Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5956
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5956, 548 aa
1>>>pF1KB5956 548 - 548 aa - 548 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5281+/-0.000938; mu= 16.7476+/- 0.056
mean_var=65.4032+/-13.325, 0's: 0 Z-trim(105.0): 66 B-trim: 90 in 2/49
Lambda= 0.158590
statistics sampled from 8126 (8191) to 8126 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 3717 859.6 0
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 2446 568.8 5.5e-162
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 2235 520.6 1.9e-147
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 2234 520.3 2.2e-147
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 2015 470.2 2.8e-132
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 1956 456.7 3.2e-128
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 1956 456.7 3.3e-128
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 1850 432.5 6.5e-121
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 1847 431.8 1e-120
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 1847 431.8 1.1e-120
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 1739 407.1 2.8e-113
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 1677 392.9 5.9e-109
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 1627 381.4 1.3e-105
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 1444 339.6 6.2e-93
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 980 233.3 3.1e-61
>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 (548 aa)
initn: 3717 init1: 3717 opt: 3717 Z-score: 4593.1 bits: 859.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3717; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGRWIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGRWIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGHD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFPA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNHV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAAM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKNL
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PPTNSEPA
::::::::
CCDS10 PPTNSEPA
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
initn: 2513 init1: 2267 opt: 2446 Z-score: 3021.6 bits: 568.8 E(32554): 5.5e-162
Smith-Waterman score: 2446; 64.4% identity (87.3% similar) in 534 aa overlap (17-548:1-531)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGR-WI
:. : :: :: :.:: ::::.:. :::::.:::: ...:. :
CCDS62 MAAQ-CVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWY
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLG
: .::: : ::: ::: :..::.:: ::::::...: :.....:.. ::::. :.::
CCDS62 EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
::::::.::::.. . .::::: :::.:.:..::::. . . .:.::.:::::::::.:
CCDS62 QIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
::.: .::.:..::::::.: .:.:::.:: . : ::: :::.: :.: ::::::::.:
CCDS62 EFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
:.:: :::..... :: : :.:::::: ::..:::.:::::.: ...:.:. . .::::
CCDS62 DLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
:.::::: ::::.:::.:::.: .:.:::::.: :.::::.:.:.:: .:::::.:::::
CCDS62 IMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
:.:::::.::.:.::::: .::::.::.:.:..::..:: .:::.:..:::::::::.::
CCDS62 AFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINH
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
:::::: ::::.::.:::.:::::::::.:..:::.:.:.::.:::::::::::.:::.:
CCDS62 VARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFK-HK
:::::::. ::: :: : ::::::::::.:.:: ::.::. ::::.::::: ::. .:
CCDS62 MEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB5 NLPPTNSEPA
::: : ::
CCDS62 LLPPKN--PATKQQKQ
530
>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (542 aa)
initn: 1865 init1: 1361 opt: 2235 Z-score: 2760.6 bits: 520.6 E(32554): 1.9e-147
Smith-Waterman score: 2235; 58.3% identity (84.2% similar) in 539 aa overlap (17-548:4-537)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTE-NNGRWI
: .:: :.::.: ..:.:.:. :::::.:::. . ..: :
CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLG
: ::: . : .: ::: . :.:.:: ::::.:...: :... .: . :::: ::::
CCDS46 ELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
::::. .: ::.: ::::.: ::..::::.::::.:. . .: :::::..:::::::
CCDS46 QIVSSQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKDNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
::.. :: ::: ::.:.:::: .:.:.:: :.::. .: :. ::::.: :::.::.:
CCDS46 EFFRQGD-GKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
:.:: :.::..:. ..:: :::::.:.::.:::.::::: : .. :... .::::::
CCDS46 DLIGTFHTSLAQL----QAVPAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
..::::. ::::.:::.:::.: .:.::::..: :.:::: :.:.::...:::::::.::
CCDS46 VMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
:.:::::.::::.::::::.::::.::.:.:..::..:: ::..:.::::::.::.::
CCDS46 AFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINH
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
::::::::..: ::.:::.::..:::...:.: ::.:::.::.::::.::::::.::: :
CCDS46 VARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKH--
:: ::.:. :....:. ::::::::::.:.:.:: .:.::..::::.: :.:.::.
CCDS46 MEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQG
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB5 ----KNLPPTNSEPA
: :::. ..::
CCDS46 WAPLKPLPPSAKDPAQAPQA
530 540
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
initn: 1865 init1: 1361 opt: 2234 Z-score: 2759.5 bits: 520.3 E(32554): 2.2e-147
Smith-Waterman score: 2234; 58.5% identity (84.7% similar) in 535 aa overlap (21-548:3-532)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTE-NNGRWI
.:: :.::.: ..:.:.:. :::::.:::. . ..: :
CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLG
: ::: . : .: ::: . :.:.:: ::::.:...: :... .: . :::: ::::
CCDS13 ELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
::::. .: ::.: ::::.: ::..::::.::::.:. . .: :::::..:::::::
CCDS13 QIVSSQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKDNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
::.. :: ::: ::.:.:::: .:.:.:: :.::. .: :. ::::.: :::.::.:
CCDS13 EFFRQGD-GKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
:.:: :.::..:. ..:: :::::.:.::.:::.::::: : .. :... .::::::
CCDS13 DLIGTFHTSLAQL----QAVPAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDY
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
..::::. ::::.:::.:::.: .:.::::..: :.:::: :.:.::...:::::::.::
CCDS13 VMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFP
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
:.:::::.::::.::::::.::::.::.:.:..::..:: ::..:.::::::.::.::
CCDS13 AFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINH
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
::::::::..: ::.:::.::..:::...:.: ::.:::.::.::::.::::::.::: :
CCDS13 VARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEA
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKH--
:: ::.:. :....:. ::::::::::.:.:.:: .:.::..::::.: :.:.::.
CCDS13 MEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQG
460 470 480 490 500 510
540
pF1KB5 ----KNLPPTNSEPA
: :::. ..::
CCDS13 WAPLKPLPPSAKDPAQAPQA
520 530
>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (558 aa)
initn: 1847 init1: 1589 opt: 2015 Z-score: 2488.4 bits: 470.2 E(32554): 2.8e-132
Smith-Waterman score: 2015; 53.9% identity (80.6% similar) in 542 aa overlap (4-542:1-542)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMG-PQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGRWI
. .:. .:.:.: : : :. :::: .: ..::::: .:::: .:. . .:.:.
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFD-QDKSSMRLDEHDFLGQFSCSL
. :::.. ..:.:.::: :..::.:::::.:.: ..: . :.. .: :::: . :.:
CCDS10 QVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELS-DNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDP
: ::..::.:::::: . :::. ::. :...: .: . ::. .:.:: ::::.::::
CCDS10 GQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDG
:::.:. .:: .::.::::.: .:.:::. : : : :::. . .:.. . .:::. :
CCDS10 FLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFL
:::::::.:. .: .: . ...:.::: ..:...:::::...: . :..: ::::
CCDS10 KHDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKM
:::.::::. :::.::::::::.: . :::::::. ::::.:. .::.: :::::::
CCDS10 DYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 FPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIV
: ::::::..:: ..:::.::::::: . : :..:...::. :::....::::: .::.
CCDS10 FSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPII
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADF
..::: :: . :.::.::::.::::..:: .::.:.:.::.:::::::::::::::
CCDS10 SKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 AAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKH
. :. ::::. .::: :: : :::::::::::..::. .::: ::::.:.:::.:..:
CCDS10 TDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSH
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 KNLPPTNSEPA
..:::
CCDS10 RGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
540 550
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
initn: 2044 init1: 1928 opt: 1956 Z-score: 2415.5 bits: 456.7 E(32554): 3.2e-128
Smith-Waterman score: 1956; 53.7% identity (81.9% similar) in 525 aa overlap (22-545:22-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGRWIE
:. :::: :. ... :::. :: :: .: ...:.:.:
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLGT
::::. . .::..:: :..:..:::::.:.: . : ... : : :::: . :.::
CCDS30 VDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB5 IVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNR-VITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
:::..:... :: . . :::. ::. :.::: : . :.. .:.:: ::.:.::::::
CCDS30 IVSQRKLSKSLLK-HGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
:... .::. .:::::::. .:.:.:: : : . :::.:: .. .. . .:.:..: :
CCDS30 EIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
:::::: .. ..: : .. ...:::::: . ::::::::: .:: :::.. .:::::
CCDS30 DFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
:.::::..:::.::::::::.: . :::::.:. ::::.:. :::.: ::::::::::
CCDS30 IMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
:.::::..::.. :::.:::::: :: :.:..:...::..:::....:::::..::...
CCDS30 AFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
::. :.. :. . :.:::::::.:::::.:: .::.:.:.::.::::.::::::::::.
CCDS30 VAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKN
:..::::. .::: :: . ::::::::::.:..:. .:::.::::.:.:::.:.. :.
CCDS30 MQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKG
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 LPPTNSEPA
. : :
CCDS30 IKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550
>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (575 aa)
initn: 2044 init1: 1928 opt: 1956 Z-score: 2415.2 bits: 456.7 E(32554): 3.3e-128
Smith-Waterman score: 1956; 53.7% identity (81.9% similar) in 525 aa overlap (22-545:40-563)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLF
:. :::: :. ... :::. :: :: .:
CCDS75 SIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TENNGRWIEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFL
...:.:.: ::::. . .::..:: :..:..:::::.:.: . : ... : : :::
CCDS75 MQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GQFSCSLGTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNR-VITLSLAGRRLDKKD
: . :.:: :::..:... :: . . :::. ::. :.::: : . :.. .:.:: ::
CCDS75 GGMECTLGQIVSQRKLSKSLLK-HGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LFGKSDPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMC
.:.:::::::... .::. .:::::::. .:.:.:: : : . :::.:: .. .. .
CCDS75 FFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YDYDNDGGHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKI
.:.:..: ::::::: .. ..: : .. ...:::::: . ::::::::: .:: :::
CCDS75 WDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 NRDYSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQ
.. .::::::.::::..:::.::::::::.: . :::::.:. ::::.:. :::.: :
CCDS75 HKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DYDSDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGP
::::::::::.::::..::.. :::.:::::: :: :.:..:...::..:::....:::
CCDS75 DYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TNFSPIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIV
::..::...::. :.. :. . :.:::::::.:::::.:: .::.:.:.::.::::.:::
CCDS75 TNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GVGNADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQ
:::::::. :..::::. .::: :: . ::::::::::.:..:. .:::.::::.:.:
CCDS75 GVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQ
490 500 510 520 530 540
540
pF1KB5 VVQYFKHKNLPPTNSEPA
::.:.. :.. : :
CCDS75 VVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
550 560 570
>>CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 1500 init1: 837 opt: 1850 Z-score: 2284.3 bits: 432.5 E(32554): 6.5e-121
Smith-Waterman score: 1850; 51.7% identity (78.1% similar) in 534 aa overlap (25-547:25-551)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNG--RW
.::.::: .::::::. :::::.:::.... : .:
CCDS87 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 IEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSL
:. :::. :.::: : .::.::: ::: ..:.: :.: :..: :..:::::: :.:
CCDS87 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GTIVSSK--KITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNR-VITLSLAGRRLDKKDLFGKS
: ::.:. .. .:.. . : : : ..:.::. : .. ... . .:::::.::::
CCDS87 GEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGT--IILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDN
:::: ::. ..::.. . :.:::.: ::.:::. : . . .::.::... :.: ::.:
CCDS87 DPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DGGHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYS
::.::::::: :: .. ..... . .: .::::. :::.: ::: . : : .. . :
CCDS87 DGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNV-YEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSD
::::: :: :. :::.:::::::::: .:.::::.::. : : :. :::.:.::::::
CCDS87 FLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSLHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSP
::::::::::.:::: ..:::::.: :: ::.:.:..:. .:: : ...::::::.:
CCDS87 KMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNA
..:::::.:... . ..:::.:::.:::::::: .:....:.:::::::::::::: :
CCDS87 VINHVARYASSV---KDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB5 DFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREF--RNAAK----ETLAKAVLAELPQ
.: :: ::::. . :. :. : ::::::::::.. :.. . ::: ::::.:.
CCDS87 EFDAMVELDGDDVRVSSR-GKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPE
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB5 QVVQYFKHKNLPPTNSEPA
: ..:.. ... :. . :
CCDS87 QFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
540 550 560
>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (557 aa)
initn: 1833 init1: 1154 opt: 1847 Z-score: 2280.7 bits: 431.8 E(32554): 1e-120
Smith-Waterman score: 1847; 50.9% identity (76.5% similar) in 544 aa overlap (10-547:4-546)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCV--CKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFT-ENNGR
: : .: : . . .::: :: ..:::::. .: : :::. .. .
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 WIEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCS
:.: .:::. . .:.::. ..:.: ::: : :.: .:: . .. . :::. :.
CCDS96 WVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LGTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSD-NRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSD
:: :::. :.:.:::: : : :::. :::.:.:.: : . :.. . .::.::::.:::
CCDS96 LGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDND
::.:.:: ..: . .:: ::::.: .:.: :.:: . : :::. :...:.. . ::::..
CCDS96 PFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GGHDFIGEFQTSVSQMCE--ARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDY
: ::::::: .. ..: : : . ....::::: . ::::::.:: ..: .: ... .
CCDS96 GKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDS
.:::::.::::. :::.::::::::.: . .::: ..: :.::.:. ::: : :::::
CCDS96 TFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFS
:: :::.::::..::...:::.:::::.: :: : ..:. .: :::.:..::::: .
CCDS96 DKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGN
::.:.::. : . . ::.: .::..::::.::: ::: :.:.::.::::::::::::
CCDS96 PIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQY
:::. :..::::. :: : ::::::::::::.:..:: .::: ::::.:.:::.:
CCDS96 ADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEY
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 FKHKNLPPTNSEPA
. ... : .:
CCDS96 YASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
540 550
>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (612 aa)
initn: 1833 init1: 1154 opt: 1847 Z-score: 2280.0 bits: 431.8 E(32554): 1.1e-120
Smith-Waterman score: 1847; 50.9% identity (76.5% similar) in 544 aa overlap (10-547:59-601)
10 20 30
pF1KB5 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCV--CKVELSVSGQNLLD
: : .: : . . .::: :: ..:::
CCDS61 ASGWSSKGVRARAREPERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RDVTSKSDPFCVLFT-ENNGRWIEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALF
::. .: : :::. .. .:.: .:::. . .:.::. ..:.: ::: : :.: .:
CCDS61 RDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVF
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 DQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLGTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSD-NR
: . .. . :::. :.:: :::. :.:.:::: : : :::. :::.:.:.: :
CCDS61 DAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTND
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 VITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLV
. :.. . .::.::::.:::::.:.:: ..: . .:: ::::.: .:.: :.:: . :
CCDS61 YVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLH
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 SLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGHDFIGEFQTSVSQMCE--ARDSVPLEFECINPKKQRK
:::. :...:.. . ::::..: ::::::: .. ..: : : . ....::::: . :
CCDS61 SLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDK
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 KKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPM
:::::.:: ..: .: ... ..:::::.::::. :::.::::::::.: . .::: ..:
CCDS61 KKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPR
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 GTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDG
:.::.:. ::: : ::::::: :::.::::..::...:::.:::::.: :: : ..:
CCDS61 QPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISG
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 IAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEET
. .: :::.:..::::: .::.:.::. : . . ::.: .::..::::.::: ::
CCDS61 VIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAET
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRN
: :.:.::.:::::::::::::::. :..::::. :: : ::::::::::::.:..
CCDS61 RTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKD
510 520 530 540 550 560
520 530 540
pF1KB5 AAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKNLPPTNSEPA
:: .::: ::::.:.:::.:. ... : .:
CCDS61 AAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
570 580 590 600 610
548 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 21:40:50 2016 done: Fri Nov 4 21:40:50 2016
Total Scan time: 3.250 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]