Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6838
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6838, 190 aa
1>>>pF1KB6838 190 - 190 aa - 190 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9829+/-0.00091; mu= 15.5424+/- 0.055
mean_var=85.1943+/-16.752, 0's: 0 Z-trim(106.9): 89 B-trim: 3 in 1/47
Lambda= 0.138953
statistics sampled from 9179 (9274) to 9179 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 1.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6932.1 NCS1 gene_id:23413|Hs108|chr9 ( 190) 1257 261.4 2.4e-70
CCDS78448.1 NCS1 gene_id:23413|Hs108|chr9 ( 172) 1120 233.9 4.1e-62
CCDS1671.1 HPCAL1 gene_id:3241|Hs108|chr2 ( 193) 803 170.4 6e-43
CCDS6292.1 NCALD gene_id:83988|Hs108|chr8 ( 193) 796 169.0 1.6e-42
CCDS370.1 HPCA gene_id:3208|Hs108|chr1 ( 193) 786 167.0 6.4e-42
CCDS1689.1 VSNL1 gene_id:7447|Hs108|chr2 ( 191) 763 162.4 1.5e-40
CCDS441.1 HPCAL4 gene_id:51440|Hs108|chr1 ( 191) 746 159.0 1.6e-39
CCDS7524.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 220) 602 130.2 8.9e-31
CCDS7525.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 225) 602 130.2 9e-31
CCDS41562.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 252) 602 130.2 9.7e-31
CCDS7522.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 270) 602 130.3 1e-30
CCDS7521.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 285) 602 130.3 1.1e-30
CCDS64313.1 KCNIP1 gene_id:30820|Hs108|chr5 ( 188) 595 128.7 2.1e-30
CCDS4374.1 KCNIP1 gene_id:30820|Hs108|chr5 ( 216) 595 128.8 2.3e-30
CCDS34285.1 KCNIP1 gene_id:30820|Hs108|chr5 ( 225) 595 128.8 2.4e-30
CCDS34286.1 KCNIP1 gene_id:30820|Hs108|chr5 ( 227) 595 128.8 2.4e-30
CCDS47035.1 KCNIP4 gene_id:80333|Hs108|chr4 ( 188) 590 127.7 4.2e-30
CCDS43215.1 KCNIP4 gene_id:80333|Hs108|chr4 ( 216) 590 127.8 4.6e-30
CCDS43217.1 KCNIP4 gene_id:80333|Hs108|chr4 ( 225) 590 127.8 4.8e-30
CCDS3428.1 KCNIP4 gene_id:80333|Hs108|chr4 ( 229) 590 127.8 4.8e-30
CCDS43216.1 KCNIP4 gene_id:80333|Hs108|chr4 ( 250) 590 127.8 5.1e-30
CCDS7523.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 227) 583 126.4 1.3e-29
CCDS33245.1 KCNIP3 gene_id:30818|Hs108|chr2 ( 230) 578 125.4 2.6e-29
CCDS2013.1 KCNIP3 gene_id:30818|Hs108|chr2 ( 256) 578 125.4 2.8e-29
CCDS11151.1 RCVRN gene_id:5957|Hs108|chr17 ( 200) 573 124.3 4.7e-29
CCDS4865.1 GUCA1B gene_id:2979|Hs108|chr6 ( 200) 453 100.3 8.1e-22
CCDS64312.1 KCNIP1 gene_id:30820|Hs108|chr5 ( 241) 419 93.5 1e-19
CCDS4864.1 GUCA1A gene_id:2978|Hs108|chr6 ( 201) 411 91.8 2.8e-19
CCDS2954.1 GUCA1C gene_id:9626|Hs108|chr3 ( 209) 330 75.6 2.2e-14
CCDS7526.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 ( 184) 286 66.7 9.2e-12
>>CCDS6932.1 NCS1 gene_id:23413|Hs108|chr9 (190 aa)
initn: 1257 init1: 1257 opt: 1257 Z-score: 1376.5 bits: 261.4 E(32554): 2.4e-70
Smith-Waterman score: 1257; 100.0% identity (100.0% similar) in 190 aa overlap (1-190:1-190)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB6 QALSLYDGLV
::::::::::
CCDS69 QALSLYDGLV
190
>>CCDS78448.1 NCS1 gene_id:23413|Hs108|chr9 (172 aa)
initn: 1120 init1: 1120 opt: 1120 Z-score: 1228.6 bits: 233.9 E(32554): 4.1e-62
Smith-Waterman score: 1120; 100.0% identity (100.0% similar) in 168 aa overlap (23-190:5-172)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MATITEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
110 120 130 140 150 160
190
pF1KB6 QALSLYDGLV
::::::::::
CCDS78 QALSLYDGLV
170
>>CCDS1671.1 HPCAL1 gene_id:3241|Hs108|chr2 (193 aa)
initn: 849 init1: 803 opt: 803 Z-score: 884.5 bits: 170.4 E(32554): 6e-43
Smith-Waterman score: 803; 61.2% identity (88.5% similar) in 183 aa overlap (1-183:1-183)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
:::.::::.:::...: ..: ::..:.:.:::::.::::.:.: . :.::: .:::.::
CCDS16 MGKQNSKLRPEVLQDLRENTEFTDHELQEWYKGFLKDCPTGHLTVDEFKKIYANFFPYGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
.::: :: .:: : :: :.: ::: :::::::: :..::.:::..::::..:::.:.:
CCDS16 ASKFAEHVFRTFDTNGDGTIDFREFIIALSVTSRGKLEQKLKWAFSMYDLDGNGYISRSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
::.::.:::.::......::.:.:::::.:.:: .:: : ::::.:.:: .:.:.:::::
CCDS16 MLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTDKIFRQMDTNNDGKLSLEEFIRGAKSDPSIV
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB6 QALSLYDGLV
. :
CCDS16 RLLQCDPSSASQF
190
>>CCDS6292.1 NCALD gene_id:83988|Hs108|chr8 (193 aa)
initn: 842 init1: 796 opt: 796 Z-score: 876.9 bits: 169.0 E(32554): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 796; 60.7% identity (88.0% similar) in 183 aa overlap (1-183:1-183)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
:::.::::.:::...: ..: :::.:.:.:::::..:::::.:. :.::: .:::.::
CCDS62 MGKQNSKLRPEVMQDLLESTDFTEHEIQEWYKGFLRDCPSGHLSMEEFKKIYGNFFPYGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
.::: :: .:: : :: :.: ::: :::::::: :..::.:::..::::..:::.. :
CCDS62 ASKFAEHVFRTFDANGDGTIDFREFIIALSVTSRGKLEQKLKWAFSMYDLDGNGYISKAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
::.::.:::.::......::.:.:::::...:: .:: : ::::.:.:: .:.:.:::::
CCDS62 MLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTEKIFRQMDTNRDGKLSLEEFIRGAKSDPSIV
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB6 QALSLYDGLV
. :
CCDS62 RLLQCDPSSAGQF
190
>>CCDS370.1 HPCA gene_id:3208|Hs108|chr1 (193 aa)
initn: 833 init1: 786 opt: 786 Z-score: 866.1 bits: 167.0 E(32554): 6.4e-42
Smith-Waterman score: 786; 60.1% identity (88.0% similar) in 183 aa overlap (1-183:1-183)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
:::.::::.::....: ..: :.: :.:.:::::.::::.: :.. :.::: .:::.::
CCDS37 MGKQNSKLRPEMLQDLRENTEFSELELQEWYKGFLKDCPTGILNVDEFKKIYANFFPYGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
.::: :: .:: :.:: :.: ::: :::::::: :..:: :::..::::..:::.:.:
CCDS37 ASKFAEHVFRTFDTNSDGTIDFREFIIALSVTSRGRLEQKLMWAFSMYDLDGNGYISREE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPSIV
::.::.:::.::......::.:.:::::...:: .:: : ::::.:.:: .:.:.:::::
CCDS37 MLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTEKIFRQMDTNNDGKLSLEEFIRGAKSDPSIV
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB6 QALSLYDGLV
. :
CCDS37 RLLQCDPSSASQF
190
>>CCDS1689.1 VSNL1 gene_id:7447|Hs108|chr2 (191 aa)
initn: 815 init1: 607 opt: 763 Z-score: 841.2 bits: 162.4 E(32554): 1.5e-40
Smith-Waterman score: 763; 58.4% identity (85.4% similar) in 185 aa overlap (1-183:1-185)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
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CCDS16 MGKQNSKLAPEVMEDLVKSTEFNEHELKQWYKGFLKDCPSGRLNLEEFQQLYVKFFPYGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
.::: .: .::.: :: :.: ::: :::.::::....:: :::..::::.:: ::: :
CCDS16 ASKFAQHAFRTFDKNGDGTIDFREFICALSITSRGSFEQKLNWAFNMYDLDGDGKITRVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEEN--TPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPS
::.:..:::.:::... . .:. :::.:::.::. :::: : ..::.::.:..:.:::
CCDS16 MLEIIEAIYKMVGTVIMMKMNEDGLTPEQRVDKIFSKMDKNKDDQITLDEFKEAAKSDPS
130 140 150 160 170 180
180 190
pF1KB6 IVQALSLYDGLV
:: :
CCDS16 IVLLLQCDIQK
190
>>CCDS441.1 HPCAL4 gene_id:51440|Hs108|chr1 (191 aa)
initn: 747 init1: 604 opt: 746 Z-score: 822.8 bits: 159.0 E(32554): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 746; 56.8% identity (84.3% similar) in 185 aa overlap (1-183:1-185)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDCPSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGD
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CCDS44 MGKTNSKLAPEVLEDLVQNTEFSEQELKQWYKGFLKDCPSGILNLEEFQQLYIKFFPYGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLDEKLRWAFKLYDLDNDGYITRNE
.::: .: .::.: :: :.: ::: ::::::::....:: :::..::::.:: ::: :
CCDS44 ASKFAQHAFRTFDKNGDGTIDFREFICALSVTSRGSFEQKLNWAFEMYDLDGDGRITRLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB6 MLDIVDAIYQMVGNTVELPEEEN--TPEKRVDRIFAMMDKNADGKLTLQEFQEGSKADPS
::.:..:::.:::... . ... ::..:::.:: ::.. : ..::.::.:..:.:::
CCDS44 MLEIIEAIYKMVGTVIMMRMNQDGLTPQQRVDKIFKKMDQDKDDQITLEEFKEAAKSDPS
130 140 150 160 170 180
180 190
pF1KB6 IVQALSLYDGLV
:: :
CCDS44 IVLLLQCDMQK
190
>>CCDS7524.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 (220 aa)
initn: 676 init1: 599 opt: 602 Z-score: 666.0 bits: 130.2 E(32554): 8.9e-31
Smith-Waterman score: 602; 45.6% identity (80.2% similar) in 182 aa overlap (9-190:39-220)
10 20 30
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDC
.:: .:.: ..: ::.::.: :.:: ..:
CCDS75 SLSDSRDLDGSYDQLTDSVDDEFELSTVCHRPEGLEQLQEQTKFTRKELQVLYRGFKNEC
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 PSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGDPTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLD
::: .. .:..::.:::: :: . .:::.::.:: :.:: . : .:. .::: :::.:
CCDS75 PSGIVNEENFKQIYSQFFPQGDSSTYATFLFNAFDTNHDGSVSFEDFVAGLSVILRGTVD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EKLRWAFKLYDLDNDGYITRNEMLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDK
..: :::.::::..:: ::..:::::. .::.:.:. . .:..:...:. .: ::.
CCDS75 DRLNWAFNLYDLNKDGCITKEEMLDIMKSIYDMMGKYTYPALREEAPREHVESFFQKMDR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KB6 NADGKLTLQEFQEGSKADPSIVQALSLYDGLV
: :: .:..:: :. . : .:.....:.:...
CCDS75 NKDGVVTIEEFIESCQKDENIMRSMQLFDNVI
190 200 210 220
>>CCDS7525.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 (225 aa)
initn: 676 init1: 599 opt: 602 Z-score: 665.9 bits: 130.2 E(32554): 9e-31
Smith-Waterman score: 602; 45.6% identity (80.2% similar) in 182 aa overlap (9-190:44-225)
10 20 30
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDC
.:: .:.: ..: ::.::.: :.:: ..:
CCDS75 QAARSLYQLVTGSLSPDSVDDEFELSTVCHRPEGLEQLQEQTKFTRKELQVLYRGFKNEC
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 PSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGDPTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLD
::: .. .:..::.:::: :: . .:::.::.:: :.:: . : .:. .::: :::.:
CCDS75 PSGIVNEENFKQIYSQFFPQGDSSTYATFLFNAFDTNHDGSVSFEDFVAGLSVILRGTVD
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EKLRWAFKLYDLDNDGYITRNEMLDIVDAIYQMVGNTVELPEEENTPEKRVDRIFAMMDK
..: :::.::::..:: ::..:::::. .::.:.:. . .:..:...:. .: ::.
CCDS75 DRLNWAFNLYDLNKDGCITKEEMLDIMKSIYDMMGKYTYPALREEAPREHVESFFQKMDR
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190
pF1KB6 NADGKLTLQEFQEGSKADPSIVQALSLYDGLV
: :: .:..:: :. . : .:.....:.:...
CCDS75 NKDGVVTIEEFIESCQKDENIMRSMQLFDNVI
200 210 220
>>CCDS41562.1 KCNIP2 gene_id:30819|Hs108|chr10 (252 aa)
initn: 676 init1: 599 opt: 602 Z-score: 665.3 bits: 130.2 E(32554): 9.7e-31
Smith-Waterman score: 602; 45.6% identity (80.2% similar) in 182 aa overlap (9-190:71-252)
10 20 30
pF1KB6 MGKSNSKLKPEVVEELTRKTYFTEKEVQQWYKGFIKDC
.:: .:.: ..: ::.::.: :.:: ..:
CCDS41 KLLPCCGPQALPSVSENSVDDEFELSTVCHRPEGLEQLQEQTKFTRKELQVLYRGFKNEC
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 PSGQLDAAGFQKIYKQFFPFGDPTKFATFVFNVFDENKDGRIEFSEFIQALSVTSRGTLD
::: .. .:..::.:::: :: . .:::.::.:: :.:: . : .:. .::: :::.:
CCDS41 PSGIVNEENFKQIYSQFFPQGDSSTYATFLFNAFDTNHDGSVSFEDFVAGLSVILRGTVD
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
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