLVEDSGIVLKDGNRNL
680 690 700 710 720
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIV
.: . .: :.: . .: ... : .. . .: .:.: ...: .. ...
CCDS34 TIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIAMFFWLLL
730 740 750 760 770 780
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 MILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDP--TQLPYD-HKWEFPRNRLSFGKTLGA
.:. . :.. . . . . .: .:::: ::::::.::..:: ::
CCDS34 VIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGR
790 800 810 820 830 840
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 GAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLL
::::.:.:: :.:. :. . :::::::: .: .:..:::::::.: ..:.:.:.::::
CCDS34 GAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLL
850 860 870 880 890 900
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 GACTI-GGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSD
:::: ::: .::.:.: .:.: ..:: ::. :. : ...: .. ..:. .
CCDS34 GACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYK----TKGARFR---QGKDYVGAI
910 920 930 940 950
720 730 740 750 760
pF1KB7 STNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSV---RIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFS
.:.: .. .. .... . . : .:.. .: . : :.: : :. .:
CCDS34 P----VDLKRRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTL--EHLICYS
960 970 980 990 1000
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 YQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPV
.:::::: ::::..:::::::::::::.. ..::::::::::: .: .:: ::.::::.
CCDS34 FQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 KWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPE
::::::.::. :::..:::::.:..:::.::::.:::::. .: .: . .::: :: .:.
CCDS34 KWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPD
1070 1080 1090 1100 1110 1120
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 HAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDH
.. :::. : :: ..: .::::...:.
CCDS34 YTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEED
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298 aa)
initn: 1236 init1: 697 opt: 721 Z-score: 358.5 bits: 78.2 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 1201; 34.1% identity (60.4% similar) in 725 aa overlap (246-920:489-1169)
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 VSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWKRENSQTKLQ--EKYNSWHHGDFNYERQA
:. ..: .. :. ..: .: ..
CCDS43 HWRPWTPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWT--EFVEGKNK
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320
pF1KB7 T---LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN--VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDG
: :.:..: : :... : ..: :. . . . .. :: .: . .. .:
CCDS43 TVSKLVIQNANV--SAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGF-TIESKPSEELL--EG
520 530 540 550 560 570
330 340 350 360 370
pF1KB7 ENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKSENESNI-----------------
. : : . ... : :: .: .: . . : . .:.
CCDS43 QPVLLSCQADSY-KYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPG
580 590 600 610 620 630
380 390 400 410 420
pF1KB7 -RYVS-ELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTK----PEILTY--DRLVN
:... : . :. . : :. :.. . . :.... :.. : :::
CCDS43 ARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVN
640 650 660 670 680 690
430 440 450 460 470
pF1KB7 GM----LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSID
.::..:: :.: :: ..: ::. :. :: .: .
CCDS43 VSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY----KDERLLEEKSGVDLADSNQ------KLSIQRVRE
700 710 720 730 740
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMIL
.: : :.. : : ... . : . . .. .:.: ..: .. ....:
CCDS43 EDA----GRYLCSVCNAKGCVNSSASVAVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIA-VFFWVLLLL
750 760 770 780 790
540 550 560 570 580
pF1KB7 TYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLP---------YD-HKWEFPRNRLSFGK
. ...: . .. .: . .:: ..: :: .:::::.:: .:.
CCDS43 IFCNMRRPAH------ADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGR
800 810 820 830 840
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 TLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNI
.:: :::::::::.:.:. :... :::::::: .: .:..:::::::.: ..:::.:.
CCDS43 VLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNV
850 860 870 880 890 900
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 VNLLGACTIG-GPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKES
:::::::: :: .::.:.: ::.: :::: :::.: ... . . .. .. :
CCDS43 VNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAFSPCAEKSPEQRGRFRAMV---EL
910 920 930 940 950 960
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 SCSDSTNEYMDMKPGVS-YVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAI-MEDDELA-LDLEDL
. : .:: : :. .. .: .. :. : ..: :: :. : .:::
CCDS43 ARLDRR------RPGSSDRVLFARFSKTEG---GA---RRASPDQEAEDLWLSPLTMEDL
970 980 990 1000 1010
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 LSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNA
. .:.:::.:: ::::..:::::::::::::... ..::::::::::: .: .:: ::.:
CCDS43 VCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 RLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRM
:::.:::::::::. ::: .:::::.:..:::.::::.:::::. .. .: . ...: ::
CCDS43 RLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRM
1080 1090 1100 1110 1120 1130
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 LSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKP
.:: : . :: .::..:: ::.:...:...
CCDS43 RAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
950 960 970
pF1KB7 VVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
CCDS43 EEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363 aa)
initn: 1236 init1: 697 opt: 721 Z-score: 358.2 bits: 78.2 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 1201; 34.1% identity (60.4% similar) in 725 aa overlap (246-920:489-1169)
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 VSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWKRENSQTKLQ--EKYNSWHHGDFNYERQA
:. ..: .. :. ..: .: ..
CCDS44 HWRPWTPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWT--EFVEGKNK
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320
pF1KB7 T---LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN--VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDG
: :.:..: : :... : ..: :. . . . .. :: .: . .. .:
CCDS44 TVSKLVIQNANV--SAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGF-TIESKPSEELL--EG
520 530 540 550 560 570
330 340 350 360 370
pF1KB7 ENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKSENESNI-----------------
. : : . ... : :: .: .: . . : . .:.
CCDS44 QPVLLSCQADSY-KYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPG
580 590 600 610 620 630
380 390 400 410 420
pF1KB7 -RYVS-ELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTK----PEILTY--DRLVN
:... : . :. . : :. :.. . . :.... :.. : :::
CCDS44 ARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVN
640 650 660 670 680 690
430 440 450 460 470
pF1KB7 GM----LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSID
.::..:: :.: :: ..: ::. :. :: .: .
CCDS44 VSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY----KDERLLEEKSGVDLADSNQ------KLSIQRVRE
700 710 720 730 740
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMIL
.: : :.. : : ... . : . . .. .:.: ..: .. ....:
CCDS44 EDA----GRYLCSVCNAKGCVNSSASVAVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIA-VFFWVLLLL
750 760 770 780 790
540 550 560 570 580
pF1KB7 TYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLP---------YD-HKWEFPRNRLSFGK
. ...: . .. .: . .:: ..: :: .:::::.:: .:.
CCDS44 IFCNMRRPAH------ADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGR
800 810 820 830 840
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 TLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNI
.:: :::::::::.:.:. :... :::::::: .: .:..:::::::.: ..:::.:.
CCDS44 VLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNV
850 860 870 880 890 900
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 VNLLGACTIG-GPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKES
:::::::: :: .::.:.: ::.: :::: :::.: ... . . .. .. :
CCDS44 VNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAFSPCAEKSPEQRGRFRAMV---EL
910 920 930 940 950 960
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 SCSDSTNEYMDMKPGVS-YVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAI-MEDDELA-LDLEDL
. : .:: : :. .. .: .. :. : ..: :: :. : .:::
CCDS44 ARLDRR------RPGSSDRVLFARFSKTEG---GA---RRASPDQEAEDLWLSPLTMEDL
970 980 990 1000 1010
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 LSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNA
. .:.:::.:: ::::..:::::::::::::... ..::::::::::: .: .:: ::.:
CCDS44 VCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 RLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRM
:::.:::::::::. ::: .:::::.:..:::.::::.:::::. .. .: . ...: ::
CCDS44 RLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRM
1080 1090 1100 1110 1120 1130
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 LSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKP
.:: : . :: .::..:: ::.:...:...
CCDS44 RAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
950 960 970
pF1KB7 VVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
CCDS44 EEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
972 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:52:51 2016 done: Thu Nov 3 22:52:52 2016
Total Scan time: 4.500 Total Display time: 0.430
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]