Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6626
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6626, 439 aa
1>>>pF1KB6626 439 - 439 aa - 439 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0577+/-0.000888; mu= 10.4039+/- 0.054
mean_var=117.9761+/-23.428, 0's: 0 Z-trim(110.3): 140 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.118080
statistics sampled from 11395 (11537) to 11395 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 ( 439) 2928 509.6 2.5e-144
CCDS14060.2 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 433) 1510 268.0 1.3e-71
CCDS54538.2 ARHGAP8 gene_id:553158|Hs108|chr22 ( 564) 1510 268.1 1.6e-71
CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 305) 1248 223.3 2.6e-58
CCDS33664.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 464) 1066 192.4 8e-49
CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 ( 376) 400 78.9 9.5e-15
CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 ( 435) 400 78.9 1.1e-14
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 714) 399 78.9 1.8e-14
CCDS34029.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4 (1023) 390 77.4 7.1e-14
CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 608) 379 75.4 1.7e-13
CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 698) 379 75.5 1.9e-13
CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 704) 379 75.5 1.9e-13
CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 ( 353) 371 73.9 2.8e-13
CCDS58175.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1155) 367 73.6 1.2e-12
CCDS58176.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1165) 367 73.6 1.2e-12
CCDS58177.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1168) 367 73.6 1.2e-12
CCDS31673.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1191) 367 73.6 1.2e-12
CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3088) 371 74.5 1.7e-12
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 366 73.6 2.6e-12
CCDS5261.1 TAGAP gene_id:117289|Hs108|chr6 ( 731) 357 71.7 2.7e-12
CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19 ( 371) 349 70.2 3.9e-12
CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3062) 354 71.6 1.2e-11
CCDS13952.2 SH3BP1 gene_id:23616|Hs108|chr22 ( 701) 342 69.2 1.5e-11
CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 ( 275) 334 67.6 1.8e-11
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099) 343 69.4 1.9e-11
CCDS5263.1 TAGAP gene_id:117289|Hs108|chr6 ( 266) 332 67.2 2.2e-11
CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 ( 357) 334 67.6 2.2e-11
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499) 341 69.2 3.2e-11
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 653) 331 67.3 5.2e-11
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 748) 331 67.3 5.8e-11
CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2 ( 606) 328 66.8 7e-11
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 655) 327 66.6 8.4e-11
>>CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 (439 aa)
initn: 2928 init1: 2928 opt: 2928 Z-score: 2704.7 bits: 509.6 E(32554): 2.5e-144
Smith-Waterman score: 2928; 100.0% identity (100.0% similar) in 439 aa overlap (1-439:1-439)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDPLSELQDDLTLDDTSEALNQLKLASIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MDPLSELQDDLTLDDTSEALNQLKLASIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 DDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 KFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 QFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LPVDFDQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQVLQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LPVDFDQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQVLQTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PEENYQVLRFLTAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 PEENYQVLRFLTAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFT
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB6 KFLLDHQGELFPSPDPSGL
:::::::::::::::::::
CCDS79 KFLLDHQGELFPSPDPSGL
430
>>CCDS14060.2 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 (433 aa)
initn: 1522 init1: 1373 opt: 1510 Z-score: 1399.3 bits: 268.0 E(32554): 1.3e-71
Smith-Waterman score: 1510; 57.3% identity (84.6% similar) in 382 aa overlap (58-438:8-388)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 IDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIV
:. . :.::.::: :..:::::..::....
CCDS14 MAGQDPALSTSHPFYDVARHGILQVAGDDRFGRRVVT
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 FSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREF
:: :::::::.:::..:: :::.:::::::.:::..:.:.::.: :::::.::..::.::
CCDS14 FSCCRMPPSHELDHQRLLEYLKYTLDQYVENDYTIVYFHYGLNSRNKPSLGWLQSAYKEF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 DRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIP
:::::::.::::.:::: :::.: ..::::: :::.:..: :::::: ::.: .:: ::
CCDS14 DRKYKKNLKALYVVHPTSFIKVLWNILKPLISHKFGKKVIYFNYLSELHEHLKYDQLVIP
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RQVLKYDDFLKSTQKSPATAP-KPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRET
.::.::. :.: ... . : : :::::::.::::::::.:..:: . : :: ::: :
CCDS14 PEVLRYDEKLQSLHEGRTPPPTKTPPPRPPLPTQQFGVSLQYLKDKN-QGELIPPVLRFT
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVILKTFLRELP
:.::. ..: :::.:::::..:.:::.:. ::.: ::.::.:...:.:::::::::::::
CCDS14 VTYLREKGLRTEGLFRRSASVQTVREIQRLYNQGKPVNFDDYGDIHIPAVILKTFLRELP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 EPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQVLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQISAHSDQNK
.:::::. : ...:. .. : :: . :.:..:::.:: :::.: .:: .: .: ::
CCDS14 QPLLTFQAYEQILGITCVESSLRVTGCRQILRSLPEHNYVVLRYLMGFLHAVSRESIFNK
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430
pF1KB6 MTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFPSPDPSGL
:...::: ::: ::.: .... .:.:. :.: ::..:... ..: .:. :
CCDS14 MNSSNLACVFGLNLIWPSQGVSSLSALVPLNMFTELLIEYYEKIFSTPEAPGEHGLAPWE
340 350 360 370 380 390
CCDS14 QGSRAAPLQEAVPRTQATGLTKPTLPPSPLMAARRRL
400 410 420 430
>>CCDS54538.2 ARHGAP8 gene_id:553158|Hs108|chr22 (564 aa)
initn: 1522 init1: 1373 opt: 1510 Z-score: 1397.6 bits: 268.1 E(32554): 1.6e-71
Smith-Waterman score: 1510; 57.3% identity (84.6% similar) in 382 aa overlap (58-438:139-519)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 IDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIV
:. . :.::.::: :..:::::..::....
CCDS54 LQRDKAAAAAVLGAVRKRPSVVPMAGQDPALSTSHPFYDVARHGILQVAGDDRFGRRVVT
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 FSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREF
:: :::::::.:::..:: :::.:::::::.:::..:.:.::.: :::::.::..::.::
CCDS54 FSCCRMPPSHELDHQRLLEYLKYTLDQYVENDYTIVYFHYGLNSRNKPSLGWLQSAYKEF
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 DRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIP
:::::::.::::.:::: :::.: ..::::: :::.:..: :::::: ::.: .:: ::
CCDS54 DRKYKKNLKALYVVHPTSFIKVLWNILKPLISHKFGKKVIYFNYLSELHEHLKYDQLVIP
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RQVLKYDDFLKSTQKSPATAP-KPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRET
.::.::. :.: ... . : : :::::::.::::::::.:..:: . : :: ::: :
CCDS54 PEVLRYDEKLQSLHEGRTPPPTKTPPPRPPLPTQQFGVSLQYLKDKN-QGELIPPVLRFT
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVILKTFLRELP
:.::. ..: :::.:::::..:.:::.:. ::.: ::.::.:...:.:::::::::::::
CCDS54 VTYLREKGLRTEGLFRRSASVQTVREIQRLYNQGKPVNFDDYGDIHIPAVILKTFLRELP
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 EPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQVLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQISAHSDQNK
.:::::. : ...:. .. : :: . :.:..:::.:: :::.: .:: .: .: ::
CCDS54 QPLLTFQAYEQILGITCVESSLRVTGCRQILRSLPEHNYVVLRYLMGFLHAVSRESIFNK
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430
pF1KB6 MTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFPSPDPSGL
:...::: ::: ::.: .... .:.:. :.: ::..:... ..: .:. :
CCDS54 MNSSNLACVFGLNLIWPSQGVSSLSALVPLNMFTELLIEYYEKIFSTPEAPGEHGLAPWE
470 480 490 500 510 520
CCDS54 QGSRAAPLQEAVPRTQATGLTKPTLPPSPLMAARRRL
530 540 550 560
>>CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 (305 aa)
initn: 1260 init1: 1111 opt: 1248 Z-score: 1160.3 bits: 223.3 E(32554): 2.6e-58
Smith-Waterman score: 1248; 62.2% identity (87.5% similar) in 288 aa overlap (58-344:8-294)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 IDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIV
:. . :.::.::: :..:::::..::....
CCDS56 MAGQDPALSTSHPFYDVARHGILQVAGDDRFGRRVVT
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 FSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREF
:: :::::::.:::..:: :::.:::::::.:::..:.:.::.: :::::.::..::.::
CCDS56 FSCCRMPPSHELDHQRLLEYLKYTLDQYVENDYTIVYFHYGLNSRNKPSLGWLQSAYKEF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 DRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIP
:::::::.::::.:::: :::.: ..::::: :::.:..: :::::: ::.: .:: ::
CCDS56 DRKYKKNLKALYVVHPTSFIKVLWNILKPLISHKFGKKVIYFNYLSELHEHLKYDQLVIP
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RQVLKYDDFLKSTQKSPATAP-KPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRET
.::.::. :.: ... . : : :::::::.::::::::.:..:: . : :: ::: :
CCDS56 PEVLRYDEKLQSLHEGRTPPPTKTPPPRPPLPTQQFGVSLQYLKDKN-QGELIPPVLRFT
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVILKTFLRELP
:.::. ..: :::.:::::..:.:::.:. ::.: ::.::.:...:.:::::::::::::
CCDS56 VTYLREKGLRTEGLFRRSASVQTVREIQRLYNQGKPVNFDDYGDIHIPAVILKTFLRELP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 EPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQVLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQISAHSDQNK
.:::::. : ...:. .
CCDS56 QPLLTFQAYEQILGITCVPGEHLQQNEQL
280 290 300
>>CCDS33664.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 (464 aa)
initn: 1500 init1: 917 opt: 1066 Z-score: 990.0 bits: 192.4 E(32554): 8e-49
Smith-Waterman score: 1438; 53.0% identity (78.2% similar) in 413 aa overlap (58-438:8-419)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 IDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIV
:. . :.::.::: :..:::::..::....
CCDS33 MAGQDPALSTSHPFYDVARHGILQVAGDDRFGRRVVT
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 FSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREF
:: :::::::.:::..:: :::.:::::::.:::..:.:.::.: :::::.::..::.::
CCDS33 FSCCRMPPSHELDHQRLLEYLKYTLDQYVENDYTIVYFHYGLNSRNKPSLGWLQSAYKEF
40 50 60 70 80 90
150 160 170
pF1KB6 DRK-------------------------------YKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKP
::: ::::.::::.:::: :::.: ..::
CCDS33 DRKDGDLTMWPRLVSNSKLKRSSHLSLPKYWDYRYKKNLKALYVVHPTSFIKVLWNILKP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LISFKFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAP-KPMPPRP
::: :::.:..: :::::: ::.: .:: :: .::.::. :.: ... . : : ::::
CCDS33 LISHKFGKKVIYFNYLSELHEHLKYDQLVIPPEVLRYDEKLQSLHEGRTPPPTKTPPPRP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQ
:::.::::::::.:..:: . : :: ::: ::.::. ..: :::.:::::..:.:::.:.
CCDS33 PLPTQQFGVSLQYLKDKN-QGELIPPVLRFTVTYLREKGLRTEGLFRRSASVQTVREIQR
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KYNMGLPVDFDQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQ
::.: ::.::.:...:.:::::::::::::.:::::. : ...:. .. : :: . :
CCDS33 LYNQGKPVNFDDYGDIHIPAVILKTFLRELPQPLLTFQAYEQILGITCVESSLRVTGCRQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINP
.:..:::.:: :::.: .:: .: .: :::...::: ::: ::.: .... .:.:. :
CCDS33 ILRSLPEHNYVVLRYLMGFLHAVSRESIFNKMNSSNLACVFGLNLIWPSQGVSSLSALVP
340 350 360 370 380 390
420 430
pF1KB6 INTFTKFLLDHQGELFPSPDPSGL
.: ::..:... ..: .:. :
CCDS33 LNMFTELLIEYYEKIFSTPEAPGEHGLAPWEQGSRAAPLQEAVPRTQATGLTKPTLPPSP
400 410 420 430 440 450
>>CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 (376 aa)
initn: 378 init1: 334 opt: 400 Z-score: 378.2 bits: 78.9 E(32554): 9.5e-15
Smith-Waterman score: 400; 35.4% identity (60.5% similar) in 223 aa overlap (6-224:158-372)
10 20 30
pF1KB6 MDPLSELQDDLTLDDTSEALNQLKLASIDEKNWPS
: .::: :.:.. . .:: : . .
CCDS81 DGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSENSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRK---GSITEYT-AA
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 DEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPP
.: : . . . . . .: .:: . : :: . :.::..: ::
CCDS81 EEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHG--GYYGDGLNA--IVVFAVCFMPE
190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SHQLDHSKLLG----YLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKY
: : .. :. :. ::. : .: ..::. . : . :::.::: :...::.
CCDS81 SSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRL
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 KKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVL
.::.:.: ::::. ::.::: . .:.:: ::.::: :: :.::.: : .: .:::. .
CCDS81 RKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIK
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRETVAYLQ
. :. :.. : :
CCDS81 QVDQELNGKQDEPKNEQ
360 370
>>CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 (435 aa)
initn: 378 init1: 334 opt: 400 Z-score: 377.3 bits: 78.9 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 400; 35.4% identity (60.5% similar) in 223 aa overlap (6-224:217-431)
10 20 30
pF1KB6 MDPLSELQDDLTLDDTSEALNQLKLASIDEKNWPS
: .::: :.:.. . .:: : . .
CCDS10 DGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSENSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRK---GSITEYT-AA
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 DEMPDFPKSDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPP
.: : . . . . . .: .:: . : :: . :.::..: ::
CCDS10 EEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHG--GYYGDGLNA--IVVFAVCFMPE
250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SHQLDHSKLLG----YLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKY
: : .. :. :. ::. : .: ..::. . : . :::.::: :...::.
CCDS10 SSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRL
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 KKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGQKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVL
.::.:.: ::::. ::.::: . .:.:: ::.::: :: :.::.: : .: .:::. .
CCDS10 RKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIK
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPIVLRETVAYLQ
. :. :.. : :
CCDS10 QVDQELNGKQDEPKNEQ
420 430
>>CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (714 aa)
initn: 357 init1: 188 opt: 399 Z-score: 373.2 bits: 78.9 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 399; 30.7% identity (68.8% similar) in 215 aa overlap (230-438:160-372)
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 KLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPP-LPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEP
:. : :: . .:.. ...: .. .:. :
CCDS58 QRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGTARRSHAHPLEPLPPGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAP
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 IPIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVIL
. .... : ... ..:: ::.:: .....::..:.... : ::. ...: : .:
CCDS58 L--LVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLL
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 KTFLRELPEPLLTFDLYPHVVG---FLNIDESQRVPATLQVLQTLPEENYQVLRFLTAFL
: .:::::::.. : : .. .:. ::.. . . ...::. ::..::.. ::
CCDS58 KLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFL
250 260 270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 VQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLL--WAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFPS
...:.:. :::. :::.:::::.: ..: . ... . .. . :. ....:: .
CCDS58 DEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTA
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PDPSGL
: : :
CCDS58 PVPEGPTSPRGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTG
370 380 390 400 410 420
>>CCDS34029.1 FAM13A gene_id:10144|Hs108|chr4 (1023 aa)
initn: 374 init1: 240 opt: 390 Z-score: 362.5 bits: 77.4 E(32554): 7.1e-14
Smith-Waterman score: 390; 32.8% identity (67.6% similar) in 204 aa overlap (230-431:28-231)
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 KLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQ-FGVSLQHLQEKNPEQEP
:. . . :. ::::::.:.... ..
CCDS34 MGAGALAICQSKAAVRLKEDMKKIVAVPLNEQKDFTYQKLFGVSLQELERQGLTENG
10 20 30 40 50
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 IPIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVIL
:: :. . : :: :.:: ::.:: ..:..::.... :.. :.::.. . ... : .:
CCDS34 IPAVVWNIVEYLTQHGLTQEGLFRVNGNVKVVEQLRLKFESGVPVELGKDGDVCSAASLL
60 70 80 90 100 110
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 KTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVPATLQ-VLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQ
: ::::::. :.: : :. . ... ... ..:. ... ::. .: .:..: ::..
CCDS34 KLFLRELPDSLITSALQPRFIQLFQDGRNDVQESSLRDLIKELPDTHYCLLKYLCQFLTK
120 130 140 150 160 170
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 ISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFPSPDPS
.. : ::.:. :::.::::: . . . .: . : . .:.. . ::
CCDS34 VAKHHVQNRMNVHNLATVFGPNCFHVPPGLEGMKEQDLCNKIMAKILENYNTLFEVEYTE
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GL
CCDS34 NDHLRCENLARLIIVKEVYYKNSLPILLTRGLERDMPKPPPKTKIPKSRSEGSIQAHRVL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 (608 aa)
initn: 357 init1: 188 opt: 379 Z-score: 355.8 bits: 75.4 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 379; 31.0% identity (67.6% similar) in 210 aa overlap (236-438:57-266)
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 IPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEP--IPIVL
:: . :: :.. ... . : :...
CCDS58 PANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLV
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 RETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVILKTFLR
.. : ... ..:: ::.:: .....::..:.... : ::. ...: : .:: .::
CCDS58 EQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLR
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 ELPEPLLTFDLYPHVVG---FLNIDESQRVPATLQVLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQISA
:::::.. : : .. .:. ::.. . . ...::. ::..::.. :: ...:
CCDS58 ELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQA
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430
pF1KB6 HSDQNKMTNTNLAVVFGPNLL--WAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFPSPDPSG
.:. :::. :::.:::::.: ..: . ... . .. . :. ....:: .: : :
CCDS58 YSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEG
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 L
CCDS58 PTSPRGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGSRC
270 280 290 300 310 320
439 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:36:04 2016 done: Sat Nov 5 11:36:05 2016
Total Scan time: 3.210 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]