Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6672
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6672, 454 aa
1>>>pF1KB6672 454 - 454 aa - 454 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8999+/-0.000822; mu= 14.9766+/- 0.049
mean_var=75.8588+/-14.787, 0's: 0 Z-trim(107.6): 42 B-trim: 82 in 1/51
Lambda= 0.147255
statistics sampled from 9657 (9699) to 9657 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 3080 663.7 1.1e-190
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 1643 358.5 9.4e-99
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 1632 356.1 4.1e-98
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 1218 268.1 1.2e-71
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 1206 265.6 6.8e-71
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 534 122.8 7.7e-28
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 502 116.0 7.2e-26
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 488 113.0 5.5e-25
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 452 105.4 1.2e-22
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 449 104.8 1.9e-22
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 421 98.8 9.9e-21
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 404 95.2 1.5e-19
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 398 93.9 3.4e-19
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 396 93.5 4e-19
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 383 90.7 3e-18
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 371 88.2 1.7e-17
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 368 87.6 3.1e-17
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 343 82.2 9.2e-16
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 344 82.5 9.5e-16
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 298 72.7 8e-13
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 290 71.0 2.4e-12
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 290 71.0 2.9e-12
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 287 70.3 4e-12
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 286 70.1 4.1e-12
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 282 69.3 7.9e-12
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 281 69.0 8.6e-12
CCDS12376.1 GDF15 gene_id:9518|Hs108|chr19 ( 308) 272 67.1 2.9e-11
>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa)
initn: 3080 init1: 3080 opt: 3080 Z-score: 3537.1 bits: 663.7 E(32554): 1.1e-190
Smith-Waterman score: 3080; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (1-454:1-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYPASP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 NGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 MVAFFKASEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MVAFFKASEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCA
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 PTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
430 440 450
>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 1074 init1: 810 opt: 1643 Z-score: 1886.4 bits: 358.5 E(32554): 9.4e-99
Smith-Waterman score: 1742; 59.3% identity (79.6% similar) in 450 aa overlap (36-454:64-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 FLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILGLPHRP
:.:.::::...:.::.:.::::.:::::::
CCDS45 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP
40 50 60 70 80 90
70 80 90
pF1KB6 RPFS---------------------------PGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPE-ES
::. : . .::::::::::::.. ... . :
CCDS45 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGAS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EYSVRASLAEET-RGARKGYPASPNGYP-RRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDAD
: . : .:. .... : ..: : .: . . ::.: .:. ::::::
CCDS45 EGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDAD
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 MVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIK
:::::::::: ::.:: ..::.:::.:.:.:::.::.::::::::::: . :.:.:.
CCDS45 MVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFL
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAET
:::::...:. .::.:::::::: . : . ::: ::::.::: ::..::.:.:::: . :
CCDS45 ISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVT
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 GDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRSVRAAN-KRKNQNRNKSSSHQD
:: .. ..::::::.:: .::::::::::.::: .:..:.:. .:..:.::.:.. ::
CCDS45 RDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQD
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHM
.:.::..:::.:: : ::.::::::::.:::::::::::.:::: ::::::::::::::
CCDS45 VARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHM
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 NATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
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CCDS45 NATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
460 470 480 490 500 510
>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa)
initn: 1098 init1: 874 opt: 1632 Z-score: 1874.9 bits: 356.1 E(32554): 4.1e-98
Smith-Waterman score: 1898; 64.7% identity (84.2% similar) in 442 aa overlap (15-454:17-431)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLG-DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILS
::. :. : . .. ::.::::::.::::..::::.::::::
CCDS13 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
:::::::::: ::. .:::.:::::::::. ::. :. :
CCDS13 ILGLPHRPRPHLQGKH-NSAPMFMLDLYNAMAVEEG-----------------GGPGGQG
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHY
: :: . .: ::.::::::.:..::.:::::::::::::.::.: : : :.
CCDS13 FS---YPYKAVFS------TQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHH
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDT
.::::::..::.:::::::::::::: .::.:::..::.::...:. .:..::::::.
CCDS13 REFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSK
: : . ::::::::.::::::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.:
CCDS13 RTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 QPFMVAFFKASEVLLRSVRAA-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKH
::::::::::.:: .::.:.. .:...:::.:. ..:.. ::..:.. ..:.:.::::::
CCDS13 QPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKH
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPK
:::::::::::::::::::::::.::.:::.::::..::::::::::::::.. :. :::
CCDS13 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPK
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450
pF1KB6 PCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS13 PCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
400 410 420 430
>>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 895 init1: 765 opt: 1218 Z-score: 1400.1 bits: 268.1 E(32554): 1.2e-71
Smith-Waterman score: 1342; 47.5% identity (72.3% similar) in 455 aa overlap (8-454:1-402)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDN----HVHSSFIYRRLRNHERREIQREIL
. .. : :: :.: : .:: . . . ::: .:::..:::::
CCDS44 MTALPGPLW----LLGLALCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQREIL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SILGLPHRPRPFSP---GKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGAR
..:::: :::: .: .. .::::::::::.::..... .
CCDS44 AVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDED------------------
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 KGYPASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQ
: :: :: :. ::.::::::.::::. ..::
CCDS44 -GAPAE-----RR------------------------LGRADLVMSFVNMVERDRALGHQ
100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 RRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLF
. :.::::::::::: ::::::::::::: : . . :.:...:..:...: .::..:::
CCDS44 EPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVPSIHLL-NRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLF
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQG
.:: . .: : ::::.:.:..:. :... ...:::.: .:: ::.:.. :::.:...
CCDS44 FLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRA
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 PQSKQPFMVAFFKASEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSV-GDYNTSEQKQA
:.:.:::.:.::.:: .:. ::. . .. .::. ...:. .. : . :. .:.
CCDS44 PRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQV
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 CKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPD
:..:::::::.:::: ::.:::.::.:.::.:::::::.. ::::::::.:.:::::.::
CCDS44 CRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPD
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450
pF1KB6 HVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
::: :::::::.: ::::.:.:.::::.:.:::::..::::
CCDS44 AVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILRKHRNMVVKACGCH
370 380 390 400
>>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 883 init1: 753 opt: 1206 Z-score: 1386.3 bits: 265.6 E(32554): 6.8e-71
Smith-Waterman score: 1327; 47.1% identity (71.7% similar) in 446 aa overlap (13-454:6-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILG
: :: . . :: . . ::: .:::..:::::..::
CCDS43 MAARPGPLWLLGLTLCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQREILAVLG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 LPHRPRPFSP---GKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
:: :::: .: .. .::::::::::.::..... .
CCDS43 LPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDED----------------------
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHY
: : . .:.: ::.::::::.::::. ..::. :.
CCDS43 ----GAPAEQRLGR----------------------ADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHW
100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDT
::::::::::: ::::::::::::: : . . :.:...:..:...: .::..:::.::
CCDS43 KEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVPSIH-LLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDL
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSK
. .: : ::::.:.:..:. :... ...:::.: .:: ::.:.. :::.:...:.:.
CCDS43 QTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQ
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 QPFMVAFFKASEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSV-GDYNTSEQKQACKKH
:::.:.::.:: .:. ::. . .. .::. ...:. .. : :. .:.:..:
CCDS43 QPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRH
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPK
::::::.:::: ::.:::.::.:.::.:::::::.. ::::::::.:.::::: :. :::
CCDS43 ELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPK
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450
pF1KB6 PCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
:::::::.: ::::.:.:.::::.:.:::::..::::
CCDS43 ACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILRKHRNMVVKACGCH
370 380 390 400
>>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 (501 aa)
initn: 509 init1: 454 opt: 534 Z-score: 613.2 bits: 122.8 E(32554): 7.7e-28
Smith-Waterman score: 546; 27.1% identity (58.1% similar) in 420 aa overlap (61-453:97-500)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTN
:: ::: .: . . : ..:
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pF1KB6 EENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYPASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNF
. . .. .:. . . .:. .: ::. . : : . ::. :
CCDS13 KGQLPGGKAPPKAGSVPSSFLLKKAREPGP---PREPKEPFRPPPITPHEYMLSLYRT--
130 140 150 160 170
160 170 180 190
pF1KB6 LNDAD-------------MVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAE
:.::: .. ........ .: . ... ::.. . . ... .::
CCDS13 LSDADRKGGNSSVKLEAGLANTITSFIDKGQDDRGPVVRKQRYVFDISALEK-DGLLGAE
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200 210 220 230 240 250
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.:: . . .. . . . . .. . ..:. :::.:.. .:: :: ::::
CCDS13 LRILRKKPSDTAKPAAPGGGRAAQLKLSSCPSGRQPAA-LLDVRSVPGLDGSGWEVFDI-
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260 270 280 290 300
pF1KB6 VTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGD---GRSINVKSAGL--VGRQGPQSKQPFMV-AFFKA
: . . . . ::: : ::...... :. ..:: . : :.: . :
CCDS13 -----WKLFRNFKNSAQLCLELEAWERGRAVDLRGLGFDRAARQ-VHEKALFLVFGRTKK
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310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSV----GDYNTSEQKQACKKHELYVSFR
.... ..: . . ... . : .: . . : ... : :... :.:.:.
CCDS13 RDLFFNEIKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLATRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFK
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370 380 390 400 410 420
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:.::.:::::: : ::.:.: : ::: .:.. ::::..:::.. : :. .: ::.::.
CCDS13 DMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPTR
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430 440 450
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CCDS13 LSPISILFIDSANNVVYKQYEDMVVESCGCR
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.... : .: ::: ...::. :. .... : :: :
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CCDS97 SRANTVR-------SFHHEEHLEN-------IPGTSENSAF--------RFLFNLSSIPE
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CCDS97 NEVISSAELRLFREQVDQGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNV
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. : .::.. . .:. . : : :: . . .: .:. . .. . : . . .
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:..:.: . . :. .: ..:. : : : .. :.: . .... :..: :
CCDS97 PLLVTFGHDG----RG-HALTRRR---RAKRSPKHHSQR--------ARKKNKNCRRHSL
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CCDS97 YVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSV-NSSIPKAC
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pF1KB6 CAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
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CCDS97 CVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
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CCDS13 YMLDLYR---------------RHS----------GQPGSPAPDHR---LERAA---SRA
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CCDS13 NTVRSFHHEESLEE---------LPETSGKTT--RR----FFFNLSSIPTEEFITSAELQ
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..... .. . :.. .:.::.::: : : . ::::: .. : ::.:
CCDS13 VFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTP
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CCDS13 AVMRWTAQGHANHGFV------------VEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQ
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CCDS13 PGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSV-NSKIPKACCVPTELSAISMLYLDE
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CCDS13 NEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
380 390
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CCDS17 QRWEAFDVADAMRRHRREPRPPRAFCLLLRAVAGPVPSPLALRRLGFGWPGGGGSAAEER
210 220 230 240 250 260
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pF1KB6 FMVAF---FKASEVLLRSVRAANK---------------------------RKNQNRNKS
... . .: :.: .:: . :. . .
CCDS17 AVLVVSSRTQRKESLFREIRAQARALGAALASEPLPDPGTGTASPRAVIGGRRRRRTALA
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... .. ...: . . .. :... :.:.:..:::.:::::: : :..:.: :.::
CCDS17 GTRTAQGSGGGAGRGHGRRGRSRCSRKPLHVDFKELGWDDWIIAPLDYEAYHCEGLCDFP
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pF1KB6 LNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVR
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CCDS17 LRSHLEPTNHAIIQTLLNSMAPDAAPASCCVPARLSPISILYIDAANNVVYKQYEDMVVE
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.:::
CCDS17 ACGCR
450
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pF1KB6 LPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPE-ESEYSVRASLAEETRGARKGYPAS
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CCDS34 ELGSTKGMRSRKEGKMQRAPRDSDAGREGQEPQPRPQDEPRAQQPRAQEPPG--RGPRVV
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pF1KB6 PNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKE
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CCDS34 PHEY--MLSIYRTYSIAEKLGINASFFQSS--KSANTITSFVD--RGLDDLSHTPLRRQK
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pF1KB6 FRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRK
. ::.... : ...::.:.... . . . . . :.. . : :: .
CCDS34 YLFDVSMLSDKEELVGAELRLFRQAPSAPWGPPAGPLHV-QLFPCLSPLLLDARTLDPQG
150 160 170 180 190 200
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pF1KB6 AQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGD---GRS------------INVK
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CCDS34 APP--AGWEVFDVWQGLRH---QPWKQLCLELRAAWGELDAGEAEARARGPQQPPPPDLR
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CCDS34 SLGFGRRVRPPQERALLVVFTRSQRKNLFAEMREQLGSAEAAGPGAGAEGSWPPPSGAPD
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CCDS34 ARPWLPSPGRRRRRTAFASRHGKRHGKKSRLRCSKKPLHVNFKELGWDDWIIAPLEYEAY
330 340 350 360 370 380
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pF1KB6 YCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVIL
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CCDS34 HCEGVCDFPLRSHLEPTNHAIIQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYIDAGNNVVY
390 400 410 420 430 440
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CCDS34 KQYEDMVVESCGCR
450
454 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]