Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7002, 3027 aa
1>>>pF1KB7002 3027 - 3027 aa - 3027 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5786+/-0.00137; mu= 20.6397+/- 0.083
mean_var=97.9068+/-19.985, 0's: 0 Z-trim(101.8): 66 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.129619
statistics sampled from 6629 (6675) to 6629 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 9.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4125.1 DMXL1 gene_id:1657|Hs108|chr5 (3027) 20208 3791.4 0
CCDS75289.1 DMXL1 gene_id:1657|Hs108|chr5 (3048) 17458 3277.2 0
CCDS10141.1 DMXL2 gene_id:23312|Hs108|chr15 (3036) 7195 1358.0 0
CCDS53946.1 DMXL2 gene_id:23312|Hs108|chr15 (3037) 7191 1357.2 0
CCDS53945.1 DMXL2 gene_id:23312|Hs108|chr15 (2400) 4178 793.8 0
>>CCDS4125.1 DMXL1 gene_id:1657|Hs108|chr5 (3027 aa)
initn: 20208 init1: 20208 opt: 20208 Z-score: 20411.1 bits: 3791.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 20208; 100.0% identity (100.0% similar) in 3027 aa overlap (1-3027:1-3027)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNLHQVLTGAVNPGDHCFSVGSIGDQRFTAYASGCDIVILGSDFERLQIIPGAKHGNIQV
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CCDS41 MNLHQVLTGAVNPGDHCFSVGSIGDQRFTAYASGCDIVILGSDFERLQIIPGAKHGNIQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GCVDCSMQQGKIAASYGNVISIFEPVNLPKQKKNLELYSQWQKSGQFFLESIAHNITWDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GCVDCSMQQGKIAASYGNVISIFEPVNLPKQKKNLELYSQWQKSGQFFLESIAHNITWDP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TGSRLLTGSSYLQLWSNTNLEKPTEDENLNKTDLNFGDWKCIWHCKTASQVHLMKFSPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TGSRLLTGSSYLQLWSNTNLEKPTEDENLNKTDLNFGDWKCIWHCKTASQVHLMKFSPDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EFFATAGKDDCLLKVWYNVENWRTAVTSPDGSSEKQSQGEIDFSFVYLAHPRAVNGFSWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EFFATAGKDDCLLKVWYNVENWRTAVTSPDGSSEKQSQGEIDFSFVYLAHPRAVNGFSWR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KTSKYMPRASVCNVLLTCCKDNVCRLWVETFLPNDCLLYGGDCSHWTESINLTNNFKRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KTSKYMPRASVCNVLLTCCKDNVCRLWVETFLPNDCLLYGGDCSHWTESINLTNNFKRNA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SSKERVQNALEVNLRHFRRGRRRSLALVAHTGYLPHQQDPHHVHRNTPLHANALCHFHIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSKERVQNALEVNLRHFRRGRRRSLALVAHTGYLPHQQDPHHVHRNTPLHANALCHFHIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 ASINPATDIPLLPSITSLSLNENEEKTGPFVVHWLNNKELHFTLSMEVFLQQLRKSFEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASINPATDIPLLPSITSLSLNENEEKTGPFVVHWLNNKELHFTLSMEVFLQQLRKSFEQP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SSEASVEDSNQADVKSDEETDDGVDDLKINPEKKELGCDKMVPNSSFTSLSSAAIDHQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSEASVEDSNQADVKSDEETDDGVDDLKINPEKKELGCDKMVPNSSFTSLSSAAIDHQIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VLLSEWSKNADMLFSIHPMDGSLLVWHVDWLDEYQPGMFRQVQVSFVSRIPVAFPTGDAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VLLSEWSKNADMLFSIHPMDGSLLVWHVDWLDEYQPGMFRQVQVSFVSRIPVAFPTGDAN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SLCKSIMMYACTKNVDLAIQQGKQKPSGLTRSTSMLISSGHNKSSNSLKLSIFTPNVMMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLCKSIMMYACTKNVDLAIQQGKQKPSGLTRSTSMLISSGHNKSSNSLKLSIFTPNVMMI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SKHADGSLNQWLVSFAEESAFSTVLSISHKSRYCGHRFHLNDLACHSVLPLLLTTSHHNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SKHADGSLNQWLVSFAEESAFSTVLSISHKSRYCGHRFHLNDLACHSVLPLLLTTSHHNA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LRTPDVDNPEQPFDALNIEECSLTQQNKSTVDVAFQDPSAVYSELILWRVDPVGPLSFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRTPDVDNPEQPFDALNIEECSLTQQNKSTVDVAFQDPSAVYSELILWRVDPVGPLSFSG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 GVSELARINSLHVSAFSNVAWLPTLIPSYCLGAYCNSPSACFVASDGQYLRLYEAVIDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GVSELARINSLHVSAFSNVAWLPTLIPSYCLGAYCNSPSACFVASDGQYLRLYEAVIDAK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 KLLSELSNPEISKYVGEVFNIVSQQSTARPGCIIALDPITKLHGRKTQLLHVFEEDFILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLLSELSNPEISKYVGEVFNIVSQQSTARPGCIIALDPITKLHGRKTQLLHVFEEDFILN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 NLEKKSLGKDSILSNAGSSPNGFSEKFYLIVIECTQDNRSLLHMWNLHLKSIPVSLDEKV
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CCDS41 NLEKKSLGKDSILSNAGSSPNGFSEKFYLIVIECTQDNRSLLHMWNLHLKSIPVSLDEKV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DTKLSEAVWQPEEHYSSSPEKILSPFSQKYQACRANLQSTSRLTLFSEMVYSQELHLPEG
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CCDS41 DTKLSEAVWQPEEHYSSSPEKILSPFSQKYQACRANLQSTSRLTLFSEMVYSQELHLPEG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 VEIISIKPSAGHLSSSSIYPACSAPYLLATSCSDEKVRFWRCRVTDGESATSKNGKIDLA
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CCDS41 VEIISIKPSAGHLSSSSIYPACSAPYLLATSCSDEKVRFWRCRVTDGESATSKNGKIDLA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 YIWEEWPLLIEDGLQSNSSITVPGRPVEVSCAHTNRLAVAYKQPASNSRSSQDFVMHVSI
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CCDS41 YIWEEWPLLIEDGLQSNSSITVPGRPVEVSCAHTNRLAVAYKQPASNSRSSQDFVMHVSI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 FECESIGGSCWVLEQTIHLDELSTVLDSGISVDSNLVAYNKQDMYLSSKENITSNTKHLV
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FECESTGGSCWVLEQTIHLDELSTVLDSGISVDSNLVAYNKQDMYLSSKENITSNTKHLV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 HLDWMSREDGSHILTVGIGSKLFMYGPLAGKVQDQTGKETLAFPLWESTKVVPLSKFVLL
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CCDS41 HLDWMSREDGSHILTVGIGSKLFMYGPLAGKVQDQTGKETLAFPLWESTKVVPLSKFVLL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 RSVDLVSSVDGSPPFPVSLSWVRDGILVVGMDCEMHVYCQWQPSSKQEPVITDSYSGSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RSVDLVSSVDGSPPFPVSLSWVRDGILVVGMDCEMHVYCQWQPSSKQEPVITDSYSGSTP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB7 SITSLIKQSNSSSGLHPPKKTLTRSMTSLAQKICGKKTAFDPSVDMEDSGLFEAAHVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SITSLIKQSNSSSGLHPPKKTLTRSMTSLAQKICGKKTAFDPSVDMEDSGLFEAAHVLSP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB7 TLPQYHPLQLLELMDLGKVRRAKAILSHLVKCIAGEVVALNEAESNHERRLRSLTISASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TLPQYHPLQLLELMDLGKVRRAKAILSHLVKCIAGEVVALNEAESNHERRLRSLTISASG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB7 STTRDPQAFNKAENTDYTEIDSVPPLPLYALLAADDDSCYSSLEKSSNESTLSKSNQLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 STTRDPQAFNKAENTDYTEIDSVPPLPLYALLAADDDSCYSSLEKSSNESTLSKSNQLSK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB7 ESYDELFQTQLLMTDTHMLETDEENTKPRVIDLSQYSPTYFGPEHAQVLSGHLLHSSLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESYDELFQTQLLMTDTHMLETDEENTKPRVIDLSQYSPTYFGPEHAQVLSGHLLHSSLPG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB7 LSRMEQMSLMALADTIATTSTDIGESRDRSQGGETLDECGLKFLLAVRLHTFLTTSLPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSRMEQMSLMALADTIATTSTDIGESRDRSQGGETLDECGLKFLLAVRLHTFLTTSLPAY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB7 RAQLLHQGLSTSHFAWAFHSVAEEELLNMLPAMQKDDPTWSELRAMGVGWWVRNTRILRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RAQLLHQGLSTSHFAWAFHSVAEEELLNMLPAMQKDDPTWSELRAMGVGWWVRNTRILRK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB7 CIEKVAKAAFYRKNDPLDAAIFYLAMKKKAVIWGLYRAEKNTRMTQFFGHNFEDERWRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CIEKVAKAAFYRKNDPLDAAIFYLAMKKKAVIWGLYRAEKNTRMTQFFGHNFEDERWRKA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB7 ALKNAFSLLGKQRFEHSAAFFLLAGCLRDAIEVCLEKLNDIQLALVIARLYESEFDTSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ALKNAFSLLGKQRFEHSAAFFLLAGCLRDAIEVCLEKLNDIQLALVIARLYESEFDTSAA
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB7 YKSILRKKVLGIDSPVSELCSLNINMHHDPFLRSMAYWILEDYSGALETLIKQPIRENDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YKSILRKKVLGIDSPVSELCSLNINMHHDPFLRSMAYWILEDYSGALETLIKQPIRENDD
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB7 QVLSASNPTVFNFYNYLRTHPLLLRRHFGSSDTFSTHMSLTGKSGLAGTINLSERRLFFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QVLSASNPTVFNFYNYLRTHPLLLRRHFGSSDTFSTHMSLTGKSGLAGTINLSERRLFFT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB7 TASAHLKAGCPMLALEVLSKMPKVIKKTRPFYRASSFLDTSKDCSPSSPLKLDAREDKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TASAHLKAGCPMLALEVLSKMPKVIKKTRPFYRASSFLDTSKDCSPSSPLKLDAREDKSS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB7 AVDWSQSLINGFGSSSEGSSEKQSNSTLSFDWSQPSVVFQDDSLELKWDSDNDEENEDVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVDWSQSLINGFGSSSEGSSEKQSNSTLSFDWSQPSVVFQDDSLELKWDSDNDEENEDVP
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB7 ISMKELKPLQRKTDKKLDDISSNYTESFSTLDENDLLNPSEDIIAVQLKFRACLKILTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ISMKELKPLQRKTDKKLDDISSNYTESFSTLDENDLLNPSEDIIAVQLKFRACLKILTVE
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB7 LRTLSTGYEIDGGKLRYQLYHWLEKEVIALQRTCDFCSDAEELQSAFGRNEDEFGLNEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRTLSTGYEIDGGKLRYQLYHWLEKEVIALQRTCDFCSDAEELQSAFGRNEDEFGLNEDA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB7 EDLPHQTKVKQLRENFQEKRQWLLKYQSLLRMFLSYCILHGSHGGGLASVRMELILLLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDLPHQTKVKQLRENFQEKRQWLLKYQSLLRMFLSYCILHGSHGGGLASVRMELILLLQE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB7 SQQETSEPLFSSPLSEQTSVPLLFACTANAKTVVANPLLHLSNLTHDILHAIINFDSPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQQETSEPLFSSPLSEQTSVPLLFACTANAKTVVANPLLHLSNLTHDILHAIINFDSPPH
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB7 PDIQSNKVYVMHTLAASLSACIYQCLCGSHNYSSFQTNQFTGMVYQTVLLPHRPSLKTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PDIQSNKVYVMHTLAASLSACIYQCLCGSHNYSSFQTNQFTGMVYQTVLLPHRPSLKTGS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB7 LDEALTPNTSPAQWPGITCLIRLLNSSGEEAQSGLTVLLCEILTAVYLSLFIHGLATHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDEALTPNTSPAQWPGITCLIRLLNSSGEEAQSGLTVLLCEILTAVYLSLFIHGLATHSS
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB7 NELFRIVAHPLNEKMWSAVFGGGAHVPSKEQTHSKTLPVSSLVEEGEKQNKRFRPSKMSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NELFRIVAHPLNEKMWSAVFGGGAHVPSKEQTHSKTLPVSSLVEEGEKQNKRFRPSKMSC
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB7 RESAPLTPSSAPVSQESLAVKEKFIPPELSIWDYFIAKPFLPSSQSRAEYDSEESLGSDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RESAPLTPSSAPVSQESLAVKEKFIPPELSIWDYFIAKPFLPSSQSRAEYDSEESLGSDD
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KB7 DDNDDDDDVLASDFHLQEHSNSNSYSWSLMRLAMVQLVLNNLKTFYPFAGHDLAELPVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DDNDDDDDVLASDFHLQEHSNSNSYSWSLMRLAMVQLVLNNLKTFYPFAGHDLAELPVSS
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KB7 PLCHAVLKTLQCWEQVLLRRLEIHGGPPQNYIASHTAEESLSAGPAILRHKALLEPTNTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLCHAVLKTLQCWEQVLLRRLEIHGGPPQNYIASHTAEESLSAGPAILRHKALLEPTNTP
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KB7 FKSKHHLALSVKRLWQYLVKQEEIQETFIKNIFTKKRCLNEIEADLGYPGGKARIIHKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FKSKHHLALSVKRLWQYLVKQEEIQETFIKNIFTKKRCLNEIEADLGYPGGKARIIHKES
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KB7 DIITAFAVNKANRNCIAIASSHDVQELDVSGILATQVYTWVDDDIEVETKGSEDFLVIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DIITAFAVNKANRNCIAIASSHDVQELDVSGILATQVYTWVDDDIEVETKGSEDFLVIHA
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KB7 RDDLTAVQGTTPYTHSNPGTPINMPWLGSTQTGRGASVMIKKAINNVRRMTSHPTLPYYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDDLTAVQGTTPYTHSNPGTPINMPWLGSTQTGRGASVMIKKAINNVRRMTSHPTLPYYL
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KB7 TGAQDGSVRMFEWGHSQQITCFRSGGNSRVTRMRFNYQGNKFGIVDADGYLSLYQTNWKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TGAQDGSVRMFEWGHSQQITCFRSGGNSRVTRMRFNYQGNKFGIVDADGYLSLYQTNWKC
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KB7 CPVTGSMPKPYLTWQCHNKTANDFVFVSSSSLIATAGLSTDNRNVCLWDTLVAPANSLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CPVTGSMPKPYLTWQCHNKTANDFVFVSSSSLIATAGLSTDNRNVCLWDTLVAPANSLVH
2830 2840 2850 2860 2870 2880
2890 2900 2910 2920 2930 2940
pF1KB7 AFTCHDSGATVLAYAPKHQLLISGGRKGFTYVFDLCQRQQRQLFQSHDSPVKAVAVDPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AFTCHDSGATVLAYAPKHQLLISGGRKGFTYVFDLCQRQQRQLFQSHDSPVKAVAVDPTE
2890 2900 2910 2920 2930 2940
2950 2960 2970 2980 2990 3000
pF1KB7 EYFVTGSAEGNIKIWSLSTFGLLHTFVSEHARQSIFRNIGTGVMQIETGPANHIFSCGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EYFVTGSAEGNIKIWSLSTFGLLHTFVSEHARQSIFRNIGTGVMQIETGPANHIFSCGAD
2950 2960 2970 2980 2990 3000
3010 3020
pF1KB7 GTMKMRILPDQFSPLNEVLKNDVKFML
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GTMKMRILPDQFSPLNEVLKNDVKFML
3010 3020
>>CCDS75289.1 DMXL1 gene_id:1657|Hs108|chr5 (3048 aa)
initn: 17458 init1: 17458 opt: 17458 Z-score: 17631.8 bits: 3277.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 20156; 99.3% identity (99.3% similar) in 3048 aa overlap (1-3027:1-3048)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNLHQVLTGAVNPGDHCFSVGSIGDQRFTAYASGCDIVILGSDFERLQIIPGAKHGNIQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MNLHQVLTGAVNPGDHCFSVGSIGDQRFTAYASGCDIVILGSDFERLQIIPGAKHGNIQV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]