FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7014, 1914 aa
1>>>pF1KB7014 1914 - 1914 aa - 1914 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0238+/-0.000994; mu= 21.5736+/- 0.060
mean_var=89.8199+/-17.614, 0's: 0 Z-trim(106.4): 65 B-trim: 14 in 1/49
Lambda= 0.135328
statistics sampled from 8893 (8955) to 8893 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 6.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 12756 2501.8 0
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 8581 1686.7 0
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 8278 1627.6 0
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 8230 1618.2 0
CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 ( 522) 1586 320.7 9.4e-87
CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 ( 492) 1585 320.5 1e-86
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1566 317.1 4.1e-85
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 1531 310.3 4.6e-83
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 1531 310.3 4.7e-83
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1282 261.7 1.9e-68
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 1243 254.1 4.3e-66
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 739 155.6 1.4e-36
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 418 92.9 9.2e-18
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 342 78.1 2.6e-13
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 328 75.4 1.8e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 325 74.7 2.5e-12
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 311 72.0 1.8e-11
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 305 70.7 2.7e-11
>>CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896 aa)
initn: 12756 init1: 12756 opt: 12756 Z-score: 13448.8 bits: 2501.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12756; 100.0% identity (100.0% similar) in 1896 aa overlap (19-1914:1-1896)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMLTPAGPEHRGPRPQPAMPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFR
10 20 30 40
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TFSASDWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQD
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 EFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFA
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370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSPLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSPLQI
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 DDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILV
410 420 430 440 450 460
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pF1KB7 DLSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCE
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pF1KB7 LCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMSQVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMSQVPL
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pF1KB7 VLQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VLQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYL
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pF1KB7 KSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNV
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730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTALRFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTALRFNS
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKA
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 DPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQGGTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQGGTRL
830 840 850 860 870 880
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pF1KB7 TITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALVEVCVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALVEVCVR
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pF1KB7 DCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVGGRPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVGGRPCS
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pF1KB7 FSWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPEWSINSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPEWSINSG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KB7 GTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSPPELGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSPPELGER
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 PDELGFVMDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGLLELKPSSPLILKGRNLLPPAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PDELGFVMDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGLLELKPSSPLILKGRNLLPPAPG
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 NSRLNYTVLIGSTPCTLTVSETQLLCEAPNLTGQHKVTVRAGGFEFSPGTLQVYSDSLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NSRLNYTVLIGSTPCTLTVSETQLLCEAPNLTGQHKVTVRAGGFEFSPGTLQVYSDSLLT
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB7 LPAIVGIGGGGGLLLLVIVAVLIAYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPAIVGIGGGGGLLLLVIVAVLIAYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAE
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KB7 LQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQANVEKSLTLFGQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQANVEKSLTLFGQLL
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pF1KB7 TKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLES
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB7 KNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITG
1430 1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KB7 EARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKG
1490 1500 1510 1520 1530 1540
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pF1KB7 VPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVP
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB7 KQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDH
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pF1KB7 LDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFL
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pF1KB7 DEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMD
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pF1KB7 SCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLH
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1870 1880 1890 1900 1910
pF1KB7 LSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
1850 1860 1870 1880 1890
>>CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871 aa)
initn: 7205 init1: 4441 opt: 8581 Z-score: 9043.6 bits: 1686.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8584; 66.7% identity (85.5% similar) in 1885 aa overlap (32-1914:6-1871)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLTPAGPEHRGPRPQPAMPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFRT
:::::.: : :. .. :::.
CCDS14 MPSVCLLLLLFLAVG----------GALGNRPFRA
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FSASDWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQS
: ..: ::::.::. ::::.::::::..::. ::: :::::::::::: .::::::..
CCDS14 FVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLAPNLTELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRV
30 40 50 60 70 80
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pF1KB7 CPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSSV
: : :. .::.:::::.:::: ::.:::: :::::::::::::::::::::::::::..
CCDS14 CAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSGA
90 100 110 120 130 140
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pF1KB7 QEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQDE
:: :::::.. ::: .:::::: .:::::::::::::.:...:..::::..:::::
CCDS14 QEPDSMAGVIVE--QGQGPSKLFVGTAVDGKSEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDE
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKIV
:::::.:::::::: .:::::::.:.: : .:::.:::::::: : :.:::.:::::::
CCDS14 FVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSASFVYFLTLQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIV
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFAQ
:.:. : .::::::::::: ::::::::.:.:..:: ::. ::. :::::::.:.:
CCDS14 RMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQSAHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQ
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSPLQID
:::::..::... :::::: :. .:..:::::::::: :.::::::::: :::.:.::.
CCDS14 GQKNRASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQSCYRGEGTLALPWLLNKELPCINTPMQIN
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILVD
.::: .:::::: .::: ::..:. ::...:::: :: ..::: ::::: ..:. ::
CCDS14 GNFCGLVLNQPLGGLHVIEGLPLLADSTDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVD
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCEL
: . : ::.: . .::::::::..::.:...: ..::::...:::.: :: ::
CCDS14 ----GFQDAHLYETVPVVDGSPILRDLLFSPDHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAA
450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 CLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMSQVPLV
:::: :::::::::. : :. :: :. :. :: .: .:::. :.: ::::: : :.
CCDS14 CLGSGDPHCGWCVLRHRCCREGACLGASAPHGFAEELSKCVQVRVRPNNVSVTSPGVQLT
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVL-EDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYL
. :::::::::.:.:: .:.:.:: .:.. : ::: .:. .:::.: :.:.: :
CCDS14 VTLHNVPDLSAGVSCAFEAAAENEAVLLPSGELLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQL
560 570 580 590 600 610
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pF1KB7 KSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNV
::::: .::..::::::::: :::.:::.. .:::::::::.:: .:.: ::::.
CCDS14 LSKETGVRFAGADFVFYNCSVLQSCMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSRPHECSFQEGRVHS
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTALRFNS
: ::.:::: .. .::::..:.:: :.:::::::::..:::. .. : :: :.::::
CCDS14 PEGCPEILPSGDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNS
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKA
::.::::.::::::.. .: ...::::.:.: ::.: ...: :::: : : ::::::::
CCDS14 SSVQCQNASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKA
740 750 760 770 780 790
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CCDS31 CLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDM
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CCDS31 NAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINA
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CCDS31 MSIES
1890
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520
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