Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6127
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6127, 587 aa
1>>>pF1KB6127 587 - 587 aa - 587 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1772+/-0.000873; mu= 15.3615+/- 0.052
mean_var=112.5313+/-23.553, 0's: 0 Z-trim(109.5): 248 B-trim: 103 in 1/50
Lambda= 0.120903
statistics sampled from 10644 (10938) to 10644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9915.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 ( 587) 3914 694.0 1.4e-199
CCDS55940.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 ( 635) 3778 670.3 2.1e-192
CCDS46856.2 ASB14 gene_id:142686|Hs108|chr3 ( 587) 1125 207.5 3.9e-53
CCDS34742.1 ASB15 gene_id:142685|Hs108|chr7 ( 588) 1109 204.7 2.7e-52
CCDS1846.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 518) 638 122.5 1.3e-27
CCDS54361.1 ASB3 gene_id:100302652|Hs108|chr2 ( 556) 638 122.5 1.4e-27
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 559 109.2 4.8e-23
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 559 109.2 4.9e-23
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 559 109.5 8.5e-23
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 526 103.4 2.6e-21
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 526 103.4 2.6e-21
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 526 103.7 5e-21
CCDS1847.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 445) 505 99.2 1.1e-20
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 512 101.0 1.4e-20
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 512 101.0 1.4e-20
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 512 101.0 1.4e-20
CCDS42650.1 KIDINS220 gene_id:57498|Hs108|chr2 (1771) 489 97.0 2.2e-19
CCDS31136.1 ANKRD16 gene_id:54522|Hs108|chr10 ( 361) 438 87.5 3.2e-17
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 440 88.1 4.4e-17
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 442 88.6 5e-17
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 442 88.7 5.5e-17
CCDS4225.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 (2542) 442 88.9 8.5e-17
CCDS4224.1 EIF4EBP3 gene_id:404734|Hs108|chr5 (2617) 442 88.9 8.7e-17
CCDS74619.1 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 993) 429 86.3 2e-16
CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 367) 421 84.5 2.5e-16
CCDS43372.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 616) 416 83.8 6.8e-16
CCDS43371.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 627) 416 83.8 6.9e-16
CCDS74908.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 ( 899) 411 83.1 1.7e-15
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 411 83.2 1.9e-15
CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 412 83.6 3e-15
CCDS11879.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 301) 399 80.6 3.1e-15
CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 412 83.6 3.1e-15
CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 412 83.7 3.3e-15
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 399 81.2 1e-14
CCDS75319.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 581) 382 77.9 4e-14
CCDS77164.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 268) 370 75.5 9.6e-14
CCDS70.1 ESPN gene_id:83715|Hs108|chr1 ( 854) 372 76.3 1.8e-13
CCDS31137.1 ANKRD16 gene_id:54522|Hs108|chr10 ( 304) 363 74.3 2.4e-13
CCDS44920.1 ANKRD52 gene_id:283373|Hs108|chr12 (1076) 370 76.0 2.7e-13
CCDS47460.1 ANKRD6 gene_id:22881|Hs108|chr6 ( 722) 363 74.6 4.7e-13
CCDS56441.1 ANKRD6 gene_id:22881|Hs108|chr6 ( 727) 363 74.6 4.7e-13
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 336 70.0 1.3e-11
CCDS58259.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 974) 334 69.7 1.9e-11
CCDS58260.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 995) 334 69.7 2e-11
CCDS44947.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 (1030) 334 69.7 2e-11
CCDS56442.1 ANKRD6 gene_id:22881|Hs108|chr6 ( 692) 327 68.3 3.5e-11
CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 951) 326 68.3 5e-11
CCDS10197.2 ANKDD1A gene_id:348094|Hs108|chr15 ( 522) 321 67.2 5.9e-11
>>CCDS9915.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 (587 aa)
initn: 3914 init1: 3914 opt: 3914 Z-score: 3696.5 bits: 694.0 E(32554): 1.4e-199
Smith-Waterman score: 3914; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTRFSYAEYFSLFHSCSAPSRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSLFKTSQLAPADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MTRFSYAEYFSLFHSCSAPSRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSLFKTSQLAPADP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKVLQRAYPGTIDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKVLQRAYPGTIDQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKNAEAVKILVQHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 TLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKNAEAVKILVQHN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQSGQLEALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 ADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQSGQLEALR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDGLLPLHIASKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDGLLPLHIASKKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNTPLAPERARLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 NYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNTPLAPERARLYE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 DRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQHGADPNRDVISPLLVAIRHGCLRTMQLLLDHGANID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQHGADPNRDVISPLLVAIRHGCLRTMQLLLDHGANID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 AYIATHPTAFPATIMFAMKCLSLLKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPPAPQPSSRFNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AYIATHPTAFPATIMFAMKCLSLLKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPPAPQPSSRFNDA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PAADKEPSVVQFCEFVSAPEVSRWAGPIIDVLLDYVGNVQLCSRLKEHIDSFEDWAVIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PAADKEPSVVQFCEFVSAPEVSRWAGPIIDVLLDYVGNVQLCSRLKEHIDSFEDWAVIKE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 KAEPPRPLAHLCRLRVRKAIGKYRIKLLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KAEPPRPLAHLCRLRVRKAIGKYRIKLLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
550 560 570 580
>>CCDS55940.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 (635 aa)
initn: 3778 init1: 3778 opt: 3778 Z-score: 3567.9 bits: 670.3 E(32554): 2.1e-192
Smith-Waterman score: 3778; 99.8% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (20-587:68-635)
10 20 30 40
pF1KB6 MTRFSYAEYFSLFHSCSAPSRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSL
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLADKTRGPTTAEATASACTNRQPAHFYPWTRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSL
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FKTSQLAPADPLIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FKTSQLAPADPLIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKVL
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 QRAYPGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRAYPGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKN
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 AEAVKILVQHNADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEAVKILVQHNADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFV
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 AAQSGQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AAQSGQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDG
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 LLPLHIASKKGNYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLPLHIASKKGNYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNT
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 PLAPERARLYEDRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQHGADPNRDVISPLLVAIRHGCLRTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PLAPERARLYEDRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQHGADPNRDVISPLLVAIRHGCLRTM
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QLLLDHGANIDAYIATHPTAFPATIMFAMKCLSLLKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLLLDHGANIDAYIATHPTAFPATIMFAMKCLSLLKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPP
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 APQPSSRFNDAPAADKEPSVVQFCEFVSAPEVSRWAGPIIDVLLDYVGNVQLCSRLKEHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APQPSSRFNDAPAADKEPSVVQFCEFVSAPEVSRWAGPIIDVLLDYVGNVQLCSRLKEHI
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 DSFEDWAVIKEKAEPPRPLAHLCRLRVRKAIGKYRIKLLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DSFEDWAVIKEKAEPPRPLAHLCRLRVRKAIGKYRIKLLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
580 590 600 610 620 630
>>CCDS46856.2 ASB14 gene_id:142686|Hs108|chr3 (587 aa)
initn: 1096 init1: 819 opt: 1125 Z-score: 1067.4 bits: 207.5 E(32554): 3.9e-53
Smith-Waterman score: 1133; 34.2% identity (66.3% similar) in 564 aa overlap (39-584:17-573)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 YFSLFHSCSAPSRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSLFK--TSQLAPADP------
: ..:. ....: :.: :: :
CCDS46 MDNYTSDEDIDEDFDTQLIIQQSLQDIYKPGTAQHAPKDESLHSFL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 ------LIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKV-LQRAY
....:. : :.::. . : . ..: .. ::.:::.:: . :.. :. .
CCDS46 SADYKKIVETIEKGKEDALSHLTKYHSAFGEADEIGWIPLHKAAVQLNRKILEITLSASD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 PGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKNAEAV
:. .: : . :: ..::. :. :: : .:. .: ..:: : : . .
CCDS46 PSLWEQTTHNGETPLFLAVSSCLLENATFLLLNGCNPNAKNFEGNSPLLAAVLRDCYDMA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KILVQHNADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQS
.:....::.: :: :::::... . ....... .::. . ...::.::: .::::
CCDS46 ALLINYGADVNLRCANERTALHEAAKLGREDMVKLMLVSGAHPDPQSTYGFTPLALAAQS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDGLLPL
:. : ...: . ::. . ::::..: : :: .. . ..: .:: ::::: ...: ::.
CCDS46 GHTEIMEMLLRKGANAHGQASDSSSILLEAASGGNPDAVALLLEYGADANIPKNSGHLPI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 HIASKKGNYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNTPLAP
:.:. .:. ...:.:::. . :..::.::.: :: : . :: :..: :::: :
CCDS46 HVAADRGHLLALKILIPVTDLAAIKQSGISPVHCAAAGAHPQCLELLIQAGFDVNFMLDQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 ERARLYEDRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQHGADPNRDVISPLLVAIRHGCLRTMQLLL
. . :.:.:.::::::: :... ...:::. :: ::.: .. : .:.: : . ..:::
CCDS46 RINKHYDDHRKSALYFAVSNSDLSSVKLLLSAGALPNQDPVNCLQIALRMGNYELISLLL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 DHGANIDAYIATHPTAFPATIMFAMKCLSLLKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPPAPQP
::::.. . ..: ::.......: .:..:.. : : : ::.: .:. ::
CCDS46 RHGANVNYFCRVNPLHFPSALQYTLKDEVMLRMLLNYGYDTERCFDCPHGDKVHPSYTVE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 SSRFNDAPAADKEPSVVQFCEFVSAPEVSRWAGPIIDVLLDYVGNVQLCSRLKEHIDSFE
. .... : ..::: .. ... .: .. :.:::: .:..::.:: ...
CCDS46 G--WTSTVIKD-----TKFCEVITLSWLQHLSGKVVRVMLDYVDQVRICSKLKAVLQKQG
470 480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KB6 DWAVIKEKAEPPRPLAHLCRLRVRKAIGKYRIK---LLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
:. :. :: : :::::..:: .:. ... ... ::::.:: :. :.
CCDS46 IWSEIHFILTNPRSLKHLCRLKIRKCMGRLHLRCPVFMSFLPLPNRLKAYVLYKEYDLYG
520 530 540 550 560 570
CCDS46 QGIFTGTW
580
>>CCDS34742.1 ASB15 gene_id:142685|Hs108|chr7 (588 aa)
initn: 1032 init1: 746 opt: 1109 Z-score: 1052.3 bits: 204.7 E(32554): 2.7e-52
Smith-Waterman score: 1109; 34.4% identity (68.0% similar) in 532 aa overlap (61-584:47-576)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 ARAPMGLFQGVMQKYSSSLFKTSQLAPADPLIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEG
:..:::.: :. ..: . : ...:
CCDS34 IQLSIQESIEASKTALCPERFVPLSAQNRKLVEAIKQGHIPELQEYVKYKYAMDEADEKG
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140
pF1KB6 WLPLHEAAYYGQVGCLK-VLQRAYPGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAE
:.:::::. :. ::. .: . .: . :: . ::. : .. . .::. :.
CCDS34 WFPLHEAVVQPIQQILEIVLDASYKTLWEFKTCDGETPLTLAVKAGLVENVRTLLEKGVW
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 PDISNKSRETPLYKACERKNAEAVKILVQHNADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQIL
:. .: . :::: : .. . . :. :..::.. .. : . :.:.::..... ... .:
CCDS34 PNTKNDKGETPLLIAVKKGSYDMVSTLIKHNTSLDQPCVKRWSAMHEAAKQGRKDIVALL
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 VSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQSGQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHE
.. :..:. ....:.::: :::. :. ..:. : . :.:. . :.:.::.:.:: . .
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CCDS37 LLQHGAKPNATTANGNTALAIAKRLGYISVVDTLKVVTEEVTTTTTTITEKHKLNVPETM
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