Result of FASTA (omim) for
pF1KB6694
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6694, 462 aa
1>>>pF1KB6694 462 - 462 aa - 462 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3523+/-0.000421; mu= 17.5442+/- 0.026
mean_var=67.8721+/-13.506, 0's: 0 Z-trim(111.4): 66 B-trim: 174 in 1/51
Lambda= 0.155678
statistics sampled from 19928 (19994) to 19928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 7.740
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011533816 (OMIM: 130590) PREDICTED: elongation ( 462) 3055 695.5 8.1e-200
NP_001393 (OMIM: 130590) elongation factor 1-alpha ( 462) 3055 695.5 8.1e-200
NP_001949 (OMIM: 602959,616393,616409) elongation ( 463) 2858 651.2 1.7e-186
NP_001138630 (OMIM: 612450) HBS1-like protein isof ( 642) 745 176.7 1.6e-43
NP_006611 (OMIM: 612450) HBS1-like protein isoform ( 684) 745 176.7 1.7e-43
NP_001123479 (OMIM: 139259) eukaryotic peptide cha ( 499) 707 168.1 4.8e-41
NP_001123478 (OMIM: 139259) eukaryotic peptide cha ( 636) 707 168.2 5.9e-41
NP_002085 (OMIM: 139259) eukaryotic peptide chain ( 637) 707 168.2 5.9e-41
NP_060564 (OMIM: 300418) eukaryotic peptide chain ( 628) 692 164.8 6e-40
XP_011544230 (OMIM: 602389,610678) PREDICTED: elon ( 427) 271 70.2 1.3e-11
XP_016879108 (OMIM: 602389,610678) PREDICTED: elon ( 455) 271 70.2 1.3e-11
NP_003312 (OMIM: 602389,610678) elongation factor ( 455) 271 70.2 1.3e-11
NP_001273145 (OMIM: 607434) GTP-binding protein 2 ( 514) 232 61.4 6.5e-09
NP_061969 (OMIM: 607434) GTP-binding protein 2 iso ( 602) 232 61.5 7.4e-09
XP_016866465 (OMIM: 607434) PREDICTED: GTP-binding ( 493) 182 50.2 1.5e-05
XP_016862469 (OMIM: 607695) PREDICTED: selenocyste ( 491) 162 45.7 0.00034
XP_016862468 (OMIM: 607695) PREDICTED: selenocyste ( 525) 162 45.7 0.00035
XP_016862467 (OMIM: 607695) PREDICTED: selenocyste ( 536) 162 45.7 0.00036
XP_016862466 (OMIM: 607695) PREDICTED: selenocyste ( 553) 162 45.7 0.00037
XP_016862465 (OMIM: 607695) PREDICTED: selenocyste ( 571) 162 45.7 0.00038
XP_016862464 (OMIM: 607695) PREDICTED: selenocyste ( 575) 162 45.8 0.00038
NP_068756 (OMIM: 607695) selenocysteine-specific e ( 596) 162 45.8 0.00039
NP_001406 (OMIM: 300161,300987) eukaryotic transla ( 472) 151 43.2 0.0018
XP_006713858 (OMIM: 606639,609060) PREDICTED: elon ( 712) 149 42.9 0.0035
XP_016884592 (OMIM: 602245) PREDICTED: GTP-binding ( 614) 147 42.4 0.0042
NP_004277 (OMIM: 602245) GTP-binding protein 1 [Ho ( 669) 147 42.4 0.0045
XP_016884589 (OMIM: 602245) PREDICTED: GTP-binding ( 726) 147 42.4 0.0048
XP_016884591 (OMIM: 602245) PREDICTED: GTP-binding ( 622) 144 41.7 0.0067
XP_016884590 (OMIM: 602245) PREDICTED: GTP-binding ( 684) 144 41.7 0.0073
XP_011528839 (OMIM: 602245) PREDICTED: GTP-binding ( 703) 144 41.8 0.0075
NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor ( 858) 145 42.0 0.0075
XP_016884588 (OMIM: 602245) PREDICTED: GTP-binding ( 734) 144 41.8 0.0077
>>XP_011533816 (OMIM: 130590) PREDICTED: elongation fact (462 aa)
initn: 3055 init1: 3055 opt: 3055 Z-score: 3708.4 bits: 695.5 E(85289): 8.1e-200
Smith-Waterman score: 3055; 100.0% identity (100.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYAPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB6 LGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK
430 440 450 460
>>NP_001393 (OMIM: 130590) elongation factor 1-alpha 1 [ (462 aa)
initn: 3055 init1: 3055 opt: 3055 Z-score: 3708.4 bits: 695.5 E(85289): 8.1e-200
Smith-Waterman score: 3055; 100.0% identity (100.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYAPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB6 LGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK
430 440 450 460
>>NP_001949 (OMIM: 602959,616393,616409) elongation fact (463 aa)
initn: 2858 init1: 2858 opt: 2858 Z-score: 3469.2 bits: 651.2 E(85289): 1.7e-186
Smith-Waterman score: 2858; 92.6% identity (97.8% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV
::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.:::::::.::::
NP_001 GEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTR
::::: :: :::::::.:::::::: :::::::::: ::.:::::..:::::: ::::::
NP_001 IGYNPATVPFVPISGWHGDNMLEPSPNMPWFKGWKVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALS
::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 PTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGILRPGMVVTFAPVNITTEVKSVEMHHEALS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYAPV
:::::::::::::::::::.::::: ::::.:::.::: ::.:::::::::::::::.::
NP_001 EALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNVCGDSKSDPPQEAAQFTSQVIILNHPGQISAGYSPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPP
.::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::.:::::::::::::.:::
NP_001 IDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPKSLKSGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB6 LGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK
::::::::::::::::::: :.::..:::::::::::::::
NP_001 LGRFAVRDMRQTVAVGVIKNVEKKSGGAGKVTKSAQKAQKAGK
430 440 450 460
>>NP_001138630 (OMIM: 612450) HBS1-like protein isoform (642 aa)
initn: 945 init1: 628 opt: 745 Z-score: 902.3 bits: 176.7 E(85289): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 1083; 39.7% identity (68.5% similar) in 438 aa overlap (5-441:216-640)
10 20 30
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGI
: .:.:::::::.:::: ::..: :.:
NP_001 QSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNI
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 DKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPG
.:::..:.:.:. . ::.:: ::::::. :::::.:.:... ::::. .:..::::
NP_001 NKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPG
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 HRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNK
:.::: :::::..::: :::.: :. ::::::. .::::::.::. .::: :: :.:::
NP_001 HKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNK
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 MDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGW
::... ..:.:..::. ... ..:. :.. . :.:.: :: .:.:.. : . : .
NP_001 MDQVN--WQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWY
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKP
: : ::: .: . :: : :::.:: ..::.: : : .:..:.: ..
NP_001 K---------GLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQT
430 440 450 460 470
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 GMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPP
: . : : : ::.. .: : .. : ::.:.... .... . : . : :
NP_001 GDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPK--VP
480 490 500 510 520 530
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 MEAAG-FTAQVIILNHPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKF
..: : :...:.: :. :. .: .:. . .: ... .:. . :::
NP_001 IKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKF
540 550 560 570 580 590
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 LKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTK
: .:. :.:.. .:. .: ..:. :::: .: .:.:.::. .
NP_001 LTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
600 610 620 630 640
460
pF1KB6 SAQKAQKAK
>>NP_006611 (OMIM: 612450) HBS1-like protein isoform 1 [ (684 aa)
initn: 945 init1: 628 opt: 745 Z-score: 901.9 bits: 176.7 E(85289): 1.7e-43
Smith-Waterman score: 1083; 39.7% identity (68.5% similar) in 438 aa overlap (5-441:258-682)
10 20 30
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGI
: .:.:::::::.:::: ::..: :.:
NP_006 QSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNI
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 DKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPG
.:::..:.:.:. . ::.:: ::::::. :::::.:.:... ::::. .:..::::
NP_006 NKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPG
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 HRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNK
:.::: :::::..::: :::.: :. ::::::. .::::::.::. .::: :: :.:::
NP_006 HKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNK
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 MDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFKGW
::... ..:.:..::. ... ..:. :.. . :.:.: :: .:.:.. : . : .
NP_006 MDQVN--WQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWY
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKP
: : ::: .: . :: : :::.:: ..::.: : : .:..:.: ..
NP_006 K---------GLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQT
470 480 490 500 510
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 GMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPP
: . : : : ::.. .: : .. : ::.:.... .... . : . : :
NP_006 GDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPK--VP
520 530 540 550 560 570
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 MEAAG-FTAQVIILNHPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKF
..: : :...:.: :. :. .: .:. . .: ... .:. . :::
NP_006 IKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKF
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pF1KB6 LKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTK
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NP_006 LTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
640 650 660 670 680
460
pF1KB6 SAQKAQKAK
>>NP_001123479 (OMIM: 139259) eukaryotic peptide chain r (499 aa)
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10 20 30
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400 410 420 430 440
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450 460
pF1KB6 KVTKSAQKAQKAK
>>NP_001123478 (OMIM: 139259) eukaryotic peptide chain r (636 aa)
initn: 909 init1: 642 opt: 707 Z-score: 856.2 bits: 168.2 E(85289): 5.9e-41
Smith-Waterman score: 1046; 38.4% identity (66.7% similar) in 445 aa overlap (4-444:208-635)
10 20 30
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGG
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pF1KB6 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN
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NP_001 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
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pF1KB6 KMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDT-VAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK
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NP_001 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWY-
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pF1KB6 GWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVL
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NP_001 -----------IGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSI
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pF1KB6 KPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKND
:. ... : . ..:: .. . . ::.:. . .:.. ... : . : .:
NP_001 CKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNN-
470 480 490 500 510 520
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pF1KB6 PPMEAAG--FTAQVIILNHPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDG
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NP_001 --LCHSGRTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTR
530 540 550 560 570 580
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pF1KB6 PKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVG-VIKAVDKKAAGAG
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NP_001 PRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
590 600 610 620 630
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pF1KB6 KVTKSAQKAQKAK
>>NP_002085 (OMIM: 139259) eukaryotic peptide chain rele (637 aa)
initn: 909 init1: 642 opt: 707 Z-score: 856.2 bits: 168.2 E(85289): 5.9e-41
Smith-Waterman score: 1046; 38.4% identity (66.7% similar) in 445 aa overlap (4-444:209-636)
10 20 30
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGG
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pF1KB6 IDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAP
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NP_002 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAP
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pF1KB6 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN
::..:. ::: :.:::: :::...: ::::.:. :.:::::::.:: : :::.::: .:
NP_002 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
300 310 320 330 340 350
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pF1KB6 KMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDT-VAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK
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NP_002 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWY-
360 370 380 390 400 410
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pF1KB6 GWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVL
: .. :: . .: .: :.:::. : :: .::: .:..:.: .
NP_002 -----------IGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSI
420 430 440 450 460
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pF1KB6 KPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKND
:. ... : . ..:: .. . . ::.:. . .:.. ... : . : .:
NP_002 CKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNN-
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pF1KB6 PPMEAAG--FTAQVIILNHPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDG
. .: : ::..:..: . : :: :: :: ... : .:..::.: .
NP_002 --LCHSGRTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTR
530 540 550 560 570 580
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pF1KB6 PKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVG-VIKAVDKKAAGAG
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NP_002 PRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
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pF1KB6 KVTKSAQKAQKAK
>>NP_060564 (OMIM: 300418) eukaryotic peptide chain rele (628 aa)
initn: 856 init1: 591 opt: 692 Z-score: 838.1 bits: 164.8 E(85289): 6e-40
Smith-Waterman score: 1029; 37.5% identity (66.5% similar) in 445 aa overlap (4-444:200-627)
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pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGG
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NP_060 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETERKHFTILDAP
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pF1KB6 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN
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NP_060 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
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pF1KB6 KMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDT-VAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK
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NP_060 KMDDPTVNWSIERYEECKEKLVPFLKKVGFSPKKDIHFMPCSGLTGANIKEQSDFCPWY-
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pF1KB6 GWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVL
.: .. :: . .: : :.:::. : :: .::: .:..:.: .
NP_060 -----------TGLPFIPYLDNLPNFNRSIDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSI
410 420 430 440 450
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pF1KB6 KPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKND
:. ... : . ..:: .. . . ::.:. . .:.. ... : . : .:
NP_060 FKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDTETDFVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPSN-
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pF1KB6 PPMEAAG--FTAQVIILNHPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDG
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NP_060 --LCHSGRTFDVQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALISLVDKKSGEKSKTR
520 530 540 550 560 570
400 410 420 430 440
pF1KB6 PKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVG-VIKAVDKKAAGAG
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NP_060 PRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
580 590 600 610 620
450 460
pF1KB6 KVTKSAQKAQKAK
>>XP_011544230 (OMIM: 602389,610678) PREDICTED: elongati (427 aa)
initn: 467 init1: 192 opt: 271 Z-score: 329.6 bits: 70.2 E(85289): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 475; 29.3% identity (51.9% similar) in 443 aa overlap (3-438:56-411)
10 20 30
pF1KB6 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCG
..: :.:. .::::: ::.: :. .
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30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDA
: :: : ..:: .:. :: :::::. . .. :. . . :
XP_011 -----------KILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDC
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pF1KB6 PGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGV
::: :..:::::::. : .:.:::. : . ::::: ::: .::....: :
XP_011 PGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYV
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pF1KB6 NKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK
:: :... ... : . :. . ..::. . . . :. . . .:
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: : ..: ::.:.: .: :.: .::. ::.. ::.. : ::: .:
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XP_011 IKPHQKV--EAQVYILSKEEGGRHKPFVSH-FMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGE
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pF1KB6 KLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKA
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420
462 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:47:58 2016 done: Sat Nov 5 11:47:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]