Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6637
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6637, 418 aa
1>>>pF1KB6637 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6580+/-0.000982; mu= 15.0933+/- 0.058
mean_var=62.6113+/-12.843, 0's: 0 Z-trim(103.6): 51 B-trim: 434 in 2/48
Lambda= 0.162087
statistics sampled from 7422 (7473) to 7422 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 2721 645.1 3.5e-185
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 1106 267.5 1.7e-71
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 1064 257.7 1.6e-68
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 1056 255.8 5.7e-68
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 1053 255.1 9e-68
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 1048 253.9 2e-67
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 1020 247.4 1.9e-65
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 1018 246.9 2.7e-65
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 998 242.2 7.1e-64
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 737 181.2 1.7e-45
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 684 168.8 6.1e-42
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 669 165.3 9e-41
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 651 161.1 1.7e-39
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 651 161.1 1.7e-39
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 651 161.1 1.7e-39
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 623 154.6 2e-37
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 618 153.4 3.5e-37
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 613 152.2 8.4e-37
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 613 152.2 8.6e-37
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 598 148.7 9.3e-36
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 593 147.5 2.1e-35
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 588 146.3 4.1e-35
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 583 145.2 1.1e-34
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 566 141.2 1.8e-33
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 565 141.0 2.1e-33
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 530 132.8 5.5e-31
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 528 132.3 7.3e-31
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 511 128.3 1.2e-29
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 511 128.3 1.3e-29
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 507 127.4 2.3e-29
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 504 126.7 4e-29
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 478 120.6 2.7e-27
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 471 119.0 8.3e-27
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 452 114.6 2.1e-25
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 431 109.6 5.1e-24
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 431 109.7 6.5e-24
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 421 107.2 1.7e-23
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 424 108.0 1.8e-23
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 403 103.1 6.2e-22
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 336 87.4 2.6e-17
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 336 87.4 2.7e-17
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 334 87.0 3.8e-17
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 330 86.0 5.4e-17
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 324 84.6 1.8e-16
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 303 79.7 6.6e-15
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 252 67.7 1.1e-11
>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
initn: 2721 init1: 2721 opt: 2721 Z-score: 3438.0 bits: 645.1 E(32554): 3.5e-185
Smith-Waterman score: 2721; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFAFS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHEGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHEGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAKKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 INDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVDQVTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 INDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVDQVTTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIITKFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIITKFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAVHKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 ENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAVHKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB6 VLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNPTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNPTQK
370 380 390 400 410
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 1083 init1: 706 opt: 1106 Z-score: 1396.9 bits: 267.5 E(32554): 1.7e-71
Smith-Waterman score: 1106; 45.0% identity (76.3% similar) in 418 aa overlap (10-417:12-422)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQD---HPTFNKITPNLA
:: ::.: :. : . :.. .. . ....:: : .. . :.
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFC---PAVLCH-PNSPLDEE-NLTQENQDRGTHVDLGLASANV-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 EFAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQ
.::::::.::. .. . :..:::.::.::.:.::::.. : :::.::.::::: ::.
CCDS32 DFAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 IHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTE
::..::.::::::: ...:::. ::..:..: :.:.:.: ::.:.:: ::::...: :.
CCDS32 IHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVD
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CCDS32 AAKKLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 QVTTVKVPMMKRLGMFNIQHCK--KLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTH
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CCDS32 KKKWVMVPMMS-LHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DIITKFLEN-EDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLK
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CCDS32 ETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 LSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPE----VKFNKPFVFLMIEQNTKSPLF
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CCDS32 VSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFF
360 370 380 390 400 410
410
pF1KB6 MGKVVNPTQK
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CCDS32 MSKVTNPKQA
420
>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 (427 aa)
initn: 1060 init1: 656 opt: 1064 Z-score: 1343.8 bits: 257.7 E(32554): 1.6e-68
Smith-Waterman score: 1064; 43.0% identity (74.4% similar) in 426 aa overlap (5-417:4-426)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHD-----QDHPTFNKITPNLA
... .:::.:: : .: . .:.. ...::.. . :.. ::.: :
CCDS99 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESC--SNSSHQQILETGEGSPSL-KIAPANA
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pF1KB6 EFAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQ
.::: .: .: .. . ::::::.::..:.::::::. . ....:::::.:::::. :..
CCDS99 DFAFRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESD
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 IHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTE
.:.:::.::.::: : :. .:..::::..::.. :::.:. .:... : .:: ::
CCDS99 VHRGFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTV
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pF1KB6 EAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVD
. . :::.:.: :.:::::::.:: .:....:::::.::. ::.:: . : .::.::
CCDS99 GTIQLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVD
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pF1KB6 QVTTVKVPMMKRLGMFN-IQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHD
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CCDS99 ENTTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 IITKF---LENED-RRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAP
.. .. :.... .. :::::.::.:.: : ..: .::.: .::. :::::.:..
CCDS99 MLMRWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQK
300 310 320 330 340 350
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pF1KB6 LKLSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPE---VKFNKPFVFLMIEQNTKSPL
:. ::. :::.: .:: :::::.: . .: . ..::.::. ... .:.: :
CCDS99 LEASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVL
360 370 380 390 400 410
410
pF1KB6 FMGKVVNPTQK
:.::::.::.
CCDS99 FLGKVVDPTKP
420
>>CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 (422 aa)
initn: 1031 init1: 536 opt: 1056 Z-score: 1333.7 bits: 255.8 E(32554): 5.7e-68
Smith-Waterman score: 1056; 42.5% identity (75.0% similar) in 416 aa overlap (7-415:7-419)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPSSVSW--GILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFA
: : .::.. : :. ::. .. . . . .. :....:::....::
CCDS32 MGPAWLWLLGTGILASVHCQ-PL-LAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFA
10 20 30 40 50
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pF1KB6 FSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHE
. ::..:: .. . :::::::::.:..:.::::..:.: :::::.::::: :::.::.
CCDS32 LRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQ
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 GFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAK
::. ::.:: :. .:.: .::.:::.. :: ...:...:.:: . ::..:: :. .
CCDS32 GFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 KQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTE-EEDFHVDQV
.:::::... : :..:: . :...:: ..:.::::::.::..:: .:. .:.: ::.
CCDS32 RQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDER
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 TTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIIT
:...::::.. : . . . :. :: ..: ::: :.. ::: ::....: : . .
CCDS32 TSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLR
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 KFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAV
:. . .::::..::.:::.:...: :.:.:.... ::.:::: . .::.
CCDS32 KWGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 HKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSI----PPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVV
:::.. ..::::::..: : . : :. :...::.::..:. : .:.: ::.::::
CCDS32 HKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVV
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 NPTQK
::
CCDS32 NPVAG
420
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 1027 init1: 988 opt: 1053 Z-score: 1330.2 bits: 255.1 E(32554): 9e-68
Smith-Waterman score: 1053; 43.9% identity (73.0% similar) in 408 aa overlap (15-415:6-406)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQK---TDTSHHDQDHPTFNKITPNLA-E
: ::: .: ::: . .. . ... .: . ..:. .
CCDS99 MQLFLLLCLVLLS----PQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRD
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQI
:.:.::: :: . : .::::::::. ..::::::. ..:. .:::::..:: . : ..
CCDS99 FTFDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKEL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 HEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEE
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CCDS99 RP
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CCDS99 PV
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CCDS14 TEA
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CCDS99 LVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
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CCDS99 LFLGRVVNPTLL
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]