Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6533
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6533, 367 aa
1>>>pF1KB6533 367 - 367 aa - 367 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1864+/-0.000992; mu= 11.7432+/- 0.060
mean_var=81.7358+/-16.132, 0's: 0 Z-trim(105.7): 67 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.141863
statistics sampled from 8509 (8575) to 8509 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 ( 367) 2422 505.6 2.7e-143
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 394) 1521 321.2 9.4e-88
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 303) 1198 255.1 6e-68
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 ( 314) 1041 222.9 2.9e-58
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 ( 384) 952 204.8 1.1e-52
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 ( 482) 532 118.8 9.6e-27
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 ( 419) 478 107.8 1.8e-23
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 ( 381) 470 106.1 5.2e-23
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX ( 384) 460 104.1 2.2e-22
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12 ( 665) 433 98.6 1.6e-20
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11 ( 625) 420 96.0 9.6e-20
CCDS11320.1 DUSP14 gene_id:11072|Hs108|chr17 ( 198) 379 87.4 1.2e-17
CCDS13883.1 DUSP18 gene_id:150290|Hs108|chr22 ( 188) 338 79.0 3.8e-15
CCDS11253.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1423) 350 81.8 4.1e-15
CCDS74024.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1450) 350 81.8 4.1e-15
CCDS55882.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 692) 333 78.2 2.4e-14
CCDS53825.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 703) 333 78.2 2.4e-14
CCDS9121.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 (1049) 333 78.3 3.5e-14
CCDS14264.1 DUSP21 gene_id:63904|Hs108|chrX ( 190) 322 75.7 3.7e-14
CCDS2289.1 DUSP19 gene_id:142679|Hs108|chr2 ( 217) 307 72.7 3.5e-13
CCDS53542.1 DUSP13 gene_id:51207|Hs108|chr10 ( 188) 301 71.4 7.2e-13
CCDS33418.1 DUSP28 gene_id:285193|Hs108|chr2 ( 176) 298 70.8 1e-12
CCDS9711.1 STYX gene_id:6815|Hs108|chr14 ( 223) 295 70.2 2e-12
CCDS6092.1 DUSP26 gene_id:78986|Hs108|chr8 ( 211) 293 69.8 2.5e-12
CCDS13193.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 235) 268 64.7 9.4e-11
>>CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 (367 aa)
initn: 2422 init1: 2422 opt: 2422 Z-score: 2686.0 bits: 505.6 E(32554): 2.7e-143
Smith-Waterman score: 2422; 100.0% identity (100.0% similar) in 367 aa overlap (1-367:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRRAKGAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRRAKGAM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCREARAAQVFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCREARAAQVFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNHKADISSWFNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNHKADISSWFNEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 FMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSP
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ITTSPSC
:::::::
CCDS43 ITTSPSC
>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (394 aa)
initn: 1387 init1: 1189 opt: 1521 Z-score: 1688.9 bits: 321.2 E(32554): 9.4e-88
Smith-Waterman score: 1521; 63.1% identity (83.5% similar) in 369 aa overlap (6-367:26-394)
10 20 30
pF1KB6 MVMEVGTLDAGGLRALLG-ERAAQCLLLDCRSFFAFNAGH
: ..: .. :: ...::::::: :.: .::.
CCDS60 MVTMEELREMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 IAGSVNVRFSTIVRRRAKGAMGLEHIVP-NAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKR
: :::::: .:::::::::...::.:.: . :.:.:: .: : ::.. :::: .. ..
CCDS60 ILGSVNVRCNTIVRRRAKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLRE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DGTLALAAGALCREARAAQVFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAE
:.:..:.. :: :.:. ... .:::::: ::. ::.::: .. .. :. :. . .
CCDS60 DSTVSLVVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 SGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHY
:::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::.:::..:::::::::
CCDS60 LGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 QYKSIPVEDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNR
::: ::::::::::::::: :::..::..:. :::.::::::::::::::::::: .:
CCDS60 QYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKR
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTT-
:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::.::. . .:: . .:
CCDS60 VRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATP
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KB6 ----VFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSPITTSPSC
::.::::. :::. :.: ::.:::::::::
CCDS60 TSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
370 380 390
>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (303 aa)
initn: 1068 init1: 1068 opt: 1198 Z-score: 1333.4 bits: 255.1 E(32554): 6e-68
Smith-Waterman score: 1198; 66.2% identity (82.9% similar) in 275 aa overlap (98-367:30-303)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCREARAAQVFFLKGGYEA
: ..::... : ..: .::::
CCDS60 MGRKVHSNGSQFAEHSRSPRRTGRDCKPVRAPSMALGVSQLAGRSRCL-CSESQGGYER
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAY
::. ::.::: .. .. :. :. . . :::::.:::.::::::::::::::::::
CCDS60 FSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAY
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 HASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNHKADISSWFNEAIDFIDSI
::.:.:::::::::::.:::..:::::::::::: ::::::::::::::: :::..::..
CCDS60 HAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAV
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQ
:. :::.::::::::::::::::::: .::.:.:::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQ
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 FESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTT-----VFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSPIT
::::::: :.:::.::. . .:: . .: ::.::::. :::. :.: ::.::::
CCDS60 FESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPIT
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TSPSC
:::::
CCDS60 TSPSC
300
>>CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 (314 aa)
initn: 944 init1: 774 opt: 1041 Z-score: 1159.5 bits: 222.9 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1041; 53.5% identity (77.6% similar) in 312 aa overlap (8-313:9-312)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MVMEVGTLDAGGLRALLGE--RAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRRAK
:. ..: .:: . .: . :::::: :.:: :. .. : .....::::.
CCDS20 MGLEAARELECAALGTLLRDPREAERTLLLDCRPFLAFCRRHVRAARPVPWNALLRRRAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 G--AMGLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCREARA
: : : ..:. :: ::. : .:.::: ::.. . :. . .:: .:.::
CCDS20 GPPAAVLACLLPDRALRTRLVRGELARAVVLDEGSASVAELRPDSPAHVLLAALLHETRA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AQ--VFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGG
. :.::.::...:.. ::.:::. .: .:: : . ... :. .:.:::::
CCDS20 GPTAVYFLRGGFDGFQGCCPDLCSEAPAP---ALP-----PTGDKTSRSDSRAPVYDQGG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNHKADI
::::::.:.::: :.: . :.: ::::..::::.::::::: ..:::::::::. ..:
CCDS20 PVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLQACGITAVLNVSASCPNHFEGLFRYKSIPVEDNQMVEI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 SSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRS
:.::.::: ::: .::.::::.:::::::::::::::::::.. ::.:::::.::::::.
CCDS20 SAWFQEAIGFIDWVKNSGGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMQSRRVRLDEAFDFVKQRRG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 IISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHSTNSA
.:::::::::::::::.:::
CCDS20 VISPNFSFMGQLLQFETQVLCH
300 310
>>CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 (384 aa)
initn: 899 init1: 658 opt: 952 Z-score: 1059.7 bits: 204.8 E(32554): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 1006; 45.4% identity (69.5% similar) in 394 aa overlap (3-367:1-384)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MVMEVGTLDAGGLRALL-GERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRRAKG-
:.: .::. :: .: : ::.:..:::: ..:: :... ::.:: ....: :::.:
CCDS75 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLNSVVLRRARGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 AMGLEHIVPNAELRGRLL---AGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGAL--CREA
:.. ....:. :.::: .:. :::.::. : . ..... .. .: : :
CCDS75 AVSARYVLPDEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVLTSLLACLPA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 RAAQVFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPL-----
. .:.:::::::.: . :: : . :.: .: .. :.:. :.
CCDS75 -GPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVK-------PISQEKIESERALISQCGKPVVNVSY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 ---YDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPV
::::::::::::::::::::::. ..: : ::::.::: . : .:: :::
CCDS75 RPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACATHLHYKWIPV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 EDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAF
::.: ::::: :.::::::: ... ::.:.:::.:::::: :::.::::.:.. .: :::
CCDS75 EDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKQFRLKEAF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB6 EFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLA-------PHCSAEA-GSPAMAVLDRGTSTT-
...:::::..::::.:::::::.::..: : :..:: :: .. :. .
CCDS75 DYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIGHLQTLSPDMQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KB6 -TVFNFPVSI----PVHSTNSALSYLQSPITTSPSC
. .::.:. :.::: : :: .::..:. ::
CCDS75 GAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELS--RSPVATATSC
360 370 380
>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 (482 aa)
initn: 445 init1: 339 opt: 532 Z-score: 593.6 bits: 118.8 E(32554): 9.6e-27
Smith-Waterman score: 532; 33.0% identity (63.6% similar) in 294 aa overlap (25-309:173-459)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRR
...::: :. .: .:: :.:.. . . :
CCDS15 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 R--AKGAMGLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCRE
: .: . . .. : . . . ... :: . . . . : .. .: ::
CCDS15 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKRE
210 220 230 240 250 260
120 130 140 150 160
pF1KB6 ARAAQVFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSC-----STP
.. : :::: .:. . .::... :.: : .: .. : .::
CCDS15 GKEPLV--LKGGLSSFKQNHENLCDNS-----LQLQECREVGGGASAASSLLPQPIPTTP
270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 LYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCP-NHFE-GHYQYKSIPV
... . :::::.::. :. : .. :.: .:::... : :.: : ..:: .:.
CCDS15 DIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPA
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 EDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAF
:..: .. ..:.::..::. .. : ...:::::.:::::: .::::. .:. . .:.
CCDS15 TDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAY
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 EFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSI
.::: .: :::::..::::::.::
CCDS15 KFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
440 450 460 470 480
>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 (419 aa)
initn: 619 init1: 331 opt: 478 Z-score: 534.8 bits: 107.8 E(32554): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 620; 36.1% identity (62.8% similar) in 352 aa overlap (22-344:70-414)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRF-ST
:. :::::: :...:: ..:. . .
CCDS33 GTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLAIPGL
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100
pF1KB6 IVRRRAKGAMGLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLL-DERSAALDGAKRDGTLALAAGAL
..:: :: . .. :.:: . :. . :.::: :: .: . . :. : . : :
CCDS33 MLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATA--EWQPEPGAPASVLGLL
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150
pF1KB6 CREAR--AAQVFFLKGGYEAFSASCPELC--------SKQSTP----MGLS-LPLSTSVP
.. : . :...:.::.. :.. : : : .:.: .::. : .:..
CCDS33 LQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLRISSDCS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]