Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6629
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6629, 415 aa
1>>>pF1KB6629 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1314+/-0.0013; mu= -5.6100+/- 0.075
mean_var=440.1472+/-102.600, 0's: 0 Z-trim(109.2): 182 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.061133
statistics sampled from 10552 (10710) to 10552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 415) 2777 259.9 3.3e-69
CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 409) 2676 250.9 1.6e-66
CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 ( 416) 2309 218.6 8.9e-57
CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 325) 1573 153.5 2.7e-37
CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 337) 1573 153.6 2.7e-37
CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 ( 337) 1510 148.0 1.3e-35
CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 424) 1223 122.8 6.1e-28
CCDS34218.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 423) 1212 121.8 1.2e-27
CCDS12077.1 CSNK1G2 gene_id:1455|Hs108|chr19 ( 415) 1208 121.5 1.5e-27
CCDS4135.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 447) 1203 121.1 2.1e-27
CCDS43355.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 455) 1203 121.1 2.2e-27
CCDS10192.2 CSNK1G1 gene_id:53944|Hs108|chr15 ( 422) 1190 119.9 4.6e-27
CCDS59492.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 348) 1084 110.4 2.7e-24
CCDS59493.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 311) 974 100.7 2.1e-21
CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 365) 848 89.7 5e-18
CCDS34455.1 TTBK1 gene_id:84630|Hs108|chr6 (1321) 626 70.8 8.8e-12
>>CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (415 aa)
initn: 2777 init1: 2777 opt: 2777 Z-score: 1355.9 bits: 259.9 E(32554): 3.3e-69
Smith-Waterman score: 2777; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
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CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB6 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVVHR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVVHR
370 380 390 400 410
>>CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (409 aa)
initn: 2675 init1: 2675 opt: 2676 Z-score: 1307.8 bits: 250.9 E(32554): 1.6e-66
Smith-Waterman score: 2676; 99.5% identity (99.5% similar) in 403 aa overlap (1-401:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB6 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQ--IPGRVASSGLQSVVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS11 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQNSIPFEHHGK
370 380 390 400
>>CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 (416 aa)
initn: 2032 init1: 2032 opt: 2309 Z-score: 1132.8 bits: 218.6 E(32554): 8.9e-57
Smith-Waterman score: 2309; 85.0% identity (94.3% similar) in 406 aa overlap (1-399:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
:::::::.::::::::::::::::::..::.:::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS13 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS13 CKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGAARN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 ADDAERERRD--REERLRHSRNPATRGLP-----STASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTA
.:..::::. ::::. . :. :::.:: .....:::.. : . :: . . ..
CCDS13 PEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTPASRIQPAG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 NTSPRPVSGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVV
::::: .: ..::::::::::::::.:.:::::::::..::. .::
CCDS13 NTSPRAISRVDRERKVSMRLHRGAPANVSSSDLTGRQEVSRIPASQTSVPFDHLGK
370 380 390 400 410
pF1KB6 HR
>>CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (325 aa)
initn: 1568 init1: 1568 opt: 1573 Z-score: 783.2 bits: 153.5 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 1573; 75.0% identity (91.0% similar) in 300 aa overlap (2-301:10-309)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
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CCDS64 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
::.::..::::::: ::: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS64 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS64 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
:::::::::::.:::::::::::.::::::::::: ::::::::::::.::::.:::::
CCDS64 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS64 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
:: :.. :
CCDS64 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
310 320
>>CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (337 aa)
initn: 1568 init1: 1568 opt: 1573 Z-score: 783.0 bits: 153.6 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 1573; 75.0% identity (91.0% similar) in 300 aa overlap (2-301:10-309)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
:. ::..:.: :::::::::::::. .:. :::::.::: :..:::: :
CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
::.::..::::::: ::: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
:::::::::::.:::::::::::.::::::::::: ::::::::::::.::::.:::::
CCDS47 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS47 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
:: :.. :
CCDS47 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF
310 320 330
>>CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 1505 init1: 1505 opt: 1510 Z-score: 753.0 bits: 148.0 E(32554): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 1510; 71.3% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (2-301:10-309)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
:: ::..:.: ::::::::::.::: . ::.::.::: :.::::: :
CCDS93 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEDVAVKLESQKVKHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
::.: ..::::::: ..: : : : ::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS93 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
::::::.:.:::.:::.:::::::: :.. : ...::::::::::: ::.:::::::.:.
CCDS93 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
: ::.::::::.:::::::::::.::::::.:::: :::::::.: ::.::::.:::::
CCDS93 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLRAMTKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS93 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
:: :.. :
CCDS93 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
310 320 330
>>CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 (424 aa)
initn: 1206 init1: 667 opt: 1223 Z-score: 615.1 bits: 122.8 E(32554): 6.1e-28
Smith-Waterman score: 1223; 51.1% identity (77.6% similar) in 370 aa overlap (3-364:37-396)
10 20 30
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAG
: :: .:.:.::: :.::.. :: .. ..
CCDS59 DKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 EEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDL
: :::::: .:.. ::::.: ..::.. .: ::: . . : : ::.::.::::::::::
CCDS59 EYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 FNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGL--GKKGNLVYIIDF
:..:.: :::::::..: :.:::.::.::::.:.:::::.:::.: .: ....::::
CCDS59 FDLCDRTFSLKTVLMIAIQLISRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRPGNKTQQVIHIIDF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 GLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGS
::::.: : .:..::::::.:.::::::: ::::::: :::::::::.::...::: ::
CCDS59 GLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
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CCDS41 GLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGS
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CCDS41 LPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRATPIEVLCENFP-EMATYLRYVRRLDFFEKPDYDYLR
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CCDS41 KLFTDLFDRKGYMFDYEYDWIGKQLPTPVGAVQQDPALSSNREAHQHRDKMQQSKNQSAD
310 320 330 340 350 360
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]