Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6424, 340 aa
1>>>pF1KB6424 340 - 340 aa - 340 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8632+/-0.0012; mu= 7.9224+/- 0.070
mean_var=120.2302+/-25.506, 0's: 0 Z-trim(104.8): 201 B-trim: 94 in 2/47
Lambda= 0.116968
statistics sampled from 7849 (8083) to 7849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3 ( 340) 2321 403.2 1.5e-112
CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 ( 340) 2152 374.7 5.9e-104
CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7 ( 340) 2151 374.6 6.7e-104
CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 ( 340) 1960 342.3 3.4e-94
CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 ( 339) 1935 338.1 6.2e-93
CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 ( 240) 1553 273.5 1.2e-73
CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 ( 353) 1259 224.0 1.4e-58
CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 ( 395) 1259 224.1 1.5e-58
CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 ( 521) 421 82.7 7.1e-16
CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 ( 522) 421 82.7 7.2e-16
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 ( 415) 409 80.6 2.4e-15
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9 ( 334) 401 79.2 5.2e-15
CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9 ( 314) 395 78.2 1e-14
CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9 ( 315) 395 78.2 1e-14
CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3 ( 330) 395 78.2 1e-14
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10 ( 800) 387 77.1 5.4e-14
CCDS1581.1 TAF5L gene_id:27097|Hs108|chr1 ( 589) 377 75.3 1.4e-13
CCDS34324.1 RACK1 gene_id:10399|Hs108|chr5 ( 317) 344 69.6 3.9e-12
CCDS55859.1 POC1B gene_id:282809|Hs108|chr12 ( 436) 336 68.3 1.3e-11
CCDS54592.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3 ( 359) 329 67.1 2.5e-11
CCDS2846.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3 ( 407) 329 67.1 2.8e-11
CCDS340.1 SNRNP40 gene_id:9410|Hs108|chr1 ( 357) 326 66.6 3.5e-11
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 589) 329 67.2 3.7e-11
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 627) 329 67.3 3.9e-11
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 707) 329 67.3 4.3e-11
CCDS10788.1 KATNB1 gene_id:10300|Hs108|chr16 ( 655) 328 67.1 4.6e-11
CCDS54591.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3 ( 369) 323 66.1 5.2e-11
>>CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3 (340 aa)
initn: 2321 init1: 2321 opt: 2321 Z-score: 2133.9 bits: 403.2 E(32554): 1.5e-112
Smith-Waterman score: 2321; 100.0% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
310 320 330 340
>>CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 (340 aa)
initn: 2152 init1: 2152 opt: 2152 Z-score: 1979.8 bits: 374.7 E(32554): 5.9e-104
Smith-Waterman score: 2152; 90.9% identity (96.8% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
::::.:::::::::.:::.:::::: :::: :::.:.: :::::::::::::::::::::
CCDS34 MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
:::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS34 CSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
:::.::::::::.:: : :::::::::.::::.:.:::::.:::: :::::. ::::: :
CCDS34 TGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
:::::::::::::::::::::. :::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:
CCDS34 FATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS34 KADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
310 320 330 340
>>CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7 (340 aa)
initn: 2151 init1: 2151 opt: 2151 Z-score: 1978.9 bits: 374.6 E(32554): 6.7e-104
Smith-Waterman score: 2151; 90.0% identity (97.9% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
::::::::::::::::::.::::::.:.::.:::...: :::::::::::::::::::::
CCDS57 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
:::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS57 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::. :
CCDS57 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
.:::::::::::.:: ::::::::::: ::::.::.::::.: :: ::::::.:::::::
CCDS57 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
:.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.::..
CCDS57 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS57 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
310 320 330 340
>>CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 (340 aa)
initn: 1960 init1: 1960 opt: 1960 Z-score: 1804.7 bits: 342.3 E(32554): 3.4e-94
Smith-Waterman score: 1960; 79.7% identity (95.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
:.:.::::::::::..:: :::::: :.::....:... :::.:::::::::::::::::
CCDS85 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
:::. ::.::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS85 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
:::::::.:::::.::::: .:::::::::::::..:::::::::::::::::.:: :.:
CCDS85 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
.::.:: :::..:::. :.:::::::.::::.:.: :::.:::: :::::. ::::: :
CCDS85 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
. ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.::::::::::::..
CCDS85 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
:..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS85 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
310 320 330 340
>>CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 (339 aa)
initn: 1069 init1: 1010 opt: 1935 Z-score: 1781.9 bits: 338.1 E(32554): 6.2e-93
Smith-Waterman score: 1935; 79.4% identity (94.7% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
:.:.::::::::::..:: :::::: :.::....:... :::.:::::::::::::::::
CCDS73 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
:::. ::.::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS73 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
:::::::.:::::.::::: .:::::::::::::..::::::::: :::::::.:: :.:
CCDS73 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTT-ALWDIETGQQKTVF
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
.::.:: :::..:::. :.:::::::.::::.:.: :::.:::: :::::. ::::: :
CCDS73 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
. ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.::::::::::::..
CCDS73 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
:..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS73 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
300 310 320 330
>>CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 (240 aa)
initn: 1553 init1: 1553 opt: 1553 Z-score: 1435.7 bits: 273.5 E(32554): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 1553; 91.2% identity (97.1% similar) in 240 aa overlap (101-340:1-240)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 VSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 GNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSL
::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::
CCDS72 GNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 SLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATC
::.:: : :::::::::.::::.:.:::::.:::: :::::. ::::: :::::::::::
CCDS72 SLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATC
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 RLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAG
:::::::::::. :::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::::
CCDS72 RLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAG
160 170 180 190 200 210
320 330 340
pF1KB6 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS72 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
220 230 240
>>CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 (353 aa)
initn: 1302 init1: 621 opt: 1259 Z-score: 1165.1 bits: 224.0 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 1259; 52.2% identity (78.9% similar) in 341 aa overlap (4-339:12-352)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLR
: .:..:::.:...... : .:. : :.. ....:.. :.:::::.
CCDS45 MATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQVAERVEALGQFVMKTRRTLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYV
:: :. : : :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::. . .:::.::::::: .
CCDS45 GHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB6 ACGGLDNICSIYNLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRFLD-DSQIVTSSGDTTCALW
::::::: ::.: : .. :. .... . ::.::: : : . : ::.:.::: :::::
CCDS45 ACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALW
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPDMR--TFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVS
:.:..: .: ::..::. :.:.:. :::::.:: .. .::.:.:.: :.: : :
CCDS45 DVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHES
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLA
:::.: ..:.: :::.:::::::::.:::::.:. .::...:: : .:: :: :::::.:
CCDS45 DINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 GYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
::.:.. ::::.:::.:...: ::.:::: : :. :: : .:::: ::.:
CCDS45 GYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHTLRVWA
310 320 330 340 350
>>CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 (395 aa)
initn: 1302 init1: 621 opt: 1259 Z-score: 1164.4 bits: 224.1 E(32554): 1.5e-58
Smith-Waterman score: 1259; 52.2% identity (78.9% similar) in 341 aa overlap (4-339:54-394)
10 20 30
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQI
: .:..:::.:...... : .:. : :.
CCDS10 RPVFKKSQQLSYCSTCAEIMATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQV
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 TSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAI
. ....:.. :.:::::.:: :. : : :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::.
CCDS10 AERVEALGQFVMKTRRTLKGHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 PLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRF
. .:::.::::::: .::::::: ::.: : .. :. .... . ::.::: : :
CCDS10 TMPCTWVMACAYAPSGCAIACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KB6 LD-DSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPDMR--TFVSGACDASS
. : ::.:.::: ::::::.:..: .: ::..::. :.:.:. :::::.:: ..
CCDS10 TNSDMQILTASGDGTCALWDVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKA
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 KLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDN
.::.:.:.: :.: : ::::.: ..:.: :::.:::::::::.:::::.:. .::...
CCDS10 MVWDMRSGQCVQAFETHESDINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKES
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 IICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVA
:: : .:: :: :::::.:::.:.. ::::.:::.:...: ::.:::: : :. :: :
CCDS10 IIFGASSVDFSLSGRLLFAGYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFC
330 340 350 360 370 380
330 340
pF1KB6 TGSWDSFLRIWN
.:::: ::.:
CCDS10 SGSWDHTLRVWA
390
>>CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 (521 aa)
initn: 510 init1: 254 opt: 421 Z-score: 398.4 bits: 82.7 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 422; 29.2% identity (59.1% similar) in 298 aa overlap (62-339:237-518)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 QITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMH
:.. .:..:..: .: .:. : .:
CCDS59 TSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLH
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130
pF1KB6 AIPLRSSWVMTCAYAPSG---------NYVACGGLDNICSIYNLKTRE------GN-VRV
.. ... : . .. :.. : ..:.. :. ....: . : :. :::
CCDS59 TLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAA-DGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRV
270 280 290 300 310 320
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 SRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPD
.: . .: ::: :. : . :::.:. .. ::: :..... :
CCDS59 ARVMWHPSG-----RFLG-----TTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQD
330 340 350 360 370
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 MRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDL
.:. :: ...::.: : : . . ::...: ...: :::: .:::: : ::...::
CCDS59 GSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDL
380 390 400 410 420 430
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 RADQELLLYS---HDNIICGITSVAFSK-SGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGH
: :. .:. :.:.. : : : : .::.: : . ..: . .::::
CCDS59 R--QRRCVYTIPAHQNLVTG---VKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGH
440 450 460 470 480 490
320 330 340
pF1KB6 DNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
...: : ...::. .:: :.: ...:
CCDS59 EGKVMGLDISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE
500 510 520
>>CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 (522 aa)
initn: 510 init1: 254 opt: 421 Z-score: 398.4 bits: 82.7 E(32554): 7.2e-16
Smith-Waterman score: 422; 29.2% identity (59.1% similar) in 298 aa overlap (62-339:238-519)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 QITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMH
:.. .:..:..: .: .:. : .:
CCDS67 TSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLH
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130
pF1KB6 AIPLRSSWVMTCAYAPSG---------NYVACGGLDNICSIYNLKTRE------GN-VRV
.. ... : . .. :.. : ..:.. :. ....: . : :. :::
CCDS67 TLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAA-DGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRV
270 280 290 300 310 320
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 SRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPD
.: . .: ::: :. : . :::.:. .. ::: :..... :
CCDS67 ARVMWHPSG-----RFLG-----TTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQD
330 340 350 360 370
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 MRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDL
.:. :: ...::.: : : . . ::...: ...: :::: .:::: : ::...::
CCDS67 GSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDL
380 390 400 410 420 430
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 RADQELLLYS---HDNIICGITSVAFSK-SGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGH
: :. .:. :.:.. : : : : .::.: : . ..: . .::::
CCDS67 R--QRRCVYTIPAHQNLVTG---VKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGH
440 450 460 470 480 490
320 330 340
pF1KB6 DNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
...: : ...::. .:: :.: ...:
CCDS67 EGKVMGLDISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE
500 510 520
340 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:06:06 2016 done: Sat Nov 5 20:06:06 2016
Total Scan time: 2.340 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]