Result of FASTA (omim) for
pF1KB6139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6139, 593 aa
1>>>pF1KB6139 593 - 593 aa - 593 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8250+/-0.000438; mu= 16.5776+/- 0.027
mean_var=84.3322+/-16.081, 0's: 0 Z-trim(111.6): 17 B-trim: 106 in 1/51
Lambda= 0.139662
statistics sampled from 20174 (20189) to 20174 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 9.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008880 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding p ( 593) 3856 787.4 0
NP_001120868 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-bindin ( 590) 3823 780.8 0
NP_001258963 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-bindin ( 604) 3329 681.3 2.5e-195
XP_011526512 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: synt ( 597) 2935 601.9 2e-171
XP_011526514 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: synt ( 439) 2688 552.0 1.5e-156
NP_001027392 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-bindin ( 594) 2558 525.9 1.5e-148
NP_003156 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-binding p ( 603) 2546 523.5 7.9e-148
NP_009200 (OMIM: 608339) syntaxin-binding protein ( 592) 1791 371.4 4.8e-102
XP_016855653 (OMIM: 610035,615285) PREDICTED: vacu ( 503) 319 74.7 8.1e-13
NP_001266283 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protei ( 534) 319 74.7 8.5e-13
NP_009190 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protein s ( 570) 319 74.8 9e-13
NP_001266284 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protei ( 447) 309 72.7 3e-12
NP_001266282 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protei ( 538) 282 67.3 1.5e-10
>>NP_008880 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding prote (593 aa)
initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856 Z-score: 4201.6 bits: 787.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3856; 99.8% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVYVMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_008 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVYVMG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB6 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
550 560 570 580 590
>>NP_001120868 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding pr (590 aa)
initn: 3312 init1: 3312 opt: 3823 Z-score: 4165.7 bits: 780.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3823; 99.3% identity (99.5% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEK---ALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVYVMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVYVMG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB6 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
540 550 560 570 580 590
>>NP_001258963 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding pr (604 aa)
initn: 3329 init1: 3329 opt: 3329 Z-score: 3627.6 bits: 681.3 E(85289): 2.5e-195
Smith-Waterman score: 3824; 98.0% identity (98.2% similar) in 604 aa overlap (1-593:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEK-----------SVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDT
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKAQAQRVIHLPQSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 CPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 EVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 ELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 ADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 YILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPT
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 YQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 YQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEAR
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 AGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLED
550 560 570 580 590 600
590
pF1KB6 IALP
::::
NP_001 IALP
>>XP_011526512 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: syntaxin (597 aa)
initn: 2934 init1: 2934 opt: 2935 Z-score: 3198.7 bits: 601.9 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 2935; 98.7% identity (98.9% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::. : : :
XP_011 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGALTPSPSLPHPSSISLCTVSPYLSLSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVYVMG
XP_011 FSLPSPFSLFSVLLPSPLRPPSVPIFLSLFPASSLVSLFAFILCLTASYLFAYLCLCLCL
490 500 510 520 530 540
>>XP_011526514 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: syntaxin (439 aa)
initn: 2688 init1: 2688 opt: 2688 Z-score: 2931.7 bits: 552.0 E(85289): 1.5e-156
Smith-Waterman score: 2688; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNATPLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
XP_011 PGTLLHWLGDSSTEVRAPC
430
>>NP_001027392 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-binding pr (594 aa)
initn: 2502 init1: 1416 opt: 2558 Z-score: 2788.2 bits: 525.9 E(85289): 1.5e-148
Smith-Waterman score: 2558; 63.5% identity (86.0% similar) in 594 aa overlap (1-591:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
NP_001 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
NP_001 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
NP_001 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
NP_001 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
NP_001 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
NP_001 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
NP_001 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
NP_001 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVY
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
NP_001 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.: :.:.
NP_001 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
550 560 570 580 590
>>NP_003156 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-binding prote (603 aa)
initn: 2497 init1: 1416 opt: 2546 Z-score: 2775.0 bits: 523.5 E(85289): 7.9e-148
Smith-Waterman score: 2546; 63.9% identity (86.2% similar) in 587 aa overlap (1-584:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
NP_003 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
NP_003 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
NP_003 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
NP_003 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
NP_003 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
NP_003 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
NP_003 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
NP_003 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVY
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
NP_003 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::::.:: ::. :
NP_003 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPTKFLMDLRHPDFRESSRVSFEDQA
550 560 570 580 590
NP_003 PTME
600
>>NP_009200 (OMIM: 608339) syntaxin-binding protein 3 [H (592 aa)
initn: 1442 init1: 590 opt: 1791 Z-score: 1953.0 bits: 371.4 E(85289): 4.8e-102
Smith-Waterman score: 1791; 46.6% identity (78.0% similar) in 599 aa overlap (1-592:5-588)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGIT
.: :::.:: .:: . :. . ::.::::....:. . ..:.:::::.:.: ::::
NP_009 MAPPVAERGLKSVVWQKIKATVFDDCKKEGEWKIMLLDEFTTKLLASCCKMTDLLEEGIT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 IVEDINKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFS
.::.: : :::. ...:.:...:: :::. ...:: . ::::.:.::: ::. ::.
NP_009 VVENIYKNREPVRQMKALYFITPTSKSVDCFLHDFASKSENKYKAAYIYFTDFCPDNLFN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQ--LEVLAQ
.. .. .: .. :::...:.:.:.::..::.: . : : : .. . .. .:..:.
NP_009 KI-KASCSKSIRRCKEINISFIPHESQVYTLDVPDAFYYCYSPDPGNAKGKDAIMETMAD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTA-QLAHAVLAKL-NAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLI
::.:.::::.: :..::.. : :.: .::. : :: . .: : :: .: ::.:::::
NP_009 QIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNASKLAQLVEKKLEDYYKIDEKSLIKG--KTHSQLLI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 MDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELR
.::. :::: .:::::::::::::: ::.:::.:.: : .:: ..:.:.:::::..:
NP_009 IDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDG----KEKEAILEEEDDLWVRIR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 HMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADD
: ::: : ... .:.. . .:. : :.... :.:..::::...:...: .::.::.:
NP_009 HRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALTQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAED
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 CMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYIL
::..:: ..::::..:::::.:.::::.:.::::....::::. ::::..::::.
NP_009 CMNKFKLNIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNCDKIRAILLYIF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 LRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRER-MEPTYQ
::..:::: .:::..... .:..::: :: .. . .: : ..: : :.:
NP_009 SINGTTEENLDRLIQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQGKPLR---KDRSAEETFQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 LSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAG-VEARA
:::::: :::.::::...::: . ::. :. . ....::::: .: .:. .: :
NP_009 LSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSKEWPYCSQCPAVWNGSGAVSAR----QKPRANYLEDRK
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB6 -GPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLED
: .:::.:.::...::.: ::::..: .. ::.:::.:.::: ..:::.: :.: .
NP_009 NGSKLIVFVIGGITYSEVRCAYEVSQAHKSC-EVIIGSTHVLTPKKLLDDIKMLNKPKDK
530 540 550 560 570 580
590
pF1KB6 IALP
..:
NP_009 VSLIKDE
590
>>XP_016855653 (OMIM: 610035,615285) PREDICTED: vacuolar (503 aa)
initn: 212 init1: 112 opt: 319 Z-score: 351.1 bits: 74.7 E(85289): 8.1e-13
Smith-Waterman score: 431; 24.2% identity (58.7% similar) in 492 aa overlap (29-499:23-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
:::.::. . :.: .:.:: . . . :
XP_016 MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFER
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 INKR-REPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELG
:... :: . :.:: .: ::...:. .:.... : .: :.:... . . :.
XP_016 IDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELR-RPKYTIY--FIYFSNVISKSDVKSLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 RSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATL
.. .:: ..:.. .. . ..:::. : : . :: .: ...:
XP_016 EADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNI------LGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTAL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 CATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ----LLIMDR
.:.. : :::. . : . .::. : : . : : :.. :::.::
XP_016 LLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECV-------KQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDR
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 AADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRY-ETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHM
: ..:::.. :.:::...:: :... .. :.:. ...:: :.:..... ..
XP_016 CDDAITPLLNQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 HIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDK-ANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDC
..:...... .:.. : ..: .: .: :.. .....::..: . : :. .. .
XP_016 NFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGEL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 MKHF-KGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYIL
. . .. .. :::.:: .: ..... : .: . : .: :...:: :
XP_016 SRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYAL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 LRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGT--SSRLEPRERMEPTY
. : ..: :.. .. : : .: ..:.. ::. . :. . :.. . :
XP_016 HYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSEKYR---KLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITK
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KB6 QL-----------SRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHW
:. .. : ...... .. :: .::.:..
XP_016 QFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLGPSTLRDRIASCL
460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 HKNKAGVEARAGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDD
>>NP_001266283 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protein so (534 aa)
initn: 212 init1: 112 opt: 319 Z-score: 350.7 bits: 74.7 E(85289): 8.5e-13
Smith-Waterman score: 426; 23.2% identity (57.6% similar) in 557 aa overlap (48-582:6-513)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 VIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVEDINKR-REPIPSLEAIYL
:.:: . . . : :... :: . :.:: .
NP_001 MVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNREIMKHLKAICF
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 LSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLA
: ::...:. .:.... : .: :.:... . . :... .:: ..:..
NP_001 LRPTKENVDYIIQELR-RPKYTIY--FIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVAEVQEFYGD
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 FLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPE
.. . ..:::. : : . :: .: ...: .:.. : :::. . :
NP_001 YIAVNPHLFSLNI------LGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSE
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 DTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ----LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAM
. .::. : : . : : :.. :::.:: : ..:::.. :.:::
NP_001 AAKRLAECV-------KQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAM
150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 AYDLLDIEQDTYRY-ETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVSKKVTELLRTFC
...:: :... .. :.:. ...:: :.:..... ....:...... .:.. :
NP_001 VHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQ
200 210 220 230 240 250
320 330 340 350 360
pF1KB6 ESKRLTTDK-ANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHF-KGSVEKLCSVEQ
..: .: .: :.. .....::..: . : :. .. . . . .. .. :::
NP_001 KKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQ
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 DLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEENLAKLIQHA
.:: .: ..... : .: . : .: :...:: : . : ..: :..
NP_001 ELACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDL
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470
pF1KB6 NVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGT--SSRLEPRERMEPTYQL-----------SRWT
.. : : .: ..:.. ::. . :. . :.. . : :. ..
NP_001 RNKGVSEKYR---KLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQ
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 PVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPR-LI
: ...... .. :: .::.:... :.. : :. .:
NP_001 PFLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG---PST---------------------LRDRPQDII
440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
:.:.::... : ..:...:.: : ....:.. . . ::... :
NP_001 VFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGV-RIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQV
470 480 490 500 510 520
NP_001 TSRSASRR
530
593 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 21:56:55 2016 done: Fri Nov 4 21:56:57 2016
Total Scan time: 9.490 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]