Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6627
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6627, 415 aa
1>>>pF1KB6627 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7641+/-0.0011; mu= 14.3521+/- 0.066
mean_var=61.3070+/-12.376, 0's: 0 Z-trim(103.0): 60 B-trim: 198 in 1/50
Lambda= 0.163802
statistics sampled from 7127 (7187) to 7127 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 2729 653.7 9.2e-188
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 1029 252.0 7.6e-67
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 1021 250.1 2.7e-66
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 998 244.6 1.2e-64
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 997 244.4 1.4e-64
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 997 244.4 1.4e-64
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 996 244.2 1.6e-64
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 994 243.7 2.2e-64
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 908 223.4 3e-58
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 905 222.7 4.9e-58
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 871 214.6 1.3e-55
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 870 214.4 1.5e-55
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 829 204.7 1.3e-52
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 829 204.7 1.4e-52
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 786 194.5 1.3e-49
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 776 192.2 7.2e-49
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 722 179.4 5e-45
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 647 161.7 1.3e-39
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 635 158.9 8.3e-39
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 624 156.3 5.1e-38
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 616 154.3 9.2e-38
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 616 154.4 1.9e-37
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 550 138.8 9.1e-33
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 537 135.7 7.6e-32
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 537 135.7 7.8e-32
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 530 134.0 1.5e-31
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 525 132.8 4.2e-31
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 524 132.6 6.4e-31
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 523 132.4 8.3e-31
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 521 131.9 1.1e-30
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 500 127.0 3.3e-29
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 478 121.8 1.3e-27
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 455 116.3 3.8e-26
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 455 116.3 4.4e-26
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 438 112.3 8.9e-25
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 434 111.4 2e-24
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 412 106.2 6.1e-23
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 388 100.5 3.7e-21
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 364 94.8 1.6e-19
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 279 74.7 1.8e-13
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 269 72.4 1.1e-12
>>CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 (415 aa)
initn: 2729 init1: 2729 opt: 2729 Z-score: 3484.4 bits: 653.7 E(32554): 9.2e-188
Smith-Waterman score: 2729; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAMVYMGSRGSTEDQMAKVLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAMVYMGSRGSTEDQMAKVLQF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYPFRVNSAQRTPVQMMYLREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYPFRVNSAQRTPVQMMYLREK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LNIGYIEDLKAQILELPYAGDVSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LNIGYIEDLKAQILELPYAGDVSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAMV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB6 DVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
370 380 390 400 410
>>CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 (397 aa)
initn: 1177 init1: 517 opt: 1029 Z-score: 1313.6 bits: 252.0 E(32554): 7.6e-67
Smith-Waterman score: 1185; 45.7% identity (74.8% similar) in 416 aa overlap (1-415:1-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAMVYMGSRGSTEDQMAKVLQF
:..: .. . :::.: :.::... .:.:.: ::::.....::.:..:.: :::.::::
CCDS11 MDSLATSINQFALELSKKLAESAQGKNIFFSSWSISTSLTIVYLGAKGTTAAQMAQVLQF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
:. . . ::. .. .: . . . ...:::.:..: : : . .
CCDS11 NR---DQGVKCDPES-------EKKRKMEF-----NLSNSEEIHSDFQTLISEILKPNDD
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
:::...: ..:::. .:...:.. . :...::: :.:.: ... :: :::::. ::.::
CCDS11 YLLKTANAIYGEKTYAFHNKYLEDMKTYFGAEPQPVNFVEASDQIRKDINSWVERQTEGK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYPFRVNSAQRTPVQMMYLREK
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CCDS11 IQNLLPDDSVDSTTRMILVNALYFKGIWEHQFLVQNTTEKPFRINETTSKPVQMMFMKKK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB6 LNIGYIEDLKAQILELPYAG-DVSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDK
:.: .:: :: :.: : . :.:...:::..: .::: ::. :::.:::.::: :
CCDS11 LHIFHIEKPKAVGLQLYYKSRDLSLLILLPEDI----NGLEQLEKAITYEKLNEWTSADM
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAM
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CCDS11 MELYEVQLHLPKFKLEDSYDLKSTLSSMGMSDAFSQSKADFSGMSSARNLFLSNVFHKAF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
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CCDS11 VEINEQGTEAAAGSGSEIDIRIRVPSIEFNANHPFLFFIRHNKTNTILFYGRLCSP
350 360 370 380 390
>>CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 (379 aa)
initn: 744 init1: 534 opt: 1021 Z-score: 1303.7 bits: 250.1 E(32554): 2.7e-66
Smith-Waterman score: 1161; 45.7% identity (71.2% similar) in 416 aa overlap (1-415:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAMVYMGSRGSTEDQMAKVLQF
::.: ::: :::.:: :.. .:. :.:.::.::::.::::..:.::.: :..:...:
CCDS44 MEQLSSANTRFALDLFLALSENNPAGNIFISPFSISSAMAMVFLGTRGNTAAQLSKTFHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
: : ...:: :.::.. :: ..
CCDS44 NTV-------------------------------------EEVHSRFQSLNADINKRGAS
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
:.:. .:.:.:::. .: :.. :: :... .::: . .:.::: ::.::: ::.::
CCDS44 YILKLANRLYGEKTYNFLPEFLVSTQKTYGADLASVDFQHASEDARKTINQWVKGQTEGK
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYPFRVNSAQRTPVQMMYLREK
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CCDS44 IPELLASGMVDNMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTNAPFRLNKKDRKTVKMMYQKKK
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KB6 LNIGYIEDLKAQILELPYAGD-VSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDK
. ::::::: ..::::: :. .:: .::::.: : ::::. .: ..: .::..::. ..
CCDS44 FAYGYIEDLKCRVLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLKKIEEQLTLEKLHEWTKPEN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAM
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CCDS44 LDFIEVNVSLPRFKLEESYTLNSDLARLGVQDLFNSSKADLSGMSGARDIFISKIVHKSF
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
:.::::::::::.:.:. : .:.:::::::.: :. .. :::.::::::
CCDS44 VEVNEEGTEAAAATAGIATFCMLMPEENFTADHPFLFFIRHNSSGSILFLGRFSSP
330 340 350 360 370
>>CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (395 aa)
initn: 923 init1: 460 opt: 998 Z-score: 1274.0 bits: 244.6 E(32554): 1.2e-64
Smith-Waterman score: 1122; 45.4% identity (71.6% similar) in 416 aa overlap (1-415:20-395)
10 20 30 40
pF1KB6 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAM
:. : :: :::::.: :.: . ..:.:.:: :.: ..::
CCDS75 MSSRQRGNFNYKLAFKSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGKDN-SKNVFFSPMSMSCALAM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 VYMGSRGSTEDQMAKVLQFNEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAAD
::::..:.: :::..:.::. :...
CCDS75 VYMGAKGNTAAQMAQILSFNKSGGGG----------------------------------
60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KIHSSFRSLSSAINASTGNYLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLEC
::..:.:: . .: . .:::. .:.:::::: .: . :::.:..: . .::.
CCDS75 DIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISA
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 AEEARKKINSWVKTQTKGKIPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYP
.:..::.::.:: .:.::: .:: :::: ::.::::::::.:.: :.:. .
CCDS75 VEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERL
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 FRVNSAQRTPVQMMYLREKLNIGYIEDLKAQILELPYAG-DVSMFLLLPDEIADVSTGLE
:.:.. .. :::::. . .. :: .. .::: :::.: ...:...:::: .:. :
CCDS75 FKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRT---
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 LLESEITYDKLNKWTSKDKMAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANF
.:.:.::.:. .:: : : :.:::: .:.::::: :...:.::..:: :::. :.:.:
CCDS75 -VEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADF
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 SGMSERNDLFLSEVFHQAMVDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMH
::::. .:: ::.: :...:.::::::::::.:...: : .. :.: :::::::.:.:
CCDS75 SGMSQ-TDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFFIQH
330 340 350 360 370 380
410
pF1KB6 KITNCILFFGRFSSP
. :: ::: ::::::
CCDS75 SKTNGILFCGRFSSP
390
>>CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (376 aa)
initn: 923 init1: 460 opt: 997 Z-score: 1273.1 bits: 244.4 E(32554): 1.4e-64
Smith-Waterman score: 1122; 45.4% identity (71.6% similar) in 416 aa overlap (1-415:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAMVYMGSRGSTEDQMAKVLQF
:. : :: :::::.: :.: . ..:.:.:: :.: ..::::::..:.: :::..:.:
CCDS44 MDVLAEANGTFALNLLKTLGKDN-SKNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
:. :... ::..:.:: . .: . .
CCDS44 NKSGGGG----------------------------------DIHQGFQSLLTEVNKTGTQ
60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
:::. .:.:::::: .: . :::.:..: . .::. .:..::.::.:: .:.::
CCDS44 YLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGK
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYPFRVNSAQRTPVQMMYLREK
: .:: :::: ::.::::::::.:.: :.:. . :.:.. .. :::::. .
CCDS44 IAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQST
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KB6 LNIGYIEDLKAQILELPYAG-DVSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDK
.. :: .. .::: :::.: ...:...:::: .:. : .:.:.::.:. .:: :
CCDS44 FKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRT----VEKELTYEKFVEWTRLDM
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAM
: :.:::: .:.::::: :...:.::..:: :::. :.:.:::::. .:: ::.: :...
CCDS44 MDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGMSQ-TDLSLSKVVHKSF
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CCDS44 VEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
330 340 350 360 370
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10 20 30 40 50
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CCDS75 HKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
330 340 350 360 370 380
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: : :. :: .:.:: . .: . .
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CCDS44 YLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELSFIRAAEESRKHINTWVSKKTEGK
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CCDS44 IEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDETYTREMPFKINQEEQRPVQMMYQEAT
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pF1KB6 LNIGYIEDLKAQILELPYA-GDVSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDK
...... ...::.:::::: ..:...::::. ...:: .:. .:..::. ::. :
CCDS44 FKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELST----VEKSLTFEKLTAWTKPDC
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CCDS44 MKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADLSAMSAERDLCLSKFVHKSF
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CCDS44 VEVNEEGTEAAAASSCFVVAECCMESGPRFCADHPFLFFIRHNRANSILFCGRFSSP
320 330 340 350 360 370
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CCDS11 ------------------C---------LYKDG--------DIHRGFQSLLSEVNRTGTQ
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CCDS11 YLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGK
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CCDS11 ISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYTRGMLFKTNEEKKT-VQMMFKEAK
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...:: .....:.:::::. . .:: .::::. .: : ..:. .::.:.. ::...:
CCDS11 FKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTD----LAVVEKALTYEKFKAWTNSEK
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CCDS11 LTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCF
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pF1KB6 VDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
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CCDS11 VEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
320 330 340 350 360 370
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CCDS11 DQV---------TENTT--------EKA----ATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDA
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CCDS11 YELKIANKLFGEKTYQFLQEYLDAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEK
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CCDS11 IKNLFPDGTIGNDTTLVLVNAIYFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNKNTYKSVQMMRQYNS
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CCDS11 FNFALLEDVQAKVLEIPYKGKDLSMIVLLPNEI----DGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQN
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CCDS11 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRK-SKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHF
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CCDS11 DQV---------TENTTG-------KAATY-----HVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDA
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CCDS11 IKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTS
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CCDS11 FHFASLEDVQAKVLEIPYKGKDLSMIVLLPNEI----DGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQN
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pF1KB6 MAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAM
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CCDS11 MRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLRTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAF
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 VDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHG-GPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
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CCDS11 VEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
340 350 360 370 380 390
415 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:09:54 2016 done: Sat Nov 5 11:09:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]