Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6684
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6684, 456 aa
1>>>pF1KB6684 456 - 456 aa - 456 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2221+/-0.000813; mu= 18.0772+/- 0.049
mean_var=66.3468+/-12.974, 0's: 0 Z-trim(107.4): 18 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.157458
statistics sampled from 9533 (9546) to 9533 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 456) 3095 712.0 3.2e-205
CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 2904 668.6 3.6e-192
CCDS56268.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 2070 479.1 3.9e-135
CCDS56269.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 283) 1934 448.1 5.4e-126
CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3 ( 451) 891 211.3 1.7e-54
CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21 ( 481) 867 205.9 7.6e-53
CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 500) 506 123.9 3.8e-28
CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 ( 465) 467 115.0 1.7e-25
CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 ( 467) 420 104.3 2.7e-22
CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 ( 475) 414 103.0 7.2e-22
CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10 ( 467) 410 102.0 1.3e-21
CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 ( 499) 386 96.6 6.1e-20
CCDS77187.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 426) 267 69.5 7.4e-12
>>CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 (456 aa)
initn: 3095 init1: 3095 opt: 3095 Z-score: 3797.8 bits: 712.0 E(32554): 3.2e-205
Smith-Waterman score: 3095; 100.0% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
430 440 450
>>CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 (440 aa)
initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904 Z-score: 3563.6 bits: 668.6 E(32554): 3.6e-192
Smith-Waterman score: 2904; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (25-456:9-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MHKSSSIWGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
350 360 370 380 390 400
430 440 450
pF1KB6 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
410 420 430 440
>>CCDS56268.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 (440 aa)
initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070 Z-score: 2539.7 bits: 479.1 E(32554): 3.9e-135
Smith-Waterman score: 2965; 96.5% identity (96.5% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WIYGSTGVYFSAVKNV----------------LGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
350 360 370 380 390 400
430 440 450
pF1KB6 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
410 420 430 440
>>CCDS56269.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 (283 aa)
initn: 1934 init1: 1934 opt: 1934 Z-score: 2375.5 bits: 448.1 E(32554): 5.4e-126
Smith-Waterman score: 1934; 100.0% identity (100.0% similar) in 283 aa overlap (174-456:1-283)
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 SLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEE
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRA
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKE
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 VKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQQRYGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQQRYGKG
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 IIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQA
220 230 240 250 260 270
450
pF1KB6 SVTVSCDLKIACV
:::::::::::::
CCDS56 SVTVSCDLKIACV
280
>>CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3 (451 aa)
initn: 751 init1: 622 opt: 891 Z-score: 1092.1 bits: 211.3 E(32554): 1.7e-54
Smith-Waterman score: 891; 35.4% identity (69.1% similar) in 404 aa overlap (23-416:14-411)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPT-PQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPS
: .:: : :. .:.:: . :: :.:...:.. .
CCDS32 MLRFYLFISLLCLSRSDAEETCPSFTRLSFHSAVV--GTGLNVRLMLYTRK
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 NPSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAV
: .:.: .. :: . : .:.: : .:.:::: :. : :.: ... :: . . ::..:
CCDS32 NLTCAQTIN-SSAFGN--LNVTKKTTFIVHGFRPTGSPPVWMDDLVKGLLSVEDMNVVVV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DWIYGSTG-VYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQL
:: :.: .: : ... :... .. :....:. :.: ..:..::::::::..:.::..
CCDS32 DWNRGATTLIYTHASSKTRKVAMVLKEFIDQMLAEGASLDDIYMIGVSLGAHISGFVGEM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 FGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNG
. : ::.::::::::: .. ..::: .:: ::..::.::: :: . :.:..:.. ::
CCDS32 YDGWLGRITGLDPAGPLFNGKPHQDRLDPSDAQFVDVIHSDTDALGYKEPLGNIDFYPNG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFN
: :::::: . .:..:. :::.:.:.::.:.:..:: . :.:: ::. . :.:..: .
CCDS32 GLDQPGCPKTILGGFQYFKCDHQRSVYLYLSSLRESCTITAYPCDSYQDYRNGKCVSCGT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 PFLLSCPRIGLVE---QGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHL--KELRNK
::: .: . .. . : .:... :. .:.::.: .:.. :..:
CCDS32 SQKESCPLLGYYADNWKDHLRGKD-PPMTKAFFDTAEESPFCMYHYFVDIITWNKNVRRG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 DTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQ-QRYGK-GIIAHATPQC-QINQVKFKFQSSNRVWKK
: .:.. ..: : :. : :.: . ...:. . . .. ... :.... . .
CCDS32 DITIKLRDKAGNTTESKINHEPTTFQKYHQVSLLARFNQDLDKVAAISLMFSTGSLIGPR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KB6 DRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
. :.
CCDS32 YKLRILRMKLRSLAHPERPQLCRYDLVLMENVETVFQPILCPELQL
410 420 430 440 450
>>CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21 (481 aa)
initn: 817 init1: 652 opt: 867 Z-score: 1062.2 bits: 205.9 E(32554): 7.6e-53
Smith-Waterman score: 867; 39.6% identity (70.7% similar) in 338 aa overlap (16-340:26-359)
10 20 30 40
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEG-TDL
.::: : . : : .:.. .. .. ::
CCDS13 MLLKCLHNNLCQKYSAHAFQFSPRNVLWLLVVCLRSDNKRP---CLEFSQLSVKDSFRDL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 KVQ-----FLLFVPSNPSCGQ-LVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDT
. ..... .: .:.. : : ...: : .::. : .:::.: .:. : :...
CCDS13 FIPRIETILMMYTRNNLNCAEPLFEQNNSL-NVNFNTQKKTVWLIHGYRPVGSIPLWLQN
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 FIRTLLRATNANVIAVDWIYGSTG-VYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHI
:.: :: . :::.::: :.: .: ::::. :... .:. ...:: :.: ...:.
CCDS13 FVRILLNEEDMNVIVVDWSRGATTFIYNRAVKNTRKVAVSLSVHIKNLLKHGASLDNFHF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 IGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDN
::::::::..:.::..: ::::.:::::::::...: ::: :: ::..::.:...
CCDS13 IGVSLGAHISGFVGKIFHGQLGRITGLDPAGPRFSRKPPYSRLDYTDAKFVDVIHSDSNG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPC
:::. :.::.:.. :::. ::::: ...: ... :.:.:::::....::..: ...:::
CCDS13 LGIQEPLGHIDFYPNGGNKQPGCPKSIFSGIQFIKCNHQRAVHLFMASLETNCNFISFPC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB6 ASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQ--GGV---KIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYC
::: . .. :.:: ::::.: . :: ..: : .. :.: :... :.:
CCDS13 RSYKDYKTSLCVDCDCFKEKSCPRLGYQAKLFKGVLKERMEGRPLRTTVFLDTSGTYPFC
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 MHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQV
..
CCDS13 TYYFVLSIIVPDKTMMDGSFSFKLLNQLGMIEEPRLYEKNKPFYKLQEVKILAQFYNDFV
360 370 380 390 400 410
>>CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 (500 aa)
initn: 346 init1: 222 opt: 506 Z-score: 618.7 bits: 123.9 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 620; 33.3% identity (61.0% similar) in 387 aa overlap (9-375:9-383)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLK--VQFLLFVP
::: .: ...:: .: :. . : :..: :.: : .
CCDS11 MSNSVPLLCFW--SLCYCFAAGSP--VPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SNP---SCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTL-LRATNA
..: .: : :. :.. .:: : : .::::. . : .:. .. .: : .:
CCDS11 KDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLG-VSESSIHIIGVSLGAHVGG
::..:::. . .: .::.:. .. :. .:. : : ...:.:: ::::::.:
CCDS11 NVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB6 MVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDN----LGIRIPV
..:.. : .:.::::::::: . :....::. :: ::...:: : . .::..::
CCDS11 YAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFGLSIGIQMPV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 GHVDYFVNGGQDQPGCP------TFFYAGYSYLI-CDHMRAVHLYISALENS-CPLMAFP
::.: . :::. :::: .. :. . .. :.: :::::....: :. : .::
CCDS11 GHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 CASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHS
:.. . : : ::.: . : :: ..: .. :.:: : .. :. ..:
CCDS11 CTDSNRFKKGICLSCRKN---RCNSIGY----NAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHY
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNI-TSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFK
...:. .: .:: :: . :.... :.:
CCDS11 QMKIHVFSYKNMG-EIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGD
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB6 FQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
CCDS11 LLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPE
410 420 430 440 450 460
>>CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 475 init1: 218 opt: 467 Z-score: 571.3 bits: 115.0 E(32554): 1.7e-25
Smith-Waterman score: 574; 35.7% identity (66.1% similar) in 280 aa overlap (48-308:50-325)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 WLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSNPSCGQLVEG-SSDLQNS
:....:::.. ::. : : . ::....:
CCDS75 CYERLGCFSDDSPWSGITERPLHILPWSPKDVNTRFLLYTNENPNNFQEVAADSSSISGS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 GFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNV
.:... :..::::: : . .:. . ..:... ..: : ::: :: : .: .:.
CCDS75 NFKTNRKTRFIIHGFIDKGEE-NWLANVCKNLFKVESVNCICVDWKGGSRTGYTQASQNI
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 IKLSLEISLFLNKLL-VLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPE
.. :.. :.. : ..: : :..:.:: :::::..: .:. .: .:.::::::: :
CCDS75 RIVGAEVAYFVEFLQSAFGYSPSNVHVIGHSLGAHAAGEAGRRTNGTIGRITGLDPAEPC
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KB6 YTRASVEERLDAGDALFVEAIHTD----TDNLGIRIP--VGHVDYFVNGGQDQPGCPT--
. . ::: .:: ::..:::: . :::. . :::.:.: ::: ..:::
CCDS75 FQGTPELVRLDPSDAKFVDVIHTDGAPIVPNLGFGMSQVVGHLDFFPNGGVEMPGCKKNI
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KB6 ---------FFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFN
.. . .. :.:.:. . : ... : . .::::::..: :..:. : .
CCDS75 LSQIVDIDGIWEGTRDFAACNHLRSYKYYTDSIVNPDGFAGFPCASYNVFTANKCFPCPS
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 PFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIE
.::..:
CCDS75 G---GCPQMGHYADRYPGKTNDVGQKFYLDTGDASNFARWRYKVSVTLSGKKVTGHILVS
320 330 340 350 360 370
>>CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 (467 aa)
initn: 416 init1: 158 opt: 420 Z-score: 513.6 bits: 104.3 E(32554): 2.7e-22
Smith-Waterman score: 534; 35.0% identity (63.2% similar) in 277 aa overlap (52-308:55-326)
30 40 50 60 70
pF1KB6 GSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSNPSCGQ--LVEGSSDLQNSGFN
.:::.. ::. : :. : .. :.:.
CCDS75 LGCFSDTEPWGGTAIRPLKILPWSPEKIGTRFLLYTNENPNNFQILLLSDPSTIEASNFQ
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 ATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNVIKL
:..::::: : . ::. . . :... ..: : ::: :: ..: .:..:: .
CCDS75 MDRKTRFIIHGFIDKGDE-SWVTDMCKKLFEVEEVNCICVDWKKGSQATYTQAANNVRVV
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 SLEISLFLNKLLV-LGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTR
. ... .:. ::. . :..:.:: ::::::.: .:. : :..::::::. .
CCDS75 GAQVAQMLDILLTEYSYPPSKVHLIGHSLGAHVAGEAGSKTPG-LSRITGLDPVEASFES
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KB6 ASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNL------GIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTF----
. : ::: .:: ::..::::. : : .::.:.: :::...:::
CCDS75 TPEEVRLDPSDADFVDVIHTDAAPLIPFLGFGTNQQMGHLDFFPNGGESMPGCKKNALSQ
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ------FYAG-YSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFL
..:: ... :.:.:. . :. .. : . :.::.:::.: . .:. : .
CCDS75 IVDLDGIWAGTRDFVACNHLRSYKYYLESILNPDGFAAYPCTSYKSFESDKCFPCPDQ--
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTF
.::..:
CCDS75 -GCPQMGHYADKFAGRTSEEQQKFFLNTGEASNFARWRYGVSITLSGRTATGQIKVALFG
330 340 350 360 370
>>CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 (475 aa)
initn: 475 init1: 201 opt: 414 Z-score: 506.1 bits: 103.0 E(32554): 7.2e-22
Smith-Waterman score: 539; 31.2% identity (59.3% similar) in 391 aa overlap (15-376:11-382)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLS--VGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVP
: .::. ..: : . . : . :: :.. .: : .:
CCDS60 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRR--DF--------IDIESKFALRTP
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SNP---SCGQLVEGSSD-LQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLL-RATN
. .: .:. : .. . . :: . : ..:::. : : ::. .. .: : .
CCDS60 EDTAEDTC-HLIPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ANVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLV-LGVSESSIHIIGVSLGAHVG
.:::.:::. . : .. . .. ... :.: . .. ...:..: :::::..
CCDS60 SNVIVVDWLSRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB6 GMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTD-----NLGIRI
:..:.: . ....:::::::::.. : . ::. :: ::...:: : ..::.
CCDS60 GIAGSLTNKKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQK
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB6 PVGHVDYFVNGGQDQPGCP------TFFYAGYS---YLI-CDHMRAVHLYISALENS-CP
:::::: . ::: :::: .. : . :. :.: :..::.:..: : :
CCDS60 PVGHVDIYPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENP
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPY
:. :.: .:: : ::.: . : .: : . :. . . :.:: : :. ::
CCDS60 SKAYRCSSKEAFEKGLCLSCRKN---RCNNLGY-EINKVRAK---RSSKMYLKTRSQMPY
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 CMHHSLVEFHLKELRNKD-TN--IEVTFLSSNITSSSKI--TIPKQQRYGKGIIAHATPQ
. : :..:.. ... :: .:.. : .... : .: :.:.
CCDS60 KVFHYQVKIHFSGTESETHTNQAFEIS-LYGTVAESENIPFTLPEVSTNKTYSFLIYTEV
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 CQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDL
CCDS60 DIGELLMLKLKWKSDSYFSWSDWWSSPGFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGK
400 410 420 430 440 450
456 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:45:54 2016 done: Sat Nov 5 11:45:55 2016
Total Scan time: 2.960 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]