Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6452
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6452, 350 aa
1>>>pF1KB6452 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6087+/-0.0013; mu= -7.0644+/- 0.074
mean_var=247.6336+/-57.668, 0's: 0 Z-trim(105.6): 490 B-trim: 107 in 1/51
Lambda= 0.081502
statistics sampled from 7931 (8519) to 7931 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10794.1 CSNK2A2 gene_id:1459|Hs108|chr16 ( 350) 2372 292.8 2.9e-79
CCDS13003.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 ( 391) 1980 246.7 2.4e-65
CCDS59224.1 CSNK2A3 gene_id:283106|Hs108|chr11 ( 391) 1977 246.4 3e-65
CCDS13004.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 ( 255) 1226 157.9 8.3e-39
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 513 74.2 1.9e-13
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 510 73.9 2.4e-13
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 506 73.4 3.3e-13
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 505 73.3 3.7e-13
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 499 72.5 5e-13
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 472 69.4 5.6e-12
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 467 68.8 7.7e-12
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 468 69.0 8e-12
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 470 69.3 8e-12
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 470 69.3 8.1e-12
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 468 69.0 8.4e-12
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 470 69.3 8.9e-12
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 466 68.7 9.8e-12
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 468 69.0 9.8e-12
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 468 69.0 9.8e-12
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 466 68.8 1e-11
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 466 68.8 1.1e-11
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 447 66.4 3.7e-11
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 443 66.0 5.6e-11
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 442 65.9 6.1e-11
>>CCDS10794.1 CSNK2A2 gene_id:1459|Hs108|chr16 (350 aa)
initn: 2372 init1: 2372 opt: 2372 Z-score: 1536.5 bits: 292.8 E(32554): 2.9e-79
Smith-Waterman score: 2372; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TNNERVVVKILKPVKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFEYINNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TNNERVVVKILKPVKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFEYINNT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQKKLRLIDWGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQKKLRLIDWGLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 EFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRREPFFHGQDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRREPFFHGQDNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIHSENRHLVSPEALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIHSENRHLVSPEALD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 LLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLTAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLTAAR
310 320 330 340 350
>>CCDS13003.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 (391 aa)
initn: 1969 init1: 1969 opt: 1980 Z-score: 1286.7 bits: 246.7 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 1980; 85.3% identity (94.9% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
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CCDS13 MSGPVP-SRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TNNERVVVKILKPVKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFEYINNT
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CCDS13 TNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQKKLRLIDWGLA
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CCDS13 DFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 EFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRREPFFHGQDNY
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::
CCDS13 EFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIHSENRHLVSPEALD
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CCDS13 DQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 LLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLTAAR
.::::::::::.::::.::::::::: :::.:..
CCDS13 FLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANMMSGISSVP
300 310 320 330 340 350
CCDS13 TPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
360 370 380 390
>>CCDS59224.1 CSNK2A3 gene_id:283106|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 1966 init1: 1966 opt: 1977 Z-score: 1284.8 bits: 246.4 E(32554): 3e-65
Smith-Waterman score: 1977; 85.0% identity (94.6% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
: ::. ::::::..::. : :::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSGPVP-SRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TNNERVVVKILKPVKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFEYINNT
::::.:::::::::::::::::.::::::::: ::: : : ::::::.:::::::..:::
CCDS59 TNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQKKLRLIDWGLA
::::::: :::.::::::::.::::::::: ::::::::::::::::...::::::::::
CCDS59 DFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 EFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRREPFFHGQDNY
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.::::::.:::
CCDS59 EFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWRLGCMLASMIFRKEPFFHGRDNY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIHSENRHLVSPEALD
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CCDS59 DQLVRIAKFLGTEDLYGYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 LLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLTAAR
.::::::::::.::::.::::::::: :::.:..
CCDS59 FLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANVMSGISSVP
300 310 320 330 340 350
CCDS59 TPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAATGAQQ
360 370 380 390
>>CCDS13004.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 (255 aa)
initn: 1226 init1: 1226 opt: 1226 Z-score: 810.2 bits: 157.9 E(32554): 8.3e-39
Smith-Waterman score: 1226; 86.8% identity (97.5% similar) in 197 aa overlap (138-334:1-197)
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KTPALVFEYINNTDFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDH
:::.::::::::: ::::::::::::::::
CCDS13 MYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDH
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 QQKKLRLIDWGLAEFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMI
...:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMI
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 FRREPFFHGQDNYDQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIH
::.::::::.::::::::::::::::.:: :. ::.:.:::.::::::.::::::: :.:
CCDS13 FRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVH
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 SENRHLVSPEALDLLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLT
:::.:::::::::.::::::::::.::::.::::::::: :::.:..
CCDS13 SENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPV
160 170 180 190 200 210
350
pF1KB6 AAR
CCDS13 SSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ
220 230 240 250
>>CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 442 init1: 131 opt: 513 Z-score: 355.0 bits: 74.2 E(32554): 1.9e-13
Smith-Waterman score: 513; 30.5% identity (62.2% similar) in 328 aa overlap (24-338:8-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
.. : . : . :: . .: : :. : :..
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDT
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 TNNERVVVKIL-KP----VKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPAL---
.. ::.:: : .: .. :. ::...:.... :.: :.: : :. . .
CCDS48 KTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKH-ENVIGLLD-VFTPARSLEEFNDV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 -VFEYINNTDFKQLY--QILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQ
. .. ..:.... : ::: ..: .:..:..: : :: :.:::.:: :. .. ..
CCDS48 YLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVN-ED
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KKLRLIDWGLAEFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFR
.:...:.:::. : .:.. ::.:....::...... :. ..:.::.::..: ..
CCDS48 CELKILDFGLAR--HTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTG
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 REPFFHGQDNYDQLVRIAKVLGTE--ELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIH
: .: : :. ::: : ...:: :: ::: . .. . : : . . : .
CCDS48 RT-LFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAEL---LKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFI
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 SENRHLVSPEALDLLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLT
. : : :.:::.:.: : ..:.:: .:. : :: ...: ::
CCDS48 GAN-----PLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESR
280 290 300 310 320 330
350
pF1KB6 AAR
CCDS48 DLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
340 350 360
>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa)
initn: 369 init1: 131 opt: 510 Z-score: 353.0 bits: 73.9 E(32554): 2.4e-13
Smith-Waterman score: 510; 30.2% identity (62.5% similar) in 328 aa overlap (24-338:8-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
.. : . : . : .: .: : :. : : .
CCDS14 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDA
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 TNNERVVVKIL-KP----VKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFE
..:.:: : .: .. .. ::...:..:. :.: :.: : :... .
CCDS14 RLRQKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKH-ENVIGLLD-VFTPATSIEDFSEV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 YINNT----DFKQLY--QILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQ
:. .: :.... : :.: ..: .:.::..: : :: ::.:::.:: :: .. ..
CCDS14 YLVTTLMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVN-ED
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KKLRLIDWGLAEFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFR
.::..:.:::. . .:.. ::.:....::...... :. ..:.::.::..: .. .
CCDS14 CELRILDFGLAR--QADEEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELL-Q
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 REPFFHGQDNYDQLVRIAKVLGTE--ELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIH
. .: :.: ::: :: .:.:: :. . ... : . . : .: ....
CCDS14 GKALFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHART---YIQSLPPMPQKDLSSIFR
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 SENRHLVSPEALDLLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLT
. : : :.::: ..: : .::..: ::. : :: ...: :.
CCDS14 GAN-----PLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAK
280 290 300 310 320 330
350
pF1KB6 AAR
CCDS14 ERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
340 350 360
>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 399 init1: 131 opt: 506 Z-score: 350.5 bits: 73.4 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 506; 29.1% identity (62.3% similar) in 326 aa overlap (24-338:8-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPGPAAGSRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI
.. : . : . :: . .: : :. : :..
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDT
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 TNNERVVVKIL-KP----VKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPAL---
.. ::.:: : .: .. :. ::...:.... :.: :.: : :. . .
CCDS48 KTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKH-ENVIGLLD-VFTPARSLEEFNDV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 -VFEYINNTDFKQLY--QILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQ
. .. ..:.... : ::: ..: .:..:..: : :: :.:::.:: :. .. ..
CCDS48 YLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVN-ED
110 120 130 140 150 160
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pF1KB6 KKLRLIDWGLAEFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]