Result of FASTA (omim) for
pF1KB6534
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6534, 390 aa
1>>>pF1KB6534 390 - 390 aa - 390 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4400+/-0.000502; mu= 16.5977+/- 0.031
mean_var=74.6992+/-14.910, 0's: 0 Z-trim(108.4): 134 B-trim: 145 in 1/51
Lambda= 0.148394
statistics sampled from 16369 (16503) to 16369 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 7.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008850 (OMIM: 600517) serpin B3 [Homo sapiens] ( 390) 2520 549.4 5.3e-156
NP_002965 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 1 [Homo ( 390) 2289 500.0 4.1e-141
XP_011524440 (OMIM: 600518) PREDICTED: serpin B4 i ( 390) 2289 500.0 4.1e-141
XP_011524331 (OMIM: 604445) PREDICTED: serpin B13 ( 390) 1527 336.8 5.2e-92
NP_036529 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 2 [Hom ( 391) 1516 334.5 2.7e-91
NP_001294852 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 1 [ ( 400) 1321 292.7 1e-78
NP_778206 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 2 [Homo ( 369) 1247 276.9 5.5e-74
XP_011524329 (OMIM: 602058) PREDICTED: serpin B10 ( 397) 1111 247.8 3.4e-65
NP_005015 (OMIM: 602058) serpin B10 [Homo sapiens] ( 397) 1111 247.8 3.4e-65
XP_011524553 (OMIM: 615682) PREDICTED: serpin B11 ( 392) 1086 242.4 1.4e-63
NP_536723 (OMIM: 615682) serpin B11 isoform a [Hom ( 392) 1086 242.4 1.4e-63
NP_109591 (OMIM: 130135) leukocyte elastase inhibi ( 379) 1021 228.5 2.1e-59
XP_011512635 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 379) 1021 228.5 2.1e-59
XP_011512636 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 379) 1021 228.5 2.1e-59
XP_011512637 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 330) 1019 228.0 2.5e-59
XP_016866430 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 332) 988 221.4 2.5e-57
XP_011512978 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 332) 988 221.4 2.5e-57
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 988 221.4 2.8e-57
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 988 221.4 2.8e-57
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 988 221.4 2.8e-57
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 988 221.4 2.8e-57
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 988 221.4 2.8e-57
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 988 221.4 2.8e-57
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 988 221.4 2.8e-57
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 988 221.4 2.8e-57
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 988 221.4 2.8e-57
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 988 221.4 2.9e-57
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 988 221.4 2.9e-57
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 988 221.5 3.2e-57
NP_003775 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isoform ( 380) 967 216.9 6.3e-56
NP_001248759 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 380) 967 216.9 6.3e-56
NP_001035237 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 380) 967 216.9 6.3e-56
XP_005266764 (OMIM: 604445) PREDICTED: serpin B13 ( 255) 957 214.7 2e-55
NP_536722 (OMIM: 615662) serpin B12 isoform 2 [Hom ( 405) 948 212.9 1.1e-54
NP_001294857 (OMIM: 615662) serpin B12 isoform 1 [ ( 425) 947 212.7 1.3e-54
XP_016881556 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 425) 947 212.7 1.3e-54
XP_011524551 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 425) 947 212.7 1.3e-54
XP_011524550 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 425) 947 212.7 1.3e-54
XP_011524548 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 432) 947 212.7 1.4e-54
XP_005266835 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 437) 947 212.7 1.4e-54
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 943 211.8 2.2e-54
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 943 211.8 2.2e-54
XP_016866432 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325) 942 211.5 2.3e-54
XP_011512980 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325) 942 211.5 2.3e-54
XP_016866431 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325) 942 211.5 2.3e-54
NP_942130 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 924 207.7 3.7e-53
NP_002631 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 924 207.7 3.7e-53
NP_001137290 (OMIM: 173390) plasminogen activator ( 415) 905 203.7 6.7e-52
NP_002566 (OMIM: 173390) plasminogen activator inh ( 415) 905 203.7 6.7e-52
XP_011524330 (OMIM: 602058) PREDICTED: serpin B10 ( 268) 852 192.2 1.2e-48
>>NP_008850 (OMIM: 600517) serpin B3 [Homo sapiens] (390 aa)
initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520 Z-score: 2921.7 bits: 549.4 E(85289): 5.3e-156
Smith-Waterman score: 2520; 100.0% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
370 380 390
>>NP_002965 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 1 [Homo sap (390 aa)
initn: 2289 init1: 2289 opt: 2289 Z-score: 2654.5 bits: 500.0 E(85289): 4.1e-141
Smith-Waterman score: 2289; 91.8% identity (96.4% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_002 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_002 QVTENTTEKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::..:::::::::
NP_002 DAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
:::::::.::.::.:::::::::::::::.::::::.::.:: :::::::::::::::::
NP_002 YFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNKNTYKSVQMMRQYNSFNFALLEDVQAKVLEIPYKGKD
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::
NP_002 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETCVDLHLPRFKMEESYDLKDTLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
:::::.:::::::::::: :.:: .: :::::::::::::.::::::::: : :::
NP_002 TMGMVNIFNGDADLSGMTWSHGLSVSKVLHKAFVEVTEEGVEAAAATAVVVVELSSPSTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EEFCCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
370 380 390
>>XP_011524440 (OMIM: 600518) PREDICTED: serpin B4 isofo (390 aa)
initn: 2289 init1: 2289 opt: 2289 Z-score: 2654.5 bits: 500.0 E(85289): 4.1e-141
Smith-Waterman score: 2289; 91.8% identity (96.4% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_011 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_011 QVTENTTEKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::..:::::::::
XP_011 DAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
:::::::.::.::.:::::::::::::::.::::::.::.:: :::::::::::::::::
XP_011 YFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNKNTYKSVQMMRQYNSFNFALLEDVQAKVLEIPYKGKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::
XP_011 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETCVDLHLPRFKMEESYDLKDTLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
:::::.:::::::::::: :.:: .: :::::::::::::.::::::::: : :::
XP_011 TMGMVNIFNGDADLSGMTWSHGLSVSKVLHKAFVEVTEEGVEAAAATAVVVVELSSPSTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
::: ::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEFCCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
370 380 390
>>XP_011524331 (OMIM: 604445) PREDICTED: serpin B13 isof (390 aa)
initn: 1405 init1: 1405 opt: 1527 Z-score: 1772.8 bits: 336.8 E(85289): 5.2e-92
Smith-Waterman score: 1527; 58.1% identity (85.7% similar) in 391 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:.::. ..:.. ::::....:....:::.::..: .:.::::::.. ::.:...:.: .
XP_011 MDSLGAVSTRLGFDLFKELKKTNDGNIFFSPVGILTAIGMVLLGTRGATASQLEEVFHSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
. :... :: ... . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.:::::::::::.::
XP_011 KETKSSRIKAEEKEIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGEKTYLFLQKYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
: ..:.:..:.: :::.:: .::::::::::::.::::::.:.:.:.:.:.: ::::: .
XP_011 DYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISSSTKLVLVNMV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
::::::...:.::.::::::: ::.: ::.::: : :: :. :::.:::.: ::::..:
XP_011 YFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAKILGIPYKNND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
:::.:::::.::::.:. .:.. :::.:::: .:.: .:.::::::.::..:::. .:
XP_011 LSMFVLLPNDIDGLEKIIDKISPEKLVEWTSPGHMEERKVNLHLPRFEVEDGYDLEAVLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 TMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTST
.::: : :. :: :::... :: . ::..:: :::::.::::::.. :: . .
XP_011 AMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGI-GFTVTSAPG
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 NEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
.:. :::::::::::.:..:::::.::::::
XP_011 HENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP
360 370 380 390
>>NP_036529 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 2 [Homo sa (391 aa)
initn: 1192 init1: 1192 opt: 1516 Z-score: 1760.1 bits: 334.5 E(85289): 2.7e-91
Smith-Waterman score: 1516; 58.2% identity (85.5% similar) in 392 aa overlap (1-390:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:.::. ..:.. ::::....:....:::.::..: .:.::::::.. ::.:...:.: .
NP_036 MDSLGAVSTRLGFDLFKELKKTNDGNIFFSPVGILTAIGMVLLGTRGATASQLEEVFHSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHV-DRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEY
. :... :: .: . . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.:::::::::::.:
NP_036 KETKSSRIKAEEKEVIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGEKTYLFLQKY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNA
:: ..:.:..:.: :::.:: .::::::::::::.::::::.:.:.:.:.:.: :::::
NP_036 LDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISSSTKLVLVNM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 IYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGK
.::::::...:.::.::::::: ::.: ::.::: : :: :. :::.:::.: ::::..
NP_036 VYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAKILGIPYKNN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTL
::::.:::::.::::.:. .:.. :::.:::: .:.: .:.::::::.::..:::. .:
NP_036 DLSMFVLLPNDIDGLEKIIDKISPEKLVEWTSPGHMEERKVNLHLPRFEVEDGYDLEAVL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 RTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTS
.::: : :. :: :::... :: . ::..:: :::::.::::::.. :: . .
NP_036 AAMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGI-GFTVTSAP
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 TNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
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NP_036 GHENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP
360 370 380 390
>>NP_001294852 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 1 [Homo (400 aa)
initn: 1198 init1: 1198 opt: 1321 Z-score: 1534.3 bits: 292.7 E(85289): 1e-78
Smith-Waterman score: 1500; 57.1% identity (83.5% similar) in 401 aa overlap (1-390:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:.::. ..:.. ::::....:....:::.::..: .:.::::::.. ::.:...:.: .
NP_001 MDSLGAVSTRLGFDLFKELKKTNDGNIFFSPVGILTAIGMVLLGTRGATASQLEEVFHSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDR----------SGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGE
. :... :: .: : . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.::::
NP_001 KETKSSRIKAEEKEVVRIKAEGKEIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 KTYLFLQEYLDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGS
:::::::.::: ..:.:..:.: :::.:: .::::::::::::.::::::.:.:.:.:.:
NP_001 KTYLFLQKYLDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NTTLVLVNAIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAK
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NP_001 STKLVLVNMVYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VLEIPYKGKDLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVE
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NP_001 ILGIPYKNNDLSMFVLLPNDIDGLEKIIDKISPEKLVEWTSPGHMEERKVNLHLPRFEVE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB6 ESYDLKDTLRTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAV
..:::. .: .::: : :. :: :::... :: . ::..:: :::::.::::::..
NP_001 DGYDLEAVLAAMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB6 VGFGSSPTSTNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
:: . . .:. :::::::::::.:..:::::.::::::
NP_001 -GFTVTSAPGHENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP
370 380 390 400
>>NP_778206 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 2 [Homo sap (369 aa)
initn: 1277 init1: 1247 opt: 1247 Z-score: 1449.2 bits: 276.9 E(85289): 5.5e-74
Smith-Waterman score: 2124; 87.4% identity (91.3% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-369)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_778 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_778 QVTENTTEKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::..:::::::::
NP_778 DAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
:::::::.::.::.:::::::::: :::::::::::::::
NP_778 YFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNK---------------------DVQAKVLEIPYKGKD
190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::
NP_778 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETCVDLHLPRFKMEESYDLKDTLR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
:::::.:::::::::::: :.:: .: :::::::::::::.::::::::: : :::
NP_778 TMGMVNIFNGDADLSGMTWSHGLSVSKVLHKAFVEVTEEGVEAAAATAVVVVELSSPSTN
280 290 300 310 320 330
370 380 390
pF1KB6 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_778 EEFCCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
340 350 360
>>XP_011524329 (OMIM: 602058) PREDICTED: serpin B10 isof (397 aa)
initn: 946 init1: 847 opt: 1111 Z-score: 1291.4 bits: 247.8 E(85289): 3.4e-65
Smith-Waterman score: 1111; 45.2% identity (75.4% similar) in 398 aa overlap (1-390:1-397)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKEN-NIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHF
:.::. . ..: ..: ... .: .. :::.: ::...: .: :::: .:: :. .::.:
XP_011 MDSLATSINQFALELSKKLAESAQGKNIFFSSWSISTSLTIVYLGAKGTTAAQMAQVLQF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 --DQVT----ENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTY
:: . :. . .... : ..: .:: :..:. : .: : :: :: ..:::::
XP_011 NRDQGVKCDPESEKKRKMEFNLSNSEEIHSDFQTLISEILKPNDDYLLKTANAIYGEKTY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LFLQEYLDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTT
: ..::. .: .. . . :.:..: .. :: :::::: ::. ::.::.:. .. :.:
XP_011 AFHNKYLEDMKTYFGAEPQPVNFVEASDQIRKDINSWVERQTEGKIQNLLPDDSVDSTTR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LVLVNAIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLE
..::::.:::: ::..: ..: :. : :..: : .::: . ..:. .: .: :.
XP_011 MILVNALYFKGIWEHQFLVQNTTEKPFRINETTSKPVQMMFMKKKLHIFHIEKPKAVGLQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 IPYKGKDLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESY
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XP_011 LYYKSRDLSLLILLPEDINGLEQLEKAITYEKLNEWTSADMMELYEVQLHLPKFKLEDSY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DLKDTLRTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGF
:::.:: .::: : :. . ::.:::...:.: ::.:.::::::..:.:.::::... .
XP_011 DLKSTLSSMGMSDAFSQSKADFSGMSSARNLFLSNVFHKAFVEINEQGTEAAAGSGSE-I
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 GSSPTSTNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
. ::. :::::::::.::::.::::::. ::
XP_011 DIRIRVPSIEFNANHPFLFFIRHNKTNTILFYGRLCSP
360 370 380 390
>>NP_005015 (OMIM: 602058) serpin B10 [Homo sapiens] (397 aa)
initn: 946 init1: 847 opt: 1111 Z-score: 1291.4 bits: 247.8 E(85289): 3.4e-65
Smith-Waterman score: 1111; 45.2% identity (75.4% similar) in 398 aa overlap (1-390:1-397)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKEN-NIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHF
:.::. . ..: ..: ... .: .. :::.: ::...: .: :::: .:: :. .::.:
NP_005 MDSLATSINQFALELSKKLAESAQGKNIFFSSWSISTSLTIVYLGAKGTTAAQMAQVLQF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 --DQVT----ENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTY
:: . :. . .... : ..: .:: :..:. : .: : :: :: ..:::::
NP_005 NRDQGVKCDPESEKKRKMEFNLSNSEEIHSDFQTLISEILKPNDDYLLKTANAIYGEKTY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LFLQEYLDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTT
: ..::. .: .. . . :.:..: .. :: :::::: ::. ::.::.:. .. :.:
NP_005 AFHNKYLEDMKTYFGAEPQPVNFVEASDQIRKDINSWVERQTEGKIQNLLPDDSVDSTTR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LVLVNAIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLE
..::::.:::: ::..: ..: :. : :..: : .::: . ..:. .: .: :.
NP_005 MILVNALYFKGIWEHQFLVQNTTEKPFRINETTSKPVQMMFMKKKLHIFHIEKPKAVGLQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 IPYKGKDLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESY
. ::..:::...:::..:.::..::. .: ::: :::: . :. .:.::::.::.:.::
NP_005 LYYKSRDLSLLILLPEDINGLEQLEKAITYEKLNEWTSADMMELYEVQLHLPKFKLEDSY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DLKDTLRTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGF
:::.:: .::: : :. . ::.:::...:.: ::.:.::::::..:.:.::::... .
NP_005 DLKSTLSSMGMSDAFSQSKADFSGMSSARNLFLSNVFHKAFVEINEQGTEAAAGSGSE-I
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 GSSPTSTNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
. ::. :::::::::.::::.::::::. ::
NP_005 DIRIRVPSIEFNANHPFLFFIRHNKTNTILFYGRLCSP
360 370 380 390
>>XP_011524553 (OMIM: 615682) PREDICTED: serpin B11 isof (392 aa)
initn: 880 init1: 717 opt: 1086 Z-score: 1262.5 bits: 242.4 E(85289): 1.4e-63
Smith-Waterman score: 1086; 42.9% identity (77.9% similar) in 394 aa overlap (1-390:1-392)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSK-ENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHF
:.::: ::..: .:.:... ... .:::.: .:. ::.::::::. .: .:..:::::
XP_011 MGSLSTANVEFCLDVFKELNSNNIGDNIFFSSLSLLYALSMVLLGARGETEEQLEKVLHF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 DQVTENTT-GKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQE
...... : . . ...: .: .: ....:. . :.:::.:.: ::. : :.
XP_011 SHTVDSLKPGFKDSPKCSQAGRIHSEFGVEFSQINQPDSNCTLSIANRLYGTKTMAFHQQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 YLDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVN
::. .:.::. ...::: .. ::.:: ::.:::..:: :. ::. ...: ....::::
XP_011 YLSCSEKWYQARLQTVDFEQSTEETRKTINAWVENKTNGKVANLFGKSTIDPSSVMVLVN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 AIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKG
::::::::..::. ..: . : ... ...:: : .:..: ... : .:::.:: .
XP_011 AIYFKGQWQNKFQVRETVKSPFQLSEGKNVTVEMMYQIGTFKLAFVKEPQMQVLELPYVN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KDLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDT
. ::::.::: : .:...:..:.. . :::: .:: : .:..::::::.: .:.:..
XP_011 NKLSMIILLPVGIANLKQIEKQLNSGTFHEWTSSSNMMEREVEVHLPRFKLETKYELNSL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LRTMGMVDIFNG-DADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATA-VVGFGSSP
:...:..:.:: ::::::. ..:: :: ..::....:.:::.::::::. .. : :
XP_011 LKSLGVTDLFNQVKADLSGMSPTKGLYLSKAIHKSYLDVSEEGTEAAAATGDSIAVKSLP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB6 TSTNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
. .:. :::::::::...::.::: :...::
XP_011 MRA--QFKANHPFLFFIRHTHTNTILFCGKLASP
370 380 390
390 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:16:31 2016 done: Fri Nov 4 23:16:32 2016
Total Scan time: 7.350 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]