Result of FASTA (omim) for
pF1KB6274
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6274, 697 aa
1>>>pF1KB6274 697 - 697 aa - 697 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3179+/-0.000542; mu= -14.2557+/- 0.033
mean_var=787.2317+/-169.926, 0's: 0 Z-trim(120.1): 1388 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.045711
statistics sampled from 32895 (34892) to 32895 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16
Scan time: 11.170
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002730 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C g ( 697) 4922 341.2 7.9e-93
NP_001303258 (OMIM: 176980,605361) protein kinase ( 710) 4917 340.9 1e-92
XP_016880329 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 1865 139.5 3.5e-32
XP_016880327 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 1865 139.5 3.5e-32
XP_016880328 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 1865 139.5 3.5e-32
NP_002728 (OMIM: 176960) protein kinase C alpha ty ( 672) 1866 139.7 3.6e-32
XP_016880326 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 621) 1865 139.6 3.6e-32
NP_002729 (OMIM: 176970) protein kinase C beta typ ( 673) 1864 139.5 4e-32
NP_997700 (OMIM: 176970) protein kinase C beta typ ( 671) 1775 133.7 2.3e-30
XP_016880330 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 324) 1634 123.9 9.6e-28
XP_016880325 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 645) 1595 121.8 8.4e-27
XP_011531285 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 436) 1366 106.4 2.4e-22
XP_006712113 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 460) 1366 106.5 2.5e-22
XP_011531284 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 497) 1366 106.5 2.6e-22
XP_016859978 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1366 106.6 2.8e-22
XP_016859980 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1366 106.6 2.8e-22
XP_011531282 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1366 106.6 2.8e-22
XP_016859979 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1366 106.6 2.8e-22
XP_011531283 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 587) 1366 106.6 2.8e-22
XP_016859976 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 623) 1366 106.6 2.9e-22
XP_011531280 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 623) 1366 106.6 2.9e-22
XP_016859977 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 623) 1366 106.6 2.9e-22
XP_016859975 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 641) 1366 106.7 3e-22
XP_011531273 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 641) 1366 106.7 3e-22
XP_011531277 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 641) 1366 106.7 3e-22
NP_005391 (OMIM: 176975) protein kinase C epsilon ( 737) 1366 106.8 3.2e-22
XP_005264485 (OMIM: 176975) PREDICTED: protein kin ( 737) 1366 106.8 3.2e-22
XP_016876947 (OMIM: 601367,605437) PREDICTED: prot ( 522) 1284 101.1 1.1e-20
XP_011535257 (OMIM: 601367,605437) PREDICTED: prot ( 603) 1284 101.2 1.2e-20
XP_011535256 (OMIM: 601367,605437) PREDICTED: prot ( 604) 1284 101.2 1.2e-20
NP_006246 (OMIM: 601367,605437) protein kinase C e ( 683) 1284 101.3 1.3e-20
NP_001310195 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 581) 1226 97.4 1.7e-19
NP_001269574 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 581) 1226 97.4 1.7e-19
XP_016871900 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 581) 1226 97.4 1.7e-19
NP_001269573 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 670) 1226 97.5 1.8e-19
XP_006717528 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 706) 1226 97.5 1.9e-19
NP_001310194 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 706) 1226 97.5 1.9e-19
NP_006248 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ty ( 706) 1226 97.5 1.9e-19
XP_016871899 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 706) 1226 97.5 1.9e-19
XP_005252553 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 740) 1226 97.5 1.9e-19
XP_006713322 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 676) 1219 97.0 2.5e-19
XP_016862345 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 676) 1219 97.0 2.5e-19
NP_997704 (OMIM: 176977,615559) protein kinase C d ( 676) 1219 97.0 2.5e-19
NP_001303256 (OMIM: 176977,615559) protein kinase ( 676) 1219 97.0 2.5e-19
XP_016862344 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 676) 1219 97.0 2.5e-19
NP_006245 (OMIM: 176977,615559) protein kinase C d ( 676) 1219 97.0 2.5e-19
XP_006713320 (OMIM: 176977,615559) PREDICTED: prot ( 692) 1219 97.0 2.6e-19
NP_001310196 (OMIM: 600448) protein kinase C theta ( 627) 1135 91.4 1.1e-17
XP_005252554 (OMIM: 600448) PREDICTED: protein kin ( 697) 1135 91.5 1.2e-17
NP_002732 (OMIM: 601032) serine/threonine-protein ( 942) 1118 90.6 3.1e-17
>>NP_002730 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C gamma (697 aa)
initn: 4922 init1: 4922 opt: 4922 Z-score: 1787.6 bits: 341.2 E(85289): 7.9e-93
Smith-Waterman score: 4922; 100.0% identity (100.0% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-697)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAGLGPGVGDSEGGPRPLFCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MAGLGPGVGDSEGGPRPLFCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADADNCSLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADADNCSLLQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYRD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 FGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 GPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB6 VLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
670 680 690
>>NP_001303258 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C ga (710 aa)
initn: 5139 init1: 4917 opt: 4917 Z-score: 1785.7 bits: 340.9 E(85289): 1e-92
Smith-Waterman score: 4917; 99.9% identity (100.0% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-697)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAGLGPGVGDSEGGPRPLFCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGLGPGVGDSEGGPRPLFCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADADNCSLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADADNCSLLQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYRD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 FGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 GPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB6 VLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_001 VLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVISCTPAFQLCPRGF
670 680 690 700 710
>>XP_016880329 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (586 aa)
initn: 2694 init1: 1553 opt: 1865 Z-score: 698.8 bits: 139.5 E(85289): 3.5e-32
Smith-Waterman score: 2996; 70.5% identity (89.4% similar) in 594 aa overlap (94-683:9-580)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYG
..:::.::::..:.:.::::::::::::::
XP_016 MLSVSSWDSNDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYG
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADE-IHVTVGEARN
:.::::::. :.::::..:: .::::::.::::.:::. : .: .::: .:::: .:.:
XP_016 LIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL--KAEVADEKLHVTVRDAKN
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRLSV
::::::::::::::::::::::.: .::::.:...:::: :::.:.:.:::.: .:::::
XP_016 LIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSV
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290
pF1KB6 EVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADAD---NCSLL
:.::::::.::::::..:::::::.: :..:::::::::::::::::. ..: : :
XP_016 EIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 QKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGK
:::: ....::... . ::: . .:. . :....::.:::::::
XP_016 QKFE----------KAKLGPAGNKVISPSEDRKQPSNNL-----DRVKLTDFNFLMVLGK
220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 GSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQ
:::::::::.:.:..::::::::::::..:::::.::.:::::::: . : ::::
XP_016 GSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPP-----FLTQ
270 280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 LHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYR
::: ::: ::::::::::.::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::..:::::
XP_016 LHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYR
320 330 340 350 360 370
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 DLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWW
::::::::::.::::::.:::::::... :.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWW
380 390 400 410 420 430
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLG
..:::::::::::::::::::.::::.:::..:.::::::.:::..:::..::::.::::
XP_016 AYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLG
440 450 460 470 480 490
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 SGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDR
::.:: .: :.::: ::::.:: :: :::.:. ::...:::::::::. :.:::::.
XP_016 CGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQ
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660 670 680 690
pF1KB6 LVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
::.:.:::.::.::.::::.::::
XP_016 LVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
560 570 580
>>XP_016880327 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (586 aa)
initn: 2694 init1: 1553 opt: 1865 Z-score: 698.8 bits: 139.5 E(85289): 3.5e-32
Smith-Waterman score: 2996; 70.5% identity (89.4% similar) in 594 aa overlap (94-683:9-580)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYG
..:::.::::..:.:.::::::::::::::
XP_016 MLSVSSWDSNDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYG
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130 140 150 160 170 180
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:.::::::. :.::::..:: .::::::.::::.:::. : .: .::: .:::: .:.:
XP_016 LIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL--KAEVADEKLHVTVRDAKN
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::::::::::::::::::::::.: .::::.:...:::: :::.:.:.:::.: .:::::
XP_016 LIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSV
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:.::::::.::::::..:::::::.: :..:::::::::::::::::. ..: : :
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pF1KB6 QKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGK
:::: ....::... . ::: . .:. . :....::.:::::::
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:::::::::.:.:..::::::::::::..:::::.::.:::::::: . : ::::
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::: ::: ::::::::::.::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::..:::::
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::::::::::.::::::.:::::::... :.:::::::::::::::::::::::::::::
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..:::::::::::::::::::.::::.:::..:.::::::.:::..:::..::::.::::
XP_016 AYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLG
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::.:: .: :.::: ::::.:: :: :::.:. ::...:::::::::. :.:::::.
XP_016 CGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQ
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pF1KB6 LVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
::.:.:::.::.::.::::.::::
XP_016 LVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
560 570 580
>>XP_016880328 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (586 aa)
initn: 2694 init1: 1553 opt: 1865 Z-score: 698.8 bits: 139.5 E(85289): 3.5e-32
Smith-Waterman score: 2996; 70.5% identity (89.4% similar) in 594 aa overlap (94-683:9-580)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYG
..:::.::::..:.:.::::::::::::::
XP_016 MLSVSSWDSNDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYG
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADE-IHVTVGEARN
:.::::::. :.::::..:: .::::::.::::.:::. : .: .::: .:::: .:.:
XP_016 LIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL--KAEVADEKLHVTVRDAKN
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pF1KB6 LIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRLSV
::::::::::::::::::::::.: .::::.:...:::: :::.:.:.:::.: .:::::
XP_016 LIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSV
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pF1KB6 EVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADAD---NCSLL
:.::::::.::::::..:::::::.: :..:::::::::::::::::. ..: : :
XP_016 EIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELR
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pF1KB6 QKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGK
:::: ....::... . ::: . .:. . :....::.:::::::
XP_016 QKFE----------KAKLGPAGNKVISPSEDRKQPSNNL-----DRVKLTDFNFLMVLGK
220 230 240 250 260
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pF1KB6 GSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQ
:::::::::.:.:..::::::::::::..:::::.::.:::::::: . : ::::
XP_016 GSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPP-----FLTQ
270 280 290 300 310
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pF1KB6 LHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYR
::: ::: ::::::::::.::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::..:::::
XP_016 LHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYR
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pF1KB6 DLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWW
::::::::::.::::::.:::::::... :.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWW
380 390 400 410 420 430
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pF1KB6 SFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLG
..:::::::::::::::::::.::::.:::..:.::::::.:::..:::..::::.::::
XP_016 AYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLG
440 450 460 470 480 490
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pF1KB6 SGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDR
::.:: .: :.::: ::::.:: :: :::.:. ::...:::::::::. :.:::::.
XP_016 CGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQ
500 510 520 530 540 550
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pF1KB6 LVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
::.:.:::.::.::.::::.::::
XP_016 LVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
560 570 580
>>NP_002728 (OMIM: 176960) protein kinase C alpha type [ (672 aa)
initn: 3193 init1: 1554 opt: 1866 Z-score: 698.5 bits: 139.7 E(85289): 3.6e-32
Smith-Waterman score: 3499; 71.4% identity (88.5% similar) in 689 aa overlap (1-683:1-666)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGLGPGVGDSEGGPRPL--FCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWG
:: . :: .:: .. : :::::::: :::::.::: :::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50
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pF1KB6 IGKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCG
.::::.::::: ::::.:::::::: :::: :::.:::::.::::..:.:.:::::::::
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pF1KB6 SLLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADE-IHVTV
::::::.::::::. :.::::..:: .::::::.::::.:::. : .: .::: .::::
NP_002 SLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL--KAEVADEKLHVTV
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pF1KB6 GEARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVE
.:.:::::::::::::::::::::::.: .::::.:...:::: :::.:.:.:::.: .
NP_002 RDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKD
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 RRLSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADAD---
::::::.::::::.::::::..:::::::.: :..:::::::::::::::::. ..:
NP_002 RRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEG
240 250 260 270 280 290
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: : :::: ....::... . ::: . .:. . :....::.::
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::::::::::::::.:.:..::::::::::::..:::::.::.:::::::: . :
NP_002 MVLGKGSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPP----
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pF1KB6 HFLTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQ
::::::: ::: ::::::::::.::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::..
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:::::::::::::::.::::::.:::::::... :.::::::::::::::::::::::::
NP_002 GIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGK
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pF1KB6 SVDWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHP
:::::..:::::::::::::::::::.::::.:::..:.::::::.:::.::::..::::
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pF1KB6 GKRLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPAL
.:::: ::.:: .: :.::: ::::.:: :: :::.:. ::...:::::::::. :.:
NP_002 AKRLGCGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVL
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pF1KB6 TPPDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
::::.::.:.:::.::.::.::::.::::
NP_002 TPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
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>>XP_016880326 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (621 aa)
initn: 2872 init1: 1553 opt: 1865 Z-score: 698.5 bits: 139.6 E(85289): 3.6e-32
Smith-Waterman score: 3178; 70.9% identity (89.1% similar) in 626 aa overlap (64-683:12-615)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 KSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGIGKQGLQC--QVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKG
:.: .:: ::::.:::::::: :::: ::
XP_016 MQPASANLQAPLSCSPHVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKG
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pF1KB6 PQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCG
:.:::::.::::..:.:.:::::::::::::::.::::::. :.::::..:: .::::::
XP_016 PDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCG
50 60 70 80 90 100
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pF1KB6 VDHTERRGRLQLEIRAPTADE-IHVTVGEARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQ
.::::.:::. : .: .::: .:::: .:.:::::::::::::::::::::::.: .::
XP_016 MDHTEKRGRIYL--KAEVADEKLHVTVRDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQ
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pF1KB6 KTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERRLSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAP
::.:...:::: :::.:.:.:::.: .::::::.::::::.::::::..:::::::.: :
XP_016 KTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMP
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pF1KB6 VDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADAD---NCSLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSP
..:::::::::::::::::. ..: : : :::: ....::... . ::
XP_016 ASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQKFE----------KAKLGPAGNKVISP
220 230 240 250 260
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pF1KB6 SPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMVLGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVI
: . .:. . :....::.::::::::::::::::.:.:..::::::::::::.
XP_016 SEDRKQPSNNL-----DRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVV
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pF1KB6 VQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHFLTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQ
.:::::.::.:::::::: .: ::::::: ::: ::::::::::.:::::::::
XP_016 IQDDDVECTMVEKRVLALL-----DKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQ
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pF1KB6 QLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGIIYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVF
:.::::::.:.::::::.:::::::..:::::::::::::::.::::::.:::::::...
XP_016 QVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMM
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pF1KB6 PGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAI
:.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::.::::.:
XP_016 DGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSI
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pF1KB6 MEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGKRLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEI
::..:.::::::.:::..:::..::::.:::: ::.:: .: :.::: ::::.:: ::
XP_016 MEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREI
500 510 520 530 540 550
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pF1KB6 PPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTPPDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARS
:::.:. ::...:::::::::. :.:::::.::.:.:::.::.::.::::.::::
XP_016 QPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQS
560 570 580 590 600 610
690
pF1KB6 PTSPVPVPVM
XP_016 AV
620
>>NP_002729 (OMIM: 176970) protein kinase C beta type is (673 aa)
initn: 3565 init1: 1536 opt: 1864 Z-score: 697.8 bits: 139.5 E(85289): 4e-32
Smith-Waterman score: 3396; 69.5% identity (86.3% similar) in 691 aa overlap (1-687:1-673)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGLGPGVGDSEGGPRPL-FCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGI
:: . : ::: . : :::::::: :::::.:::::::::::::::::::::::.
NP_002 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 GKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGS
::::.::::: ::::.:::::::: :::: ::: .::::.::::..:.::::::::::::
NP_002 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 LLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGE
:::::.::::::. : ::::.::: .::::::.::::::::. .. . : . : : .
NP_002 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDR-DVLIVLVRD
130 140 150 160 170
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pF1KB6 ARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERR
:.::.::::::::::::::::::::.. .::::.:.: .::: ::::: :.:: .: .::
NP_002 AKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRR
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 LSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPV---ADADNC
::::.:::: ::::::::..:::.::: :: ::::.:::.::::::.:::: .. :
NP_002 LSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 SLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMV
: :::: :.... ... .: . . : : : :....::.::::
NP_002 ELRQKFE----------RAKIS-QGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRD-RMKLTDFNFLMV
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 LGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHF
:::::::::::.::.:.:::::.:::::::..:::::.::.:::::::: :: .: :
NP_002 LGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLAL----PG-KPPF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 LTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGI
:::::: ::: ::::::::::.::::::::::.:.::::::.:::::::::::::...::
NP_002 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
:::::::::::::.::::::.::::::::.. :.::.:::::::::::::::::::::::
NP_002 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 DWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGK
:::.:::::::::::: ::.::::.::::.:::..:.::::.:.::::::::..::::::
NP_002 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 RLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTP
::: ::.:: :. :.:::.::::.::: :: ::..:. :::..::::.:::: :.:::
NP_002 RLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTP
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690
pF1KB6 PDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
::. :. .:::..:.::..:: .:..:...:
NP_002 PDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
650 660 670
>>NP_997700 (OMIM: 176970) protein kinase C beta type is (671 aa)
initn: 3330 init1: 1302 opt: 1775 Z-score: 666.1 bits: 133.7 E(85289): 2.3e-30
Smith-Waterman score: 3307; 69.1% identity (84.3% similar) in 686 aa overlap (1-681:1-668)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGLGPGVGDSEGGPRPL-FCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGI
:: . : ::: . : :::::::: :::::.:::::::::::::::::::::::.
NP_997 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGS
::::.::::: ::::.:::::::: :::: ::: .::::.::::..:.::::::::::::
NP_997 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGE
:::::.::::::. : ::::.::: .::::::.::::::::. .. . : . : : .
NP_997 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDR-DVLIVLVRD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERR
:.::.::::::::::::::::::::.. .::::.:.: .::: ::::: :.:: .: .::
NP_997 AKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPV---ADADNC
::::.:::: ::::::::..:::.::: :: ::::.:::.::::::.:::: .. :
NP_997 LSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 SLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMV
: :::: .. .: . .: . . : : : :....::.::::
NP_997 ELRQKFE--------RAKISQG---TKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRD-RMKLTDFNFLMV
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 LGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHF
:::::::::::.::.:.:::::.:::::::..:::::.::.:::::::: :: .: :
NP_997 LGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLAL----PG-KPPF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 LTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGI
:::::: ::: ::::::::::.::::::::::.:.::::::.:::::::::::::...::
NP_997 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
:::::::::::::.::::::.::::::::.. :.::.:::::::::::::::::::::::
NP_997 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 DWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGK
:::.:::::::::::: ::.::::.::::.:::..:.::::.:.::::::::..::::::
NP_997 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 RLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCG-RSGENFDKFFTRAAPALT
::: ::.:: :. :.:::.::::.::: :: ::..:. :. :::: ::: ::
NP_997 RLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVELT
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690
pF1KB6 PPDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
: :.: . ..:: .: ::.:.::.::
NP_997 PTDKLFIMNLDQNEFAGFSYTNPEFVINV
650 660 670
>>XP_016880330 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kinase (324 aa)
initn: 1742 init1: 917 opt: 1634 Z-score: 619.0 bits: 123.9 E(85289): 9.6e-28
Smith-Waterman score: 1634; 72.8% identity (88.7% similar) in 309 aa overlap (1-303:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAGLGPGVGDSEGGPRPL--FCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWG
:: . :: .:: .. : :::::::: :::::.::: :::::::::::::::::::
XP_016 MADVFPG-NDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 IGKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCG
.::::.::::: ::::.:::::::: :::: :::.:::::.::::..:.:.:::::::::
XP_016 FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 SLLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADE-IHVTV
::::::.::::::. :.::::..:: .::::::.::::.:::. : .: .::: .::::
XP_016 SLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL--KAEVADEKLHVTV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GEARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVE
.:.:::::::::::::::::::::::.: .::::.:...:::: :::.:.:.:::.: .
XP_016 RDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 RRLSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPVADAD---
::::::.::::::.::::::..:::::::.: :..:::::::::::::::::. ..:
XP_016 RRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 NCSLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFL
: : ::::
XP_016 NMELRQKFELRMQTWGTGQDHLLEPHP
300 310 320
697 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 14:30:49 2016 done: Sat Nov 5 14:30:51 2016
Total Scan time: 11.170 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]