Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6666
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6666, 453 aa
1>>>pF1KB6666 453 - 453 aa - 453 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2231+/-0.00104; mu= 12.9306+/- 0.062
mean_var=82.5377+/-16.394, 0's: 0 Z-trim(104.7): 48 B-trim: 161 in 2/50
Lambda= 0.141172
statistics sampled from 8002 (8041) to 8002 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 2.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 453) 3132 648.0 5.7e-186
CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 437) 2991 619.3 2.4e-177
CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 ( 312) 756 164.0 1.9e-40
CCDS3787.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 ( 866) 705 153.8 6.4e-37
CCDS3786.1 FGB gene_id:2244|Hs108|chr4 ( 491) 560 124.2 3e-28
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 485 108.9 1.1e-23
CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 456 103.0 7.1e-22
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 454 102.6 9.6e-22
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 449 101.6 2e-21
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 442 100.1 5.2e-21
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 438 99.3 6.3e-21
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 432 98.1 2.1e-20
CCDS8312.1 ANGPTL5 gene_id:253935|Hs108|chr11 ( 388) 423 96.2 6.1e-20
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 420 95.6 7.4e-20
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 419 95.5 1.3e-19
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 412 94.0 2.4e-19
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 407 92.9 4.5e-19
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 407 92.9 4.7e-19
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 404 92.4 1.1e-18
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 403 92.2 1.2e-18
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 403 92.2 1.3e-18
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 378 87.0 2.4e-17
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 378 87.0 2.6e-17
CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 355 82.4 1.1e-15
CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 406) 352 81.8 1.4e-15
CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 348 81.2 7e-15
CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 306 72.5 1.5e-12
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 310 73.4 1.6e-12
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 300 71.5 9.8e-12
>>CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 (453 aa)
initn: 3132 init1: 3132 opt: 3132 Z-score: 3452.2 bits: 648.0 E(32554): 5.7e-186
Smith-Waterman score: 3132; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSWSLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQT
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CCDS37 MSWSLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVDKDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KVDKDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KYEASILTHDSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KYEASILTHDSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DIANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DIANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 WMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 WMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 GEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETEYDSLYPEDDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETEYDSLYPEDDL
430 440 450
>>CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 (437 aa)
initn: 2991 init1: 2991 opt: 2991 Z-score: 3297.3 bits: 619.3 E(32554): 2.4e-177
Smith-Waterman score: 2991; 100.0% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSWSLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSWSLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVDKDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KVDKDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KYEASILTHDSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KYEASILTHDSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DIANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DIANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 WMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 GEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETEYDSLYPEDDL
:::::::::::::
CCDS47 GEGQQHHLGGAKQAGDV
430
>>CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 (312 aa)
initn: 549 init1: 262 opt: 756 Z-score: 839.5 bits: 164.0 E(32554): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 756; 42.3% identity (71.9% similar) in 274 aa overlap (145-414:46-304)
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 MLEEIMKYEASILTHDSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDI
:. :..:. . . :.: . : . :.
CCDS60 MGREISALEDCAQEQMRLRAQVRLLETRVKQQQVKIKQLLQENEVQFLDK-GDENTVIDL
20 30 40 50 60 70
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TGK----DCQDIANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDF
.: ::..: : : : ::.: ::::.. .: :::... .:.::::.:.: ::: .:
CCDS60 GSKRQYADCSEIFNDGYKLSGFYKIKPLQSPAEFSVYCDMS-DGGGWTVIQRRSDGSENF
80 90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KKNWIQYKEGFGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAM
...: .:..:::.. :.::::...:...:: :.:...: :.. . :.:
CCDS60 NRGWKDYENGFGNFVQKHG-EYWLGNKNLHFLTTQE--DYTLKIDLADFEKNSRYAQYKN
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 FKVGPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEG
:::: : . :.:. . ..: :::.. : .: : ....::. :.::::: :.:..::
CCDS60 FKVGDEKNFYELNIGEYSG-TAGDSLAG-NF--HPEVQWWASHQRMKFSTWDRDHDNYEG
200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 NCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTM
::::.: ::::.:.::...::::::.: .:. ::::.: ::. :::.:...:
CCDS60 NCAEEDQSGWWFNRCHSANLNGVYYSGPYTAKT------DNGIVWYTWHGWWYSLKSVVM
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450
pF1KB6 KIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETEYDSLYPEDDL
:: :
CCDS60 KIRPNDFIPNVI
310
>>CCDS3787.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 (866 aa)
initn: 697 init1: 266 opt: 705 Z-score: 776.3 bits: 153.8 E(32554): 6.4e-37
Smith-Waterman score: 705; 42.6% identity (71.9% similar) in 242 aa overlap (177-415:630-863)
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 IVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQDI--ANKGAKQSGLYFIKPLKANQQF
.::.:. .. .. :::.. :: ... :
CCDS37 SYKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIF
600 610 620 630 640 650
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 LVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGFGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLIST
:::. . : .:: ..:.:.:::..:...: .::.::: :. : ::::::. .::..
CCDS37 SVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQ
660 670 680 690 700 710
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 QSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDD
.... :::::::: : . :.: :.:: ::. : : . . : ::::. :.
CCDS37 RGSV---LRVELEDWAGNEAYAEY-HFRVGSEAEGYALQVSSYEG-TAGDALIE---GSV
720 730 740 750 760 770
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 PSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYS-KA
.::::.:::::.: : :..: :::: :.:::.:.:.:..:::.:: ::.:. .
CCDS37 EEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAANLNGIYYPGGSYDPRN
780 790 800 810 820 830
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 STPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETE
..: .::..:.... ::.. . ::: :.
CCDS37 NSPYEIENGVVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
840 850 860
450
pF1KB6 YDSLYPEDDL
>>CCDS3786.1 FGB gene_id:2244|Hs108|chr4 (491 aa)
initn: 779 init1: 295 opt: 560 Z-score: 620.6 bits: 124.2 E(32554): 3e-28
Smith-Waterman score: 827; 33.2% identity (64.2% similar) in 400 aa overlap (34-415:95-487)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 SLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQTKVD
: : .: ::: : . . : . .
CCDS37 PISGGGYRARPAKAAATQKKVERKAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQERPIR
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIMKYE
.... :.. .. : . .: : . .. .. ... . .... : .. .. . .
CCDS37 NSVDELNNNVEAVSQTSSSSFQYMYLLKDLWQKRQKQVKDNENVVNEYSSELEKHQLYID
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ASILTH-DSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKV-AQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQD
.. .. ...: :. : .. .:: .:. : ::.: :. :: . .: ..::.:..
CCDS37 ETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQME-YCRTPCTVSCNIPVVSGKECEE
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGF
: ::.. : .:.:.: .. . . :::... ..::::.:.: :::::: ..: ::.::
CCDS37 IIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTVIQNRQDGSVDFGRKWDPYKQGF
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290
pF1KB6 GHLSPT--GTT------EFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKV
:... . : . :.::::.:: .. .. : : .:.:::.: : :. : :
CCDS37 GNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMG--PTELLIEMEDWKGDKVKAHYGGFTV
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340
pF1KB6 GPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAF-DGFD--FGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKF--
::.::... . : ::.:. :: . .:.. . .: :::: :::.: ::: .
CCDS37 QNEANKYQISVNKYRG-TAGNALMDGASQLMGEN---RTMTIHNGMFFSTYDRDNDGWLT
370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 ---EGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSM
. .:...::.:::.:.:::.. :: :: :: :. . .: :.:..: .:: ::::
CCDS37 SDPRKQCSKEDGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGQYTWDMAKHGTDDGVVWMNWKGSWYSM
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KB6 KKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETEYDSLYPEDDL
.: .::: ::
CCDS37 RKMSMKIRPFFPQQ
480 490
>>CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 (439 aa)
initn: 528 init1: 239 opt: 485 Z-score: 538.8 bits: 108.9 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 608; 30.9% identity (55.7% similar) in 427 aa overlap (13-398:7-410)
10 20 30 40
pF1KB6 MSWSLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTT------------
:. . :.. ::. .. : ::: . ::.
CCDS55 MKLANWYWLSSAVLATYGFLVVANNETEEIKDERAKDVCPVRLESRGKCEEAGE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 CGIADFLSTYQTKVDKDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQ-LTYNPDESSKP--NMI
: : .. :... .:.....:.: :..: :. : . :... : : .
CCDS55 CPYQVSLPPLTIQLPKQFSRIEEVFKEVQNLKEIVNSLKKSCQDCKLQADDNGDPGRNGL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB6 ---------DAATLKSRKMLEEIMKYEASILTHDSSIRYLQ------EIYNSNN------
... . :.. :. : . . . : :. .. : ::
CCDS55 LLPSTGAPGEVGDNRVRELESEVNKLSSELKNAKEEINVLHGRLEKLNLVNMNNIENYVD
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 QKIVNLKEKVAQLEAQCQE-PCKDTVQ---IHDITGKDCQDIANKGAKQSGLYFIKPLKA
.:..:: : .:...:.. : .. .: .. . :::.: : ..: : . :
CCDS55 SKVANLTFVVNSLDGKCSKCPSQEQIQSRPVQHLIYKDCSDYYAIGKRSSETYRVTPDPK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 NQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGFGHLSPTGTTEFWLGNEKIH
:..: :::... :.::::.: :::::..: ..: .:: :::.: ::::::.:::
CCDS55 NSSFEVYCDMETMGGGWTVLQARLDGSTNFTRTWQDYKAGFGNLR----REFWLGNDKIH
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAFDGFD
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CCDS55 LLTKSKEM--ILRIDLEDFNGVELYALYDQFYVANEFLKYRLHVGNY-NGTAGDALR-FN
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
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350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
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. : :::.:.::
CCDS55 ----QKYRGVRNGIFWGTWPGVSEAHPGGYKSSFKEAKMMIRPKHFKP
400 410 420 430
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CCDS13 SVSGIYMIKPENSNGPMQLWCENSLDPGGWTVIQKRTDGSVNFFRNWENYKKGFGNID--
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CCDS13 --GEYWLGLENIYMLSNQDN--YKLLIELEDWSDKKVYAEYSSFRLEPESEFYRLRLGTY
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CCDS13 QQHSLRQLLVLLRHLV-QERANASAPA--FIMAGEQVFQDCAEIQRSGASASGVYTIQVS
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CCDS13 -------RQSSLVLQN-TSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYH--
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