Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6441, 314 aa
1>>>pF1KB6441 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8599+/-0.000871; mu= 13.0638+/- 0.052
mean_var=78.3415+/-15.519, 0's: 0 Z-trim(107.1): 22 B-trim: 7 in 1/50
Lambda= 0.144903
statistics sampled from 9363 (9381) to 9363 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 2.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 ( 376) 2105 449.5 1.8e-126
CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 ( 435) 2105 449.6 2.1e-126
CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 ( 353) 1142 248.2 6.9e-66
CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3088) 1146 249.5 2.4e-65
CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3062) 1124 244.9 5.9e-64
CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19 ( 371) 971 212.5 4.2e-55
CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 ( 357) 914 200.5 1.6e-51
CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 ( 275) 908 199.2 3e-51
CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 ( 439) 400 93.1 4.1e-19
CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 305) 345 81.6 8.8e-16
CCDS14060.2 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 433) 345 81.6 1.2e-15
CCDS54538.2 ARHGAP8 gene_id:553158|Hs108|chr22 ( 564) 345 81.7 1.5e-15
>>CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 (376 aa)
initn: 2105 init1: 2105 opt: 2105 Z-score: 2383.9 bits: 449.5 E(32554): 1.8e-126
Smith-Waterman score: 2105; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:63-376)
10 20 30
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADIL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SWYRTKKLGLLDIGSLDYQEFVVDIESRLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADIL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 AITGPEDQPGSLEVNGNKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AITGPEDQPGSLEVNGNKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 NSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPY
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 KKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVY
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQ
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310
pF1KB6 KIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
340 350 360 370
>>CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 (435 aa)
initn: 2105 init1: 2105 opt: 2105 Z-score: 2383.0 bits: 449.6 E(32554): 2.1e-126
Smith-Waterman score: 2105; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:122-435)
10 20 30
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADIL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEDEGAKASSGDIGSLDYQEFVVDIESRLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADIL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 AITGPEDQPGSLEVNGNKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AITGPEDQPGSLEVNGNKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSE
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 NSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPY
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 KKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVY
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQ
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310
pF1KB6 KIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
400 410 420 430
>>CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (353 aa)
initn: 1093 init1: 987 opt: 1142 Z-score: 1296.3 bits: 248.2 E(32554): 6.9e-66
Smith-Waterman score: 1142; 58.9% identity (80.9% similar) in 304 aa overlap (13-311:27-328)
10 20 30 40
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADILAITGPEDQPGSLEVNG
:: . .: .... . : :: :.::..:
CCDS83 MLKSCSRASFSPSVRKPPLILRRLLSEDVGMDIPFEEGVLSPSAADMRPEP-PNSLDLND
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 NKVRK-KLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL--DGLDTPSE-NSNEFEWEDDL
.. :. :: ::.:.:.:: :.::.:::: :: :::. : ::::.: .: :. ..:
CCDS83 THPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTGHED-
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 PKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYG
: . .. :: :::: ::.::.: :: ::::..:.:::.::::..:::::::::
CCDS83 PTANKDSGQESESIPEYTAEEEREDNRLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYRRVISHGGYYG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMP
::::::.:::.::.:.::. .:.:.:.::: :::.::::.:::.:::::::::: ::.::
CCDS83 DGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYLNGATPRRRMP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAEL
.:::..::::.:::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.::.:: .:.::
CCDS83 GLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSKIKYVNSLSEL
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KB6 AELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
. :.::. . ::: : ..:.:: .. :
CCDS83 SGLIPMDCIHIPESIIKLDEELREASEAAKTSCLYNDPEMSSMEKDIDLKLKEKP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3088 aa)
initn: 1074 init1: 968 opt: 1146 Z-score: 1286.5 bits: 249.5 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 1146; 58.7% identity (80.5% similar) in 303 aa overlap (13-311:2763-3063)
10 20 30 40
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADILAITGPEDQPGSL
:: . .: .... . : :: :.::
CCDS47 KNMIPDTEMEEETEFLELGTRISRPNGLLSEDVGMDIPFEEGVLSPSAADMRPEP-PNSL
2740 2750 2760 2770 2780 2790
50 60 70 80 90
pF1KB6 EVNGNKVRK-KLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL--DGLDTPSENSNEFEWE
..: .. :. :: ::.:.:.:: :.::.:::: :: :::. : ::::.: .. ::.
CCDS47 DLNDTHPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDE-ADSFEYT
2800 2810 2820 2830 2840 2850
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DDLPKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGG
: . .. :: :::: ::.::.: :: ::::..:.:::.::::..::::::
CCDS47 GHDPTANKDSGQESESIPEYTAEEEREDNRLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYRRVISHGG
2860 2870 2880 2890 2900 2910
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 YYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRR
:::::::::.:::.::.:.::. .:.:.:.::: :::.::::.:::.:::::::::: ::
CCDS47 YYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYLNGATPRR
2920 2930 2940 2950 2960 2970
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNL
.::.:::..::::.:::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.::.:: .:
CCDS47 RMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSKIKYVNSL
2980 2990 3000 3010 3020 3030
280 290 300 310
pF1KB6 AELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
.::. :.::. . ::: : ..:.:: .. :
CCDS47 SELSGLIPMDCIHIPESIIKLDEELREASEAAKTSCLYNDPEMSSMEKDIDLKLKEKP
3040 3050 3060 3070 3080
>>CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3062 aa)
initn: 1066 init1: 744 opt: 1124 Z-score: 1261.7 bits: 244.9 E(32554): 5.9e-64
Smith-Waterman score: 1124; 58.8% identity (80.4% similar) in 301 aa overlap (13-306:2763-3061)
10 20 30 40
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADILAITGPEDQPGSL
:: . .: .... . : :: :.::
CCDS78 KNMIPDTEMEEETEFLELGTRISRPNGLLSEDVGMDIPFEEGVLSPSAADMRPEP-PNSL
2740 2750 2760 2770 2780 2790
50 60 70 80 90
pF1KB6 EVNGNKVRK-KLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL--DGLDTPSENSNEFEWE
..: .. :. :: ::.:.:.:: :.::.:::: :: :::. : ::::.: .. ::.
CCDS78 DLNDTHPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDE-ADSFEYT
2800 2810 2820 2830 2840 2850
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DDLPKPKTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGG
: . .. :: :::: ::.::.: :: ::::..:.:::.::::..::::::
CCDS78 GHDPTANKDSGQESESIPEYTAEEEREDNRLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYRRVISHGG
2860 2870 2880 2890 2900 2910
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 ---YYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGAT
:::::::::.:::.::.:.::. .:.:.:.::: :::.::::.:::.::::::::::
CCDS78 DSGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYLNGAT
2920 2930 2940 2950 2960 2970
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 TRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYV
::.::.:::..::::.:::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.::.::
CCDS78 PRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSKIKYV
2980 2990 3000 3010 3020 3030
280 290 300 310
pF1KB6 FNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKNEQ
.:.::. :.::. . ::: : ..: .:. :
CCDS78 NSLSELSGLIPMDCIHIPESIINIDLKLKEKP
3040 3050 3060
>>CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19 (371 aa)
initn: 1173 init1: 886 opt: 971 Z-score: 1102.8 bits: 212.5 E(32554): 4.2e-55
Smith-Waterman score: 1182; 53.7% identity (78.5% similar) in 335 aa overlap (1-313:10-340)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADILAITGPEDQPGSLEVNG-NKVR
::.:..::::::::.: ::::. ..: . . :..:. :: .. :
CCDS45 MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KB6 KKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL--DGLDTPSE--------NSNEFEWED
: :.::.:...:: :.::.:::: :: ..:. : ..::.: :.::.::::
CCDS45 KTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWED
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DLP------KP-KTTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKK
: : : ..... :. . .:: .:: :: ::::.::.:.. :.:: :
CCDS45 DTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAA----NGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMK
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLN
:..::::::.:::::.:::.::.:.:: :.:.:.:.::: :::..:::::::.:::::::
CCDS45 VVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLN
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 GATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKI
::: ::.::..:::.::::.:::::::::::::::::::::::.::..::::: :: .::
CCDS45 GATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KB6 RYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQE-LNGKQD--EPKNEQ
.:: .: .: .:.:::.: ::.:. : ..: :..... .:. :
CCDS45 QYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVE
300 310 320 330 340 350
CCDS45 NRSALVSEDQETSMS
360 370
>>CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 (357 aa)
initn: 1009 init1: 823 opt: 914 Z-score: 1038.7 bits: 200.5 E(32554): 1.6e-51
Smith-Waterman score: 1029; 47.1% identity (77.8% similar) in 325 aa overlap (4-305:33-353)
10 20 30
pF1KB6 MEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIEADILAIT
.:::::::::.:: :::. . :
CCDS97 TIQEAGKKTDVGVREIAEAPELGAALRHGELELKEEWQDEEFPRLLPEEAGTSEDPEDPK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KB6 GPEDQ----PGSLEVNGNK-VRKKLMAPDI--SLTLDP-SDGSVLSDDL----DESGEID
: . :..: . :.. .::.: ::.. ::: : .::. ... : :....
CCDS97 GDSQAAAGTPSTLALCGQRPMRKRLSAPELRLSLTKGPGNDGASPTQSAPSSPDGSSDLE
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KB6 LDGLDTPSEN-----SNEFEWEDDLPKPK------TTEVIRKGSITEYTAAEEKEDGRRW
.: :.:::.. ..::::::.::. . :.: . .: . . :. :::..:
CCDS97 IDELETPSDSEQLDSGHEFEWEDELPRAEGLGTSETAERLGRGCMWDVTG----EDGHHW
130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 RMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNL
:.::.: ...:::: .:::::::.:::::.::::::...:: :..:.:: ::: :.:..:
CCDS97 RVFRMGPREQRVDMTVIEPYKKVLSHGGYHGDGLNAVILFASCYLPRSSIPNYTYVMEHL
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 FKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPS
:.:..:::::::::::..:.:.:.:.: ..: :.:.:.::. .::::::::..:..:: .
CCDS97 FRYMVGTLELLVAENYLLVHLSGGTSRAQVPPLSWIRQCYRTLDRRLRKNLRALVVVHAT
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 WFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEP
:.....::. ::::::::..:::.. .:.:::.:. .. : ::: ..:.:..:.:
CCDS97 WYVKAFLALLRPFISSKFTRKIRFLDSLGELAQLISLDQVHIPEAVRQLDRDLHGSGGT
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KNEQ
>>CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 (275 aa)
initn: 919 init1: 823 opt: 908 Z-score: 1033.6 bits: 199.2 E(32554): 3e-51
Smith-Waterman score: 936; 48.7% identity (81.5% similar) in 275 aa overlap (49-305:1-271)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 LPEDDSIEADILAITGPEDQPGSLEVNGNKVRKKLMAPDI--SLTLDP-SDGSVLSDDL-
.::.: ::.. ::: : .::. ...
CCDS53 MRKRLSAPELRLSLTKGPGNDGASPTQSAP
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KB6 ---DESGEIDLDGLDTPSEN-----SNEFEWEDDLPKPK------TTEVIRKGSITEYTA
: :.....: :.:::.. ..::::::.::. . :.: . .: . . :.
CCDS53 SSPDGSSDLEIDELETPSDSEQLDSGHEFEWEDELPRAEGLGTSETAERLGRGCMWDVTG
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130 140 150 160 170 180
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