Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5987
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5987, 570 aa
1>>>pF1KB5987 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2001+/-0.0011; mu= 13.4832+/- 0.065
mean_var=75.3984+/-15.034, 0's: 0 Z-trim(103.3): 49 B-trim: 89 in 1/50
Lambda= 0.147704
statistics sampled from 7278 (7323) to 7278 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 570) 3810 821.9 0
CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 687) 3291 711.3 9.3e-205
CCDS46982.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 356) 2401 521.6 6.3e-148
CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX ( 686) 1140 253.0 8.9e-67
CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX ( 696) 963 215.3 2e-55
CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 ( 541) 578 133.2 8e-31
CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 ( 575) 545 126.2 1.1e-28
CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 ( 599) 544 126.0 1.3e-28
CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 569) 534 123.8 5.6e-28
CCDS74547.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 538) 367 88.2 2.7e-17
CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 556) 355 85.7 1.7e-16
CCDS31325.1 SIGIRR gene_id:59307|Hs108|chr11 ( 410) 320 78.2 2.2e-14
CCDS2054.1 IL1R2 gene_id:7850|Hs108|chr2 ( 398) 313 76.7 6.1e-14
CCDS2058.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 328) 300 73.9 3.5e-13
CCDS58719.1 IL1R2 gene_id:7850|Hs108|chr2 ( 296) 287 71.1 2.1e-12
>>CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (570 aa)
initn: 3810 init1: 3810 opt: 3810 Z-score: 4388.6 bits: 821.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3810; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKFNYST
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CCDS32 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKFNYST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPKNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYARNAEEEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYARNAEEEEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDETLSFIQKSRRLLVVLSPNYVLQGTQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDETLSFIQKSRRLLVVLSPNYVLQGTQAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVKETKVKELKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQGRFWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVKETKVKELKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQGRFWK
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB5 QLQVAMPVKKSPRRSSSDEQGLSYSSLKNV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLQVAMPVKKSPRRSSSDEQGLSYSSLKNV
550 560 570
>>CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (687 aa)
initn: 3266 init1: 3169 opt: 3291 Z-score: 3789.5 bits: 711.3 E(32554): 9.3e-205
Smith-Waterman score: 3291; 86.1% identity (94.5% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKFNYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKFNYST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPKNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYARNAEEEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYARNAEEEEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDETLSFIQKSRRLLVVLSPNYVLQGTQAL
:::::::::::::::::::::::::::: ... ...:::.:::..:::::.:: . . ..
CCDS54 VLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGNTVEAVFDFIQRSRRMIVVLSPDYVTEKSISM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVKETKVKELKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQGRFWK
::.: :. . : .. ..:.:.:. ... . :. ..: . ..:::::::. ..:::
CCDS54 LEFKLGVMCQNSIAT-KLIVVEYRPLEHPHPGILQLKESV-SFVSWKGEKSKHSGSKFWK
490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KB5 QLQVAMPVKKSPRRSSSDEQGLSYSSLKNV
:..:.:... :. .:. : :..
CCDS54 ALRLALPLRSLSASSGWNESCSSQSDISLDHVQRRRSRLKEPPELQSSERAAGSPPAPGT
540 550 560 570 580 590
>>CCDS46982.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (356 aa)
initn: 2401 init1: 2401 opt: 2401 Z-score: 2769.3 bits: 521.6 E(32554): 6.3e-148
Smith-Waterman score: 2401; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKFNYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKFNYST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPKNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQKGNRCGQ
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYARNAEEEEF
>>CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX (686 aa)
initn: 978 init1: 267 opt: 1140 Z-score: 1312.3 bits: 253.0 E(32554): 8.9e-67
Smith-Waterman score: 1151; 36.2% identity (65.6% similar) in 588 aa overlap (1-562:7-577)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTLLWC-VVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHF
..:. : ::: . . . .. . : ::..: .. ... ::.:.:: :: .
CCDS14 MKPPFLLALVVCSVVSTNLKMVSKRNSVDGCIDWSVD-LKTYMALAGEPVRVKCALFYSY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LKFNYSTAHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYT
.. :::::.:.:: :.:: .. :::::: : : :.:::.: .::. . .:.: ::
CCDS14 IRTNYSTAQSTGLRLMWY--KNKGDLEEPIIF--SEVRMSKEEDSIWFHSAEAQDSGFYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDS--CFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSV
:.:::.::: ::.. : :....: :.:: .. ..: . ..:.::..: . :.
CCDS14 CVLRNSTYCMKVSMSLTVAENESGLCYNSRIRY-LEKSEVTKR-KEISCPDMDDFKKSDQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB5 KPTITWYMGCYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALIS--NNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTL
.: ..:: : : . . ..: . : ..:: .. ..::::: . : .:. . ::
CCDS14 EPDVVWYKEC-KPKMWRSIIIQKGN-ALLIQEVQEEDGGNYTCELKY--EGKL--VRRTT
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TVKVVGSPKNAVP-PVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKK
.::.. . : :.. :. : . . :. : ::: ..:.: .: ..: :
CCDS14 ELKVTALLTDKPPKPLFPMENQPSVIDVQLGKPLNIPCKAFFGFSGESGPMIYWMKGEKF
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 PDDITIDVTINES--ISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAK
.... . .: ... : :.. .. . .:. :: .:.::... .:. : :.
CCDS14 IEELAGHIREGEIRLLKEHLGEKEVELALI-FDSVVEADLA-NYTCHVENRNGR--KHAS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VKQKVPAPRYTVELACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYD
: . : .::: :.:: ::.:.:.:.:. : .:..:::: :::.::: :.::::
CCDS14 VLLRKKDLIYKIELAGGLGAIFLLLVLLVVIYKCYNIELMLFYRQHFGADETNDDNKEYD
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB5 IYVSYAR---------NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDETLSF
:.::.. : :::.:.: .: :::...:::: : .:: .:.: .. .
CCDS14 AYLSYTKVDQDTLDCDNPEEEQFALEVLPDVLEKHYGYKLFIPERDLIPSGTYMEDLTRY
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 IQKSRRLLVVLSPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVKET----KVKE
...::::..::.:.:.:. ...::.. :.:: :.:.:::.. .: .:.
CCDS14 VEQSRRLIIVLTPDYILRRGWSIFELESRLHNMLVSGEIKVILIECTELKGKVNCQEVES
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KB5 LKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQGRFWKQLQVAMPVKKS---PRRSSSD--EQGLSYSSLK
:::. .:..::::: ::. ...:::.: ::.::. :: : ::::
CCDS14 LKRSIKLLSLIKWKGSKSSKLNSKFWKHLVYEMPIKKKEMLPRCHVLDSAEQGLFGELQP
530 540 550 560 570 580
570
pF1KB5 NV
CCDS14 IPSIAMTSTSATLVSSQADLPEFHPSDSMQIRHCCRGYKHEIPATTLPVPSLGNHHTYCN
590 600 610 620 630 640
>>CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX (696 aa)
initn: 965 init1: 262 opt: 963 Z-score: 1108.4 bits: 215.3 E(32554): 2e-55
Smith-Waterman score: 1073; 34.0% identity (63.9% similar) in 588 aa overlap (1-565:8-576)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHF
. ::. . . . . . ... : ::..: ... ::. ::.:::: :: .
CCDS14 MKAPIPHLILLYATFTQSLKVVTKRGSADGCTDWSID-IKKYQVLVGEPVRIKCALFYGY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LKFNYSTAHSAGLTLIWYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYT
.. ::: :.::::.:.:: . :.:::: : .:.:::.: .:::::::.:.: :.
CCDS14 IRTNYSLAQSAGLSLMWYKSSGPGDFEEPIAF--DGSRMSKEEDSIWFRPTLLQDSGLYA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDS--CFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSV
:..::.::: ::.. : : ..:. :.:: :: .: . . ..:.: ... .. .
CCDS14 CVIRNSTYCMKVSISLTVGENDTGLCYNSKMKY-FEKAELSKS-KEISCRDIEDFLLPTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB5 KPTITWYMGCYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNN--GNYTCVVTYPENGRTFHLTRTL
.: : :: : . ... : . ..:: . .. ::::: . : .: . . : :
CCDS14 EPEILWYKEC-RTKTWRPSIVFKRD-TLLIREVREDDIGNYTCELKY--GGFVVRRTTEL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TVKVVGSPKNAVPPVIHSPNDH--VVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGK
:: .: . :: . : . .. : . :. . : ..:.. : ..: :
CCDS14 TVT---APLTDKPPKLLYPMESKLTIQETQLGDSANLTCRAFFGYSGDVSPLIYWMKGEK
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KPDDITIDVTINES----ISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAK
.:. . . :: ... :.:. ... . .: :: .: :......:. .
CCDS14 FIEDLD-ENRVWESDIRILKEHLGEQEVSISLI-VDSVEEGDLG-NYSCYVENGNGR--R
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 AAKVKQKVPAPRYTVELACGFGATVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGK
:.: . :::::: :.:: .::.: :...:. : .:..:::: :::..: :.:
CCDS14 HASVLLHKRELMYTVELAGGLGAILLLLVCLVTIYKCYKIEIMLFYRNHFGAEELDGDNK
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB5 EYDIYVSYAR---------NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDET
.:: :.::.. ..:::.:.: : .::...:::: : ::: .: : ...
CCDS14 DYDAYLSYTKVDPDQWNQETGEEERFALEILPDMLEKHYGYKLFIPDRDLIPTGTYIEDV
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 LSFIQKSRRLLVVLSPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVK----ETK
...:.::..:..::::.. ...::.. :.:: :.:.:::.. . .. .
CCDS14 ARCVDQSKRLIIVMTPNYVVRRGWSIFELETRLRNMLVTGEIKVILIECSELRGIMNYQE
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CCDS14 GELQTVSAISMAAATSTALATAHPDLRSTFHNTYHSQMRQKHYYRSYEYDVPPTGTLPLT
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.:. .... ::..::.. . .:..::... : . . :: :. :.:::
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CCDS20 LWYRDSCYDFLPIKASDGKTYDAYILYPKTVGEGSTSDCDIFVFKVLPEVLEKQCGYKLF
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CCDS74 KEREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWY---KD-DSKTPVSTE-QASRIHQHK
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CCDS74 EKLWFVPAKVEDSGHYYCVVRNSSYCLRIKISAKFVENEPNLCYNAQAIFK-QKLPVA-G
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CCDS74 TCHASYTYLGKQYPITRVIEF-ITLEENKPTRPVIVSPANETM-EVDLGSQIQLICNVTG
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CCDS74 QL---SDIAYWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANKRRS--TLITVLNISEIESRFYK
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CCDS74 HPFTCFAKNTHG--IDAAYIQLIYPVTNFQKHMI-GICVTLTVIIVCSVFIYKIFKIDIV
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CCDS74 LWYR-----DSC------YDF------------LPIKVLPEVLEKQCGYKLFIYGRDDYV
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pF1KB5 GGIVTDETLSFIQKSRRLLVVL---SPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGNINVILVQY
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CCDS74 GEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSS--EEQIAMYNALVQDGIKVVLLEL
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pF1KB5 KAVKE-TKVKE-LKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQG---RFWKQLQVAMPVKKSPRRSSSD
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CCDS74 EKIQDYEKMPESIKFIKQKHGAIRWSGDFTQGPQSAKTRFWKNVRYHMPVQR--RSPSSK
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pF1KB5 EQGLSYSSLKNV
.: ::
CCDS74 HQLLSPATKEKLQREAHVPLG
520 530
570 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 17:35:24 2016 done: Sun Nov 6 17:35:24 2016
Total Scan time: 2.900 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]