Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6194
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6194, 706 aa
1>>>pF1KB6194 706 - 706 aa - 706 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9099+/-0.00139; mu= 2.1763+/- 0.081
mean_var=293.8676+/-65.859, 0's: 0 Z-trim(107.7): 729 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.074817
statistics sampled from 8884 (9729) to 8884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 4935 547.6 2.3e-155
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 4071 454.3 2.4e-127
CCDS55701.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 643) 3837 429.1 1e-119
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 1718 200.4 7.5e-51
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 1318 157.2 7.4e-38
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 1317 157.1 8.5e-38
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 1311 156.4 1.3e-37
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 1294 154.6 4.4e-37
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 1275 152.6 1.8e-36
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1226 147.3 7.4e-35
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1137 137.8 7e-32
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1137 137.8 7.2e-32
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1119 135.9 2.7e-31
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1119 135.9 2.7e-31
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 1014 124.2 4.4e-28
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 1008 123.6 6.8e-28
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 1002 122.9 1.1e-27
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 986 121.2 3.6e-27
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 990 121.9 4e-27
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 919 113.9 5.1e-25
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 919 113.9 5.2e-25
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 919 113.9 5.3e-25
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 919 114.0 5.8e-25
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 892 110.9 3.4e-24
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 892 111.0 3.8e-24
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 893 111.2 3.9e-24
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 883 110.1 7.7e-24
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 883 110.1 7.9e-24
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 883 110.1 8.5e-24
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 878 109.8 1.6e-23
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 864 108.2 4.4e-23
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 864 108.2 4.4e-23
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 864 108.3 4.5e-23
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 853 107.0 9.9e-23
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 853 107.0 1e-22
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 846 106.1 1.3e-22
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 844 106.1 2e-22
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 835 104.8 2.6e-22
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 835 104.9 2.9e-22
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 838 105.4 3.1e-22
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 835 105.0 3.3e-22
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 837 105.3 3.4e-22
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 801 101.3 4.3e-21
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 794 100.5 6.4e-21
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 398) 779 98.8 1.7e-20
CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX ( 358) 777 98.5 1.8e-20
CCDS83147.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 644) 779 99.0 2.3e-20
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 772 97.9 2.6e-20
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 772 98.0 2.6e-20
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 772 98.0 2.7e-20
>>CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (706 aa)
initn: 4935 init1: 4935 opt: 4935 Z-score: 2902.9 bits: 547.6 E(32554): 2.3e-155
Smith-Waterman score: 4935; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYPPWDSTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYPPWDSTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 YFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 WGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 EPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 ATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 GTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 WLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 WLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB6 CSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 CSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
670 680 690 700
>>CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (581 aa)
initn: 4071 init1: 4071 opt: 4071 Z-score: 2399.9 bits: 454.3 E(32554): 2.4e-127
Smith-Waterman score: 4071; 100.0% identity (100.0% similar) in 580 aa overlap (127-706:2-581)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 RKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNARYFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHH
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINS
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 RETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTK
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTP
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 GKREPQGISWESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GKREPQGISWESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFL
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 AEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFF
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 VMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDG
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 HIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQ
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 SPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFRE
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 INWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 INWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSF
520 530 540 550 560 570
700
pF1KB6 MNPGMERLIS
::::::::::
CCDS60 MNPGMERLIS
580
>>CCDS55701.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (643 aa)
initn: 3981 init1: 3837 opt: 3837 Z-score: 2262.8 bits: 429.1 E(32554): 1e-119
Smith-Waterman score: 4351; 91.1% identity (91.1% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-643)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYPPWDSTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYPPWDSTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 ATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 GTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPR
:::::::::
CCDS55 GTPDYIAPE---------------------------------------------------
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 WLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ------------LFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFD
550 560 570 580 590
670 680 690 700
pF1KB6 CSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
600 610 620 630 640
>>CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 3221 init1: 1707 opt: 1718 Z-score: 1026.5 bits: 200.4 E(32554): 7.5e-51
Smith-Waterman score: 3055; 63.0% identity (82.8% similar) in 705 aa overlap (1-705:1-674)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYPPWDSTF
:.:::::...... :: :. . :: .:.::: .:: . .: :. .:::::::: : :::
CCDS28 MAPFLRIAFNSYELGSLQA-EDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSTF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNAR
:::: .:::.::.. . .::.:: . :::::.:::::.:.::.:.::...::...
CCDS28 DAHIYEGRVIQIVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQ
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 YFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFV
:::: : :. . : :. : .:::::::::.:..: ::: :::: ::::::::..::
CCDS28 YFLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 WGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYK
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CCDS28 WGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYM
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pF1KB6 SPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQ
:::::.:::.:::::..:::::. :::::::.:. ::::::::::::.:::: .. ::.
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240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 ARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLP
: : ... : :: : : .. :.. :. :. . ..
CCDS28 AS--RRSDSASSE-PVGI----------------YQGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIW
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pF1KB6 EPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDD
: . : .:..::.::.:::::::::.:.:.: ...::::::::::::.::
CCDS28 EG---------SSKCNINNFIFHKVLGKGSFGKVLLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDD
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::::::::::::.:: :.:::::..::::::..::::::.:::::::::::. .:.: :
CCDS28 DVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYR
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::::::::. ::::::::::.::::::::.:::.:::::::::::::::..:.....:::
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::::::::::: : ::. :::::::::::::::::::::::.::.:::.:::.:.: :::
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:. ::.::.: ::: ::: ::::: :.:. ::.:. ::: ::.....:::::::::: :
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CCDS28 YSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQSAFAGFSFVNPKFEHLLED
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CCDS10 WAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRL
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CCDS10 GCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVELTPT
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CCDS10 DKLFIMNLDQNEFAGFSYTNPEFVINV
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CCDS18 AWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYD-DFVANCTIQFEELLQNGSRH---FEDWIDL
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.:.::. . ....: . :: .: . . ..:.::... .::.:. :.: :
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. . .:..:: . : . . .. : .. . .: : : .. : : :: :
CCDS18 DARGIAKVLADLGVTPDK--ITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPC
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340 350 360 370 380
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.: . .: .: : . :. .: : : : . .: ...: . :
CCDS18 DQEIKELENNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDGQLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIK
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390 400 410 420 430 440
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.:::::::::.:::.: .. .:.:.:::::.:.::::.:::.:::.:.:: .::.::..
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CCDS18 YCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRD
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CCDS18 LKLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWA
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CCDS18 LGVLMYEMMAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGC
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630 640 650 660 670
pF1KB6 ----RGD--IRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFA
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CCDS18 VASQNGEDAIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLV
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680 690 700
pF1KB6 DRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
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CCDS18 DEAIVKQINQEEFKGFSYFGEDLMP
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pF1KB6 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYP
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CCDS97 YLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQV---RVGQTSTKQK-TNKP
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pF1KB6 PWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKN---VD-LISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELK
.. : :... : ... : .. : .... :... : : . : :..:.
CCDS97 TYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELL-RTTGASDTFEGWVDLE
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pF1KB6 PQGRMLMNARYFLEMSDTKDMNEFETEGFFA--LHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFP
:.:.... . .. . .. . .: ..:. :... .::... :.: ::..
CCDS97 PEGKVFV----VITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLR
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pF1KB6 QPTFCSVCHEFVWGL-NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCT-GSAINSRETMFHKERF
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CCDS97 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
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pF1KB6 KIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK
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CCDS97 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
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pF1KB6 LMAEALAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISW
.:..:: . : . : .. .. ... ... ...: .::.
CCDS97 ELAKTLAGM--GLQPGNISPTSKLVSRS--------TLRRQGKE------SSKEGNGIGV
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pF1KB6 ESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFF
.: . .: :..: . ..:::::::::.::. :.:....
CCDS97 NS-----------------------SNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLY
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pF1KB6 AIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDL
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CCDS97 AVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDL
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pF1KB6 MYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMC
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CCDS97 MFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMC
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pF1KB6 KENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEE
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CCDS97 KEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDD
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pF1KB6 LFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLG--VRGD---IRQHPLFREINWEE
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CCDS97 LFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQ
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pF1KB6 LERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGM
:....:.:::::..:: : :::: .:..:.: :. :.. . ..:. :::::...: .
CCDS97 LNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPEL
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pF1KB6 ERLIS
.
CCDS97 QP
>>CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 (672 aa)
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CCDS11 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCS
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pF1KB6 VCHEFVWGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRF
: .:.::..:::.::. : ..::.: . : .: : : .. .: : : :.:
CCDS11 HCTDFIWGFGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPG-ADKGPDT--DDPRSK----HKF
60 70 80 90 100
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pF1KB6 KVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK-------L
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CCDS11 KIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL
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pF1KB6 MAEA-----------------------------LAMI-----ESTQQARCLRDTEQ----
::. : .: :: :... .:.: .
CCDS11 KAEVADEKLHVTVRDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWN
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:. : ::: . .:. .. .:. : . .:
CCDS11 ESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGE
230 240 250 260 270 280
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CCDS12 LQLEIRAPTADEIHVTVGEARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]