Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7017, 888 aa
1>>>pF1KB7017 888 - 888 aa - 888 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1845+/-0.00103; mu= 0.4872+/- 0.062
mean_var=328.0957+/-67.922, 0's: 0 Z-trim(114.6): 55 B-trim: 148 in 1/51
Lambda= 0.070807
statistics sampled from 15141 (15191) to 15141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.765), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16
Scan time: 5.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 6154 643.1 6.8e-184
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 2393 258.9 3.4e-68
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 2393 258.9 3.4e-68
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 2188 238.0 6.7e-62
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 2078 226.8 1.7e-58
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 2074 226.3 2.2e-58
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 2064 225.1 3e-58
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 2014 220.2 1.5e-56
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 1909 209.4 2.4e-53
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 1817 200.1 1.7e-50
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 1758 193.7 6.6e-49
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 1217 138.7 4.6e-32
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 894 105.8 4.4e-22
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 849 101.2 1e-20
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 849 101.2 1.1e-20
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 849 101.3 1.1e-20
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 753 91.3 7.3e-18
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 741 90.0 1.7e-17
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 739 89.8 1.8e-17
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 723 88.2 6e-17
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 723 88.3 6.8e-17
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 685 84.3 9.1e-16
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 600 75.6 3.7e-13
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 600 75.7 3.8e-13
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 582 73.8 1.4e-12
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 573 72.9 2.5e-12
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 558 71.4 7.4e-12
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 556 71.1 8.1e-12
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 556 71.1 8.4e-12
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 557 71.3 8.4e-12
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 556 71.2 8.5e-12
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 549 70.4 1.4e-11
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 542 69.6 2e-11
>>CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 (888 aa)
initn: 6154 init1: 6154 opt: 6154 Z-score: 3415.0 bits: 643.1 E(32554): 6.8e-184
Smith-Waterman score: 6154; 100.0% identity (100.0% similar) in 888 aa overlap (1-888:1-888)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGLFPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGLFPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPKH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGSH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 YFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 IWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGMQYNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPWILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGMQYNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPWILR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTSGLSVFLEEFET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTSGLSVFLEEFET
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 YRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNCIGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNCIGSQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 DPYCGWAPDGSCIFLSPGTRAAFEQDVSGASTSGLGDCTGLLRASLSEDRAGLVSVNLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DPYCGWAPDGSCIFLSPGTRAAFEQDVSGASTSGLGDCTGLLRASLSEDRAGLVSVNLLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 TSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEAILAHGAGEAVLSVSRLGERRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEAILAHGAGEAVLSVSRLGERRAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 GPGGRGGGGGGGAGVPPEALLAPLMQNGWAKATLLQGGPHDLDSGLLPTPEQTPLPQKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GPGGRGGGGGGGAGVPPEALLAPLMQNGWAKATLLQGGPHDLDSGLLPTPEQTPLPQKRL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 PTPHPHPHALGPRAWDHGHPLLPASASSSLLLLAPARAPEQPPAPGEPTPDGRLYAARPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTPHPHPHALGPRAWDHGHPLLPASASSSLLLLAPARAPEQPPAPGEPTPDGRLYAARPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RASHGDFPLTPHASPDRRRVVSAPTGPLDPASAADGLPRPWSPPPTGSLRRPLGPHAPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RASHGDFPLTPHASPDRRRVVSAPTGPLDPASAADGLPRPWSPPPTGSLRRPLGPHAPPA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KB7 ATLRRTHTFNSGEARPGDRHRGCHARPGTDLAHLLPYGGADRTAPPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATLRRTHTFNSGEARPGDRHRGCHARPGTDLAHLLPYGGADRTAPPVP
850 860 870 880
>>CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030 aa)
initn: 2183 init1: 1575 opt: 2393 Z-score: 1337.8 bits: 258.9 E(32554): 3.4e-68
Smith-Waterman score: 2519; 45.7% identity (68.4% similar) in 924 aa overlap (12-846:5-898)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGLFPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPAE
:::: . :: : . :::. :.:.. .: ..:::::: ::: : .
CCDS47 MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMKG
:.:: .. .: ::.:. ::..: :... . :. ..::::.: .:...:::::
CCDS47 --HRLDIQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPKH
:.. ::.::.:::: .....:::::.::::: : ::..:::.: ::..::::::::: ::
CCDS47 KHKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGSH
::::::.:: :..::::::::::::::::::. ::::::::::::.::::::.::..:..
CCDS47 ANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
.::::::::.:.: . ::: :::.:::::.::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 YFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPES
:::.::::: :. ..:: ::::.:::: ::::::::::.:. ..:.:: :::.:::::.:
CCDS47 YFNILQAVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB7 IWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGM--QYNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPWI
:::::...::.:::::::. . .: .:. .::: :::.::::::::::::. . ::.
CCDS47 TWTPVPDERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LRTLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTSGLSVFLEEF
:::..:..::..:::..:::. :.:::::::: : .::::.: ..:: . :.::::.
CCDS47 LRTMVRYRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLAR--IGNSGFLNDSLFLEEM
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ETYRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNCIG
.: ..:. : . .:.....:: ::..: .:: ::..::..::.... : :.::.
CCDS47 SVYNSEKCSYDGVED--KRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIA
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB7 SQDPYCGWAPDG-SCIFLSPGTRAAFEQDVSGASTSGLGDC-----------TGLLRASL
:.:::::: .: .: :::..: .::::. ..:.::::: ..:: ..
CCDS47 SRDPYCGWIKEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNGHSSSLLPSTT
530 540 550 560 570 580
590
pF1KB7 SED---------RAG------------------------------------------LVS
. : :.: ::
CCDS47 TSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHDQLVP
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 VNLLVTSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEAILAHGAGEAVLSVSRL-
:.::. . . :::.::: ::..: . : ..:...: . :: :.:. .. ::..:
CCDS47 VTLLAIAVILAFVMGAVFSGITV-YCVCDHRRKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVTKLS
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700
pF1KB7 ---GERRAQGPGGRGGGGGGGAGVPPEALLAPLMQNGW------AKATLLQGGPHDLDSG
:. ... : :::.:.:::.:: . :... : ::
CCDS47 GLFGDTQSKDP-------------KPEAILTPLMHNGKLATPGNTAKMLIKADQHHLDLT
710 720 730 740 750
710 720 730 740 750
pF1KB7 LLPTPEQTP-LPQKRLPTPHPHPHALGPRAWDHGHPL-------LPASASSSLLLLAPAR
:::::.:: : ::: :. : : :.... : .: .: . : :
CCDS47 ALPTPESTPTLQQKRKPSR-------GSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLR
760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 A-PEQPPA----PGEPTPDGRLYAARPGRASHGDFPLTPHASPDRRRVVSAPTGPLDPAS
: : . :. : . :. .: . ... : .:. . .... . .:
CCDS47 ASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEYVDQPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIKEHLSSKSPNH
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KB7 AADGLPRPWSPPPTGSLRRP-LGPHAPPAATLRRTHTFNSGEARPGDRHRGCHARPGTDL
... . : :: :. ::: :.:.: .:
CCDS47 GVNLVENLDSLPPKVPQREASLGP---PGASLSQTGLSKRLEMHHSSSYGVDYKRSYPTN
870 880 890 900 910 920
880
pF1KB7 AHLLPYGGADRTAPPVP
CCDS47 SLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRVDSIQVHSSQPSGQAVTV
930 940 950 960 970 980
>>CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047 aa)
initn: 2183 init1: 1575 opt: 2393 Z-score: 1337.7 bits: 258.9 E(32554): 3.4e-68
Smith-Waterman score: 2475; 44.8% identity (67.0% similar) in 937 aa overlap (12-842:5-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGLFPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPAE
:::: . :: : . :::. :.:.. .: ..:::::: ::: : .
CCDS75 MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMKG
:.:: .. .: ::.:. ::..: :... . :. ..::::.: .:...:::::
CCDS75 --HRLDIQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPKH
:.. ::.::.:::: .....:::::.::::: : ::..:::.: ::..::::::::: ::
CCDS75 KHKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGSH
::::::.:: :..::::::::::::::::::. ::::::::::::.::::::.::..:..
CCDS75 ANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
.::::::::.:.: . ::: :::.:::::.::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 YFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPES
:::.::::: :. ..:: ::::.:::: ::::::::::.:. ..:.:: :::.:::::.:
CCDS75 YFNILQAVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB7 IWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGM--QYNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPWI
:::::...::.:::::::. . .: .:. .::: :::.::::::::::::. . ::.
CCDS75 TWTPVPDERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LRTLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTSGLSVFLEEF
:::..:..::..:::..:::. :.:::::::: : .::::.: ..:: . :.::::.
CCDS75 LRTMVRYRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLAR--IGNSGFLNDSLFLEEM
420 430 440 450 460
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pF1KB7 ETYRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNCIG
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CCDS32 DAESAQSCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMV
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CCDS32 ---PQFFPSSPP-PHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLT
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360 370 380 390 400 410
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. .: .:..:: ..:: .:::. : ::.:.::::: ::: : :.:: : . ::.::
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:.:.: .:. . : ....::.:: .: .:: :..:.:..::..:..: :.:
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CCDS32 KSSLESPTRWST
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CCDS32 FYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPD
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CCDS32 SCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQ
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pF1KB7 KHANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWG
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..:::::::: . .:. . . :.. ..: :: . .: :: :: . .:
CCDS53 LASQDPYCGWHSSRGCVDIRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYVLP
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pF1KB7 --------------------RASLSEDRAGL------------VSVNLLVTSSVAAFVVG
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CCDS53 GPGPSPGTPSPPSDAHPRPQSSTLGVHTRGVRRDLPPASASRSVPIPLLLASVAAAFALG
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CCDS53 -AGDPWEWNQNRNNAKEGPGRSRGGHAAGGPAPRVLVRPPPPGCPGQAVEVTTLEELLRY
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CCDS53 LHG--PQPPRKGAEPPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSP-RPHECAS---PLRLDVPPEGR
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pF1KB7 LRRTHTFNSGEARPGDRHRGCHARPGTDLAHLLPYGGADRTAPPVP
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CCDS53 C------ASAPARPALSAPA--PRLGVGGGRRLPFSG--HRAPPALLTRVPSGGPSRYSG
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CCDS53 GPGKHLLYLGRPEGYRGRALKRVDVEKPQLSLKPPLVGPSSRQAVPNGGRFNF
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888 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]