Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7008, 465 aa
1>>>pF1KB7008 465 - 465 aa - 465 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0614+/-0.00118; mu= 0.4212+/- 0.072
mean_var=427.9416+/-87.411, 0's: 0 Z-trim(114.0): 73 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.061999
statistics sampled from 14534 (14601) to 14534 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.449), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 465) 3126 293.8 2.6e-79
CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 448) 1784 173.7 3.5e-43
CCDS53367.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 415) 1725 168.4 1.3e-41
CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 481) 1589 156.3 6.5e-38
CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 485) 1544 152.3 1.1e-36
CCDS53956.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 454) 1499 148.2 1.7e-35
CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 409) 1344 134.3 2.3e-31
CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 482) 1291 129.6 6.9e-30
CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 486) 1238 124.9 1.8e-28
CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 1229 124.1 3.2e-28
CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 485) 1221 123.4 5.3e-28
CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 1210 122.4 1e-27
CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 508) 1165 118.4 1.8e-26
CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 483) 1146 116.7 5.5e-26
CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 485) 961 100.1 5.3e-21
CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 486) 961 100.1 5.3e-21
CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 512) 961 100.2 5.5e-21
CCDS53955.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 344) 955 99.4 6.2e-21
CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 488) 618 69.4 9.2e-12
CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 490) 617 69.4 9.8e-12
CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 521) 617 69.4 1e-11
CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 514) 615 69.2 1.1e-11
>>CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 (465 aa)
initn: 3126 init1: 3126 opt: 3126 Z-score: 1537.3 bits: 293.8 E(32554): 2.6e-79
Smith-Waterman score: 3126; 100.0% identity (100.0% similar) in 465 aa overlap (1-465:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQFGRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQFGRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSESRGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSESRGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 IDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAATPVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAATPVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYTAAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYTAAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 KCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
430 440 450 460
>>CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (448 aa)
initn: 2280 init1: 1228 opt: 1784 Z-score: 888.7 bits: 173.7 E(32554): 3.5e-43
Smith-Waterman score: 1926; 64.0% identity (80.2% similar) in 469 aa overlap (1-465:48-448)
10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. ::::::.:::::.:.::::::.::.:
CCDS45 LSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIPMKDHDAIKLFIGQIPRNLDEKDLKPLFEEF
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
:.:.::::.::..::.:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 RGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQA
::::::::::::.:::...:::..:: ::.:.:::.::::::.::::::::...::::::
CCDS45 RGEDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILRGPDGNSKGCAFVKYSSHAEAQA
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQA
:::.::.:.:.::::::::::::::.::: .:::::.: :.:::.:.:. ::::.::.::
CCDS45 AINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMAGQMGMFNPMAIPFGAYGAYAQA
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KB7 LMQQQAALVA--AHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAAT
::::::::.: :...::.:::..::.:::.:::.: ::: :.:.::.:: ::::.:.:
CCDS45 LMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNMNGLAAAPMTPTSGGSTPPGITAP
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 PVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHY
: .::. .::::.. .: : .:::: .:.. ::.::::::::.: .:::::::::.:.:
CCDS45 AVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHPYPAQSPTA-ADPLQQAYAGVQQY
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 T--AAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYH
. :::::::. .. :::::: .. :::: :::
CCDS45 AGPAAYPAAYGQISQAFPQPPPMI-------PQQQ------------REG----------
380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 LPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQI
:::::::::::.::::::::::
CCDS45 --------------------------------------FVSFDNPASAQTAIQAMNGFQI
410 420
450 460
pF1KB7 GMKRLKVQLKRPKDANRPY
:::::::::::::::::::
CCDS45 GMKRLKVQLKRPKDANRPY
430 440
>>CCDS53367.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 (415 aa)
initn: 2069 init1: 1682 opt: 1725 Z-score: 860.6 bits: 168.4 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 2666; 89.2% identity (89.2% similar) in 465 aa overlap (1-465:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQFGRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQFGRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSESRGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSESRGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 IDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAATPVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYP
:::::::::::::::::
CCDS53 AAINANGLIATPITPSS-------------------------------------------
250
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYTAAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -------AQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYTAAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQ
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQS
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460
pF1KB7 KCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
380 390 400 410
>>CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 (481 aa)
initn: 1764 init1: 1178 opt: 1589 Z-score: 794.1 bits: 156.3 E(32554): 6.5e-38
Smith-Waterman score: 2116; 68.7% identity (85.8% similar) in 466 aa overlap (1-465:40-481)
10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. :::::::::::: :.:.::::.::.:
CCDS10 QPAGPGPRLGFSTADSGVGMSGLNPGPAVPMKDHDAIKLFVGQIPRGLDEQDLKPLFEEF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
:::.::::.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.
CCDS10 GRIYELTVLKDRLTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPAASEG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 RGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQA
:::::::::::::::: .::::..:.::: :.::::::.::::::::::::: ...::::
CCDS10 RGEDRKLFVGMLGKQQGEEDVRRLFQPFGHIEECTVLRSPDGTSKGCAFVKFGSQGEAQA
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQA
:: ::.:::. :::::::::.:::..::.::::::.: .:: : : : .:: .::: :
CCDS10 AIRGLHGSRTMAGASSSLVVKLADTDRERALRRMQQMAGHLGAFHPAPLPLGACGAYTTA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 LMQQQAALVAA-HSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAATP
..:.::::.:: .. :.:.:..:: ::::.::.. :.:.:. :......::. .
CCDS10 ILQHQAALLAAAQGPGLGPVAAVAA-QMQHVAAFS---LVAAPLLPAAAANSPPGSGPGT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 VSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYT
. ..:: .::::..:. : .:::. :.:: ::. :::::::.. .::::::::::.::.
CCDS10 LPGLPAPIGVNGFGPLTPQTNGQPGSDTLYNNGLSPYPAQSPGV-ADPLQQAYAGMHHYA
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 AAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQ
::::.::. :. :::: :: :::: ::::.:::.:::::::
CCDS10 AAYPSAYAPVSTAFPQ-------QPSALPQQQ------------REGPEGCNLFIYHLPQ
370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 EFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMK
:: :.:..: :.::: :.::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::
CCDS10 EFGDAELIQTFLPFGAVVSAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPTSAQTAIQAMNGFQIGMK
410 420 430 440 450 460
450 460
pF1KB7 RLKVQLKRPKDANRPY
::::::::::::::::
CCDS10 RLKVQLKRPKDANRPY
470 480
>>CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 (485 aa)
initn: 1357 init1: 674 opt: 1544 Z-score: 772.3 bits: 152.3 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 2067; 66.0% identity (86.3% similar) in 468 aa overlap (1-465:39-485)
10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. ::::::::::::::.::::::.::::
CCDS12 ARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKDLKPLFEQF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
:::.::::.:: :::.:::::::::::::::.:::.::::::::::: ::::::::::::
CCDS12 GRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQVKPADSES
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB7 RG-EDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQ
:: .:::::::::.:::..::: ..:.:::.::::::::::::.:::::::::..:.:::
CCDS12 RGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQ
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 AAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSP-IALQFGAYSAYT
:::..::.:.:.::::::::::::::.::: ::::::.. :::...: ..: :. ::::.
CCDS12 AAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLPFSPYSAYA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAAT
:::::::...... ..:::: .... ..:...:.. ::: ::::.:.:: .:: ...:
CCDS12 QALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGLHSPPLLGTT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 PVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHY
: .. : . .::.. : : :.:: ...: ::. :::::::.. .. :. :..:.:.:
CCDS12 AVPGLVAPI-TNGFAGVVPFPGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTV-AETLHPAFSGVQQY
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 TAAYP-AAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHL
:: :: :: . .: . :::: :. ::::::::.:::.:::::
CCDS12 TAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLL-------------------QQQQREGPEGCNLFIYHL
370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 PQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIG
:::: :.:. :::.:::..::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PQEFGDTELTQMFLPFGNIISSKVFMDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIG
410 420 430 440 450 460
450 460
pF1KB7 MKRLKVQLKRPKDANRPY
::::::::::::: ..::
CCDS12 MKRLKVQLKRPKDPGHPY
470 480
>>CCDS53956.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 (454 aa)
initn: 1905 init1: 1178 opt: 1499 Z-score: 750.9 bits: 148.2 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 1943; 64.6% identity (81.1% similar) in 466 aa overlap (1-465:40-454)
10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. :::::::::::: :.:.::::.::.:
CCDS53 QPAGPGPRLGFSTADSGVGMSGLNPGPAVPMKDHDAIKLFVGQIPRGLDEQDLKPLFEEF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
:::.::::.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.
CCDS53 GRIYELTVLKDRLTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPAASEG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 RGEDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQA
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CCDS53 RGEDRKLFVGMLGKQQGEEDVRRLFQPFGHIEECTVLRSPDGTSKGCAFVKFGSQGEAQA
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSPIALQFGAYSAYTQA
:: ::.:::. :::::::::.:::..::.::::::.: .:: : : : .:: .::: :
CCDS53 AIRGLHGSRTMAGASSSLVVKLADTDRERALRRMQQMAGHLGAFHPAPLPLGACGAYTTA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 LMQQQAALVAA-HSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAATP
..:.::::.:: .. :.:.:..:: ::::.::.. :.:.:. :......::. .
CCDS53 ILQHQAALLAAAQGPGLGPVAAVAA-QMQHVAAFS---LVAAPLLPAAAANSPPGSGPGT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 VSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYT
. ..:: .::::..:. : .:::. :.:: ::. :::::::.. .::::::::::.::.
CCDS53 LPGLPAPIGVNGFGPLTPQTNGQPGSDTLYNNGLSPYPAQSPGV-ADPLQQAYAGMHHYA
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 AAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQ
::.:::.:::::::
CCDS53 ----------------------------------------------GPEGCNLFIYHLPQ
370
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 EFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMK
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CCDS53 EFGDAELIQTFLPFGAVVSAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPTSAQTAIQAMNGFQIGMK
380 390 400 410 420 430
450 460
pF1KB7 RLKVQLKRPKDANRPY
::::::::::::::::
CCDS53 RLKVQLKRPKDANRPY
440 450
>>CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 (409 aa)
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Smith-Waterman score: 1444; 62.6% identity (83.7% similar) in 356 aa overlap (1-353:39-367)
10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. ::::::::::::::.::::::.::::
CCDS54 ARRQQQQLLQPRPSPVGSSGPEPPGGQPDGMKDLDAIKLFVGQIPRHLDEKDLKPLFEQF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
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CCDS54 GRIYELTVLKDPYTGMHKGCAFLTYCARDSAIKAQTALHEQKTLPGMARPIQVKPADSES
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB7 RG-EDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQ
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CCDS54 RGGRDRKLFVGMLNKQQSEEDVLRLFQPFGVIDECTVLRGPDGSSKGCAFVKFSSHTEAQ
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 AAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSP-IALQFGAYSAYT
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CCDS54 AAIHALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTLRRMQQMVGQLGILTPSLTLPFSPYSAYA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QALMQQQAALVAAHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGTSTPPAIAAT
:::::::...... ..:::: .... ..:...:.. ::: ::::.:.::.
CCDS54 QALMQQQTTVLSTSGSYLSPGVAFSPCHIQQIGAVSLNGLPATPIAPASGV---------
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 PVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHY
:: : :.:: ...: ::. :::::::.. .. :. :..:.:.:
CCDS54 ----------------VPF-PGGHPALETVYANGLVPYPAQSPTV-AETLHPAFSGVQQY
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 TAAYP-AAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHL
:: :: :: . .: . :::: :. ::
CCDS54 TAMYPTAAITPIAHSVPQPPPLLQQQQREGVWRHGADADVPTLRQYHFLQGVYGSSYQPE
350 360 370 380 390 400
>>CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (482 aa)
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Smith-Waterman score: 1291; 45.8% identity (70.8% similar) in 476 aa overlap (5-465:14-482)
10 20 30 40
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQFGRIFELTVIKDKYTG--LHKG
::::.::::.:: ::::. .:::.: ..:..:..:. . ::
CCDS79 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKG
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50 60 70 80 90 100
pF1KB7 CAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSESRG--EDRKLFVGMLGKQQT
: :.:. .: .::.::.:::..:.::::..:::.::::::. . ::::::.::..:. :
CCDS79 CCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 DEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVKFQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSS
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CCDS79 ENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 LVVKFADTEKERGLRRM-QQVATQLGMFSPIALQ---FGAYSAYTQ--ALMQQQAALVAA
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CCDS79 MVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGNLAGLNTLGPQYLALLQQTASSGNL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB7 HS-AYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSG----TSTPPAIAATPVSAIPAA
.. . : ::. . :.:.:..::. : . :. :::. ::. : . : .. :..
CCDS79 NTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAAS-AAQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSS
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQQAYAGMQHYTAAYPAAY
. :. .:. . . : : :.. . :: : . .:... :.. :
CCDS79 SSSNSVNPIASLGALQTLAGAT--AGLNVGSLAGMAALNGGLGS--SGLSNGTGSTMEAL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 SLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPDGCNIFIYHLPQEFTDSEI
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CCDS79 TQAYSGIQQYAA--AALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 LQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLK
::::.:::.:.:::::.:. :: ::::::::.:::.:::::::.::::::::::::::::
CCDS79 LQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLK
420 430 440 450 460 470
460
pF1KB7 RPKDANRPY
: :. ..::
CCDS79 RSKNDSKPY
480
>>CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (486 aa)
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10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. ::::::.:::::.:.::::::.::.:
CCDS32 LSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIPMKDHDAIKLFIGQIPRNLDEKDLKPLFEEF
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
:.:.::::.::..::.:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB7 RG----------EDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFV
:: .:::::::::.:::...:::..:: ::.:.:::.::::::.:::::::
CCDS32 RGGSSCLRQPPSQDRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILRGPDGNSKGCAFV
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150 160 170 180 190 200
pF1KB7 KFQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSPIALQ
:...:::::::::.::.:.:.::::::::::::::.::: .:::::.: :.:::.:.:.
CCDS32 KYSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMAGQMGMFNPMAIP
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KB7 FGAYSAYTQALMQQQAALVA--AHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSG
::::.::.::::::::::.: :...::.:::..::.:::.:::.: ::: :.:.::.::
CCDS32 FGAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNMNGLAAAPMTPTSG
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 TSTPPAIAATPVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPL
::::.:.: : .::. .::::.. .: : .:::: .:.. ::.::::::::.: .:::
CCDS32 GSTPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHPYPAQSPTA-ADPL
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QQAYAGMQHYT--AAYPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREG
::::::.:.:. :::::::. .. :::::: .. :::: :::
CCDS32 QQAYAGVQQYAGPAAYPAAYGQISQAFPQPPPMI-------PQQQ------------REG
380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 PDGCNIFIYHLPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQA
:.:::.::::::::: :.:..:::.::: :::::::::::.
CCDS32 PEGCNLFIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQT
420 430 440 450
440 450 460
pF1KB7 AIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
460 470 480
>>CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 (484 aa)
initn: 1585 init1: 666 opt: 1229 Z-score: 620.1 bits: 124.1 E(32554): 3.2e-28
Smith-Waterman score: 2116; 66.9% identity (84.1% similar) in 477 aa overlap (1-465:48-484)
10 20 30
pF1KB7 MKEPDAIKLFVGQIPRHLEEKDLKPIFEQF
::. ::::::.:::::.:.::::::.::.:
CCDS82 LSTNGLGSSPGSAGHMNGLSHSPGNPSTIPMKDHDAIKLFIGQIPRNLDEKDLKPLFEEF
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GRIFELTVIKDKYTGLHKGCAFLTYCARDSALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
:.:.::::.::..::.:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GKIYELTVLKDRFTGMHKGCAFLTYCERESALKAQSALHEQKTLPGMNRPIQVKPADSES
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB7 RG---------EDRKLFVGMLGKQQTDEDVRKMFEPFGTIDECTVLRGPDGTSKGCAFVK
:: ::::::::.:::...:::..:: ::.:.:::.::::::.::::::::
CCDS82 RGGSSCLRQPPSHRKLFVGMLNKQQSEDDVRRLFEAFGNIEECTILRGPDGNSKGCAFVK
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 FQTHAEAQAAINTLHSSRTLPGASSSLVVKFADTEKERGLRRMQQVATQLGMFSPIALQF
...:::::::::.::.:.:.::::::::::::::.::: .:::::.: :.:::.:.:. :
CCDS82 YSSHAEAQAAINALHGSQTMPGASSSLVVKFADTDKERTMRRMQQMAGQMGMFNPMAIPF
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KB7 GAYSAYTQALMQQQAALVA--AHSAYLSPMATMAAVQMQHMAAINANGLIATPITPSSGT
:::.::.::::::::::.: :...::.:::..::.:::.:::.: ::: :.:.::.::
CCDS82 GAYGAYAQALMQQQAALMASVAQGGYLNPMAAFAAAQMQQMAALNMNGLAAAPMTPTSGG
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 STPPAIAATPVSAIPAALGVNGYSPVPTQPTGQPAPDALYPNGVHPYPAQSPAAPVDPLQ
::::.:.: : .::. .::::.. .: : .:::: .:.. ::.::::::::.: .::::
CCDS82 STPPGITAPAVPSIPSPIGVNGFTGLPPQANGQPAAEAVFANGIHPYPAQSPTA-ADPLQ
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QAYAGMQHYTAA-YPAAYSLVAPAFPQPPALVAQQPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQREGPD
:::::.:.:.:: :::::. .. :::::: .. :::: ::::.
CCDS82 QAYAGVQQYAAAAYPAAYGQISQAFPQPPPMI-------PQQQ------------REGPE
380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 GCNIFIYHLPQEFTDSEILQMFVPFGHVISAKVFVDRATNQSKCFGFVSFDNPASAQAAI
:::.::::::::: :.:..:::.::: :::::::::::.::
CCDS82 GCNLFIYHLPQEFGDAELMQMFLPFG--------------------FVSFDNPASAQTAI
420 430 440 450
440 450 460
pF1KB7 QAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QAMNGFQIGMKRLKVQLKRPKDANRPY
460 470 480
465 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:50:02 2016 done: Thu Nov 3 22:50:02 2016
Total Scan time: 3.630 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]