Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6017, 827 aa
1>>>pF1KB6017 827 - 827 aa - 827 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5769+/-0.00108; mu= 18.6798+/- 0.065
mean_var=62.8240+/-12.693, 0's: 0 Z-trim(102.1): 21 B-trim: 383 in 1/50
Lambda= 0.161812
statistics sampled from 6809 (6818) to 6809 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 3.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33582.1 PFKL gene_id:5211|Hs108|chr21 ( 780) 4963 1167.9 0
CCDS8760.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 ( 780) 3674 867.0 0
CCDS53786.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 ( 851) 3674 867.0 0
CCDS7059.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10 ( 784) 3562 840.9 0
CCDS55698.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10 ( 776) 3307 781.4 0
>>CCDS33582.1 PFKL gene_id:5211|Hs108|chr21 (780 aa)
initn: 4963 init1: 4963 opt: 4963 Z-score: 6253.3 bits: 1167.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4963; 100.0% identity (100.0% similar) in 752 aa overlap (76-827:29-780)
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 HCSPGSRGQGDRKEEVTSEPGGTSIMSRLGGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGL
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CCDS33 MAAVDLEKLRASGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGL
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VEGGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VEGGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGG
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DGSLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DGSLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDG
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 WENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGH
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VQRGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQRGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEV
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QKAMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKEKSNFSLAILNVGAPAAGMNAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKAMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKEKSNFSLAILNVGAPAAGMNAAV
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 RSAVRTGISHGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHDVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKGQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RSAVRTGISHGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHDVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKGQLE
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 SIVENIRIYGIHALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGRYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIVENIRIYGIHALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGRYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDFS
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 LGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFEDP
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB6 FNIHDLKVNVEHMTEKMKTDIQRGLVLRNEKCHDYYTTEFLYNLYSSEGKGVFDCRTNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FNIHDLKVNVEHMTEKMKTDIQRGLVLRNEKCHDYYTTEFLYNLYSSEGKGVFDCRTNVL
600 610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB6 GHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKAMLWLSEKLREVYRKGRVFANAPDSACVIGLKKKAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKAMLWLSEKLREVYRKGRVFANAPDSACVIGLKKKAVA
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB6 FSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLSLRLMLKMLAQYRISMAAYVSGELEHVTRRTLSMDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLSLRLMLKMLAQYRISMAAYVSGELEHVTRRTLSMDK
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 GF
::
CCDS33 GF
780
>>CCDS8760.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 (780 aa)
initn: 3657 init1: 1933 opt: 3674 Z-score: 4627.1 bits: 867.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3674; 69.9% identity (91.0% similar) in 745 aa overlap (76-819:29-773)
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 HCSPGSRGQGDRKEEVTSEPGGTSIMSRLGGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGL
:::::::::.:.::..::.::...:::.::
CCDS87 MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGL
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VEGGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGG
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CCDS87 VDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGG
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DGSLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
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CCDS87 DGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDG
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CCDS87 DSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDD
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 WENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGH
::. .:.::.:::.:::::::::.::::::.:::::.: .:.:::.:::.:::::::::
CCDS87 WEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGH
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VQRGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEV
::::::::::::::.:.::.::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::.::.:
CCDS87 VQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDV
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QKAMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKEKS-NFSLAILNVGAPAAGMNAA
::::.:.:::: .::: :: :::..:::::: .:: :: . ..:..::::::::::::
CCDS87 TKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAA
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 VRSAVRTGISHGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHDVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKGQL
:::.:: :. .:. : :::::::::::::..:.:: :.:: :.::: ::::::::: ..
CCDS87 VRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSF
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 ESIVENIRIYGIHALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGRYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDF
:.: :: ..:..:...:::::: : :.:.:.: ...:::: . :::::.::::::.::
CCDS87 EQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDF
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 SLGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFED
:.:.:::.:. .::::::::.::::::::.::::::::::::..:.:.::::::.::.
CCDS87 SVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEE
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB6 PFNIHDLKVNVEHMTEKMKTDIQRGLVLRNEKCHDYYTTEFLYNLYSSEGKGVFDCRTNV
::.:.::..::::...:::: ..::::::::::.. :::.:..:::: ::::.:: : ::
CCDS87 PFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNV
600 610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB6 LGHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKAMLWLSEKLREVYRKGRVFANAPDSACVIGLKKKAV
:::.::::.:::::::..::.:.::: :.: :..: ::.::.:::.:::.::.:..:.:.
CCDS87 LGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRAL
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB6 AFSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLSLRLMLKMLAQYRISMAAYVSGELEHVTRRTLSMD
.:.::.::: .::::::.:.:::::.:: .::.::.:.:.. . ..:::.::.
CCDS87 VFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEA
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 KGF
CCDS87 AV
780
>>CCDS53786.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12 (851 aa)
initn: 3657 init1: 1933 opt: 3674 Z-score: 4626.4 bits: 867.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3674; 69.9% identity (91.0% similar) in 745 aa overlap (76-819:100-844)
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 HCSPGSRGQGDRKEEVTSEPGGTSIMSRLGGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGL
:::::::::.:.::..::.::...:::.::
CCDS53 WIMTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VEGGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGG
:.::..::.:.: ::: ..:::::.::::::: : :::: ::::::..::::::::::
CCDS53 VDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DGSLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
:::::::. :::::..:: .: :::.. : :.:::.:::::::::::::::::::
CCDS53 DGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDG
:::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::..:. ::::.:::: ::.:
CCDS53 DSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 WENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGH
::. .:.::.:::.:::::::::.::::::.:::::.: .:.:::.:::.:::::::::
CCDS53 WEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VQRGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEV
::::::::::::::.:.::.::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::.::.:
CCDS53 VQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QKAMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKEKS-NFSLAILNVGAPAAGMNAA
::::.:.:::: .::: :: :::..:::::: .:: :: . ..:..::::::::::::
CCDS53 TKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAA
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 VRSAVRTGISHGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHDVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKGQL
:::.:: :. .:. : :::::::::::::..:.:: :.:: :.::: ::::::::: ..
CCDS53 VRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 ESIVENIRIYGIHALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGRYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDF
:.: :: ..:..:...:::::: : :.:.:.: ...:::: . :::::.::::::.::
CCDS53 EQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDF
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 SLGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFED
:.:.:::.:. .::::::::.::::::::.::::::::::::..:.:.::::::.::.
CCDS53 SVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEE
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB6 PFNIHDLKVNVEHMTEKMKTDIQRGLVLRNEKCHDYYTTEFLYNLYSSEGKGVFDCRTNV
::.:.::..::::...:::: ..::::::::::.. :::.:..:::: ::::.:: : ::
CCDS53 PFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNV
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB6 LGHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKAMLWLSEKLREVYRKGRVFANAPDSACVIGLKKKAV
:::.::::.:::::::..::.:.::: :.: :..: ::.::.:::.:::.::.:..:.:.
CCDS53 LGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRAL
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB6 AFSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLSLRLMLKMLAQYRISMAAYVSGELEHVTRRTLSMD
.:.::.::: .::::::.:.:::::.:: .::.::.:.:.. . ..:::.::.
CCDS53 VFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEA
790 800 810 820 830 840
pF1KB6 KGF
CCDS53 AV
850
>>CCDS7059.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10 (784 aa)
initn: 3561 init1: 1845 opt: 3562 Z-score: 4485.7 bits: 840.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3562; 68.2% identity (90.3% similar) in 743 aa overlap (76-816:38-779)
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 HCSPGSRGQGDRKEEVTSEPGGTSIMSRLGGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGL
:::::::::.::::::::::..:::::.:.
CCDS70 APKGSLRKFLEHLSGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRMGIYVGAKVYFIYEGYQGM
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VEGGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGG
:.:: :: .:.: :::.:.:.::::::::::.:: ::::: :: ::.:.::::::::::
CCDS70 VDGGSNIAEADWESVSSILQVGGTIIGSARCQAFRTREGRLKAACNLLQRGITNLCVIGG
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DGSLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGT
::::::::.::.::..:::::. .:.:.. ... :..::..:.:::::::::::::::::
CCDS70 DGSLTGANLFRKEWSGLLEELARNGQIDKEAVQKYAYLNVVGMVGSIDNDFCGTDMTIGT
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDG
:::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:.::.:::.:
CCDS70 DSALHRIIEVVDAIMTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALACGADWVFLPESPPEEG
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 WENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGH
::. :: .:.:.:.: .::::::.:::::: ..:::.: .:.::: .::.:::::.:::
CCDS70 WEEQMCVKLSENRARKKRLNIIIVAEGAIDTQNKPITSEKIKELVVTQLGYDTRVTILGH
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VQRGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEV
::::::::::::::.:.::.:::.::::::::::::::.:.::..::::::::::::..:
CCDS70 VQRGGTPSAFDRILASRMGVEAVIALLEATPDTPACVVSLNGNHAVRLPLMECVQMTQDV
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QKAMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKE--KSNFSLAILNVGAPAAGMNA
:::::..::..:..::: :: .: : :: :: . : . :.: ..:..:::::::::::
CCDS70 QKAMDERRFQDAVRLRGRSFAGNLNTYKRLAIKLPDDQIPKTNCNVAVINVGAPAAGMNA
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 AVRSAVRTGISHGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHDVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKGQ
:::::::.::. :: . ...:::.:.::::..:.:: ::.:: :.:::.:::::.::
CCDS70 AVRSAVRVGIADGHRMLAIYDGFDGFAKGQIKEIGWTDVGGWTGQGGSILGTKRVLPGKY
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 LESIVENIRIYGIHALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGRYEELCIVMCVIPATISNNVPGTD
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