Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6246, 680 aa
1>>>pF1KB6246 680 - 680 aa - 680 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0872+/-0.000911; mu= -0.6050+/- 0.055
mean_var=252.5215+/-50.267, 0's: 0 Z-trim(115.1): 88 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.080710
statistics sampled from 15589 (15677) to 15589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.785), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 4.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34447.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 ( 680) 4570 545.2 1.1e-154
CCDS34448.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 ( 678) 4544 542.2 9e-154
CCDS58839.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 676) 2382 290.5 5.4e-78
CCDS2914.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 677) 2366 288.6 2e-77
CCDS58837.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 679) 2300 280.9 4.1e-75
CCDS55154.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 732) 2189 268.0 3.4e-71
CCDS74963.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 577) 2175 266.3 8.6e-71
CCDS5760.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 715) 2176 266.5 9.4e-71
CCDS43635.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 740) 2176 266.5 9.7e-71
CCDS4856.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 ( 667) 2107 258.4 2.3e-68
CCDS74964.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 693) 2032 249.7 1e-65
CCDS58838.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 601) 1929 237.7 3.7e-62
CCDS5761.2 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 432) 1129 144.5 3.1e-34
CCDS48109.1 FOXP3 gene_id:50943|Hs108|chrX ( 396) 500 71.2 3.3e-12
CCDS14323.1 FOXP3 gene_id:50943|Hs108|chrX ( 431) 500 71.2 3.5e-12
>>CCDS34447.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 (680 aa)
initn: 4570 init1: 4570 opt: 4570 Z-score: 2890.5 bits: 545.2 E(32554): 1.1e-154
Smith-Waterman score: 4570; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LLHFQQQQALQVARQFLLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLHFQQQQALQVARQFLLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ILSPPQLQALLQQQQALMLQQLQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEALGNKQLAFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILSPPQLQALLQQQQALMLQQLQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEALGNKQLAFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AEDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AEDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 ERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PLRPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLRPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPS
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB6 ASGPPEDRDLEEELPGEELS
::::::::::::::::::::
CCDS34 ASGPPEDRDLEEELPGEELS
670 680
>>CCDS34448.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 (678 aa)
initn: 3683 init1: 3683 opt: 4544 Z-score: 2874.2 bits: 542.2 E(32554): 9e-154
Smith-Waterman score: 4544; 99.7% identity (99.7% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-678)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LLHFQQQQALQVARQFLLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLHFQQQQALQVARQFLLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ILSPPQLQALLQQQQALMLQQLQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEALGNKQLAFQ
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILSPPQLQALLQQQQALMLQ--QEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEALGNKQLAFQ
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AEDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AEDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKES
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 ERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PLRPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLRPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPS
600 610 620 630 640 650
670 680
pF1KB6 ASGPPEDRDLEEELPGEELS
::::::::::::::::::::
CCDS34 ASGPPEDRDLEEELPGEELS
660 670
>>CCDS58839.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 1653 init1: 832 opt: 2382 Z-score: 1513.7 bits: 290.5 E(32554): 5.4e-78
Smith-Waterman score: 2382; 57.5% identity (77.2% similar) in 701 aa overlap (1-679:1-675)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNG-EMSPA
:: ::..:: .. . ::: :::.. : :: ..... . ... :
CCDS58 MMQESGTETKSNGSAIQNG-----------SGGSNHLLECGGLREGRSNGETPAVDIGAA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ELLHFQQQQ--ALQVARQFLLQQ-----ASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQM
.: : :::: :::::::.:::: .:::.:: :: :: : .:::::::::.::.
CCDS58 DLAHAQQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQVSGLKSPKRND-KQPA--LQVPVSVAMMTPQV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 LTPQQMQQIL-----SPPQLQALLQQQQALMLQQ--LQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGK
.::::::::: :: :::.:::::::::::: :::.::::::::.:::: ::.:::
CCDS58 ITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 PQPKEA--LGNKQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVC
:::: ....::::::::::::::::::::.::::::...::.: . ::: : :. .
CCDS58 -QPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPLAQGMI-
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 PTDLPQLWKGEGAPGQPAEDSV--KQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQ
::.: :::: : . .. ::... .. .:::: : .... :: :.: .. :. :::
CCDS58 PTELQQLWK-EVTSAHTAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSS---APSKTSLIMNPHASTNGQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 PTVLTSRRDSSSHEETPGSHPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQ
.: : .:.: :::: : :::::::: :::::::..:::. .:.::::.:::::::::::
CCDS58 LSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHALDDRSTAQ
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 CRVQMQVVQQLEIQLAKESERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAA
::::::::::::.::::..:::::::.:::.. .::: :::: : .: ..:: ::.
CCDS58 CRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLV-SSVTLSK---SAS
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KB6 DSFPDGLVHPPTSAAAPVTPLR--PPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHE
.. :..: : ::. .::.::. : . ..:.: :: ::: :::. ::::..:::.:
CCDS58 EASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSDIAQNQE
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 FYKNADVRPPFTYASLIRQAILETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNL
:::::.:::::::::::::::::.:..:::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS58 FYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHNL
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 SLHKCFVRVENVKGAVWTVDEREYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGA-LNASYQAAL
::::::::::::::::::::: :.::::: :..:.:.:.::: :. .: . :::. ::..
CCDS58 SLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKISGNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQASM
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 AESSFPLLNSPGMLNPGSASSLLPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVK
::.:.:: .. .: :: . ..: ...... .: :: :.: : :: : : :.::
CCDS58 AENSIPLYTTASMGNP-TLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHVK
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680
pF1KB6 EEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPSASGPPEDRDLEEELPGEELS
::: . :: . : . . : : . .::: :.: .:..
CCDS58 EEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFD-HDRDYEDEPVNEDME
640 650 660 670
>>CCDS2914.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (677 aa)
initn: 1574 init1: 768 opt: 2366 Z-score: 1503.6 bits: 288.6 E(32554): 2e-77
Smith-Waterman score: 2370; 57.4% identity (77.1% similar) in 702 aa overlap (1-679:1-676)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNG-EMSPA
:: ::..:: .. . ::: :::.. : :: ..... . ... :
CCDS29 MMQESGTETKSNGSAIQNG-----------SGGSNHLLECGGLREGRSNGETPAVDIGAA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ELLHFQQQQ--ALQVARQFLLQQ-----ASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQM
.: : :::: :::::::.:::: .:::.:: :: :: : .:::::::::.::.
CCDS29 DLAHAQQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQVSGLKSPKRND-KQPA--LQVPVSVAMMTPQV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 LTPQQMQQIL-----SPPQLQALLQQQQALMLQQ--LQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGK
.::::::::: :: :::.:::::::::::: :::.::::::::.:::: ::.:::
CCDS29 ITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 PQPKEA--LGNKQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVC
:::: ....::::::::::::::::::::.::::::...::.: . ::: : :. .
CCDS29 -QPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPLAQGMI-
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 PTDLPQLWKGEGAPGQPAEDSV--KQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQ
::.: :::: : . .. ::... .. .:::: : .... :: :.: .. :. :::
CCDS29 PTELQQLWK-EVTSAHTAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSS---APSKTSLIMNPHASTNGQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 PTVLTSRRDSSSHEETPGSHPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQ
.: : .:.: :::: : :::::::: :::::::..:::. .:.::::.:::::::::::
CCDS29 LSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHALDDRSTAQ
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 CRVQMQVVQQLEIQLAKESERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAA
::::::::::::.::::..:::::::.:::.. .::: :::: : .: ..:: ::.
CCDS29 CRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLV-SSVTLSK---SAS
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KB6 DSFPDGLVHPPTSAAAPVTPLR--PPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISS-ELAQNH
.. :..: : ::. .::.::. : . ..:.: :: ::: :::. :::: ..:::.
CCDS29 EASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADIAQNQ
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 EFYKNADVRPPFTYASLIRQAILETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHN
::::::.:::::::::::::::::.:..:::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS29 EFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHN
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 LSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEREYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGA-LNASYQAA
:::::::::::::::::::::: :.::::: :..:.:.:.::: :. .: . :::. ::.
CCDS29 LSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKISGNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQAS
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 LAESSFPLLNSPGMLNPGSASSLLPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQV
.::.:.:: .. .: :: . ..: ...... .: :: :.: : :: : : :.:
CCDS29 MAENSIPLYTTASMGNP-TLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHV
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680
pF1KB6 KEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPSASGPPEDRDLEEELPGEELS
:::: . :: . : . . : : . .::: :.: .:..
CCDS29 KEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFD-HDRDYEDEPVNEDME
640 650 660 670
>>CCDS58837.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (679 aa)
initn: 1574 init1: 768 opt: 2300 Z-score: 1462.1 bits: 280.9 E(32554): 4.1e-75
Smith-Waterman score: 2300; 60.5% identity (79.6% similar) in 631 aa overlap (69-679:63-678)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 ASGTGREVTTGADSNGEMSPAELLHFQQQQALQVARQFLLQQ-----ASGLSSPGNNDSK
:::::::.:::: .:::.:: :: :
CCDS58 QKQPEPIYSKKTEIQRQTVRAPFAKLFIFSALQVARQLLLQQQQQQQVSGLKSPKRND-K
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140
pF1KB6 QSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQIL-----SPPQLQALLQQQQALMLQQ--LQEYY
: : .:::::::::.::..::::::::: :: :::.:::::::::::: :::.:
CCDS58 QPA--LQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFY
100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 KKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEA--LGNKQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVS
:::::::.:::: ::.::: :::: ....::::::::::::::::::::.::::::..
CCDS58 KKQQEQLQLQLLQQQHAGK-QPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLT
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 LQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQPAEDSV--KQEGLDLTGTAATATSF
.::.: . ::: : :. . ::.: :::: : . .. ::... .. .:::: .: .:
CCDS58 IQPGQPALPLQPLAQGMI-PTELQQLWK-EVTSAHTAEETTGNNHSSLDLT---TTCVSS
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 AAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGSHPLYGHGECKWPGCETLCEDLG
.:: :.: .. :. ::: .: : .:.: :::: : :::::::: :::::::..:::.
CCDS58 SAPSKTSLIMNPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQ
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 QFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKESERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQ
.:.::::.:::::::::::::::::::::::.::::..:::::::.:::.. .::: :
CCDS58 SFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQ
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 PLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVTPLR--PPGLGSASLHGGGPARR
::: : .: ..:: ::... :..: : ::. .::.::. : . ..:.: :: ::
CCDS58 PLNLV-SSVTLSK---SASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRR
390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KB6 RSSDKFCSPISS-ELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAILETPDRQLTLNEIYNWFTR
: :::. :::: ..:::.::::::.:::::::::::::::::.:..:::::::::::::
CCDS58 RYSDKYNVPISSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTR
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 MFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEREYQKRRPPKMTGSPTLVK
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::: :..:.:.:.:
CCDS58 MFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKISGNPSLIK
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 NMISGLSYGA-LNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSLLPLSHDDVGAPVEPLPSN
:: :. .: . :::. ::..::.:.:: .. .: :: . ..: ...... .: ::
CCDS58 NMQSSHAYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNP-TLGNLASAIREELNGAMEHTNSN
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 GSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPSASGPPEDRDLEEELPGEE
:.: : :: : : :.::::: . :: . : . . : : . .::: :.: .:.
CCDS58 ESDSSPGRSPMQAVHPVHVKEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFD-HDRDYEDEPVNED
620 630 640 650 660 670
680
pF1KB6 LS
.
CCDS58 ME
>>CCDS55154.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 (732 aa)
initn: 2049 init1: 1041 opt: 2189 Z-score: 1391.7 bits: 268.0 E(32554): 3.4e-71
Smith-Waterman score: 2413; 56.8% identity (75.1% similar) in 710 aa overlap (44-679:32-731)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 PSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAELLHFQQQQALQVA
:. ...:...:.: .::::.:::::::.:
CCDS55 MQESATETISNSSMNQNGMSTLSSQLDAGSRDGRSSGDTSSEVSTVELLHLQQQQALQAA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KB6 RQFLLQQ-ASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQIL-----SPPQL
::.:::: .:::.:: ..:... .:::::::::.::..::::::::: :: ::
CCDS55 RQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQR---PLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KB6 QALLQQQQALMLQQ-------------------LQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQA-----
:::::::::.:::: :::.::::::::::::: :::
CCDS55 QALLQQQQAVMLQQDFLDSGLENFRAALEKNQQLQEFYKKQQEQLHLQLLQQQQQQQQQQ
120 130 140 150 160 170
170 180
pF1KB6 --------------------------------GKP--------QPKEALGNKQLAFQQQL
:: : .. :. .::.:::::
CCDS55 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHPGKQAKEQQQQQQQQQQLAAQQLVFQQQL
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LQMQQLQQQ-HLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQPAE
::::::::: :::.::::::.:. :.::. :.:.::::.. :... :::: . . .
CCDS55 LQMQQLQQQQHLLSLQRQGLISIPPGQAALPVQSLPQAGLSPAEIQQLWKEVTGVHSMED
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGSHP
...:. ::::: . ...:. . :.:::..::.. ::: .::..:::::::::: .::
CCDS55 NGIKHGGLDLTTNNSSSTTSSNTSKASPPITHHSIVNGQSSVLSARRDSSSHEETGASHT
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKESER
::::: :::::::..:::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::.:: ::
CCDS55 LYGHGVCKWPGCESICEDFGQFLKHLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERER
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVTPL
:::::.::::::::::: .::: : .: ..:: . .. :..: . ::. .:::::.
CCDS55 LQAMMTHLHMRPSEPKPSPKPLNLV-SSVTMSK---NMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTPI
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 R--PPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
: . ::. . : ::: :::. :.:::.: :.:::::::::::::::.::::::
CCDS55 TQGPSVITPASVPNVGAIRRRHSDKYNIPMSSEIAPNYEFYKNADVRPPFTYATLIRQAI
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
.:. ::::::::::.:::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590
pF1KB6 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGA-LNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASS
:::::: :.:::::::::. ..:.::: :::: ::::::::.:::..::..: .: :.
CCDS55 VEYQKRRSQKITGSPTLVKNIPTSLGYGAALNASLQAALAESSLPLLSNPGLINNAS-SG
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 LLPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNP
:: :.:... .. . :::.::: :: . :...:::::. ::.. : . . :
CCDS55 LLQAVHEDLNGSLDHIDSNGNSSPG-CSPQPHIHSIHVKEEPVIAEDEDCPMSLVTTANH
660 670 680 690 700 710
660 670 680
pF1KB6 SASGPPEDRDLEEELPGEELS
: .::..::: .:.:
CCDS55 SPELE-DDREIEEEPLSEDLE
720 730
>>CCDS74963.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (577 aa)
initn: 1574 init1: 768 opt: 2175 Z-score: 1384.4 bits: 266.3 E(32554): 8.6e-71
Smith-Waterman score: 2175; 60.2% identity (79.9% similar) in 588 aa overlap (107-679:1-576)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 LLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQIL-----SPPQLQALL
::.::..::::::::: :: :::.::
CCDS74 MMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLL
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KB6 QQQQALMLQQ--LQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEA--LGNKQLAFQQQLLQMQ
:::::::::: :::.::::::::.:::: ::.::: :::: ....::::::::::::
CCDS74 QQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGK-QPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQ
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQPAEDSV--
::::::::.::::::...::.: . ::: : :. . ::.: :::: : . .. ::...
CCDS74 QLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPLAQGMI-PTELQQLWK-EVTSAHTAEETTGN
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGSHPLYG
.. .:::: .: .: .:: :.: .. :. ::: .: : .:.: :::: : ::::::
CCDS74 NHSSLDLT---TTCVSSSAPSKTSLIMNPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYG
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKESERLQA
:: :::::::..:::. .:.::::.:::::::::::::::::::::::.::::..:::::
CCDS74 HGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQA
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 MMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVTPLR--
::.:::.. .::: :::: : .: ..:: ::... :..: : ::. .::.::.
CCDS74 MMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLV-SSVTLSK---SASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQG
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISS-ELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAILE
: . ..:.: :: ::: :::. :::: ..:::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS74 PSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILE
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 TPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDERE
.:..:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS74 SPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVE
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 YQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGA-LNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSLL
.::::: :..:.:.:.::: :. .: . :::. ::..::.:.:: .. .: :: . ..:
CCDS74 FQKRRPQKISGNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNP-TLGNLA
450 460 470 480 490
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPSA
...... .: :: :.: : :: : : :.::::: . :: . : . . : :
CCDS74 SAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHVKEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSP
500 510 520 530 540 550
670 680
pF1KB6 SGPPEDRDLEEELPGEELS
. .::: :.: .:..
CCDS74 DFD-HDRDYEDEPVNEDME
560 570
>>CCDS5760.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 (715 aa)
initn: 2060 init1: 1041 opt: 2176 Z-score: 1383.7 bits: 266.5 E(32554): 9.4e-71
Smith-Waterman score: 2480; 56.8% identity (75.9% similar) in 729 aa overlap (8-679:8-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
::: .. .:::...::.: :..: :. ...:...:.: .:
CCDS57 MMQESATETISNSSMNQNGMSTLSSQLDAGS------------RDGRSSGDTSSEVSTVE
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 LLHFQQQQALQVARQFLLQQ-ASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQ
:::.:::::::.:::.:::: .:::.:: ..:... .:::::::::.::..::::::
CCDS57 LLHLQQQQALQAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRP---LQVPVSVAMMTPQVITPQQMQ
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 QIL-----SPPQLQALLQQQQALMLQQ--LQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQA---------
::: :: :::::::::::.:::: :::.::::::::::::: :::
CCDS57 QILQQQVLSPQQLQALLQQQQAVMLQQQQLQEFYKKQQEQLHLQLLQQQQQQQQQQQQQQ
110 120 130 140 150 160
170 180
pF1KB6 ----------------------------GKP--------QPKEALGNKQLAFQQQLLQMQ
:: : .. :. .::.:::::::::
CCDS57 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHPGKQAKEQQQQQQQQQQLAAQQLVFQQQLLQMQ
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QLQQQ-HLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQPAEDSVK
::::: :::.::::::.:. :.::. :.:.::::.. :... :::: . . ....:
CCDS57 QLQQQQHLLSLQRQGLISIPPGQAALPVQSLPQAGLSPAEIQQLWKEVTGVHSMEDNGIK
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGSHPLYGH
. ::::: . ...:. . :.:::..::.. ::: .::..:::::::::: .:: ::::
CCDS57 HGGLDLTTNNSSSTTSSNTSKASPPITHHSIVNGQSSVLSARRDSSSHEETGASHTLYGH
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 GECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKESERLQAM
: :::::::..:::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::
CCDS57 GVCKWPGCESICEDFGQFLKHLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERERLQAM
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 MAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVTPLR--P
:.::::::::::: .::: : .: ..:: . .. :..: . ::. .:::::. :
CCDS57 MTHLHMRPSEPKPSPKPLNLV-SSVTMSK---NMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTPITQGP
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAILETP
. ::. . : ::: :::. :.:::.: :.:::::::::::::::.::::::.:.
CCDS57 SVITPASVPNVGAIRRRHSDKYNIPMSSEIAPNYEFYKNADVRPPFTYATLIRQAIMESS
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEREYQ
::::::::::.:::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS57 DRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQ
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 KRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGA-LNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSLLPL
::: :.:::::::::. ..:.::: :::: ::::::::.:::..::..: .: :.::
CCDS57 KRRSQKITGSPTLVKNIPTSLGYGAALNASLQAALAESSLPLLSNPGLINNAS-SGLLQA
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 SHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPSASG
:.:... .. . :::.::: :: . :...:::::. ::.. : . . : :
CCDS57 VHEDLNGSLDHIDSNGNSSPG-CSPQPHIHSIHVKEEPVIAEDEDCPMSLVTTANHSPEL
650 660 670 680 690
670 680
pF1KB6 PPEDRDLEEELPGEELS
.::..::: .:.:
CCDS57 E-DDREIEEEPLSEDLE
700 710
>>CCDS43635.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 (740 aa)
initn: 2060 init1: 1041 opt: 2176 Z-score: 1383.5 bits: 266.5 E(32554): 9.7e-71
Smith-Waterman score: 2394; 56.4% identity (74.7% similar) in 711 aa overlap (48-679:36-739)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 NGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAELLHFQQQQALQVARQFL
...:...:.: .::::.:::::::.:::.:
CCDS43 ATETISNSSMNQNGMSTLSSQLDAGSRDGRSSGDTSSEVSTVELLHLQQQQALQAARQLL
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110
pF1KB6 LQQ-ASGLSSPGNNDSKQSASAV----------------------QVPVSVAMMSPQMLT
::: .:::.:: ..:... . . ::::::::.::..:
CCDS43 LQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQELLPETKLCICGHSSGDGHPHNTFAVPVSVAMMTPQVIT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB6 PQQMQQIL-----SPPQLQALLQQQQALMLQQ--LQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQA----
:::::::: :: :::::::::::.:::: :::.::::::::::::: :::
CCDS43 PQQMQQILQQQVLSPQQLQALLQQQQAVMLQQQQLQEFYKKQQEQLHLQLLQQQQQQQQQ
130 140 150 160 170 180
170 180
pF1KB6 ---------------------------------GKP--------QPKEALGNKQLAFQQQ
:: : .. :. .::.::::
CCDS43 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHPGKQAKEQQQQQQQQQQLAAQQLVFQQQ
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LLQMQQLQQQ-HLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQPA
:::::::::: :::.::::::.:. :.::. :.:.::::.. :... :::: . .
CCDS43 LLQMQQLQQQQHLLSLQRQGLISIPPGQAALPVQSLPQAGLSPAEIQQLWKEVTGVHSME
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGSH
....:. ::::: . ...:. . :.:::..::.. ::: .::..:::::::::: .::
CCDS43 DNGIKHGGLDLTTNNSSSTTSSNTSKASPPITHHSIVNGQSSVLSARRDSSSHEETGASH
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKESE
::::: :::::::..:::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::.:: :
CCDS43 TLYGHGVCKWPGCESICEDFGQFLKHLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERE
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVTP
::::::.::::::::::: .::: : .: ..:: . .. :..: . ::. .:::::
CCDS43 RLQAMMTHLHMRPSEPKPSPKPLNLV-SSVTMSK---NMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTP
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470
pF1KB6 LR--PPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQA
. : . ::. . : ::: :::. :.:::.: :.:::::::::::::::.:::::
CCDS43 ITQGPSVITPASVPNVGAIRRRHSDKYNIPMSSEIAPNYEFYKNADVRPPFTYATLIRQA
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 ILETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVD
:.:. ::::::::::.:::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVD
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 EREYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGA-LNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSAS
: :::::: :.:::::::::. ..:.::: :::: ::::::::.:::..::..: .: :
CCDS43 EVEYQKRRSQKITGSPTLVKNIPTSLGYGAALNASLQAALAESSLPLLSNPGLINNAS-S
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 SLLPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPN
.:: :.:... .. . :::.::: :: . :...:::::. ::.. : . . :
CCDS43 GLLQAVHEDLNGSLDHIDSNGNSSPG-CSPQPHIHSIHVKEEPVIAEDEDCPMSLVTTAN
670 680 690 700 710
660 670 680
pF1KB6 PSASGPPEDRDLEEELPGEELS
: .::..::: .:.:
CCDS43 HSPELE-DDREIEEEPLSEDLE
720 730 740
>>CCDS4856.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 (667 aa)
initn: 3336 init1: 1938 opt: 2107 Z-score: 1340.7 bits: 258.4 E(32554): 2.3e-68
Smith-Waterman score: 4440; 98.1% identity (98.1% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-667)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MMVESASETIRSAPSGQNGVGSLSGQADGSSGGATGTTASGTGREVTTGADSNGEMSPAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LLHFQQQQALQVARQFLLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LLHFQQQQALQVARQFLLQQASGLSSPGNNDSKQSASAVQVPVSVAMMSPQMLTPQQMQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ILSPPQLQALLQQQQALMLQQLQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEALGNKQLAFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ILSPPQLQALLQQQQALMLQQLQEYYKKQQEQLHLQLLTQQQAGKPQPKEALGNKQLAFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQAAVCPTDLPQLWKGEGAPGQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS48 QQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQASGPLQTLPQA-VCPTDLPQLWKGEGAPGQP
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AEDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AEDSVKQEGLDLTGTAATATSFAAPPKVSPPLSHHTLPNGQPTVLTSRRDSSSHEETPGS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIKHLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKES
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 ERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPLNPVPGSSSFSKVTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVT
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQP------------VTVSAADSFPDGLVHPPTSAAAPVT
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PLRPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLRPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQNHEFYKNADVRPPFTYASLIRQAI
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 REYQKRRPPKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQAALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSL
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQVQVKEEPAEAEEDRQPGPPLGAPNPS
590 600 610 620 630 640
670 680
pF1KB6 ASGPPEDRDLEEELPGEELS
::::::::::::::::::::
CCDS48 ASGPPEDRDLEEELPGEELS
650 660
680 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 14:27:05 2016 done: Sat Nov 5 14:27:05 2016
Total Scan time: 4.270 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]